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大約克種豬大腸桿菌F4ac MUC13基因的不同基因型組合選配選育

2018-08-13 09:53陳光侯熊勝利陳大芳謝玲玲任麗群龍清孟冉雪琴
養(yǎng)豬 2018年4期
關(guān)鍵詞:種豬品系后備

陳光侯,熊勝利,李 平,陳大芳,謝玲玲,任麗群,李 波,王 欽,龍清孟,冉雪琴

(1.貴州省種畜禽種質(zhì)測(cè)定中心,貴州 貴陽 550018;2.貴州大學(xué),貴州 貴陽 550025)

斷奶前后仔豬腹瀉是生豬養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)中的一種常見疾病,而且死亡率很高,直接影響?zhàn)B豬生產(chǎn)的經(jīng)濟(jì)效益。據(jù)報(bào)道,在養(yǎng)豬業(yè)發(fā)達(dá)國家,如瑞典、英國和丹麥,新生仔豬腹瀉病的發(fā)生率分別為75.0%、50.5%和36.6%[1-3]。我國仔豬腹瀉病的發(fā)生率也很高,2012年對(duì)國內(nèi)某省4 118個(gè)養(yǎng)豬場(chǎng)戶進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn),哺乳仔豬腹瀉發(fā)生率高達(dá)18.31%、死亡率在10.44%~57.01%之間不等[4-5]。早年在豬流行性腹瀉病毒還沒大量報(bào)道之前,我國仔豬腹瀉病的發(fā)生率全年平均高達(dá)46.5%[6],個(gè)別地區(qū)甚至更高。近年來更是出現(xiàn)豬流行性腹瀉病毒和腸毒素大腸桿菌(ETEC)混合感染導(dǎo)致仔豬大面積腹瀉發(fā)生和死亡的事件。研究表明,產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(Enterotoxigenic Escherichia coli F4,ETEC F4)是引發(fā)斷奶前后仔豬腹瀉病的最主要致病菌[7-8]。F4為大腸桿菌ETEC的菌毛類型之一,分為F4ab、F4ac及F4ad,其中分布最廣泛的主要血清型是F4ac[9]。研究表明ETEC的F4ab、F4ac候選受體為MUC13(跨膜黏蛋白),主要是在胃腸道上皮表面[10-11]。

多年來,貴州省種畜禽種質(zhì)測(cè)定中心一直致力于開展國外引進(jìn)種豬選種選育研究,尤其是抗性新品系的培育工作及推廣應(yīng)用研究。種豬場(chǎng)在世代選育中采用了抗腹瀉基因檢測(cè)技術(shù),保留腹瀉抗性有利基因GG型個(gè)體,組建核心群種豬抗腹瀉新品系,建立大約克種豬抗腹瀉選育示范點(diǎn)?;A(chǔ)豬群采耳樣組織,送往江西農(nóng)業(yè)大學(xué)進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè)研究,結(jié)果表明大約克種豬在MUC13基因腹瀉抗性等位基因GG的頻率為16.79%(23/137),G基因頻率為0.46,腹瀉易感不利等位基因A基因頻率為0.54[12-13],這一檢測(cè)結(jié)果表明,利用分子育種技術(shù)輔助育種,兼顧選留表型和生產(chǎn)性能優(yōu)秀個(gè)體,逐世代加大GG純合抗性個(gè)體的選留比例,逐步淘汰AA和GA易感基因型個(gè)體,可使得育種群中有利基因頻率提高,最終建立抗K88(F4ac)腹瀉專門化品系。中心開展了大約克種6個(gè)不同基因型的組合配種方案:GG♂×GG♀、GG♂×GA♀、GA♂×GA♀、AA♂×GG♀、AA♂×GA♀、AA♂×AA♀,在相同的飼養(yǎng)環(huán)境條件下,跟蹤觀察其哺乳仔豬腹瀉發(fā)生率、腹瀉致死率、其他原因致死率、斷奶成活率,結(jié)果表明不同組合選配所生仔豬在哺乳期間的腹瀉發(fā)生率相應(yīng)為 2.71%、26.44%、46.18%、30.32%、40.96%、44.14%;不同組合選配其后代腹瀉致死率相應(yīng)為 0、3.07%、6.49%、3.94%、11.65%、12.5%;不同組合選配其哺乳仔豬其他原因致死率相應(yīng)為0.78%、1.92%、2.67%、1.97%、4.42%、5.08%;其斷奶成活率分別為 99.22%、95.02%、90.84%、94.09%、83.94%、82.42%[13]。由此可見,利用分子技術(shù)輔助選育進(jìn)行ETEC F4ac腹瀉抗性有利基因GG型個(gè)體選育,組建種豬抗腹瀉基礎(chǔ)群(新品系),可以從種源上提高種豬質(zhì)量,從而最大限度控制規(guī)?;i場(chǎng)新生仔豬及斷奶前后仔豬腹瀉的發(fā)生率,挖掘斷奶仔豬提高成活率的潛力,對(duì)提高豬場(chǎng)的經(jīng)濟(jì)效率和國外引進(jìn)種豬的使用價(jià)值具有重要意義。

1 材料與方法

1.1 樣品

貴州省種畜禽種質(zhì)測(cè)定中心課題組人員在科研試驗(yàn)場(chǎng)挑選46頭大約克種豬為研究群體,于2017年6月13日采耳樣組織,進(jìn)行腹瀉基因檢測(cè),明確基因型。2017年7月中旬,將大約克種豬按照3個(gè)不同組合(GA♂×GG♀、GG♂×GG♀、GA♂×GA♀)進(jìn)行選配,對(duì)不同組合生下的后代進(jìn)行后備種豬初選。2018年1月18日對(duì)仔豬進(jìn)行耳組織采樣,每頭豬采1份耳組織,開展抗腹瀉基因的個(gè)體選育研究。耳組織2~3 g,于75%乙醇的離心管中-20℃低溫保存,采用天根生化科技(北京)有限公司生產(chǎn)的血液基因組DNA,提取試劑盒制備基因組DNA,作為PCR檢測(cè)的模板。

1.2 主要驗(yàn)儀器設(shè)備

①離心機(jī)(Avanti-J30I),美國貝克曼庫爾特公司生產(chǎn);②制冰機(jī)(banshen),美國Grant公司生產(chǎn);③凝膠成像系統(tǒng)(Gel Doc XR),美國Bio-rad公司生產(chǎn);④熒光定量PCR儀(MyCycler),美國Bio-rad公司生產(chǎn);⑤標(biāo)準(zhǔn)型凈化工作臺(tái)(SW-CJ-IFD),上海錦星科學(xué)儀器有限公司生產(chǎn);⑥電泳儀(DYY.III2穩(wěn)壓電泳儀),北京六一儀器廠生產(chǎn);⑦-80℃超低溫冰箱,美國Thermo公司生產(chǎn);⑧水浴恒溫鍋(SHZ-82),中國金壇市醫(yī)療儀器廠生產(chǎn)。

1.3 PCR擴(kuò)增

根據(jù)GenBank上公布的豬MUC13基因序列設(shè)計(jì)4條特異性的引物(表1),由英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司合成。

表1 引物序列

PCR 反應(yīng)體系為 10 μL:2×PCR mix 5.0 μL,引物(10 pmol/L)各 0.5 μL,基因組 DNA(100 ng/μL)1.0 μL,雙蒸水補(bǔ)足 10 μL 體積。擴(kuò)增條件:95℃預(yù)變性5 min,95℃變性30 s,60℃/63℃退火 30 s,72℃延伸 45 s,30個(gè)循環(huán);72℃延伸 10 min,4℃保存。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)以2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

2 結(jié)果與分析

2.1 基因型檢測(cè)結(jié)果

將電泳得到173 bp條帶定為A基因,83 bp條帶定為G基因,如只得到1條173 bp條帶的樣品定義為AA基因型,只得到1條83 bp條帶的樣品定義為GG基因型,如得到2個(gè)條帶即為雜合的AG基因型(圖1)。

圖1 GG基因型(左)和AA基因型(右)

2.2 克隆測(cè)序

將得到的173 bp和83 bp兩種條帶分別切膠回收,連接T-載體,送上海英濰捷基貿(mào)易有限公司進(jìn)行基因克隆測(cè)序,證實(shí)擴(kuò)增片段確為MUC13基因,位于內(nèi)含子7當(dāng)中,根據(jù)峰的移動(dòng)位置確定該延伸產(chǎn)物對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn),依據(jù)峰的顏色可得知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型為G或A。

2.3 基因型頻率和基因頻率

試驗(yàn)從豬場(chǎng)的基礎(chǔ)繁殖群中挑選46頭大約克種豬為研究對(duì)象,開展基因檢測(cè),明確其腹瀉相關(guān)基因型,結(jié)果見表2。

從表2可以看出,本次檢測(cè)的基礎(chǔ)群46頭大約克(40頭母、6頭公),檢出抗腹瀉基因型GG個(gè)體12頭(2頭公豬,10頭母豬),腹瀉易感基因型GA個(gè)體為34頭(30頭母豬、4頭公豬),腹瀉易感基因AA型個(gè)體為0,其基因型頻率與基因頻率見表3。

表2 基礎(chǔ)繁育群抽檢的46頭大約克(母豬40頭、公豬6頭)抗腹瀉基因型

表3 46頭大約克豬的基因型頻率及基因頻率

試驗(yàn)將已明確基因型的母豬與公豬,采用3種不同基因型進(jìn)行組合選配:①GA♂×GG♀組合方式配 3產(chǎn)(即分別對(duì)應(yīng) 1、2、3窩);②GA♂×GA♀組合方式配 3產(chǎn)(分別對(duì)應(yīng) 4、5、6窩);③GG♂×GG♀組合方式配2產(chǎn)(分別對(duì)應(yīng)7、8窩)。保育期結(jié)束(仔豬滿雙月齡)時(shí),根據(jù)豬場(chǎng)豬群血統(tǒng)、系譜實(shí)際情況,確定預(yù)留后備豬仔豬。預(yù)留仔豬查看分娩記錄,包括窩產(chǎn)仔數(shù)、初生重、斷奶重,觀察仔豬乳頭對(duì)數(shù)是否達(dá)到7對(duì)、要求乳頭對(duì)稱、無發(fā)育不良的奶頭,公豬睪丸發(fā)育是否良好、睪丸是否對(duì)稱,仔豬體重及體型外貌表現(xiàn)是否優(yōu)秀等情況,初步預(yù)留后備豬。本研究是在傳統(tǒng)選育的基礎(chǔ)上,對(duì)初步預(yù)留的后備仔豬,采耳組織樣,開展抗腹瀉基因檢測(cè),目的是選留腹瀉抗性有利基因型GG個(gè)體作為后備豬,最終組建抗腹瀉新品系。本次對(duì)8產(chǎn)(8窩)選留的60頭預(yù)留后備豬仔開展抗腹瀉基因型檢測(cè),結(jié)果見表4。

表4 大約克種豬不同配種方案后代抗腹瀉基因檢測(cè)結(jié)果與分析

續(xù)表4 大約克種豬不同配種方案后代抗腹瀉基因檢測(cè)結(jié)果與分析

本研究按照GG♂×GG♀組合選配2窩,其后代預(yù)選留(隨機(jī)挑選)的16頭仔豬,進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè),結(jié)果均為抗腹瀉有利基因GG型個(gè)體,有利基因型檢出率100%,說明大約克種豬按照GG♂×GG♀組合選配,所生的仔豬均為抗腹瀉GG個(gè)體。這一結(jié)果與熊勝利等、龍清孟等對(duì)杜洛克豬群、加系大約克豬群的抗腹瀉基因研究基本一致[14-15]。

從表4可知,預(yù)留的60頭大約克后備豬仔豬,抗腹瀉基因GG型個(gè)體24頭(12頭母豬、12頭公豬),腹瀉易感基因GA型個(gè)體31頭(20頭母、11頭公),腹瀉易感基因AA型個(gè)體5頭(3頭母豬、2頭公豬),其基因型頻率、基因頻率見表5。

表5 選留的60頭大約克后備豬抗腹瀉基因的基因型頻率和基因頻率

3 討論

3.1 建立大約克種豬抗腹瀉新品系選育思路

抗性育種是種豬育種發(fā)展的重要方向,優(yōu)質(zhì)抗病種豬新品種(系)的培育是一項(xiàng)復(fù)雜的系統(tǒng)工程,傳統(tǒng)的常規(guī)選育技術(shù)難以獲得有效的遺傳進(jìn)展。參考前人的研究結(jié)果,結(jié)合抗腹瀉基因檢測(cè)輔助選育,總結(jié)分析一個(gè)豬場(chǎng)要開展腹瀉抗性新品系選育時(shí),首先最好把該豬場(chǎng)的核心群、基礎(chǔ)繁育群的公母全部采樣,進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè),明確核心群種豬、基礎(chǔ)繁育群不同個(gè)體的基因型。

3.2 組建抗腹瀉種豬基礎(chǔ)群(包括種公豬及種母豬)

根據(jù)抗腹瀉基因檢測(cè)結(jié)果,可組建核心群種豬(原種豬群)腹瀉抗性基因GG型群體,或抗腹瀉基因GG型基礎(chǔ)繁育群。

3.3 根據(jù)系譜,開展不同組合基因型公母選配

(1)最佳組合選配方案為GG♂×GG♀。選用該組合選配方式,其所生的后代均為腹瀉抗性GG型個(gè)體,直接根據(jù)血統(tǒng)需要選留體型外貌、生產(chǎn)性能等優(yōu)秀的個(gè)體作為后備種豬進(jìn)行擴(kuò)繁,最終建立大約克抗腹瀉新品系,這是最直接最理想的選育方案。

(2)其次考慮 GA♂×GG♀、GG♂×GA♀兩種組合選配,其后代在選留后備豬時(shí),采樣進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè),最終選留腹瀉抗性GG型個(gè)體。

本研究根據(jù)生產(chǎn)需要,把生產(chǎn)性能、體型外貌都表現(xiàn)優(yōu)秀的腹瀉易感基因GA型先保留下來,按照GA♂×GG♀,進(jìn)行組合選配,從其F1代中選出符合種用的預(yù)留后備種豬21頭,并采耳組織樣進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè),檢出GG型個(gè)體8頭,GG型個(gè)體檢出率 38.1%(8/21)。

按照GA♂×GA♀組合選配,從F1代中選留符合種用的預(yù)留后備仔豬23頭,進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè),結(jié)果抗腹瀉有利基因型個(gè)體GG檢出率為0,說明按照該組合選配,其所生的后代抗腹瀉基因GG型個(gè)體檢出率低。

因?yàn)楸狙芯坎皇遣捎谜C仔豬都檢測(cè),而是只針對(duì)符合后備種豬預(yù)留條件的仔豬進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè),只能說明GA♂×GG♀組合其后代GG型個(gè)體的檢出率高于GA♂×GA♀組合選配的。要深入了解GA♂×GG♀與GA♂×GA♀組合選配其所生仔豬的有關(guān)腹瀉基因型分配情況,這有待于進(jìn)一步深入研究,需要整窩仔豬采樣檢測(cè),并且擴(kuò)大檢測(cè)窩數(shù)。

(3)最后考慮按照GG♂×AA♀、AA♂×GG♀方案進(jìn)行組合選配。

在實(shí)際生產(chǎn)中,尤其在純種繁育場(chǎng),必須充分考慮血統(tǒng)、系譜、繁殖性能、兼顧體形外貌等指標(biāo),因此,保全種豬場(chǎng)血統(tǒng)、系譜需要的前提下,必須盡可能保留繁殖性能較為優(yōu)秀的GA、AA基因型個(gè)體,再按照GG♂×AA♀、AA♂×GG♀方案進(jìn)行組合選配,對(duì)符合后備種豬選用條件的F1代、F2代、甚至F3代進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè),最終選留其抗腹瀉后代,再逐步淘汰腹瀉易感型基因GA型、AA型的父母本。可見選育多個(gè)血統(tǒng)純種大約克抗腹瀉新品系所需的時(shí)間更長。

3.4 種豬腹瀉抗性新品系建立后導(dǎo)入新的血緣,擴(kuò)大抗腹瀉基因型個(gè)體的最佳組合選配面

在純種繁育場(chǎng)保全血統(tǒng)、系譜完整、已建立健全抗性新品系基礎(chǔ)群的前提下,通過引種導(dǎo)入新血緣,避免重蹈閉鎖選育的覆轍。

首先將新引進(jìn)的新血緣個(gè)體,進(jìn)行抗腹瀉基因檢測(cè),明確引進(jìn)群體的基因型情況。其次再根據(jù)優(yōu)先組合選配原則,最先考慮GG♂×GG♀組合選配方案,其次考慮GA♂×GG♀、GG♂×GA♀兩種組合選配。

3.5 雜交利用

抗性新品系核心群組建后,開展不同品種間的雜交利用,一方面提高了抗腹瀉種豬的利用價(jià)值,另一方面可以提高雜交后代的抗腹瀉能力,減少仔豬腹瀉死亡率,從而提高了豬場(chǎng)的經(jīng)濟(jì)效益。

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