董靜,楊振邦,劉沖,劉睿,張雪梅,張志
(1華北理工大學(xué)附屬唐山工人醫(yī)院,河北唐山063000;2華北理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院)
模式識(shí)別受體是進(jìn)化保守的機(jī)體先天性免疫系統(tǒng)感受器,通過識(shí)別外源致病物(病原體相關(guān)分子模式)和內(nèi)源致病物(損傷相關(guān)分子模式)激活胞內(nèi)特異的信號(hào)途徑,進(jìn)而啟動(dòng)免疫應(yīng)答。目前發(fā)現(xiàn)有5個(gè)模式識(shí)別受體家族,包括Toll受體、核苷酸結(jié)合寡聚域樣受體(NOD)、AIM受體、GIG-1受體(RLRs)和C型凝集素受體。若模式識(shí)別受體信號(hào)失調(diào),會(huì)導(dǎo)致感染、炎癥和腫瘤發(fā)生[1]。NOD1是NLRs家族的重要一員,廣泛表達(dá)于胚胎和成體的多種組織細(xì)胞中[2],定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜[3]。NOD1天然識(shí)別一種稱為GM-TriDAP(GlcNAc-MurNAc-L-Ala-D-Glu-mesoDAP)的肽聚糖結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)存在于絕大多數(shù)革蘭陰性菌和部分革蘭陽性菌的胞壁中,其中,iE-DAP(γ-D-Glu-mesoDAP)是NOD1的最小活性配體[4]。除了直接結(jié)合細(xì)菌病原體(外源致病物)外,NOD1受體還可感知Rho GTPases活性改變[5]、細(xì)胞骨架組裝異常[3]、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激[6]和病毒寄生蟲入侵[7](均為內(nèi)源致病物),從而啟動(dòng)先天性免疫應(yīng)答,并與惡性腫瘤[8]的發(fā)生密切相關(guān)。
肺癌是目前嚴(yán)重威脅人類健康的惡性腫瘤[9]。目前認(rèn)為,肺結(jié)核、肺炎、哮喘和慢性阻塞性肺疾病等炎性肺部疾病可能是肺癌發(fā)生發(fā)展的誘因[10],提示模式識(shí)別受體基因多態(tài)性可能賦予個(gè)體對(duì)環(huán)境不同的敏感度,進(jìn)而影響罹患肺癌的風(fēng)險(xiǎn)。研究表明,NOD1基因多態(tài)性可影響多種腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)[11,12],但關(guān)于NOD1基因多態(tài)性與肺癌易感性之間的關(guān)系少見報(bào)道。本研究旨在探討NOD1基因rs2075819A>G和rs2075820G>A遺傳變異與肺癌發(fā)病的關(guān)系。
1.1 臨床資料 收集2008年3月~2012年12月在唐山市工人醫(yī)院經(jīng)病理檢查確診的原發(fā)性肺癌患者706例(病例組),男471例、女235例,年齡平均59.26歲,腺癌404例(57.2%)、鱗狀細(xì)胞癌273例(38.7%),其他類型29例(4.10%)(腺鱗癌15例,支氣管肺泡癌9例和大細(xì)胞肺癌5例),吸煙者316例(44.8%),吸煙量平均22.36支/d,非吸煙者390例(55.2%);選擇同一時(shí)期該院的體檢健康者706例作為對(duì)照組,男474例、女232例,年齡平均59.05歲。吸煙者200例(28.3%),吸煙量平均25.64支/d,非吸煙者506例(71.7%)。既往無腫瘤史。病例組與對(duì)照組性別、年齡分布差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。病例組較對(duì)照組有更多的吸煙者(P<0.01)。用查閱病歷資料結(jié)合問卷調(diào)查方式收集研究對(duì)象一般人口學(xué)資料及臨床病理資料,并獲得知情同意。本研究獲得華北理工大學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。
1.2 NOD1基因rs2075819A>G和rs2075820G>A遺傳變異的基因分型 采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析(PCR-RLFP)法。DNA提取:收集研究對(duì)象的外周靜脈血2 mL,采用北京天根生化科技有限公司提供的DNA提取試劑盒提取DNA。NOD1 rs2075819上游引物:5′-GCAACTCGCAGATGCCTAC-3′,下游引物:5′-CATTCCCATACTTCCAAAG-3′。NOD1 rs2075820上游引物:5′-CACGGGCCGGCTAGACGCAGGGGT-3′,下游引物:5′-AGGCGCGCAGGTGGCTGGGGGAGA-3′。PCR反應(yīng)體系為11 L,含上下游引物各0.3 L(10 mmol/L),基因組DNA 1~100 ng,2×PCR mix(2×Es Taq MasterMix,康為世紀(jì)生物科技公司)6 L,加水補(bǔ)足。PCR反應(yīng)條件:94 ℃、3 min,94 ℃、40 s,56 ℃、1 min(rs2075819)/65 ℃、1 min(rs2075820),72 ℃、30 s,共35個(gè)循環(huán),72 ℃、3 min。酶切反應(yīng)體系為10 L,含PCR產(chǎn)物6 L,10×CutSmart Buffer(NEB公司)1 L,F(xiàn)BS(Gibco公司)0.1 L,限制性內(nèi)切酶BsmFⅠ(rs2075819,NEB公司)0.1 L/BseRⅠ(rs2075820,NEB公司)0.25 L,加水補(bǔ)足。酶切條件為65 ℃水浴2 h(rs2075819)/37 ℃水浴3 h(rs2075820)。酶切產(chǎn)物于2%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行基因型判斷和分析。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS16.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)數(shù)資料以頻次或百分比表示,比較采用χ2檢驗(yàn);用Logistic回歸分析評(píng)價(jià)NOD1基因rs2075819A>G和rs2075820G>A變異與肺癌遺傳易感性之間的關(guān)系。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 基因型判讀 NOD1 rs2075819A>G酶切后三種基因型:AA基因型產(chǎn)生一個(gè)338 bp的片段;AG基因型產(chǎn)生338 bp、247 bp和91 bp三個(gè)片段;GG基因型產(chǎn)生247 bp和91 bp兩個(gè)片段。NOD1 rs2075820 G>A酶切后三種基因型:AA基因型產(chǎn)生一個(gè)419 bp片段;GA基因型產(chǎn)生419 bp、267 bp和152 bp三個(gè)片段;GG基因型產(chǎn)生267 bp和152 bp兩個(gè)片段。每個(gè)檢測(cè)單元均設(shè)立陰性對(duì)照及兩個(gè)以上隨機(jī)重復(fù)樣本進(jìn)行質(zhì)量控制,并于總樣本中隨機(jī)抽取30個(gè)進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。
2.2 NOD1基因rs2075819A>G和rs2075820G>A遺傳變異與肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系 Logistic回歸分析表明,與NOD1 rs2075819AA基因型攜帶者相比,rs2075819AG基因型攜帶者發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)降低(OR=0.79,95%CI=0.63~0.99,P<0.05)。而NOD1 rs2075820各基因型在兩組的分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P均>0.05)。
2.3 NOD1基因rs2075819A>G和rs2075820G>A遺傳變異對(duì)肺癌發(fā)病影響的分層分析 年齡分層顯示,在≤60歲組中,rs2075819 AG基因型攜帶者具有較低的肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.69,95%CI=0.51~0.94,P=0.018),而在>60歲組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。吸煙分層顯示,在不吸煙者中,rs2075819 AG基因型攜帶者具有較低的肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.74,95%CI=0.56~0.98,P=0.037)。見表1。rs2075820G>A遺傳變異在年齡和吸煙分層中差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見表2。
表1 NOD1 rs2075819A>G遺傳變異與肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)系分層研究
表2 NOD1 rs2075820G>A遺傳變異與肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)系分層研究
NOD1基因位于人染色體7p14-15,編碼953aa,蛋白由3段結(jié)構(gòu)域構(gòu)成:C端亮氨酸重復(fù)序列結(jié)構(gòu)域,直接識(shí)別外源致病物和內(nèi)源致病物[13];中央核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域,具有天然ATP酶活性,負(fù)責(zé)與配體結(jié)合后發(fā)生自身寡聚化,從而招募下游信號(hào)蛋白[14];N端半胱天冬酶募集結(jié)構(gòu)域(CARD),與適配蛋白R(shí)IP2通過同型CARD-CARD相互作用激活神經(jīng)生長(zhǎng)因子κB、絲裂原激活的蛋白激酶和干擾素刺激基因因子3等信號(hào)通路及轉(zhuǎn)錄因子激活蛋白1[15,16],進(jìn)而啟動(dòng)免疫應(yīng)答,介導(dǎo)炎癥反應(yīng)。通過分析癌癥基因數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)信息,我們發(fā)現(xiàn),NOD1在肺腺癌和肺鱗癌中均呈現(xiàn)顯著性低表達(dá),盡管有研究顯示乳腺癌細(xì)胞中低表達(dá)的NOD1可能通過抑制腫瘤細(xì)胞凋亡的形式而促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)[8],但這種失調(diào)對(duì)于肺癌發(fā)生發(fā)展的影響機(jī)制尚不明確,也可能是弱化機(jī)體免疫對(duì)肺癌細(xì)胞的監(jiān)控,從而促進(jìn)肺癌細(xì)胞的生存和發(fā)展[17]。
本研究首次發(fā)現(xiàn),NOD1基因rs2075819A>G變異影響中國(guó)北方人群非小細(xì)胞肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),與NOD1rs2075819AA基因型攜帶者相比,rs2075819AG基因型攜帶者具有較低的肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。通過年齡分層分析,我們發(fā)現(xiàn)在≤60歲者中,rs2075819AG基因型攜帶者具有較低的肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),而在>60歲者中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,這個(gè)結(jié)果同M?ckelmann等[11]在德國(guó)人群中對(duì)結(jié)直腸癌的研究結(jié)果一致,顯示僅在<50歲組中,rs2075819A>G會(huì)降低結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。NOD1 rs2075819位于NOD1基因第5號(hào)內(nèi)含子中,該位點(diǎn)多態(tài)性的功能意義不十分清楚,可能位于剪接元件中影響轉(zhuǎn)錄本的剪接效率。此外,我們同時(shí)對(duì)NOD1 rs2075820G>A對(duì)非小細(xì)胞肺癌遺傳易感性的影響進(jìn)行了研究,未發(fā)現(xiàn)具有相關(guān)性。這與M?ckelmann等[11]的研究結(jié)果不一致,提示NOD1 rs2075820遺傳變異可能在不同人種、不同組織中具有不同的作用機(jī)制。NOD1 rs2075820G>A(也稱NOD1 E266K)位于NOD1基因第6號(hào)外顯子中,G>A變異使編碼谷氨酸變?yōu)橘嚢彼?,?dǎo)致氨基酸性質(zhì)發(fā)生改變,但關(guān)于這種變異如何影響NOD1基因功能未有報(bào)道。
吸煙是導(dǎo)致肺癌發(fā)病的高風(fēng)險(xiǎn)環(huán)境因素。本研究病例組中44.8%的患者為吸煙者,而對(duì)照組中僅有28.3%為吸煙者,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,證實(shí)了吸煙因素增加肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。有研究顯示吸煙會(huì)直接影響NOD1信號(hào)通路[18],我們進(jìn)一步對(duì)NOD1 rs2075819A>G和NOD1 rs2075820G>A進(jìn)行吸煙分層分析,結(jié)果顯示rs2075819A>G遺傳變異與肺癌易感性相關(guān)只發(fā)生在不吸煙者中。
本研究同Ozbayer等[12]的研究均表明NOD1基因多態(tài)性與肺癌發(fā)病相關(guān),證實(shí)了先天性免疫受體在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的重要作用,提示包括NOD1受體在內(nèi)的先天性免疫受體作為肺癌治療靶點(diǎn)的潛能。然而,本研究對(duì)NOD1多態(tài)位點(diǎn)的功能學(xué)機(jī)制未做深入研究,同時(shí)所研究的多態(tài)位點(diǎn)較少,因此還需要更多的多態(tài)位點(diǎn)在更大的樣本量中進(jìn)一步研究。
參考文獻(xiàn):
[1] Werts C, Rubino S, Ling A, et al. Nod-like receptors in intestinal homeostasis, inflammation, and cancer[J]. J Leukoc Biol, 2011,90(3):471-482.
[2] Uehara A, Fujimoto Y, Fukase K, et al. Various human epithelial cells express functional Toll-like receptors, NOD1 and NOD2 to produce anti-microbial peptides, but not proinflammatory cytokines[J]. Mol Immunol, 2007,44(12):3100-3111.
[3] Kufer TA, Kremmer E, Adam AC, et al. The pattern-recognition molecule Nod1 is localized at the plasma membrane at sites of bacterial interaction[J]. Cell Microbiol, 2008,10(2):477-486.
[4] Girardin SE, Boneca IG, Carneiro LA, et al. Nod1 detects a unique muropeptide from gram-negative bacterial peptidoglycan[J]. Science, 2003,300(5625):1584-1587.
[5] Keestra AM, Winter MG, Auburger JJ, et al. Manipulation of small Rho GTPases is a pathogen-induced process detected by NOD1[J]. Nature, 2013,496(7444):233-237.
[6] Keestra-Gounder AM, Byndloss MX, Seyffert N, et al. NOD1 and NOD2 signalling links ER stress with inflammation[J]. Nature, 2016,532(7599):394-397.
[7] Fan YH, Roy S, Mukhopadhyay R, et al. Role of nucleotide-binding oligomerization domain 1 (NOD1) and its variants in human cytomegalovirus control in vitro and in vivo[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2016,113(48):E7818-E7827.
[8] Chen GY, Shaw MH, Redondo G, et al. The innate immune receptor Nod1 protects the intestine from inflammation-induced tumorigenesis[J]. Cancer Res, 2008,68(24):10060-10067.
[9] Chen W, Zheng R, Baade PD, et al. Cancer statistics in China, 2015[J]. CA Cancer J Clin, 2016,66(2):115-132.
[10] Engels EA. Inflammation in the development of lung cancer: epidemiological evidence[J]. Expert Rev Anticancer Ther, 2008,8(4):605-615.
[11] M?ckelmann N, von Schonfels W, Buch S, et al. Investigation of innate immunity genes CARD4, CARD8 and CARD15 as germline susceptibility factors for colorectal cancer[J]. BMC Gastroenterol, 2009,9:79.
[12] Ozbayer C, Kurt H, Bayramoglu A, et al. The role of NOD1/CARD4 and NOD2/CARD15 genetic variations in lung cancer risk[J]. Inflamm Res, 2015,64(10):775-779.
[13] Vijayrajratnam S, Pushkaran AC, Balakrishnan A, et al. Understanding the molecular differential recognition of muramyl peptide ligands by LRR domains of human NOD receptors[J]. Biochem J, 2017,474(16):2691-2711.
[14] Koonin EV, Aravind L. The NACHT family—a new group of predicted NTPases implicated in apoptosis and MHC transcription activation[J]. Trends Biochem Sci, 2000,25(5):223-224.
[15] Allison CC, Kufer TA, Kremmer E, et al. Helicobacter pylori induces MAPK phosphorylation and AP-1 activation via a NOD1-dependent mechanism[J]. J Immunol, 2009,183(12):8099-8109.
[16] Watanabe T, Asano N, Fichtner-Feigl S, et al. NOD1 contributes to mouse host defense against Helicobacter pylori via induction of type I IFN and activation of the ISGF3 signaling pathway[J]. J Clin Invest, 2010,120(5):1645-1662.
[17] Hanahan D, Weinberg RA. Hallmarks of cancer: the next generation[J]. Cell, 2011,144(5):646-674.
[18] Qian YJ, Wang X, Gao YF, et al. Cigarette smoke modulates NOD1 signal pathway and human beta defensins expression in human oral mucosa[J]. Cell Physiol Biochem, 2015,36(2):457-473.