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基于二次聚類的主動(dòng)脈弓分割方法

2018-05-03 03:07:45陳中中楊亞茹張建飛王倩倩朱惠玉
關(guān)鍵詞:彩色圖像主動(dòng)脈弓均值

陳中中, 楊亞茹, 張建飛, 王倩倩, 朱惠玉

(1.鄭州大學(xué) 機(jī)械工程學(xué)院,河南 鄭州 450001; 2.河南省生產(chǎn)力促進(jìn)中心,河南 鄭州 450001)

0 引言

體內(nèi)流場(chǎng)的監(jiān)測(cè)與評(píng)估對(duì)于觀測(cè)動(dòng)脈粥樣硬化、主動(dòng)脈夾層、動(dòng)脈瘤等心血管疾病具有重要作用,而建立人體主動(dòng)脈弓三維模型對(duì)于血液動(dòng)力學(xué)研究有指導(dǎo)意義,但就目前的醫(yī)學(xué)測(cè)量手段而言,由于人體胸主動(dòng)脈幾何形狀的復(fù)雜性,僅依靠醫(yī)療器械來實(shí)現(xiàn)三維模型建立較為困難,只有通過圖像處理的方法來得以實(shí)現(xiàn).

基于彩色空間特性的分割一般采取區(qū)域分割和聚類的方法來實(shí)現(xiàn)[1].其中,模糊聚類法對(duì)彩色圖像的色相飽和度進(jìn)行處理,能夠快速實(shí)現(xiàn)聚類中心的初始化[2];均值漂移法在圖像平滑、分割及物體跟蹤處理中都得到了較好的結(jié)果[3];基于小波分析的k-means聚類分割對(duì)骨髓細(xì)胞圖像的分割效果良好,改善了傳統(tǒng)算法誤分割、過分割等問題[4];分水嶺與區(qū)域生長算法結(jié)合起來用于彩色圖像分割,該算法能夠充分利用分水嶺和區(qū)域生長算法的優(yōu)勢(shì)[5].然而模糊聚類算法需要預(yù)先定義模糊隸屬度函數(shù)且處理圖像復(fù)雜噪聲較多的圖像時(shí),邊緣多呈現(xiàn)出毛刺狀,易產(chǎn)生大量孤立點(diǎn)[6];均值漂移算法的準(zhǔn)確性易受圖像中目標(biāo)區(qū)域大小的影響;分水嶺算法中目標(biāo)的標(biāo)記提取會(huì)影響圖像分割效果;k-means算法中聚類數(shù)的設(shè)定需要先驗(yàn)知識(shí),若選取不當(dāng)分割效果會(huì)很差;區(qū)域生長法種子點(diǎn)的選取決定了目標(biāo)物能否完整分割.

筆者針對(duì)彩色人體切片圖像,提出了一種基于二次聚類的圖像分割方法,通過均值漂移和層次聚類算法完成圖像分割處理,以期獲得良好的分割效果,建立精確的主動(dòng)脈弓三維模型.

1 算法分析

1.1 均值漂移算法

均值漂移算法(meanshift)本質(zhì)上是一個(gè)自適應(yīng)的梯度上升搜索峰值的方法,不需要任何先驗(yàn)知識(shí),數(shù)據(jù)集中的每一點(diǎn)都可作為初始值,對(duì)任意形狀分布的數(shù)據(jù)都有效,運(yùn)用它進(jìn)行圖像分割時(shí),能在保留圖像基本特性的基礎(chǔ)上將圖像分割成一些子區(qū)域,減少圖像中基本的實(shí)體數(shù)目[7-8].均值漂移算法目標(biāo)函數(shù)表示為:

(1)

式中:G(x)表示任意一個(gè)單位核函數(shù),核函數(shù)決定了采樣點(diǎn)xi與核中心點(diǎn)x之間的相似性度量;w(xi)≥0表示相應(yīng)樣本點(diǎn)xi的權(quán)重值;均值漂移算法的收斂點(diǎn)為局部密度極大值點(diǎn).

1.2 層次聚類算法

層次聚類法(hierarchical clustering)是將每一個(gè)區(qū)域的特征看作是一個(gè)類,不同類之間的距離可以有不同的計(jì)算方式,根據(jù)計(jì)算得到的類間距參數(shù)合并兩個(gè)最接近的類,重復(fù)此過程,直到結(jié)果滿足條件為止.根據(jù)不同類間距的計(jì)算方法不同,分為最小距離法、最大距離法、組平均聚類法和ward法[9-10].

隨機(jī)選取20個(gè)二維點(diǎn)的樣本數(shù)據(jù),如圖1所示,運(yùn)用最小距離法、最大距離法、組平均法以及ward法對(duì)樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,如表1所示.采用歐氏距離計(jì)算方法,獲得不同的處理結(jié)果,如圖2所示.

圖1 樣點(diǎn)數(shù)據(jù)Fig.1 Sample data

樣本數(shù)據(jù)算法P1(023,042)P2(020,045)P3(035,033)P4(033,053)P5(045,030)……P18(030,021)P19(034,016)P20(027,012)dmin(Ci,Cj)=minx∈Ci,y∈Cj‖x-y‖dmax(Ci,Cj)=maxx∈Ci,y∈Cj‖x-y‖davg(Ci,Cj)=1ninj∑x∈Ci∑x∈Cj‖x-y‖dward(Ci,Cj)=ninjni+nj‖ui-uj‖

表1中,類Ci、Cj表示meanshift算法聚類后得到的兩個(gè)區(qū)域,其顏色向量分別為XCi、XCj,大小和均值分別為ni、ui、nj、uj.

最小距離法和最大距離法會(huì)因?yàn)閮蓚€(gè)區(qū)域中的極端點(diǎn)而使聚類結(jié)果出現(xiàn)錯(cuò)誤;組平均法和ward法是對(duì)整個(gè)區(qū)域中的所有點(diǎn)進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,得到的結(jié)果能反映兩類之間的相似度.筆者采用組平均法對(duì)圖像進(jìn)行第二次聚類處理.

圖2 不同算法的結(jié)果Fig.2 Result of different methods

1.3 二次聚類算法

筆者提出基于均值漂移算法和層次聚類算法的二次聚類算法(MSHC),最后利用種子區(qū)域生長法實(shí)現(xiàn)對(duì)主動(dòng)脈弓的分割提取,具體算法步驟,如圖3所示.

2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

2.1 實(shí)驗(yàn)對(duì)象

所用的人體數(shù)據(jù)來源于美國國立醫(yī)學(xué)圖書館可視人計(jì)劃男性數(shù)據(jù)集,共1 878人體切片圖像,如圖4所示.每張圖像像素2 048×1 216,體元大小0.33 mm×0.33 mm×1.00 mm.重建主動(dòng)脈弓所需要的圖像為胸腔部分的161張圖像并將其按順序編號(hào)0~160.

2.2 圖像預(yù)處理

考慮到某些外在因素,比如成像設(shè)備晃動(dòng),會(huì)造成圖像的偏移,在進(jìn)行切片成像時(shí),會(huì)預(yù)先設(shè)定一個(gè)定位桿,在重建血管前需要對(duì)選取的圖像參照定位桿進(jìn)行配準(zhǔn).用Matlab記錄每張圖像定位桿的偏移量并繪出偏移曲線,如圖5所示.對(duì)定位桿進(jìn)行配準(zhǔn),配準(zhǔn)前后定位桿對(duì)比效果,如圖6所示.

圖3 算法流程圖Fig.3 Flowchart of the proposed method

圖5 定位桿偏移曲線Fig.5 The curve of locating rod offset

圖6 配準(zhǔn)前后Fig.6 Before registration and after registration

由于RGB顏色空間將色調(diào)、亮度、飽和度3個(gè)量放在一起表示,通過歐氏距離計(jì)算得到的與同一點(diǎn)色差值相同點(diǎn)的顏色很可能不同,在進(jìn)行顏色分離時(shí)容易造成誤分離.L*U*V*是一種均勻顏色空間,如果用一個(gè)三維向量Xi=(x1i,x2i,x3i)表示彩色圖像中的一個(gè)像素點(diǎn),則像素點(diǎn)的色差為dik=‖Xi-Xk‖2.因此可用于測(cè)量小的色差,以提高圖像分割的效果.

將RGB顏色空間先轉(zhuǎn)換為XYZ顏色空間,如公式(2)所示,再由XYZ顏色空間轉(zhuǎn)換為L*U*V*顏色空間,如公式(3)所示[11]:

(2)

(3)

式中:R、G、B、X、Y、Z、L*、U*、V*分別為RGB、XYZ、L*U*V*顏色空間的顏色矩陣.

2.3 實(shí)驗(yàn)對(duì)比

為了驗(yàn)證本文算法的有效性,選取部分組織結(jié)構(gòu)復(fù)雜的圖像進(jìn)行不同分割算法處理.在MATLAB環(huán)境中對(duì)34#、42#、49#、66#的圖像分別進(jìn)行模糊聚類算法(FCM)、k-means聚類算法(k=4)以及本文聚類算法(MSHC)分割處理,如圖7所示.算法效果判斷依據(jù)是能否獲得完整主動(dòng)脈輪廓以及是否利于進(jìn)一步的后續(xù)處理.其中圖(b)FCM算法結(jié)果中存在大量孤立點(diǎn),不便于區(qū)域生長法的進(jìn)行;圖(c)k-means算法結(jié)果不理想,主動(dòng)脈弓部分存在過分割現(xiàn)象,且圖像中存在大量孤立點(diǎn);圖(d)MSHC算法結(jié)果較滿意,主動(dòng)脈部分分割完整,且邊緣平滑.綜合分析這3種聚類算法結(jié)果,可以發(fā)現(xiàn)FCM算法和k-means算法分割結(jié)果中的組織整體性差,而本文提出的算法分割結(jié)果較為滿意.

2.4 主動(dòng)脈弓三維重建

對(duì)原圖像進(jìn)行剪裁,截取主要部分進(jìn)行分割處理.圖像處理結(jié)果如圖8所示,其中圖8(a)為meanshift算法結(jié)果,圖8(b)為hierarchical clustering算法結(jié)果,圖8(c)為區(qū)域生長處理結(jié)果,圖8(d)為特定區(qū)域填充結(jié)果.

將最終結(jié)果導(dǎo)入醫(yī)學(xué)軟件3D-DOCTOR中,進(jìn)行閾值分割,并對(duì)其進(jìn)行表面重建,獲取原始的主動(dòng)脈弓三維模型.用Geomagic軟件對(duì)模型進(jìn)行網(wǎng)格優(yōu)化,如圖9所示.

圖7 不同算法處理結(jié)果Fig.7 Result of different methods

圖8 算法每步的處理結(jié)果Fig.8 Each step of method processing result

圖9 三維重建效果圖Fig.9 Effect of 3D reconstruction

3 結(jié)束語

筆者通過對(duì)彩色圖像分割及主動(dòng)脈弓三維重建的研究,完成了應(yīng)用二次聚類算法(MSHC)對(duì)人體切片圖像的分割處理,并建立了主動(dòng)脈弓三維模型.該模型立體感強(qiáng),三維效果逼真,可清晰展現(xiàn)其空間三維結(jié)構(gòu),對(duì)于血液動(dòng)力學(xué)的直觀研究具有重要意義:一方面在微創(chuàng)介入手術(shù)中幫助醫(yī)生選擇合理的導(dǎo)管介入路徑與方式,為醫(yī)生提供介入手術(shù)訓(xùn)練平臺(tái),提高介入手術(shù)的安全與效率;另一方面,血液動(dòng)力學(xué)的研究為血管狹窄等血管疾病的預(yù)測(cè)及診斷提供了一定的研究基礎(chǔ).

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