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人溶菌酶基因密碼子優(yōu)化及其在小鼠乳腺中的表達(dá)

2018-04-20 06:50:10楊雪珍葉亞瓊何蘭花張綺瓊
關(guān)鍵詞:溶菌酶密碼子外源

楊雪珍,葉亞瓊,何蘭花,張綺瓊,王 曄,劉 燊*

(佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院動(dòng)物科學(xué)系,廣東佛山528000)

溶菌酶(lysozyme),又稱胞壁質(zhì)酶,根據(jù)其來(lái)源可分為動(dòng)物型、植物型、細(xì)菌型和T4噬菌體型,其中動(dòng)物型又分為C型、G型和I型。與蛋清溶菌酶類似,人溶菌酶(human lysozyme,hLZ)屬于動(dòng)物型的C型。在人體內(nèi),人溶菌酶作為一種非特異性免疫因子,是免疫系統(tǒng)和乳汁構(gòu)成(0.4 mg/mL)的重要成員之一,發(fā)揮著殺菌消炎、免疫調(diào)節(jié)、改善胃腸道菌群等作用。然而,溶菌酶在其它動(dòng)物乳汁中的表達(dá)卻很低,如牛乳 0.13 μg/mL、山羊乳 0.25 μg/mL、豬乳 0.065 μg/mL[1-2],且其生物活性也明顯低于人溶菌酶,如蛋清溶菌酶活性只有人溶菌酶的1/3[3],其中的原因值得進(jìn)一步探究。人溶菌酶由130個(gè)氨基酸組成,分子量為14.7 kD,等電點(diǎn)為11。人溶菌酶基因位于12號(hào)染色體長(zhǎng)臂上(12q15),序列全長(zhǎng)6 807 bp(GenBank序列號(hào):X14008),含有4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子。人溶菌酶作用機(jī)理主要為水解細(xì)菌細(xì)胞壁肽聚糖N-乙酰葡萄糖胺與N-乙酰氨基葡萄糖乳酸之間的β-1,4糖苷鍵,從而破壞細(xì)菌的細(xì)胞壁。同時(shí),人溶菌酶還能螯合脂多糖和脂磷壁酸從而抑制炎癥反應(yīng)[4],以及對(duì)中性粒細(xì)胞的免疫調(diào)節(jié)作用,減少促炎癥因子的產(chǎn)生[5]。

利用轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,以動(dòng)物乳腺為“生產(chǎn)車間”表達(dá)外源蛋白,是新一代的動(dòng)物乳腺生物反應(yīng)器技術(shù)。與微生物發(fā)酵和動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)相比,它具有生物活性高、易分離提純、產(chǎn)量高等突出特點(diǎn)。人溶菌酶乳腺生物反應(yīng)器的嘗試最早為美國(guó)加州大學(xué)戴維斯分校Murray實(shí)驗(yàn)室,他們使用20 kb αS1酪蛋白啟動(dòng)子和人溶菌酶cDNA序列構(gòu)建了乳腺表達(dá)載體,表達(dá)量在250~710 μg/mL間[6],之后使用該表達(dá)載體獲得了轉(zhuǎn)基因羊,表達(dá)量為270 μg/mL[7]。中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)研究人員利用商業(yè)化載體pBC1(4.1 kb山羊β-酪蛋白啟動(dòng)子)和人溶菌酶基因組DNA構(gòu)建了表達(dá)載體,獲得轉(zhuǎn)基因小鼠的最高表達(dá)量為1.4 mg/mL[8],但轉(zhuǎn)基因牛的表達(dá)量卻低至25.96 μg/mL[9]。之后,改造和利用人乳鐵蛋白基因座作為控制元件,調(diào)控人溶菌酶基因組DNA,獲得轉(zhuǎn)基因小鼠乳汁的表達(dá)量為1.76 mg/mL[10],獲得了轉(zhuǎn)基因牛乳的表達(dá)量為3.1 mg/mL[11],實(shí)現(xiàn)了高效表達(dá)。但是,伴隨著轉(zhuǎn)基因輿論壓力的增大和基因編輯技術(shù)(zinc-finger nucleases,ZFN;transcription activator like effector nucleases,TALENs 和 clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR/Cas)日益成熟的情況下,原有的人溶菌酶乳腺生物反應(yīng)器獲得生物安全證書(shū)審批通過(guò)的可能性益加漫長(zhǎng),需要整合新的生物技術(shù),制備外源基因定點(diǎn)整合、重組蛋白高效表達(dá)的人溶菌酶轉(zhuǎn)基因動(dòng)物[12]。為此,西北農(nóng)林科技大學(xué)研究人員設(shè)計(jì)了鋅指核糖核酸酶(ZFN)打靶體系,利用內(nèi)源的αS2酪蛋白調(diào)控序列,指導(dǎo)人溶菌酶基因cDNA的表達(dá),表現(xiàn)為微量表達(dá)(23~31 μg/mL)[13],需要繼續(xù)提高表達(dá)量才有產(chǎn)業(yè)化價(jià)值,而密碼子優(yōu)化策略是提高外源基因表達(dá)量的方法之一,目前尚沒(méi)有關(guān)于人溶菌酶優(yōu)化密碼子乳腺表達(dá)研究的報(bào)道。

基于不同物種或同一物種的不同器官/組織對(duì)密碼子的使用頻率不同,密碼子優(yōu)化策略可以顯著提高其表達(dá)量[14]。本研究根據(jù)牛乳主要蛋白的密碼子使用偏好,優(yōu)化了人溶菌酶基因cDNA序列,連入已驗(yàn)證好的乳腺表達(dá)載體中(pMWAP-Zeo,包含8.5 kb 5’和 8.0 kb 3’小鼠乳清酸蛋白基因座調(diào)控序列)[15],制備了轉(zhuǎn)基因小鼠,并驗(yàn)證了優(yōu)化的人溶菌酶密碼子表達(dá)效率,以為外源基因定點(diǎn)整合的人溶菌酶轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的高效表達(dá)研究奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)材料

乳腺表達(dá)載體pMWAP-Zeo:由本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建和保存;密碼子優(yōu)化設(shè)計(jì)的hLZ cDNA序列、PCR引物:由生工生物工程(上海)股份有限公司合成;實(shí)驗(yàn)動(dòng)物:昆明白小鼠購(gòu)自國(guó)家計(jì)劃生育研究所動(dòng)物部;分子生物學(xué)試劑(包括:pMD19-T載體、各種DNA內(nèi)切酶、連接酶、聚合酶等;以及dNTP混合物、DNA分子量標(biāo)記、感受態(tài)細(xì)胞等):購(gòu)于大連TaKaRa公司;標(biāo)準(zhǔn)人溶菌酶純品:購(gòu)自Sigma-Aldrich公司;人溶菌酶多克隆抗體:購(gòu)自US Biological Inc.公司。

1.2 pMWAP-hLZ-OP乳腺表達(dá)載體的構(gòu)建

經(jīng)密碼子優(yōu)化后的人溶菌酶cDNA序列(hLZ-OP)由全基因合成獲得,并且在序列兩端各加上一個(gè)NotⅠ酶切位點(diǎn),以及在5′端的酶切位點(diǎn)與ATG之間加上ACC堿基以使起始序列符合Kozak規(guī)則[16]。pMWAP-Zeo由本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建和保存,含有小鼠乳清酸蛋白(mWAP)基因座的8.5 kb 5’端,8.0 kb 3’端調(diào)控序列,以及新霉素(Zeocin)基因(替代mWAP基因)及其兩端的NotⅠ酶切位點(diǎn)。通過(guò)NotⅠ酶切位點(diǎn),將hLZ-OP DNA序列與pMWAP-Zeo載體相連,構(gòu)建pMWAP-hLZ-OP乳腺表達(dá)載體。

1.3 轉(zhuǎn)基因小鼠的PCR檢測(cè)

表達(dá)載體pMWAP-hLZ-OP經(jīng)PvuI和SalI酶切后,去除了原核序列骨架,回收得到線性化的目標(biāo)片段。通過(guò)顯微注射,將回收片段注射到受精卵的雄原核內(nèi),并將此受精卵移植到假孕受體鼠的輸卵管內(nèi),出生小鼠。

取2~3周齡小鼠的尾巴組織樣,提取DNA,使用3對(duì)引物鑒定小鼠的轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性和插入基因的完整性(圖 3A)。P1 引物,F(xiàn):5′GAT CCA CAG GAC GGG TGT 3′,R:5′CTC CAG CCC ACT ATT TAG ACA 3′,產(chǎn)物長(zhǎng)度 538 bp;PcDNA 引物,F(xiàn):5′ACC ATG AAG GCC CTG ATC GTG 3′,R:5′TTA CAC TCC ACA TCC CTG CAC 3′,產(chǎn)物長(zhǎng)度 450 bp;P2 引物,F(xiàn):5′CCG AGT GAA TAA ATT AGA CA 3′,R:5′ACG GAA ATG TTG AAT ACT CAT 3′,產(chǎn)物長(zhǎng)度 568 bp。

1.4 轉(zhuǎn)基因小鼠乳汁的Western blot檢測(cè)

在轉(zhuǎn)基因小鼠生出仔鼠后的第7 d,按照文獻(xiàn)方法采集轉(zhuǎn)基因小鼠的乳汁[14]。將乳汁離心去除乳脂,調(diào)節(jié)pH值至4.0左右去除酪蛋白,再將pH值調(diào)至8.0,終稀釋濃度為1∶10。之后進(jìn)行蛋白電泳,乳清上樣量為10 μL,轉(zhuǎn)移至纖維素膜,然后用兔抗人溶菌酶多克隆抗體和羊抗兔二抗進(jìn)行Western blot檢測(cè)重組溶菌酶的表達(dá)。

2 結(jié)果與分析

2.1 人溶菌酶密碼子優(yōu)化

對(duì)牛乳主要的蛋白質(zhì)(α-乳清蛋白、β-乳球蛋白、以及5種酪蛋白等)密碼子的使用偏好性進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)牛乳蛋白質(zhì)基因偏好以CG結(jié)尾(未發(fā)表數(shù)據(jù)),而野生型(WT)人溶菌酶基因偏好以CT結(jié)尾?;诿艽a子使用規(guī)則,在不改變編碼氨基酸序列的基礎(chǔ)上對(duì)447 bp的人溶菌酶基因密碼子進(jìn)行了偏好CG結(jié)尾的優(yōu)化設(shè)計(jì)(圖1)。相比野生型(WT),優(yōu)化后的hLZ基因(hLZ-OP)共改變了95個(gè)堿基,約占hLZ基因堿基總數(shù)的21.3%,G+C含量由46.9%上升至57.9%。

圖1 人溶菌酶基因的密碼子優(yōu)化

2.2 乳腺表達(dá)載體pMWAP-hLZ-OP構(gòu)建

全基因合成的447 bp hLZ-OP首先連入pMD 19-T載體,測(cè)序驗(yàn)證cDNA序列和酶切位點(diǎn)正確后,命名為pMD19-hLZ-OP載體。乳腺表達(dá)載體pMWAP-Zeo由本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建和保存,含有mWAP基因座的8.5 kb 5’端調(diào)控序列,兩端為NotⅠ酶切位點(diǎn)的Zeocin基因和8.0 kb 3’端調(diào)控序列。使用NotⅠ內(nèi)切酶分別酶切pMD19-hLZ-OP和pMWAP-Zeo載體,膠回收hLZ-OP和pMWAP目標(biāo)片段。將兩段回收的目標(biāo)片段通過(guò)NotⅠ酶切位點(diǎn)連接,轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,挑選單克隆菌落測(cè)序并驗(yàn)證出正確的插入方向后,即構(gòu)建完pMWAP-hLZ-OP乳腺表達(dá)載體(圖2)。

圖2 人溶菌酶基因的密碼子優(yōu)化

2.3 轉(zhuǎn)基因小鼠制備和PCR鑒定

乳腺表達(dá)載體pMWAP-hLZ-OP經(jīng)PvuI和SalI酶切線性化后,去除原核骨架序列,再通過(guò)顯微注射技術(shù),注入小鼠受精卵的雄原核內(nèi)。移植約500枚受精卵到12只受體鼠的輸卵管內(nèi),共出生21只仔鼠。

采集鼠尾組織,提取基因組,進(jìn)行PCR鑒定。使用3對(duì)引物鑒定轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性和插入載體的完整性。引物P1位于表達(dá)載體的5′端,產(chǎn)物長(zhǎng)度538 bp;引物P2位于表達(dá)載體的3′端,產(chǎn)物長(zhǎng)度568 bp;引物PcDNA擴(kuò)增的是hLZ cDNA序列,產(chǎn)物長(zhǎng)度450 bp(圖3A)。結(jié)果顯示,共有4只仔鼠(編號(hào)為:4、6、9和19)為轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性小鼠,陽(yáng)性率19.04%,且插入的表達(dá)載體均具備完整性(圖3B)。

圖3 人溶菌酶轉(zhuǎn)基因小鼠的PCR鑒定

2.4 重組人溶菌酶在乳腺中的表達(dá)

轉(zhuǎn)基因小鼠配種并生出仔鼠后,采集乳汁,進(jìn)行Western blot檢測(cè)重組人溶菌酶在乳汁中的表達(dá)。結(jié)果如圖4所示,4只轉(zhuǎn)基因小鼠的乳清樣品均獲得了陽(yáng)性雜交信號(hào),但又明顯低于陽(yáng)性對(duì)照(PC,30 ng/mL的人溶菌酶標(biāo)準(zhǔn)品)信號(hào)。因此,4、6、9、19轉(zhuǎn)基因小鼠乳汁中均有微量的重組人溶菌酶表達(dá)。

圖4 Western blot檢測(cè)鼠乳中rhLZ的表達(dá)

2.5 外源基因的遺傳檢測(cè)

4只原代轉(zhuǎn)基因小鼠與非轉(zhuǎn)基因公鼠配種后,共出生42只后代,其中20只經(jīng)PCR鑒定為轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性后代,陽(yáng)性率為47.6%,基本符合孟德?tīng)栠z傳規(guī)律。這表明,轉(zhuǎn)基因小鼠的外源基因均可以穩(wěn)定遺傳給下一代。

表1 表達(dá)載體pMWAP-hLZ-OP獲得的轉(zhuǎn)基因小鼠情況

3 討論

利用動(dòng)物乳腺生物反應(yīng)器大規(guī)模生產(chǎn)藥用/保健蛋白,已是一項(xiàng)技術(shù)成熟且正在產(chǎn)業(yè)化的生物技術(shù),且越來(lái)越表現(xiàn)獨(dú)特的技術(shù)優(yōu)勢(shì)[17]。人溶菌酶是人乳蛋白的主要成分之一,在醫(yī)藥保健產(chǎn)品市場(chǎng),特別是在嬰幼兒奶粉方面,具有巨大的潛在價(jià)值。傳統(tǒng)的細(xì)菌、酵母和細(xì)胞發(fā)酵等方法表達(dá)重組人溶菌酶存在著許多缺陷,無(wú)法進(jìn)行產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用。而市場(chǎng)上銷售的雞蛋清溶菌酶,因?yàn)橹旅粜砸矘O少能夠應(yīng)用于人類的保健產(chǎn)品。因此,利用動(dòng)物乳腺生物反應(yīng)器來(lái)生產(chǎn)重組人溶菌酶,制備“人乳化”牛奶一直是科學(xué)家的夢(mèng)想[18]。

目前,美國(guó)加州大學(xué)戴維斯分校和中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)已分別獲得了具備產(chǎn)業(yè)化潛能的人溶菌酶轉(zhuǎn)基因羊和轉(zhuǎn)基因奶牛[6,10],西北農(nóng)林科技大學(xué)研究人員利用內(nèi)源的αS2酪蛋白啟動(dòng)子,指導(dǎo)人溶菌酶基因cDNA的表達(dá),但是只有微量表達(dá)13,密碼子優(yōu)化策略是提高外源基因表達(dá)量的方法之一。

本研究主要根據(jù)牛乳主要蛋白偏好以CG結(jié)尾的特征,對(duì)野生型人溶菌酶基因進(jìn)行了偏好CG結(jié)尾的優(yōu)化設(shè)計(jì),使用經(jīng)驗(yàn)證過(guò)的乳腺表達(dá)載體pMWAP-Zeo,來(lái)驗(yàn)證密碼子優(yōu)化后的人溶菌酶基因的乳腺表達(dá)效率。原核注射后獲得4只轉(zhuǎn)基因小鼠,能按照孟德?tīng)栠z傳規(guī)律將將外源基因傳遞給下一代,Western blot檢測(cè)顯示小鼠乳汁中有微量重組人溶菌酶的表達(dá)。因此,密碼子優(yōu)化后的人溶菌酶基因可以在小鼠乳腺中獲得有效表達(dá)。由于影響外源基因表達(dá)的因素很多,諸如“位置效應(yīng)”[20]、啟動(dòng)子的強(qiáng)弱、使用基因組DNA或cNDA、起始位點(diǎn)序列[16]等,這需要進(jìn)一步的研究才能得到最優(yōu)的結(jié)果。本研究可為外源基因定點(diǎn)整合的人溶菌酶轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的高效表達(dá)研究奠定基礎(chǔ)。

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