陳培富
(云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物醫(yī)學(xué)院, 昆明 650201)
動(dòng)物病毒分類的口訣法教學(xué)
陳培富
(云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物醫(yī)學(xué)院, 昆明 650201)
對(duì)于動(dòng)物醫(yī)學(xué)相關(guān)專業(yè)本科生,學(xué)習(xí)動(dòng)物病毒分類知識(shí)是重點(diǎn),也是難點(diǎn)。尋找適合方法學(xué)習(xí)并盡快掌握種類眾多、概念抽象的動(dòng)物病毒的分類地位及現(xiàn)狀,對(duì)理解特定病毒的結(jié)構(gòu)、增殖特性、致病性、抗原性及變異性,開展相關(guān)的病毒分離培養(yǎng)、檢測(cè)與鑒定、疫苗研制和疾病控制,有著直接的引領(lǐng)作用。通過編寫涵蓋常見動(dòng)物病毒分類地位的口訣,并在教學(xué)中試用,發(fā)現(xiàn)可以幫助學(xué)生實(shí)現(xiàn)快速識(shí)記。
病毒分類;口訣法;快速識(shí)記
AbstractIt is important and also difficult for college students in such majors as veterinary science to study knowledge of animal virus taxonomy. Finding a suitable method to learn classification of a great number of veterinary viruses with abstract concept and their current taxonomic status as soon as possible plays a simply leading role in understanding structure, proliferative characteristic, pathogenicity, antigenicity and variability of a particular virus and conducting viral isolation and culture, detection and identification, vaccine development and disease control. The author made out a set of formulas in rhyme covering conventional veterinary viruses and found it useful for students to realize rapid memorization in the teaching trials.
Keywordsvirus classification; formulas in rhyme; rapid memorization
病毒(virus)是一類專門寄生在活細(xì)胞內(nèi)并通過復(fù)制方式產(chǎn)生細(xì)胞外存在形式的子代致病微生物或遺傳因子。在動(dòng)物微生物學(xué)課程的本科教學(xué)內(nèi)容中,動(dòng)物病毒分類知識(shí)是一個(gè)重點(diǎn),要求學(xué)生掌握具有重要致病性或代表性的病毒的分類現(xiàn)狀,這在國(guó)家執(zhí)業(yè)獸醫(yī)師資格考試中就有所反映,同時(shí)也是一個(gè)難點(diǎn),因?yàn)椴《緜€(gè)體極其微小,形態(tài)結(jié)構(gòu)和分類命名讓人感到抽象,而且人類發(fā)現(xiàn)的動(dòng)物病毒種類一直在增加,以致每隔幾年國(guó)際病毒分類委員會(huì)(ICTV)就需根據(jù)病毒分類的研究進(jìn)展對(duì)某些病毒的分類地位做出補(bǔ)充和調(diào)整。
最近的病毒分類報(bào)告是2012年由ICTV發(fā)布的第9次病毒分類報(bào)告[1],并沿用David Baltimore病毒分類系統(tǒng),但較上一次分類報(bào)告增加了目(order)、科(family)、屬(genus)和種(species)的數(shù)量[2-3]。具體說,首先依據(jù)病毒的核酸組成及性質(zhì),將病毒分為雙鏈DNA、單鏈DNA、雙鏈RNA、正鏈RNA、負(fù)鏈RNA、RNA反轉(zhuǎn)錄和DNA反轉(zhuǎn)錄共7類病毒;再依據(jù)病毒的形態(tài)、大小、基因組結(jié)構(gòu)及復(fù)制方式,將病毒分為若干個(gè)科;最后依據(jù)致病性、抗原性等特性的相似性或差異,將同一科的病毒分為若干個(gè)屬或種。病毒的命名一般都有標(biāo)準(zhǔn)化結(jié)尾,即目(-virales)、科(-viridae)、亞科(-virinae)和屬(-virus)。但病毒種的命名沒有任何后綴,也不采用雙名法,分類名均用斜體書寫,俗名及暫定名則用正體書寫。
目前與獸醫(yī)有關(guān)的動(dòng)物病毒可分為至少32科(表1),涉及人、畜禽、野生動(dòng)物、水產(chǎn)動(dòng)物、蜜蜂、家蠶等宿主動(dòng)物,其中有一些科已被分別用于組建4個(gè)目,即單負(fù)股病毒目(Mononegavirales)、套式病毒目(Nidovirales)、皰疹病毒目(Herpesvirales)和微RNA病毒目(Picornavirales)[4-7]。單負(fù)股病毒目包括副黏病毒科、彈狀病毒科、絲狀病毒科和博納病毒科,它們具有相似的基因排列、基因產(chǎn)物和某些核衣殼基因的共同序列。套式病毒目包括冠狀病毒科、動(dòng)脈炎病毒科和桿套病毒科,它們的基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物均為一系列3′端相同的mRNA分子,稱為套式系列(nested set)RNAs。
第9次病毒分類報(bào)告確認(rèn)的病毒有2284個(gè)種。但由于絕大多數(shù)病毒在自然生存條件下容易發(fā)生變異,病毒種是一個(gè)不足夠確定的分類單元。譬如,貓細(xì)小病毒即貓泛白細(xì)胞減少癥病毒(FPV)與貂細(xì)小病毒即貂腸炎病毒(MEV)相似程度之高,以至于用中和試驗(yàn)都不能將二者區(qū)別開。于是有學(xué)者建議使用準(zhǔn)種(quasispecies)來描述核苷酸序列大致相同但又各自進(jìn)化、具有遺傳異質(zhì)性的病毒群體,或者直接用型(type)及株(strain)作為具體描述的對(duì)象。在這種情況下,科與屬便成為病毒分類的主要單元[8]。同一個(gè)科的病毒具有相同的病毒粒子(virion)形態(tài)、基因組結(jié)構(gòu)及復(fù)制方式。新近發(fā)現(xiàn)的病毒需要單獨(dú)關(guān)注,如戊型肝炎病毒(HepatitisEvirus)為具有獸醫(yī)公共衛(wèi)生意義的正股RNA病毒,其基因結(jié)構(gòu)類似披膜病毒科,暫歸為戊肝病毒科(Hepeviridae)戊肝病毒屬(Hepevirus);感染太平洋對(duì)蝦和南美白對(duì)蝦的傳染性肌壞死病毒(Infectious myonecrosis virus,IMNV),因其基因組dsRNA不分節(jié)段,暫歸為單分病毒科(Totiviridae),但尚未定屬。
如此看來,動(dòng)物病毒不僅種類眾多,其分類情況也相當(dāng)復(fù)雜。由于病毒進(jìn)行胞內(nèi)寄生,并通過生物合成及裝配方式增殖,使得抗體和抗病毒藥物對(duì)病毒的抑制作用有限,其引起的感染對(duì)動(dòng)物健康危害巨大。學(xué)習(xí)并掌握重要?jiǎng)游锊《镜姆诸惖匚患艾F(xiàn)狀,對(duì)理解特定病毒的結(jié)構(gòu)、增殖特性、致病性、抗原性及變異性,開展相關(guān)的病毒分離培養(yǎng)、檢測(cè)與鑒定、疫苗研制和疾病控制,有著直接的引領(lǐng)作用。正可謂,沒有分類,就沒有應(yīng)用。
筆者查閱文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)國(guó)內(nèi)學(xué)者發(fā)表介紹動(dòng)物病毒分類進(jìn)展的文章不少[9-12],但未見對(duì)如何掌握動(dòng)物病毒分類地位的具體教學(xué)方法。那么,對(duì)于動(dòng)物醫(yī)學(xué)、動(dòng)物科學(xué)、水產(chǎn)養(yǎng)殖學(xué)、微生物學(xué)、醫(yī)學(xué)等專業(yè)的本科生和工作人員,如何識(shí)記種類眾多、概念抽象的動(dòng)物病毒及其分類地位呢?本人在攻讀碩士學(xué)位期間,受“乘法口訣表”的啟示,曾編寫一套覆蓋絕大多數(shù)病毒科、屬、種的口訣,發(fā)現(xiàn)能化繁為簡(jiǎn),有效提高識(shí)記效果,甚至后來在丁香園網(wǎng)絡(luò)論壇做交流時(shí)還引起部分同行的興趣。在上課、考試、聽報(bào)告、寫論文等時(shí)候經(jīng)常使用這套口訣,久而久之,我便可對(duì)重要病毒的科、屬歸類做到脫口而出。即便后來動(dòng)物病毒分類陸陸續(xù)續(xù)有一些變動(dòng),但病毒分類的總體框架并沒有改變,只需做一些相應(yīng)的修正,便能滿足平時(shí)的學(xué)習(xí)和工作需要。
筆者在本科生及研究生教學(xué)中試用過此法,發(fā)現(xiàn)教學(xué)效果明顯,于是依據(jù)2012年ICTV發(fā)布的第9次病毒分類報(bào)告,對(duì)自編口訣表做了補(bǔ)充、完善,現(xiàn)將該口訣表及其注釋依次寫出來(表2),供讀者對(duì)照表1來學(xué)習(xí)動(dòng)物病毒的分類地位,讀者最后只需記住表2中的口訣即可。希望該口訣表能惠及更多讀者,尤其對(duì)專業(yè)領(lǐng)域的初學(xué)者,這也許不失為一種便捷、有效的學(xué)習(xí)方法。
表1 動(dòng)物病毒的分類現(xiàn)狀(ICTV第9次病毒分類報(bào)告,2012年)[1]
續(xù)表1(Continued table 1)
核酸特點(diǎn)病毒科代表屬(亞科)代表種或重要種雙股RNA病毒呼腸病毒科(Reoviridae)雙RNA病毒科(Birnaviridae)單分病毒科(Totiviridae)環(huán)狀病毒屬水生呼腸病毒屬質(zhì)型多角體病毒屬禽雙RNA病毒屬未定屬BTVGCHVBmCPVIBDVIMNV正股RNA病毒微RNA病毒科(Picornaviridae)嵌杯病毒科(Caliciviridae)戊肝病毒科(Hepeviridae)星狀病毒科(Astroviridae)冠狀病毒科(Coronaviridae)黃病毒科(Flaviviridae)披膜病毒科(Togaviridae)動(dòng)脈炎病毒科(Arteriviridae)桿套病毒科(Roniviridae)野田村病毒科(Nodaviridae)雙順反子病毒科(Dicistroviridae)傳染性軟腐病病毒科(Iflaviridae)口蹄疫病毒屬鼻病毒屬腸病毒屬心病毒屬肝病毒屬兔病毒屬戊肝病毒屬星狀病毒屬冠狀病毒屬黃病毒屬瘟病毒屬丙肝病毒屬甲病毒屬風(fēng)疹病毒屬動(dòng)脈炎病毒屬頭甲病毒屬乙型野田村病毒屬急性麻痹病毒屬傳染性軟腐病病毒屬FMDVHumanrhinovirusPoliovirus;EV71EMCVHAVRHDV;NorwalkvirusHEVHumanastrovirus1TGEV;AIBV;SARSVJEV;DenguevirusCSFV;BVDVHCVSindbisvirusRubellavirusEAV;PRRSVGillassociatedvirusSJNNVTaurasyndromevirusDeformedwingvirus負(fù)股RNA病毒正黏病毒科(Orthomyxoviridae)副黏病毒科(Paramyxoviridae)彈狀病毒科(Rhabdoviridae)絲狀病毒科(Filoviridae)布尼亞病毒科(Bunyaviridae)砂粒樣病毒科(Arenaviridae)博納病毒科(Bornaviridae)甲型流感病毒屬禽腮腺炎病毒屬麻疹病毒屬亨尼病毒屬肺病毒屬狂犬病病毒屬水皰病病毒屬馬堡病毒屬埃博拉病毒屬漢坦病毒屬白蛉病毒屬砂粒樣病毒屬博納病毒屬EIV;PIV;AIVNDVPPRV;CDVHendravirusBovinerespiratorysyncytialvirusRVVSV;SVCVMarburgmarburgvirusZaireebolavirusHantaanvirusRVFVLCMVBornadiseasevirus
表2 動(dòng)物病毒分類的口訣
續(xù)表2(Continued table 2)
分類口訣a注釋補(bǔ)充正副禽山兔豬鹿,囊腫壞死為虹彩痘病毒科包括正痘病毒屬、副痘病毒屬、禽痘病毒屬、山羊病毒屬、兔痘病毒屬、豬痘病毒屬、鹿痘病毒屬等。淋巴囊腫病毒(LCDV)和3種魚類血液組織壞死病毒均為魚類及兩棲類虹彩病毒科成員這3種魚類血液組織壞死病毒分別是魚紅細(xì)胞壞死病毒(PENV)、流行性造血器官壞死病毒(EHNV)和傳染性脾腎壞死病毒(ISKNV)人禽腺,多瘤乳;雞貧圓,依賴細(xì)腺病毒科主要包括哺乳動(dòng)物腺病毒屬和禽腺病毒屬;雞貧血病毒(CAV)為圓環(huán)病毒科成員,腺依賴病毒(AAV)則為細(xì)小病毒科成員細(xì)小病毒按宿主差異可分為犬、貓、豬、貂及鵝的細(xì)小病毒;圓環(huán)病毒科還包括豬圓環(huán)病毒(PCV)等成員正嗜乙肝接反錄,牛白血,人缺陷正嗜肝病毒屬的代表是乙型肝炎病毒(HBV),它與牛白血病毒、人免疫缺陷病毒同為反轉(zhuǎn)錄病毒。反轉(zhuǎn)錄病毒科慢病毒屬成員還有馬傳染性貧血病毒(EIAV)、貓免疫缺陷病毒(FIV)和牛免疫缺陷病毒(BIV)藍(lán)舌環(huán),輪狀呼,草魚孤藍(lán)舌病病毒(BTV)、輪狀病毒和草魚出血癥病毒(GCHV)分別屬于環(huán)狀病毒屬、輪狀病毒屬和水生呼腸孤病毒屬這3個(gè)屬均為呼腸孤病毒科法氏囊,胰壞死,雙RNA傳染性法氏囊病病毒(IBDV)和傳染性胰壞死病毒(IPNV)為雙鏈RNA病毒但傳染性肌壞死病毒(IMNV)屬于單分病毒科成員豬水皰,腸毒屬;鴨星狀,傳支冠豬水皰病毒(SVDV)為腸病毒屬成員;鴨星狀病毒(DAV)致病性強(qiáng);禽傳染性支氣管炎病毒(AIBV)為冠狀病毒科成員口蹄疫病毒(FMDV)為微RNA病毒科口蹄疫病毒屬成員,臨床易與SVDV感染混淆;冠狀病毒科還包括傳染性胃腸炎病毒(TGEV)、貓傳染性腹膜炎病毒(FIPV)、重癥急性呼吸綜合征病毒(SARSV)等牛腹瀉,丙肝黃;辛德比斯甲風(fēng)披牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)和丙型肝炎病毒(HCV)均為黃病毒科成員黃病毒科還包括豬瘟病毒和乙型腦炎病毒等常見蟲媒病毒;辛德比斯病毒為甲病毒屬成員,它與風(fēng)疹病毒屬構(gòu)成披膜病毒科漢坦內(nèi)羅在布尼,口鼻腸心甲肝微漢坦病毒和內(nèi)羅畢病毒均為布尼亞病毒科成員;口蹄疫病毒屬、鼻病毒屬、腸病毒屬、心病毒屬和甲肝病毒屬均為微RNA病毒科成員“口鼻腸心(甲)肝”是恰好可以聯(lián)系起來的動(dòng)物身體器官,便于記憶水皰時(shí)熱狂犬彈,甲流鮭貧正黏科水皰性口膜炎病毒(VSV)和牛暫時(shí)熱病毒(BEFV)均為彈狀病毒科成員;甲型流感病毒屬和傳染性鮭貧血病毒(ISAV)均歸入正黏病毒科彈狀病毒往往是穿透、殺傷力很強(qiáng)的病毒;彈狀病毒科的典型代表是狂犬病病毒(RV),還包括鯉春病毒血癥病毒(SVCV)等成員副流感,禽腮腺,再與肺犬或人的副流感病毒、禽腮腺炎病毒和肺病毒屬均為副黏病毒科成員通常所說的禽腮腺炎病毒就是指新城疫病毒(NDV);肺病毒屬主要包括呼吸道合胞病毒;犬瘟熱病毒(CDV)和羊瘟病毒即小反芻獸疫病毒(PPRV)為獸醫(yī)上重要的麻疹病毒屬成員;亨尼病毒屬則為副黏病毒科的新設(shè)屬埃博拉,馬堡絲,脈絡(luò)砂埃博拉病毒和馬堡病毒都是絲狀病毒科成員;小鼠的淋巴細(xì)胞性脈絡(luò)叢腦膜炎病毒(LCMV)則為砂粒樣病毒科成員絲狀病毒科成員是對(duì)人致病性超強(qiáng)的動(dòng)物源性病毒
A:前面的6句口訣是關(guān)于各常見病毒科的總結(jié),其中“痘、皰、(嗜)肝、冠黃披”和所有負(fù)鏈RNA病毒均為有囊膜的病毒,“正、布、砂”和所有雙鏈RNA病毒均為核酸分節(jié)段的病毒;后面的口訣主要涉及各病毒屬和重要的病毒種;馬立克病病毒(MDV)、口蹄疫病毒(FMDV)、豬瘟病毒(CSFV)、新城疫病毒(NDV)、犬瘟熱病毒(CDV)、狂犬病病毒(RV)、豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)等獸醫(yī)上非常重要的病毒,因時(shí)常提及,其分類地位易被記住,故未編入口訣
[1]KING A M Q, ADAMS M J, CARSTENS E B, et al. Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses [M]. San Diego: Elsevier / Academic Press, 2012: 37-1196.
[2]張忠信. ICTV第九次報(bào)告對(duì)病毒分類系統(tǒng)的一些修改[J]. 病毒學(xué)報(bào), 2012, 28(5): 595-599.
[3]李 彤, 莊 輝. 醫(yī)學(xué)微生物學(xué)教學(xué)中病毒分類學(xué)更新要點(diǎn)分析[J]. 中華醫(yī)學(xué)教育雜志, 2013, 33(1): 37-39.
[4]陸承平. 獸醫(yī)微生物學(xué)(第5版)[M]. 北京: 中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社, 2013: 348-478.
[5]葛均青, 龔 暉, 陳 超. 水生動(dòng)物雙RNA病毒的研究進(jìn)展[J]. 武夷科學(xué), 2014, 30: 162-167.
[6]汪天澍, 施騰飛, 劉 芳, 等. 安徽省七種蜜蜂病毒的發(fā)生與流行研究[J]. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報(bào), 2015, 52(2): 324-332.
[7]石生林, 李苗苗, 姜義仁, 等. 5種家蠶病毒的密碼子及密碼對(duì)使用模式分析[J]. 蠶業(yè)科學(xué), 2012, 38(2): 273-280.
[8]陳培富. 動(dòng)物微生物學(xué)與免疫學(xué)[M]. 昆明:云南科技出版社, 2015: 54-55, 210-228.
[9]陸承平. 最新動(dòng)物病毒分類簡(jiǎn)介[J]. 中國(guó)病毒學(xué), 2005, 20(6): 682-688.
[10]方忠意, 崔保安. 脊椎動(dòng)物病毒分類的新近變化[J]. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展, 2005, 26(6): 101-104.
[11]劉二龍, 唐 婕. 脊椎動(dòng)物病毒分類現(xiàn)狀[J]. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展, 2006, 27(11): 101-103.
[12]譚嘉琳, 景天忠, 梅 靜. ICTV第Ⅸ報(bào)告以來昆蟲病毒分類上的變化[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué), 2014, 42(26): 9040-9043.
Teaching animal virus classification using formulas in rhyme
CHEN Pei-fu
(College of Veterinary Medicine, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China)
G642.4
C
2095-1736(2017)05-0116-04
2016-09-30;
2016-11-01
云南省“獸醫(yī)學(xué)”優(yōu)勢(shì)特色重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科(A3007875);云南省高校獸醫(yī)公共衛(wèi)生重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室發(fā)展專項(xiàng)(A3007954)
陳培富,博士,副教授,從事動(dòng)物微生物學(xué)與免疫學(xué)的教學(xué)和科研,E-mail:cltwins2003@163.com
doi∶10.3969/j.issn.2095-1736.2017.05.116