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宿遷地區(qū)漢族人群25個(gè)Y-STR遺傳標(biāo)記的遺傳多態(tài)性

2017-07-19 11:22:16許淑君于海龍
法醫(yī)學(xué)雜志 2017年3期
關(guān)鍵詞:基因座法醫(yī)學(xué)宿遷

許淑君,于海龍

(宿遷市公安局物證鑒定所,江蘇宿遷 223800)

·研究簡(jiǎn)報(bào)·

宿遷地區(qū)漢族人群25個(gè)Y-STR遺傳標(biāo)記的遺傳多態(tài)性

許淑君,于海龍

(宿遷市公安局物證鑒定所,江蘇宿遷 223800)

法醫(yī)遺傳學(xué);多態(tài)現(xiàn)象,遺傳;短串聯(lián)重復(fù)序列;Y染色體;漢族

Y染色體是人類染色體中最小的一條,目前已經(jīng)精確定位到Y(jié)染色體上的STR遺傳標(biāo)記有400多個(gè)[1],而在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域被廣泛研究的只有20多個(gè)[2,3]。YSTR遺傳標(biāo)記被廣泛應(yīng)用于人類進(jìn)化、群體遺傳結(jié)構(gòu)分析、親子鑒定、性犯罪等領(lǐng)域。

Y-STR遺傳標(biāo)記呈現(xiàn)嚴(yán)格的父系遺傳特征,在混合斑男性成分分析、男性個(gè)體來(lái)源推斷、父系親權(quán)關(guān)系鑒定、性犯罪和重大刑事案件排查等方面發(fā)揮重要作用[4-6]。本研究采用Yfiler?Plus PCR擴(kuò)增試劑盒對(duì)宿遷地區(qū)639名漢族無(wú)關(guān)男性個(gè)體進(jìn)行25個(gè)YSTR遺傳標(biāo)記的遺傳多態(tài)性調(diào)查,在群體水平評(píng)估其法醫(yī)學(xué)鑒定的可行性,為法醫(yī)學(xué)鑒定應(yīng)用提供科學(xué)的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1 材料與方法

639名宿遷地區(qū)漢族無(wú)關(guān)男性個(gè)體FTA卡血樣,全部來(lái)自日常案件。采用Yfiler?Plus PCR擴(kuò)增試劑盒(美國(guó)AB公司)在9700型PCR擴(kuò)增儀(美國(guó)AB公司)上對(duì)25個(gè)Y-STR基因座進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系為10 μL,擴(kuò)增產(chǎn)物用3130xl型遺傳分析儀(美國(guó)AB公司)進(jìn)行毛細(xì)管電泳,運(yùn)用GeneMapper? ID-X軟件分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),得到Y(jié)-STR基因分型后,用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算各等位基因頻率。按照公式[n(1-∑Pi2)]/(n-1)計(jì)算基因多態(tài)性(gene diversity,GD)和單倍型多樣性(haplotype diversity,HD),其中Pi為等位基因(或單倍型)頻率,n為樣本數(shù)。

2 結(jié)果與討論

宿遷地區(qū)漢族人群639名無(wú)關(guān)男性個(gè)體25個(gè)Y-STR基因座都得到了有效擴(kuò)增,等位基因分布頻率見(jiàn)表1,基因多樣性(GD)見(jiàn)表2。結(jié)果顯示,DYS385a/b基因座在639例樣本中檢測(cè)到40種不同的基因分型,DYF387S1基因座檢測(cè)到38種不同的基因分型。其中DYS385a/b的GD值最高,為0.964,DYF387S1為0.949,DYS391和DYS438的GD值低于0.5,其他23個(gè)基因座在宿遷地區(qū)漢族人群中具有較高的基因多樣性。本研究使用Arlequin v3.1軟件計(jì)算639名無(wú)關(guān)男性個(gè)體樣本的單倍型頻率為0.001 565,單倍型多樣性可以達(dá)到0.99999989,且在所有樣本中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)共享的單倍型。

表1 宿遷地區(qū)漢族人群25個(gè)Y-STR基因座等位基因頻率分布(n=639)

續(xù)表1

表2 25個(gè)Y-STR遺傳標(biāo)記在宿遷地區(qū)漢族人群中的基因多樣性(n=639)

本研究使用的試劑盒為美國(guó)AB公司推出的Yfiler?Plus PCR擴(kuò)增試劑盒,該試劑盒增加的YSTR遺傳標(biāo)記在宿遷地區(qū)漢族人群中具有較高的多態(tài)性和單倍型解析度,完全能夠滿足法醫(yī)學(xué)檢案中涉及Y染色體基因檢測(cè)的各種需求,可用于法醫(yī)學(xué)實(shí)際應(yīng)用。

[1]Kayser M,Kittler R,Erler A,et al.A comprehensive survey of human Y-chromosomal microsatellites[J]. Am J Hum Genet,2004,74(6):1183-1197.

[2]Current State of the Database[DB/OL].[2015-03-30]. http://www.yhrd.org/index.html.

[3]Y STR plsitions along Ychromosome[DB/OL].[2015-03-30].http://www.cstl.nist.gov/strbase/ystrpos1.htm.

[4]楊雪,石美森,袁麗,等.多種遺傳標(biāo)記分析在1例半同胞鑒定中的綜合應(yīng)用[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2016,32(1):45-48.

[5]Roewer L.Y chromosome STR typing in crime casework[J].Forensic Sci Med Pathol,2009,5(2):77-84.

[6]Calacal GC,Delfin FC,Tan MM,et al.Identification of exhumed remains of fire tragedy victims using conventionalmethodsandautosomal/Y-chromosomal short tandem repeat DNA profiling[J].Am J Forensic Med Pathol,2005,26(3):285-291.

DF795.2

B

10.3969/j.issn.1004-5619.2017.03.020

1004-5619(2017)03-0307-03

2015-04-01)

(本文編輯:李成濤)

許淑君(1975—),女,副主任法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)DNA研究;E-mail:Xuliyu66@163.com

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