呂平+檀小輝+張繼+韋麗君+黃秋偉+金剛+黃顯雅
摘 要:利用SDS方法提取純化供體巴西甘蔗B8總DNA,通過(guò)懸浮共培養(yǎng)方法將巴西甘蔗DNA轉(zhuǎn)入到桂熱甘蔗03-75品系中,篩選獲得轉(zhuǎn)化的甘蔗植株。對(duì)轉(zhuǎn)化植株、供體和受體進(jìn)行SRAP分子驗(yàn)證。結(jié)果表明,用瓊脂糖凝膠電泳從112對(duì)引物組合中篩選出13對(duì)擴(kuò)增多態(tài)性好、條帶清晰、穩(wěn)定好的引物組合,再通過(guò)非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳進(jìn)一步篩選出4對(duì)較好引物組合,選擇引物M5E8組合對(duì)巴西甘蔗、轉(zhuǎn)化植株和桂熱甘蔗03-75品系進(jìn)行SRAP檢測(cè),轉(zhuǎn)化植株檢出帶有供體差異條帶,證明巴西甘蔗DNA導(dǎo)入了桂熱甘蔗03-75品系,引起了甘蔗基因組的變化,說(shuō)明通過(guò)懸浮共培養(yǎng)方法進(jìn)行甘蔗總DNA導(dǎo)入是可行的。
關(guān)鍵詞:甘蔗 懸浮共培養(yǎng) SRAP
甘蔗是我國(guó)重要的糖料作物和能源作物。中國(guó)蔗區(qū)主要分布在廣西、云南、廣東等12個(gè)?。ㄗ灾螀^(qū))[1-5]。廣西是全國(guó)最大的蔗糖生產(chǎn)基地,但廣西甘蔗栽培品種單一化嚴(yán)重,長(zhǎng)時(shí)間推廣新臺(tái)糖22號(hào)品種,導(dǎo)致品種種性退化、產(chǎn)量下降等嚴(yán)重問(wèn)題[6-9]。高產(chǎn)、高效甘蔗新種質(zhì)的創(chuàng)新顯得迫在眉睫。長(zhǎng)期以來(lái),甘蔗育種采用常規(guī)雜交育種,需要耗費(fèi)大量人力、物力和財(cái)力,且育種周期長(zhǎng)、篩選困難。還有另一個(gè)重要原因是許多野生甘蔗種質(zhì)(或親緣關(guān)系較遠(yuǎn))與栽培甘蔗之間出現(xiàn)了雜交不親和現(xiàn)象。通過(guò)常規(guī)雜交方法將優(yōu)良的性狀轉(zhuǎn)入到甘蔗品種(品系)中難度大。此外,由于廣西氣候因素原因,種植在廣西區(qū)域的甘蔗開(kāi)花十分困難,經(jīng)過(guò)人工技術(shù)調(diào)節(jié)開(kāi)花難度大,且開(kāi)花后花粉活力很弱,雜交育種非常困難,目前廣西甘蔗雜交育種主要在海南南繁育種基地進(jìn)行,給本地的育種帶來(lái)許多不便,育種受到一定的障礙。隨著現(xiàn)代分子育種技術(shù)的快速發(fā)展,為遠(yuǎn)緣種質(zhì)的創(chuàng)新利用開(kāi)辟了新的途徑。在1974年,周光宇等人[10,11]在調(diào)查了植物遠(yuǎn)緣雜交廣泛實(shí)踐的基礎(chǔ)上,提出了植物遠(yuǎn)緣雜交存在著染色體水平以下的DNA片段雜交假說(shuō),在此基礎(chǔ)上進(jìn)行了外源總DNA導(dǎo)入農(nóng)作物技術(shù)研究,達(dá)到種質(zhì)創(chuàng)新和改良品種的目的,外源總DNA導(dǎo)入技術(shù)已在水稻、大豆、玉米、小麥、花生和煙草等作物品種改良中得到了應(yīng)用[12-17]。同時(shí)對(duì)外源DNA導(dǎo)入后獲得的轉(zhuǎn)化植株進(jìn)行了分子驗(yàn)證。倪建福等人通過(guò)花粉管通道法將高粱DNA導(dǎo)入普通小麥后,RAPD鑒定表明高粱基因組部分片段整合到小麥染色體中[18]。
研究選擇以巴西甘蔗為供體,桂熱甘蔗03-75品系為受體, 通過(guò)懸浮共培養(yǎng)的方法將供體總DNA直接導(dǎo)入受體技術(shù), 獲得在株型、株高等性狀有差異的類(lèi)型,利用SRAP技術(shù)對(duì)其進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化分析,試圖通過(guò)生物技術(shù)手段將巴西甘蔗總DNA導(dǎo)入桂熱甘蔗03-75品系創(chuàng)新種質(zhì),探索甘蔗新的遺傳轉(zhuǎn)化方法的可行性,進(jìn)一步為高產(chǎn)、高效等甘蔗育種生產(chǎn)提供理論依據(jù)和技術(shù)支撐。
1 材料與方法
1.1 材料
供體:巴西甘蔗B8品種;受體: 桂熱甘蔗03-75品系。實(shí)驗(yàn)所用到甘蔗品種/品系均來(lái)自廣西壯族自治區(qū)亞熱帶作物研究所/廣西農(nóng)墾甘蔗研究所種質(zhì)資源圃。
1.2 方法
1.2.1 DNA提取方法
采用王關(guān)林的SDS提取方法[19]提取新鮮甘蔗葉片的總DNA,瓊脂糖凝膠電泳法與紫外分光光度計(jì)法檢測(cè)DNA分子的濃度和純度。
1.2.2 懸浮共培養(yǎng)導(dǎo)入法
采用體細(xì)胞胚與供體巴西甘蔗B8總DNA懸浮共培養(yǎng)導(dǎo)入方法,具體步驟為:選取長(zhǎng)至10~20 cm桂熱甘蔗03-75品系頂芽,消毒滅菌后接種到誘導(dǎo)培養(yǎng)基MS+2,4-D3.5 mg/L + NAA0.1 mg/L上誘導(dǎo)愈傷組織,愈傷組織培養(yǎng)在MS+2,4-D3.0 mg/L+NAA0.1 mg/L上增殖,挑選結(jié)構(gòu)疏松、顏色淡黃的胚性愈傷組織(結(jié)合顯微鏡挑選),搖床震蕩培養(yǎng),用孔徑50目細(xì)胞篩濾去較大孔徑的組織,再用孔徑80~150目的細(xì)胞篩濾,得到直徑0.1~0.2 mm的較分散的微小細(xì)胞粒。轉(zhuǎn)移至MS+2,4-D1.0 mg/L+NAA0.1 mg/L培養(yǎng)基上,加入B8總DNA(濃度為200 g/mL),在搖床120 rpm的轉(zhuǎn)速進(jìn)行懸浮共培養(yǎng),后轉(zhuǎn)至MS+ 6-BA 2.0 mg/NAA0.1 mg/L培養(yǎng)基上分化不定芽,生根移栽,獲得甘蔗轉(zhuǎn)化植株。
1.2.3 SRAP引物、PCR體系與程序及PCR產(chǎn)物電泳
1.2.3.1 引物與PCR反應(yīng)程序、體系
本實(shí)驗(yàn)所用的SRAP引物參考朱弦弦、Li和Quiros等[20,21],由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成見(jiàn)表1,PCR反應(yīng)程序與反應(yīng)體系見(jiàn)表2、表3。
1.2.3.2 PCR產(chǎn)物電泳
瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
取5 μl PCR產(chǎn)物,加入2 μl 6×Loading Buffer混勻后點(diǎn)樣,進(jìn)行電泳分離,電泳的參數(shù)為120 v恒壓,EB染色法。
聚丙烯酰胺凝膠電泳
采用6 %的非變性聚丙烯酰胺凝膠,電泳的參數(shù)為180 v恒壓,銀染染色法。
2 結(jié)果與分析
2.1 供體巴西甘蔗B8總DNA提取與純度情況
用紫外分光光度計(jì)測(cè)定甘蔗總DNA A260/230、A260/280,瓊脂糖凝膠電泳鑒定相對(duì)分子量,其純度、濃度鑒定結(jié)果為:純度:A260/230=2.56>2,A260/280=1.95>1.8;濃度:ds =1250 μg/ml。從電泳圖1可以看出 ,DNA沉淀均為白色,通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),DNA片段、帶型均一,沒(méi)有拖尾現(xiàn)象,說(shuō)明蛋白雜質(zhì)與酚類(lèi)物質(zhì)含量少,DNA的純度較高。上述檢測(cè)結(jié)果表明,純化后的總DNA溶液純度、濃度符合導(dǎo)入條件,以MS溶液配成相應(yīng)的DNA濃度,低溫保存?zhèn)溆谩?
2.2 轉(zhuǎn)化甘蔗試管苗的形態(tài)表現(xiàn)
轉(zhuǎn)化的植株經(jīng)過(guò)培養(yǎng)后與CK相比,其形態(tài)特征有明顯的差異,結(jié)果見(jiàn)圖2。從圖2中可以看出,轉(zhuǎn)化后的植株從葉片、莖粗等特征差異較大,轉(zhuǎn)化的植株葉片濃綠,植株較粗壯,長(zhǎng)勢(shì)較好。另外,實(shí)驗(yàn)中也發(fā)現(xiàn)有些轉(zhuǎn)化植株的長(zhǎng)勢(shì)比對(duì)照差。說(shuō)明通過(guò)懸浮共培養(yǎng)法將巴西甘蔗B8 DNA導(dǎo)入受體桂熱甘蔗03-75品系后,受體甘蔗發(fā)生了不同程度的變化,這可能是巴西甘蔗的某些基因片段在桂熱甘蔗03-75品系進(jìn)行了重組整合而發(fā)生了變化。
2.3 SRAP分析
2.3.1 適合SRAP實(shí)驗(yàn)要求的DNA純度
甘蔗基因組DNA質(zhì)量的好壞直接影響后續(xù)的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的成敗。采用SDS法提取甘蔗DNA后用核酸測(cè)定儀測(cè)定所有供試的DNA樣品。本實(shí)驗(yàn)提取的21份甘蔗樣品DNA的濃度介于200 ng/μl到1300 ng/μl之間,21份樣品A260/280的比值均在1.8~2.0之間、A260/230的比值均大于2.0,說(shuō)明本次實(shí)驗(yàn)提取的甘蔗DNA的質(zhì)量較好,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),蛋白質(zhì)等雜質(zhì)少,純度較純(見(jiàn)圖3),可以滿足后續(xù)SRAP等分子生物學(xué)的實(shí)驗(yàn)要求。
2.3.2 SRAP引物的篩選
上下游引物搭配組成112對(duì)引物組合,先用瓊脂糖凝膠電泳從中篩選出13對(duì)擴(kuò)增多態(tài)性好、條帶清晰、穩(wěn)定好的引物組合(見(jiàn)圖4)。再用6 %的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳對(duì)13對(duì)引物組合進(jìn)行進(jìn)一步篩選,從中篩選出4對(duì)較好引物組合,分別為M4E8、M5E1、M5E8、M6E2。
2.3.3 SRAP圖譜分析
從圖5可以看出(圖示僅標(biāo)注了差異明顯的條帶),甘蔗03-75品系轉(zhuǎn)化植株的SRAP分子標(biāo)記多態(tài)性比較豐富,多態(tài)性有差異條帶的主要集中在50 bp~150 bp范圍間。甘蔗03-75轉(zhuǎn)化植株在①②位置出現(xiàn)了供體巴西甘蔗B8品種特有的而受體甘蔗03-75品系未有條帶。在①位置,編號(hào)5、7、12轉(zhuǎn)化植株的條帶強(qiáng)弱與供體巴西甘蔗B8品種一致;在②位置,編號(hào)8、9、12、13轉(zhuǎn)化植株的條帶出現(xiàn)比供體巴西甘蔗B8品種條帶更強(qiáng)的條帶;在③位置轉(zhuǎn)化植株出現(xiàn)了供體巴西B8甘蔗品種、受體甘蔗03-75品系都沒(méi)有的新條帶;在④位置轉(zhuǎn)化植株出現(xiàn)了條帶顏色更深的加強(qiáng)條帶;在⑤位置受體甘蔗03-75品系有弱條帶而轉(zhuǎn)化植株沒(méi)有,出現(xiàn)了缺失條帶。SRAP標(biāo)記結(jié)果表明:通過(guò)懸浮共培養(yǎng)方法將巴西甘蔗總DNA導(dǎo)入甘蔗03-75品系后,獲得的甘蔗轉(zhuǎn)化植株可能為巴西甘蔗基因部分片段插入受體甘蔗03-75品系,或缺失了受體甘蔗的基因片段,或出現(xiàn)了供受體未有的新片段,說(shuō)明巴西甘蔗的DNA導(dǎo)入受體甘蔗后使其基因組發(fā)生了不同程度的重組。
3 討論
植物外源總DNA導(dǎo)入技術(shù)是在20世紀(jì)80年代發(fā)展起來(lái)的,并被許多科研工作者發(fā)展應(yīng)用,在水稻、玉米、小麥和煙草等作物取得成功,培育出的許多優(yōu)良品種(系)在生產(chǎn)上已推廣應(yīng)用,取得了良好的經(jīng)濟(jì)和社會(huì)效益。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)懸浮共培養(yǎng)法將遠(yuǎn)源(或近源)植物的DNA導(dǎo)入作物技術(shù),該技術(shù)在馬鈴薯上有研究報(bào)道,洪亞輝等人[22]利用這一技術(shù)將人參總DNA導(dǎo)入馬鈴薯單細(xì)胞,獲得的馬鈴薯后代塊莖中含有人參皂苷RB1,且氨基酸、蛋白質(zhì)含量大幅度提高,而其他性狀并沒(méi)有因?yàn)閴K莖蛋白質(zhì)含量和質(zhì)量的提高而變化,但這一技術(shù)在其他植物還尚未應(yīng)用。本課題組將自選育的優(yōu)良甘蔗03-75品系的胚性愈傷組織直接在巴西甘蔗B8的總DNA進(jìn)行懸浮培養(yǎng),其目的是加強(qiáng)某些特殊性狀,特別是加強(qiáng)巴西甘蔗B8的固氮能力,據(jù)楊榮仲等人[23]利用15N同位素稀釋法測(cè)定在溫室盆栽條件下巴西甘蔗B8的生物固氮能力,結(jié)果顯示B8平均固氮百分率為26.91 %,而對(duì)照種桂糖11號(hào)不具固氮能力,對(duì)照種ROC16的固氮能力弱,僅為3.51 %。如何能將巴西甘蔗B8的這些優(yōu)良特性導(dǎo)入到甘蔗03-75品系中,篩選優(yōu)良的轉(zhuǎn)化植株,對(duì)甘蔗種質(zhì)材料進(jìn)行創(chuàng)新,從而為更進(jìn)一步選育新品種做準(zhǔn)備。通過(guò)本試驗(yàn)有力的證實(shí)了將巴西甘蔗B8的總DNA通過(guò)該方法導(dǎo)入甘蔗03-75品系是可行的,轉(zhuǎn)化的植株不僅在形態(tài)上有差異,還在DNA水平上的SRAP(相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性)有遺傳多態(tài)性。SRAP是一種基于PCR技術(shù)的新型的分子標(biāo)記,由美國(guó)加州大學(xué)蔬菜作物系Li與Quiros博士[21]于2001年提出的,具有簡(jiǎn)便、穩(wěn)定、中等產(chǎn)率和容易得到選擇條帶序列的特點(diǎn),在構(gòu)建分子遺傳圖譜、遺傳多樣性研究及種質(zhì)資源的鑒定、作物起源與進(jìn)化關(guān)系研究以及作物目標(biāo)性狀連鎖標(biāo)記研究上都有廣泛的應(yīng)用。SRAP結(jié)果表明,甘蔗03-75品系的轉(zhuǎn)化植株不同引物的DNA擴(kuò)增產(chǎn)物,顯示出受體對(duì)照甘蔗具有的DNA條帶在轉(zhuǎn)化甘蔗中大部分出現(xiàn),總體表現(xiàn)為轉(zhuǎn)化后的甘蔗與受體對(duì)照甘蔗03-75品系具有大部分的相似性,說(shuō)明轉(zhuǎn)化后甘蔗與受體對(duì)照的同源性很高,轉(zhuǎn)化后的甘蔗遺傳了受體對(duì)照甘蔗的大部分基因。另外,在轉(zhuǎn)化的甘蔗還出現(xiàn)了新的條帶,轉(zhuǎn)化甘蔗比受體對(duì)照甘蔗缺失了條帶或插入了新的條帶,兩者的基因組上存在分子水平遺傳差異。此外轉(zhuǎn)化后的甘蔗與巴西甘蔗B8擴(kuò)增出一些相同大小的DNA片段,而相應(yīng)的受體對(duì)照甘蔗03-75品系沒(méi)有擴(kuò)增出此片段,這從分子角度進(jìn)一步證實(shí)了巴西甘蔗B8的某些DNA片段在轉(zhuǎn)化甘蔗03-75品系基因組里有部分的重組或整合,或是轉(zhuǎn)化甘蔗已轉(zhuǎn)入部分供體的性狀。
現(xiàn)階段,甘蔗優(yōu)良的種質(zhì)材料非常稀缺,遠(yuǎn)不能滿足當(dāng)前生產(chǎn)的需要。為了拓寬優(yōu)良基礎(chǔ)材料、豐富甘蔗種質(zhì)資源,通過(guò)外源DNA 導(dǎo)入的方法引入遠(yuǎn)緣(近緣)物種有益性狀的基因,克服遠(yuǎn)緣雜交不親和、雜種不育等問(wèn)題,為創(chuàng)新甘蔗種質(zhì)資源提供了一種非常有效、可行的途徑,這在普通的常規(guī)雜交育種上是很難實(shí)現(xiàn)的。這不僅為以后選育優(yōu)良的甘蔗新品種(品系)提供良好的育種材料,同時(shí)進(jìn)一步為甘蔗分子育種奠定基礎(chǔ)并提供參考價(jià)值。
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