吳丹丹，彭 忠，陳煥春，吳 斌

(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,生豬健康養(yǎng)殖協(xié)同創(chuàng)新中心 ，湖北武漢 430070)

專論與講座

豬瘟病毒基因型概述

吳丹丹，彭 忠，陳煥春，吳 斌*

(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,生豬健康養(yǎng)殖協(xié)同創(chuàng)新中心 ，湖北武漢 430070)

豬瘟的發(fā)生和流行嚴(yán)重危害我國(guó)及世界養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展。由于豬瘟病毒(Classical swine fever virus，CSFV)只有一個(gè)血清型，所以基于傳統(tǒng)的血清學(xué)方法針對(duì)臨床上CSFV開(kāi)展流行病學(xué)研究較為困難。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展，人們?cè)趯?duì)CSFV基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究的過(guò)程中發(fā)現(xiàn)，基于其部分基因序列可以將該病毒分為若干基因型和基因亞型，進(jìn)而揭示CSFV的區(qū)域分布和進(jìn)化規(guī)律，有效地追蹤C(jī)SFV的起源和傳播特點(diǎn)。論文結(jié)合我國(guó)已有的CSFV流行病學(xué)數(shù)據(jù)，對(duì)現(xiàn)有的CSFV基因分型標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行介紹，為進(jìn)一步研究CSFV的變化規(guī)律、監(jiān)測(cè)新型病毒出現(xiàn)，以及制定有效的防控凈化措施提供參考。

豬瘟病毒；遺傳進(jìn)化分析；基因型

豬瘟(Classical swine fever，CSF)是由豬瘟病毒(Classical swine fever virus，CSFV)引起的一種以高熱、出血等為特征的高度接觸性傳染病，該病嚴(yán)重威脅我國(guó)乃至全球養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展[1]。豬瘟是世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(OIE)規(guī)定的必須上報(bào)的動(dòng)物疫病，也是我國(guó)規(guī)定的一類動(dòng)物疫病及《國(guó)家中長(zhǎng)期動(dòng)物疫病防治規(guī)劃(2012年-2020年)》中明確規(guī)定的需要被凈化的重大疫病。我國(guó)何時(shí)確診發(fā)生豬瘟無(wú)明確記載，但是東南大學(xué)在1925年開(kāi)始研制免疫血清防控豬瘟[2]。1954年，我國(guó)科學(xué)家利用分離自本土的CSFV強(qiáng)毒株(Shimen株)成功培育出豬瘟兔化弱毒疫苗(簡(jiǎn)稱C株)，該疫苗的使用改變了豬瘟在我國(guó)大規(guī)模流行的現(xiàn)狀，從而轉(zhuǎn)為以地方性散發(fā)流行為主的模式[3]。然而，豬瘟在我國(guó)流行的形勢(shì)依然嚴(yán)峻，據(jù)《獸醫(yī)公報(bào)》中豬瘟發(fā)生數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)，2005年-2009年全國(guó)共有23個(gè)省市區(qū)發(fā)生豬瘟疫情4 409起，對(duì)中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的論文進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，2005年-2009年共報(bào)道豬瘟病例323起[4]。說(shuō)明我國(guó)豬瘟的防控形勢(shì)嚴(yán)峻，針對(duì)豬瘟病毒及豬瘟疫苗開(kāi)展相關(guān)研究依然十分緊迫。

CSFV為RNA單股正鏈病毒，其基因序列全長(zhǎng)約為12.3 kb，基因組兩端各有一個(gè)非編碼區(qū)5′-UTR和3′-UTR，中間部分是一個(gè)大的開(kāi)放閱讀框(ORF)，能夠編碼3 898個(gè)氨基酸，對(duì)應(yīng)12種蛋白質(zhì)，其中4種為結(jié)構(gòu)蛋白[C，Erns(E0)，E1，E2]，8種為非結(jié)構(gòu)蛋白(Npro，p7，NS2，NS3，NS4A，NS4B，NS5A和NS5B)[5]。在這些蛋白中，E2蛋白是CSFV最主要的保護(hù)性抗原蛋白，并且E2蛋白的氨基酸序列保守性最低，其中一段氨基酸序列被作為與同屬牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)區(qū)別的依據(jù)，因此，E2基因片段是用于豬瘟病毒基因分型的主要片段。CSFV只有一個(gè)血清型，因此基于傳統(tǒng)的血清學(xué)方法針對(duì)臨床上CSFV的流行規(guī)律開(kāi)展研究較為困難。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展，人們?cè)卺槍?duì)CSFV的基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究的過(guò)程中發(fā)現(xiàn)，基于CSFV的部分基因序列可以將CSFV分為若干基因型和基因亞型，而且根據(jù)CSFV基因型和亞型能夠揭示CSFV的區(qū)域分布和進(jìn)化規(guī)律，并有效地追蹤C(jī)SFV的起源和傳播特點(diǎn)[6]。本文就CSFV的基因分型方法進(jìn)行綜述，并對(duì)我國(guó)CSFV流行毒株的基因型(基因亞型、亞亞型)進(jìn)行簡(jiǎn)要介紹，為揭示我國(guó)豬瘟的流行狀況及開(kāi)展豬瘟的流行病學(xué)調(diào)查提供依據(jù)。

1 CSFV基因分型標(biāo)準(zhǔn)的建立和發(fā)展

CSFV基因型的分類方法最早見(jiàn)于20世紀(jì)80年代至90年代，Hofmann M A等[7-8]收集世界各國(guó)CSFV核苷酸序列，探索了CSFV的基因型分類方法。2000年由德國(guó)學(xué)者Paton D J等[6]所建立的CSFV基因分型方法才被世界各國(guó)的研究人員廣泛采用。該方法以CSFV的5′-UTR序列片段150個(gè)核苷酸(nt)、E2序列片段190 nt和NS5B序列片段409 nt這3段核苷酸序列作為分型標(biāo)準(zhǔn)，將CSFV分為3個(gè)基因型(基因1型、2型和3型)；同時(shí)又將每個(gè)基因型分為3～4個(gè)亞型，共10個(gè)亞型(1.1-1.3；2.1-2.3；3.1-3.4)。

Paton等基于短序列片段所建立的CSFV基因型分類方法，為研究CSFV基因型及遺傳進(jìn)化關(guān)系提供了一種研究手段，具有十分重要的意義。然而，該方法也具有一定的局限性。Postel A等[9]在針對(duì)拉脫維亞2009年和2011年豬瘟暴發(fā)時(shí)分離的CSFV流行毒株進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析時(shí)，發(fā)現(xiàn)利用5′-UTR 150 nt和E2 190 nt短序列作為分型標(biāo)準(zhǔn)無(wú)法對(duì)這兩次流行的毒株進(jìn)行有效的區(qū)分，也無(wú)法鑒別出兩次豬瘟流行時(shí)分離CSFV在核苷酸水平上的差異；而利用E2基因的全長(zhǎng)片段(1 119 nt)作為分型依據(jù)，不但能夠有效區(qū)分這兩次豬瘟流行過(guò)程中的CSFV核苷酸水平上的突變，而且還發(fā)現(xiàn)引起2011年豬瘟流行的CSFV可能源于2009年豬瘟流行時(shí)分離的2個(gè)毒株。這說(shuō)明基于CSFV E2基因全序列進(jìn)行基因分型，既能靈敏地發(fā)現(xiàn)核酸突變位點(diǎn)，又能更準(zhǔn)確地尋找病毒的進(jìn)化關(guān)系。因此，Postel A等[9]提出了基于E2基因全長(zhǎng)片段(1 119 nt)對(duì)CSFV進(jìn)行基因分型的方法。李儒曙等[10]研究也證實(shí)利用序列比對(duì)的方法對(duì)病毒進(jìn)行遺傳分型時(shí)，比對(duì)的序列越長(zhǎng)越有利于不同毒株的區(qū)分，通過(guò)完整的E2基因序列對(duì)豬瘟病毒進(jìn)行進(jìn)化分析，具有較高的置信度和區(qū)分度。

基于完整的E2基因序列對(duì)CSFV進(jìn)行基因分型的優(yōu)越性在隨后的研究中再次得到證實(shí)。Postel A等[11]在針對(duì)4株分離自古巴的CSFV毒株Margarita(分離自1958年)、Holguin(分離自2009年)、Santiago de Cuba(分離自2011年)和Pinar del Rio(分離自2010年)進(jìn)行分析時(shí)發(fā)現(xiàn)，如果基于E2基因的部分序列(190 nt)進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析，這4個(gè)臨床毒株均為1.2亞型，且置信度非常低；然而，若采用E2基因全長(zhǎng)(1 119 nt)進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析，則獲得較高的置信度(bootstrap值位于88.7%～100%)，因此，這4個(gè)毒株應(yīng)歸于一個(gè)全新的亞型，將其命名為1.4亞型；并且采用5′NTR-E2序列(3 361 nt)對(duì)這4個(gè)臨床毒株進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析，也得到了相同的結(jié)果。Postel A等[11]的研究不僅再次說(shuō)明了基于E2基因完整序列相對(duì)于利用其部分序列對(duì)CSFV進(jìn)行基因分型的優(yōu)越性，而且還基于此研究提出了CSFV基因亞型1.4，從而豐富了CSFV基因亞型，使CSFV亞型增加為11個(gè)。Silva M N等[12]在采用E2基因全長(zhǎng)對(duì)2001年-2009年巴西7株CSFV進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析時(shí)發(fā)現(xiàn)，雖然這7個(gè)流行毒株均位于基因1型分支，但是其中6株與CSFV基因1型中現(xiàn)有亞型(1.1-1.4亞型)表現(xiàn)出顯著的遺傳進(jìn)化差異，它們均位于新的亞型分支上；并且這6個(gè)毒株中，有5株位于同一進(jìn)化分支，另一株位于另一個(gè)獨(dú)立的進(jìn)化分支，進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，這些毒株的E2基因與現(xiàn)有的CSFV基因1型毒株E2基因在遺傳距離上表現(xiàn)出顯著差異。因此，Silva M N等[12]將6個(gè)毒株中位于同一進(jìn)化分支的5株劃分為1.5亞型，另1株劃為1.6亞型，但是這些毒株在流行病學(xué)和分子生物學(xué)上的研究有待進(jìn)一步開(kāi)展。至此，CSFV的基因亞型增加為13個(gè)。

2 我國(guó)豬瘟病毒流行毒株的基因型概述

2.1 基因1型的研究進(jìn)展

CSFV基因1型在我國(guó)的報(bào)道最早見(jiàn)于20世紀(jì)80年代至90年代，Tu C等[13]通過(guò)E2部分序列片段分析我國(guó)1986年-1999年110株CSFV流行毒株，發(fā)現(xiàn)其中7株為基因1型，基因1型流行毒株與我國(guó)Shimen株和“C”株均屬于1.1亞型，通過(guò)分析流行毒株的分布特征，發(fā)現(xiàn)基因1型流行毒株在我國(guó)造成的流行有限。韓雪清等[14]通過(guò)比對(duì)疫苗株和10株CSFV流行毒株E2 360 nt序列片段和E2氨基酸同源性，表明我國(guó)20世紀(jì)80年代CSFV流行毒株由基因1型轉(zhuǎn)變?yōu)榛?型，CSFV流行株已向遠(yuǎn)離疫苗毒株的方向變化。

然而，近年來(lái)的研究表明基因1型毒株在我國(guó)的流行毒株中仍然占有相當(dāng)大的比重。Sun S Q等[15]通過(guò)分析1984年-2006年間分離自我國(guó)不同地區(qū)的73株CSFV，發(fā)現(xiàn)分離于1990s的50株CSFV流行毒株屬于基因1型和2型的分別為17株和33株(基因1型占34%)，而2000s后分離的20株CSFV流行毒株屬于基因1型和2型的各有10株 (基因1型占50%)。Shen H等[16]2008年-2010年從來(lái)源于廣東、廣西、海南3省的病豬脾或淋巴結(jié)等器官中分離出14株CSFV，遺傳進(jìn)化分析，發(fā)現(xiàn)這些毒株全部為1.1亞型。另外，根據(jù)黃耀華等[17]報(bào)道，2012年-2014年來(lái)源于湖北、河南等16個(gè)省234份豬瘟陽(yáng)性病料經(jīng)RT-PCR檢測(cè)和遺傳進(jìn)化分析，發(fā)現(xiàn)其中77份樣品對(duì)應(yīng)的毒株為1.1亞型，基因1型分離率為33%。以上報(bào)道均說(shuō)明CSFV基因1型毒株在我國(guó)的流行趨勢(shì)不僅沒(méi)有降低，并且還占有相當(dāng)?shù)谋戎?。此外，涂長(zhǎng)春等[18]早期的研究還表明我國(guó)流行的基因1型毒株可能源自本土，其地理分布上呈現(xiàn)出原始特征，大多數(shù)毒株分布于青海、西藏、廣西等邊遠(yuǎn)養(yǎng)豬地區(qū)，需要引起重視的是隨著生豬交易的頻繁運(yùn)輸和引種流動(dòng)，基因1型毒株在我國(guó)各省均有分離發(fā)現(xiàn)。

現(xiàn)有的研究還表明，我國(guó)當(dāng)前流行的基因1型毒株與疫苗毒株“C”株的親緣關(guān)系更近。Luo T R等[19]從2001年-2009年來(lái)源于廣西地區(qū)的豬瘟病毒陽(yáng)性病料中分離出31株毒株，其中11株屬于1.1亞型，通過(guò)比對(duì)這些毒株與“C”株及Shimen株的E2基因核酸全序列，發(fā)現(xiàn)它們與“C”株的核苷酸水平上的同源性更高。值得注意的是，通過(guò)樣品追溯發(fā)現(xiàn)這些毒株部分分離自健康豬扁桃體或母豬白細(xì)胞，說(shuō)明這些毒株本身的毒力并不強(qiáng)，可能是弱毒株。類似的研究還見(jiàn)于王博揚(yáng)等[20]的報(bào)道，他們通過(guò)分析47株1.1亞型CSFV流行株與“C”株和Shimen株親緣關(guān)系，發(fā)現(xiàn)這些1.1亞型的毒株均與“C”株親緣關(guān)系較近，而與Shimen株親緣關(guān)系較遠(yuǎn)，推測(cè)可能是由于我國(guó)長(zhǎng)期大面積使用豬瘟疫苗“C”株使得疫苗毒株在野外長(zhǎng)期存在，但也不能排除自然存在1.1亞型弱毒株的可能性。越來(lái)越多關(guān)于CSFV基因1型流行毒株與“C”株的親緣關(guān)系較近的報(bào)道提醒我們，對(duì)豬瘟疫苗“C”株的使用需要提高警惕。

Ji W等[21]基于CSFV的E2基因?qū)⒅袊?guó)流行的CSFV毒株分為疫苗相關(guān)組和疫苗無(wú)關(guān)組，通過(guò)對(duì)兩組毒株進(jìn)行生物信息學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)豬瘟疫苗毒株有可能通過(guò)與流行毒株進(jìn)行重組或者自身發(fā)生基因突變，從而導(dǎo)致CSFV流行毒株變異及免疫逃避，同時(shí)相關(guān)分析還表明，疫苗的使用也能影響CSFV種群進(jìn)化動(dòng)力和進(jìn)化速率?！癈”株在我國(guó)使用時(shí)間長(zhǎng)達(dá)60多年，作為弱毒疫苗，其是否會(huì)出現(xiàn)毒力返強(qiáng)，是否會(huì)與野毒發(fā)生重組等問(wèn)題還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。在我國(guó)尚未實(shí)現(xiàn)豬瘟凈化之前，如何安全有效地使用豬瘟疫苗，是一個(gè)非常值得關(guān)注的問(wèn)題。

2.2 基因2型及基因2型亞亞型的研究進(jìn)展

2.2.1 基因2型的研究發(fā)現(xiàn) CSFV基因2型毒株在我國(guó)豬瘟流行中占主導(dǎo)地位，并且我國(guó)流行的基因2型毒株與歐洲毒株之間表現(xiàn)出一定的親緣關(guān)系[13]。就亞型而言，2.1、2.2和2.3亞型在我國(guó)同時(shí)存在，其中2.1和2.2亞型曾經(jīng)是流行的優(yōu)勢(shì)基因亞型[13，20，22-24]。近年來(lái)的研究表明，我國(guó)在2000年后未檢測(cè)到2.3亞型毒株，2009年以后未檢測(cè)到2.2亞型毒株，目前在我國(guó)流行的基因2型毒株主要是2.1亞型，該亞型也是我國(guó)最主要的流行亞型[25]。近年的研究發(fā)現(xiàn)，2.1流行亞型及亞亞型在我國(guó)CSFV流行毒株中不斷出現(xiàn)演變。

2.2.2 2.1亞亞型的研究發(fā)現(xiàn) Deng M C等[26]根據(jù)E2 190 nt和NS5B 409 nt序列片段的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)將臺(tái)灣地區(qū)流行的2.1亞型CSFV毒株分為2.1a和2.1b兩個(gè)亞亞型。其中，2.1a亞亞型毒株主要分離于1994年-2001年，并且與歐洲Paderborn流行株位于同一進(jìn)化分支，該亞亞型流行毒株間E2和NS5B部分核酸序列同源性大于97.4%；2.1b亞亞型毒株僅在2001年分離到，并且與中國(guó)GS-LT等流行株和意大利S7D2流行株位于同一進(jìn)化分支，其與2.1a流行株在E2、NS5B和全基因序列的核酸同源性僅為94.1%～95.1%。

2013年，Jiang D L等[27-28]從湖南30份豬瘟疑似病料中分離出8份CSFV，通過(guò)E2全序列遺傳進(jìn)化分析，發(fā)現(xiàn)其中5株CSFV位于新的分支2.1c亞亞型，該亞亞型流行株與2.1a、2.1b亞亞型流行株的E2全序列核苷酸同源性分別為90.2%～94.9%和89.9%～93.8%，低于2.1a和2.1b兩個(gè)亞亞型間的核酸同源性(91.1%～95.7%)，而且該亞亞型毒株在777-779氨基酸位點(diǎn)上有特異的突變(SPA→TPV)；后續(xù)通過(guò)E2 216 nt和190 nt部分序列的分析，都證實(shí)了該亞亞型的成立，而且發(fā)現(xiàn)早期在廣西分離的GXBH-3/98毒株也屬于2.1c，說(shuō)明該亞亞型可能已經(jīng)在地方流行近14年。Gong W等[29]從30日齡被豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)、豬圓環(huán)病毒2型(PCV-2)和CSFV混合感染的保育豬體內(nèi)分離培養(yǎng)的CSFV GD53/2011也屬于2.1c亞亞型，通過(guò)在豬腎傳代細(xì)胞(PK-15)上連續(xù)傳至46代，發(fā)現(xiàn)該毒株TCID50由第6代時(shí)的103.39/mL增長(zhǎng)為108.5/mL，第46代毒株的全基因組序列與其他12株2.1亞型CSFV進(jìn)行核酸序列和氨基酸對(duì)比后，發(fā)現(xiàn)GD53/2011毒株在C蛋白和NS5B區(qū)域的氨基酸突變比E2區(qū)域更活躍。這是首次報(bào)道該亞型流行毒株在體外培養(yǎng)中發(fā)生的突變。

Zhang H等[30]報(bào)道了來(lái)自山東的15株CSFV流行株屬于新的2.1d亞亞型，其通過(guò)E2全序列和部分序列以及NS5B部分序列三種方法建立的遺傳進(jìn)化樹(shù)確定了新亞亞型的成立。Hu D等[31]從山東省已經(jīng)接種疫苗，但是母豬出現(xiàn)流產(chǎn)、產(chǎn)死胎，保育豬出現(xiàn)發(fā)熱、皮膚出血斑點(diǎn)和高死亡率等臨床癥狀的169份病料中分離出25株CSFV，研究發(fā)現(xiàn)25株CSFV均屬于2.1亞型，與Zhang H[30]報(bào)道的毒株位于同一分支上；同時(shí)將這25株CSFV流行毒株和120株標(biāo)準(zhǔn)株進(jìn)行E2全基因的氨基酸選擇壓力分析，發(fā)現(xiàn)有7個(gè)位點(diǎn)出現(xiàn)氨基酸的正向選擇突變，其中位于17、34、72和200位點(diǎn)的氨基酸變化可能與這些CSFV避開(kāi)宿主中和抗體、引起臨床發(fā)病的現(xiàn)象有關(guān)。越來(lái)越多的2.1亞型流行株被報(bào)道，這些毒株中的細(xì)微差異也被研究發(fā)現(xiàn)，但是對(duì)這些毒株的系統(tǒng)分析尚未形成，因此建立2.1亞型的系統(tǒng)分析顯得尤為重要。

Gong W等[32]收集2004年-2012年分離自廣東和廣西地區(qū)的39株CSFV及GenBank中收錄的160株2.1亞型CSFV參考菌株的E2基因序列片段(190 nt)，將基因2.1亞型分為2.1a-2.1j共10個(gè)亞亞型；同時(shí)針對(duì)39株CSFV分離株中的15株及GenBank中收錄的47株2.1亞型CSFV參考菌株的E2基因全長(zhǎng)(1 119 nt)展開(kāi)遺傳進(jìn)化分析，得到了與E2基因部分序列(190 nt)展開(kāi)時(shí)相同的結(jié)果；并且這些不同亞亞型毒株間E2基因的全序列核苷酸的遺傳距離分別為3.9%～11.4%，其對(duì)應(yīng)的氨基酸的遺傳距離為2.1%～8.0%；基于氨基酸的序列的比對(duì)發(fā)現(xiàn)，不同亞亞型毒株在E2蛋白特點(diǎn)位點(diǎn)上出現(xiàn)特異性氨基酸替換，如2.1b、2.1c和2.1j型毒株各有1個(gè)特異性氨基酸替換，分別為K31→R31、S88→T88和I364→V364；2.1d型毒株則有2個(gè)特異性氨基酸替換，分別為K31→T31和N121→S121；2.1g和2.1i分別有5個(gè)及3個(gè)特異性氨基酸替換。根據(jù)特征性的氨基酸變化，Gong W等[32]在研究中將Zhang H等[30]報(bào)道的2.1d型毒株歸于2.1b型。該研究還發(fā)現(xiàn)2.1d型毒株當(dāng)前只存在于泰國(guó)，而其他9種亞亞型的毒株在我國(guó)不同地區(qū)都有分布，其中2.1b型毒株廣泛分布于我國(guó)21個(gè)省(市、自治區(qū))，是我國(guó)最主要的優(yōu)勢(shì)流行毒株[32]。該觀點(diǎn)也證實(shí)了Chen N等[33]的研究。隨后，Gong W等[34]報(bào)道了屬于新亞型2.1g的CSFV流行株GD19/2011，該毒株在PK-15細(xì)胞傳代12次后全基因組序列與原毒株全基因組有6個(gè)位點(diǎn)的基因突變和2個(gè)位點(diǎn)的氨基酸的發(fā)生替換，再次說(shuō)明2.1亞型CSFV在我國(guó)仍處在不斷演變中。

通過(guò)對(duì)基因2型尤其是2.1亞亞型的深入研究，為建立我國(guó)CSFV遺傳進(jìn)化關(guān)系和監(jiān)控病毒進(jìn)化方向提供了一定的參考信息，有利于今后對(duì)我國(guó)CSFV流行株的監(jiān)測(cè)和病原傳播的研究。同時(shí)眾多的病毒亞亞型被發(fā)現(xiàn)也說(shuō)明當(dāng)前我國(guó)CSFV流行毒株不斷發(fā)生變異的嚴(yán)峻現(xiàn)實(shí)。針對(duì)這一問(wèn)題如何采取更加有效的防控措施，將是今后豬瘟防控和凈化將面臨的難題。

2.3 基因3型

CSFV基因3型流行毒株的報(bào)道僅見(jiàn)于我國(guó)臺(tái)灣地區(qū)。據(jù)報(bào)道[26]，CSFV基因3型尤其是3.4亞型曾造成臺(tái)灣早期的豬瘟疫情流行，然而到1996年以后，CSFV基因3型(3.4亞型)毒株在臺(tái)灣地區(qū)很少被分離到，取而代之的是基因2型特別是2.1和2.2亞型毒株，這說(shuō)明臺(tái)灣地區(qū)CSFV流行毒株的基因型已經(jīng)發(fā)生了變化，這與歐洲CSFV的流行趨勢(shì)相同。雖然基因3型毒株到目前為止還沒(méi)有在我國(guó)大陸地區(qū)被發(fā)現(xiàn)，但是與我國(guó)鄰近的泰國(guó) 、韓國(guó)等國(guó)家都有基因3型CSFV毒株流行的報(bào)道[7，35]，從而使CSFV基因3型毒株傳入我國(guó)的風(fēng)險(xiǎn)性增加，因此我國(guó)一定要加強(qiáng)進(jìn)出口檢驗(yàn)檢疫，謹(jǐn)防基因3型CSFV傳入。

3 展望

歐美一些國(guó)家通過(guò)采取豬瘟凈化措施宣布消滅了豬瘟。我國(guó)在豬瘟兔化弱毒疫苗“C”株的廣泛使用后，豬瘟的大面積流行已經(jīng)得到了很好的控制。近年豬瘟在我國(guó)呈現(xiàn)出流行范圍廣、散發(fā)性流行為主、持續(xù)感染普遍、非典型豬瘟和繁殖障礙性豬瘟較多、混合感染情況嚴(yán)重等新特點(diǎn)[4]。研究表明，當(dāng)前在我國(guó)流行的CSFV毒株主要為基因1型(1.1亞型)和基因2型(2.1亞型)，且不同基因型的毒株在我國(guó)流行情況和地域分布特點(diǎn)呈現(xiàn)復(fù)雜多樣性。CSFV基因型及遺傳進(jìn)化分析的研究為揭示我國(guó)CSFV流行毒株的分子生物學(xué)特點(diǎn)及流行規(guī)律做出了十分重要的貢獻(xiàn)，隨著相關(guān)研究的不斷深入，未來(lái)針對(duì)CSFV基因型的研究將能更加準(zhǔn)確地反映我國(guó)CSFV的流行特點(diǎn)，并為預(yù)測(cè)CSFV基因變化和監(jiān)測(cè)新病毒的產(chǎn)生提供了有效信息，為我國(guó)制定豬瘟病毒的防控和凈化措施提供更加科學(xué)的理論支持。

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GenotypesofClassicalSwineFeverVirus-AReview

WU Dan-dan,PENG Zhong,CHEN Huan-chun,WU Bin

(StateKeyLaboratoryofAgriculturalMicrobiology，TheCooperativeInnovationCenterforSustainablePigProduction，CollegeofVeterinaryMedicine,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan,Hubei，430070,China)

The outbreak and prevalence of classical swine fever (CSF) are the high-impact problems for global pig industry.More worrisome,relying on the traditional serological methodology to perform epidemic investigation on the causative agent of CSF,the classical swine fever virus (CSFV),is too difficult because CSFV displays only one serotype.However,with the development of molecular biology,it has been mentioned that CSFV could be divided into several genotypes based on some specific gene sequence harbored by the virus genome,and more helpful,the CSFV genotype could be regarded as a good indicator to monitor the virus evolution and transmission.In this review,we briefly summarized the current genotypes of CSFV,and also discussed the prevalent CSFV genotypes in China.Our aim is to provide some reference information for the further study of CSFV monitoring and even the CSFV prevention and control plan design.

Classical swine fever virus; phylogenetic analysis; genotype

2016-11-11

十二五”國(guó)家科技支撐計(jì)劃優(yōu)良種豬高效利用關(guān)鍵工程化技術(shù)集成與示范(2014BAD20B00)和“十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國(guó)家科技計(jì)劃口蹄疫等重要家畜疫病防控凈化技術(shù)集成研究與示范(2015BAD12B04)

吳丹丹(1985-)，女，湖南長(zhǎng)沙人，獸醫(yī)碩士，主要從事規(guī)?；i場(chǎng)豬瘟凈化工作。 *

S852.651

A

1007-5038(2017)11-0107-05