国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

新疆南疆驢源H3N8亞型EIV NA基因序列分析

2016-11-26 07:13:59劉永宏張路瑤李飛趙麗
新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年8期
關(guān)鍵詞:南疆核苷酸流感病毒

劉永宏,張路瑤,李飛,趙麗

(塔里木大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院/新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)塔里木畜牧科技重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,新疆阿拉爾 843300)

?

新疆南疆驢源H3N8亞型EIV NA基因序列分析

劉永宏,張路瑤,李飛,趙麗

(塔里木大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院/新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)塔里木畜牧科技重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,新疆阿拉爾 843300)

【目的】明確新疆南疆驢是否感染EIV,及EIV NA基因特征?!痉椒ā扛鶕?jù)GenBank登錄的EIV基因序列,設(shè)計(jì)合成1對(duì)引物,針對(duì)新疆南疆地區(qū)2個(gè)驢屠宰點(diǎn)33份驢肺進(jìn)行EIV NA基因RT-PCR擴(kuò)增、電泳分析、膠回收、測序及序列分析?!窘Y(jié)果】中國新疆南疆驢源EIV A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8)株NA基因長1 413 bp,編碼470個(gè)氨基酸。與國內(nèi)外H3N8亞型EIV參考毒株核苷酸同源性為75.2%~99.6%,與國內(nèi)外參考毒株氨基酸同源性為80%~100%,與國內(nèi)毒株、哈薩克斯坦毒株和印度毒株在一個(gè)進(jìn)化分支內(nèi)。與GenBank數(shù)據(jù)庫中唯一一個(gè)驢源毒株A/donkey/Xinjiang/5/2007(H3N8)糖基化位點(diǎn)個(gè)數(shù)和分布位置完全一致?!窘Y(jié)論】新疆南疆存在驢感染EIV,可能為國內(nèi)疫情的延續(xù)或周邊國家傳入。

驢;馬流感病毒;H3N8亞型

0 引 言

【研究意義】馬流行性感冒,簡稱馬流感(Equine influenza, EI),是由馬流感病毒(Equine influenza virus, EIV)引起馬、驢和騾的一種高度接觸性呼吸道傳染病[1,2],現(xiàn)發(fā)現(xiàn)該病毒還感染犬和豬[3,4]。世界動(dòng)物衛(wèi)生組織OIE將其列為法定報(bào)告動(dòng)物傳染病,我國將其列為三類動(dòng)物疫病[5]。馬流感病毒屬于正黏病毒科(Orthomyxoviridae)A型流感病毒屬(Influenza virus A)。目前A型流感病毒根據(jù)HA分為16個(gè)亞型(H1~H16),而NA分為9個(gè)亞型(N1~N9)。從系統(tǒng)發(fā)育生物學(xué)角度分別對(duì)HA和NA基因的核苷酸序列及其編碼的氨基酸序列進(jìn)行了分析,所獲結(jié)果也為上述分類提供了佐證[6]。EIV有2個(gè)亞型,分別是H7N7亞型EIV(即馬甲1型)和H3N8亞型EIV(即馬甲2型)[1,7,8]。馬流感的頻繁暴發(fā),對(duì)養(yǎng)馬業(yè),尤其賽馬業(yè)危害極其嚴(yán)重,已在世界范圍內(nèi)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。我國歷史上至少發(fā)生4次馬流感大流行,即1974年由H7N7亞型EIV引起的首次大流行,當(dāng)時(shí)首先從新疆開始,然后向南向東傳播蔓延至17個(gè)省(市)、自治區(qū),自此之后H7N7亞型EIV在中國馬群中再未分離到;1989~1990年,在吉林、黑龍江和內(nèi)蒙古連續(xù)2次暴發(fā)馬流感疫情;1992~1994年,我國西部、西北、華北和西南等地區(qū)馬群中暴發(fā)馬流感疫情;2007年,新疆、甘肅相繼暴發(fā)了馬流感疫情,并迅速蔓延傳播到華北地區(qū)。后3次馬流感疫情均由H3N8亞型EIV引起[9]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】目前,新疆及新疆周邊鄰國存在馬流感疫情[10-12],這對(duì)當(dāng)前新疆地區(qū)馬屬動(dòng)物的威脅十分巨大??紤]新疆南疆特殊的氣候環(huán)境和地域地貌因素,有必要深入研究?!緮M解決的關(guān)鍵問題】研究對(duì)新疆南疆驢肺組織病料進(jìn)行EIV核酸檢測,并對(duì)EIV NA基因進(jìn)行序列分析,為新疆南疆該病的防制提供依據(jù),具有一定的指導(dǎo)意義。

1 材料與方法

1.1 材 料

1.1.1 病料

33份驢肺組織病料,來自2015年新疆南疆地區(qū)2個(gè)驢屠宰點(diǎn),-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.1.2 主要試劑

Trizol invitrogenTM(Code No.:15596-026),購自Invitrogen生物工程有限公司;TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0(Code No.:DRR019A),PremixTaq? Version2.0(Code No.:D331A)和DNA Marker2000,購自寶生物工程(大連)有限公司;TIANgel Midi Purification Kit(Code No.:DP209),購自天根生化科技(北京)有限公司等。

1.1.3 引物

按照引物設(shè)計(jì)原則,利用Primer Premier5.0分子生物學(xué)軟件,以GenBank數(shù)據(jù)庫中國內(nèi)外已發(fā)表的保守的馬屬動(dòng)物H3N8亞型EIV和H7N7亞型EIV的NA基因全序列為參照設(shè)計(jì)特異性引物。引物序列為5ˊ-AGCAAAAGCAGGAGATTAAAATG-3ˊ,5ˊ-AGTAGAAACAAGGAGTTTTTTCATT-3ˊ,由生工生物工程(上海)有限公司合成。

1.1.4 參考毒株

國內(nèi)外具有代表性的39個(gè)EIVNA基因全序列,均來源于GenBank數(shù)據(jù)庫,列出毒株詳細(xì)信息。表1

表1 參考毒株
Table1 Reference isolates

No.序號(hào)毒株名稱StrainName登錄號(hào)GenBankaccessionnumbersGenBank宿主Host備注Remarks1A/equine/Xinjiang/1/2015(H3N8)未登錄donkey中國新疆南疆2A/equine/Yokohama/aq5/2011(H3N8)AB727556horse日本3A/equine/Santiago/77(H7N7)AY383757Equine智利4A/equine/Cordoba/18/1985(H3N8)CY032303Equine阿根廷5A/equine/Austria/421/1992(H3N8)CY032351Equine奧地利6A/equine/Switzerland/173/1993(H3N8)CY032359Equine瑞士7A/equine/Roma/5/1991(H3N8)CY032367Equine意大利8A/equine/Switzerland/1118/1979(H3N8)CY032383Equine瑞士9A/equine/Romania/1/1980(H3N8)CY032391Equine羅馬尼亞10A/equine/SaoPaulo/1/1969(H3N8)CY032399Equine巴西11A/equine/Fontainbleu/1/1979(H3N8)CY032407Equine法國12A/equine/Berlin/1/1989(H3N8)CY032415Equine德國13A/equine/Uruguay/1/1963(H3N8)CY032423Equine烏拉圭14A/equine/Algiers/1/1972(H3N8)CY032947Equine阿爾及利亞15A/equine/Johannesburg/1/1986(H3N8)CY032955Equine南非16A/equine/SaoPaulo/4/1976(H7N7)CY036881Equine巴西17A/equine/Uruguay/1063/1976(H7N7)CY036889Equine烏拉圭18A/equine/Argentina/1/1977(H7N7)CY036897Equine阿根廷19A/equine/NewMarket/nasalwash1/1979(H3N8)CY096901Equine美國20A/equine/Prague/1/1956(H7N7)CY096909Equine捷克21A/equine/Tokyo/2/1971(H3N8)CY096917Equine日本22A/equine/InnerMongolia/8/2008(H3N8)EU794529horse中國23A/equine/Qinghai/1/1994(H3N8)EU794537horse中國24A/equine/Xinjiang/1/2007(H3N8)EU794545horse中國25A/donkey/Xinjiang/5/2007(H3N8)EU794577donkey中國26A/equine/Lonquen/1/2006(H3N8)EU926630Equine智利27A/equine/Newmarket/1/1993(H3N8)FJ375222horse聯(lián)合王國28A/Equine/Jilin/1/89(H3N8)FLANAJILINhorse中國29A/equine/Huabei/1/2007(H3N8)GU571145Equine中國30A/equine/Colorado/10/2007(H3N8)HQ993105Equine美國31A/equine/Mysore/12/2008(H3N8)JN674068horse印度

表1 參考毒株

續(xù)表1

Table1 Reference isolates

1.1.5 儀器

PCR儀(TC-5000, Bibby scientific Ltd),小型高速冷凍離心機(jī)(R134a, Hermetically sealed refigeration system),電泳儀(DYY-12,北京市六一儀器廠),紫外分析儀(JY02S, 北京君意東方電泳儀設(shè)備有限公司)等。

1.2 方 法

1.2.1 總RNA提取

從驢肺組織病料中提取總RNA,按Trizol invitrogenTM試劑盒說明書操作。

1.2.2 RT-PCR反應(yīng)

總RNA按照TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0試劑盒,利用實(shí)驗(yàn)室已合成的NA基因特異性引物,進(jìn)行一步法擴(kuò)增NA基因片段,退火溫度均為54℃。

1.2.3 PCR產(chǎn)物純化回收

取NA基因片段RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳切膠后,按照TIANgel Midi Purification Kit試劑盒說明進(jìn)行回收純化。

1.2.4 測序

將純化產(chǎn)物標(biāo)記后送生工生物工程(上海)有限公司測序,測序引物為NA基因擴(kuò)增引物。

1.2.5 序列分析

搜索GenBank數(shù)據(jù)庫中部分EIV NA基因全序列和該實(shí)驗(yàn)獲得的NA基因全序列,用DNAStar軟件EditSeq程序?qū)⑵浜塑账岷桶被嵝蛄蟹謩e保存為*.Seq和*.Pro格式文件,應(yīng)用該軟件MegAlign程序Clustal W法進(jìn)行比對(duì),然后在Veiw菜單中Sequence Distance和Phylogenetic Tree提取序列比對(duì)結(jié)果和進(jìn)化樹圖。同時(shí)結(jié)合毒株時(shí)空分布,分析中國新疆南疆地區(qū)驢源EIV來源及演變特征。

2 結(jié)果與分析

2.1 EIV NA基因片段RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果

研究的33例樣品,根據(jù)NA基因特異性引物RT-PCR擴(kuò)增相應(yīng)基因片段,結(jié)果顯示其中2份病料為陽性,擴(kuò)增片段約1.4kb,與預(yù)期擴(kuò)增長度一致,陰性對(duì)照成立。圖1

2.2 中國新疆南疆EIV NA基因核苷酸序列分析

經(jīng)對(duì)其NA基因測序及序列比對(duì)分析,中國新疆南疆驢源EIV為H3N8亞型,命名為A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8),其NA基因包括一個(gè)完整閱讀框架長1 413 bp。與GenBank數(shù)據(jù)庫中唯一一個(gè)驢源NA全基因毒株,即中國新疆2007年毒株A/donkey/Xinjiang/5/2007(H3N8)核苷酸同源性為99.4%;與中國毒株核苷酸同源性最高的為2007年中國新疆馬源毒株A/equine/Xinjiang/1/2007(H3N8),同源性為99.6%;與中國毒株核苷酸同源性最低的為1989年中國吉林A/Equine/Jilin/1/89 (H3N8))株,同源性為75.2%;國外毒株與其核苷酸同源性最高的毒株為印度2008年毒株A/equine/Mysore/12/2008(H3N8),同源性達(dá)99.2%;國外毒株與其核苷酸同源性最低的毒株為阿爾及利亞A/equine/Algiers/1/1972(H3N8)株,同源性為90.2%。以上所述均為H3N8亞型EIV毒株,與H7N7亞型EIV毒株核苷酸同源性為44.0%~45.7%。

根據(jù)NA基因核苷酸全序列基因進(jìn)化樹顯示,囊括22個(gè)國家的40個(gè)EIV毒株被劃分2個(gè)大的分支,一個(gè)分支為H3N8亞型EIV毒株,另一個(gè)分支為H7N7亞型EIV毒株,A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8)被劃分到H3N8亞型分支。該研究毒株與2007年新疆1個(gè)馬源毒株A/equine/Xinjiang/1/2007(H3N8)和1個(gè)驢源毒株A/donkey/Xinjiang/5/2007(H3N8),以及2007年華北1個(gè)毒株A/equine/Huabei/1/2007(H3N8)在一個(gè)小的進(jìn)化分支內(nèi)。其次,與2013年中國徐州A/equine/Xuzhou/01/2013(H3N8)株、2012年哈薩克斯坦A/equine/Kostanay/09/2012(H3N8)株、2008年印度A/equine/Mysore/12/2008(H3N8)株和2008年中國廣西A/equine/Guangxi/1/2008(H3N8)株進(jìn)化關(guān)系也非常近。圖1

M:Maker;1:陰性對(duì)照;2~3:NA基因

2.3 中國新疆南疆EIV NA基因氨基酸序列分析

中國新疆南疆驢源EIV毒株A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8)的NA基因編碼470個(gè)氨基酸,與GenBank數(shù)據(jù)庫中唯一一個(gè)驢源NA全基因毒株,即中國新疆2007年毒株A/donkey/Xinjiang/5/2007(H3N8)氨基酸同源性為99.6%;與國內(nèi)毒株氨基酸同源性最高的為2008年中國內(nèi)蒙古A/equine/Inner Mongolia/8/2008(H3N8)株、2007年新疆A/equine/Xinjiang/1/2007(H3N8)株和2007年中國華北A/equine/Huabei/1/2007(H3N8)株,同源性均為100%;與中國毒株氨基酸同源性最低的為1989年中國吉林A/Equine/Jilin/1/89(H3N8)株,同源性為80%;國外毒株與其氨基酸同源性最高的毒株為哈薩克斯坦2012年毒株A/equine/Kostanay/09/2012(H3N8),同源性達(dá)99.1%;國外毒株與其氨基酸同源性最低的毒株為阿爾及利亞A/equine/Algiers/1/1972(H3N8)株,氨基酸同源性為88.7%。以上所述均為H3N8亞型EIV毒株,與H7N7亞型EIV毒株氨基酸同源性為38.6%~39.0%。

圖2 馬流感病毒毒株NA基因系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.2 Phylogenetic tree of NA gene of EIV isolated

中國新疆南疆驢源EIV毒株A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8)NA氨基酸序列含有7個(gè)糖基化位點(diǎn),分別位于N39ET、N54ET、N67TS、N84NT、N144GT、N293WT和N398WS位,與毒株A/donkey/Xinjiang/5/2007(H3N8)糖基化位點(diǎn)個(gè)數(shù)和分布位置均相同。

注:糖基化是糖鏈以N-糖苷鍵結(jié)合在Asn(天冬酰胺)-X-Thr/Ser的Asn殘基上,X為除脯氨酸外的任一氨基酸殘基。

3 討 論

通過對(duì)新疆南疆驢肺組織病料進(jìn)行EIV核酸檢測及NA序列分析,證實(shí)中國新疆南疆目前驢體內(nèi)存在H3N8亞型EIV。A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8)與中國新疆2007年驢源毒株核苷酸同源性為99.4%;與中國毒株核苷酸同源性最高的為2007年中國新疆毒株,達(dá)99.6%;與國外毒株核苷酸同源性最高的為印度2008年毒株,同源性達(dá)98.9%。HA基因核苷酸全序列基因進(jìn)化樹也顯示,研究毒株與新疆2007年1個(gè)馬源毒株和1個(gè)驢源毒株,以及2007年1個(gè)中國華北毒株在一個(gè)小的進(jìn)化分支內(nèi)。其次,與2013年中國徐州株、2012年哈薩克斯坦株、2008年印度株和2008年中國廣西株進(jìn)化關(guān)系也非常近。由上述結(jié)果分析得出,新疆南疆驢源毒株可能為早些時(shí)間中國EIV毒株的延續(xù)或周邊國家毒株跨境或季風(fēng)原因傳播擴(kuò)散。

NA蛋白由基因組片段6編碼,是馬流感病毒另一個(gè)主要表面抗原,其成分為整體膜糖蛋白。寡糖鏈對(duì)NA的功能有重要影響,如果缺乏糖基化,NA結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性和酶活性都會(huì)受到影響[8,13,14]。中國新疆南疆驢源EIV毒株A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8)NA氨基酸序列含有7個(gè)糖基化位點(diǎn),與唯一的一個(gè)驢源毒株糖基化位點(diǎn)個(gè)數(shù)和分布位置完全一致。

H3N8亞型EIV能從馬跨越種間障礙傳播給狗和豬[3-4],是因?yàn)镠3N8亞型EIV屬于A型流感病毒,可感染多種哺乳動(dòng)物,并在宿主間進(jìn)行廣泛傳播[15-17]。馬業(yè)相關(guān)單位重視對(duì)馬屬動(dòng)物馬流感疫情的監(jiān)測,以及哺乳動(dòng)物馬流感病毒的監(jiān)測,為馬業(yè)的健康長期發(fā)展提供保障。

4 結(jié) 論

根據(jù)NA基因RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果及其所得序列分析結(jié)果可知,新疆南疆存在驢感染EIV;根據(jù)NA基因遺傳演化分析結(jié)果顯示,新疆南疆現(xiàn)存的驢源EIV為國內(nèi)疫情的延續(xù)或周邊國家傳入。

References)

[1]楊建德,相文華.我國馬流感的研究現(xiàn)狀[J].黑龍江畜牧獸醫(yī),2002,(3):42-44.

YANG Jian-de, XIANG Wen-hua. (2002). Research status of equine influenza in China [J].HeilongjinagJournalofAnimalScienceandVeterinaryMedicine, (3):42-44. (in Chinese)

[2] 韋建華,何奇松,馮淑萍,等.廣西馬流感病毒(A/Equine/Guangxi/1/09)NA基因的克隆與序列分析[J].南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2015,46(5):895-899.

WEI Jian-hua, HE Qi-song, FENG Su-ping, et al. (2015). Cloning and sequence analysis on NA gene of equine influenza virus(A/Equine/Guangxi/1/09)in Guangxi [J].JournalofSouthernAgriculture, 46(5):895-899. (in Chinese)

[3] Crawford PC; Dubovi EJ; Castleman WL; Stephenson I; Gibbs EP; Chen L; Smith C; Hill RC; Ferro P; Pompey J; Bright RA; Medina MJ; Johnson CM; Olsen CW; Cox NJ; Klimov AI; Katz JM; Donis RO. (2005).Transmissionofequineinfluenzavirustodogs.Science, 310(5747):482-485.

[4] Tu, J., Zhou, H., Jiang, T., Li, C., Zhang, A., & Guo, X., et al. (2009). Isolation and molecular characterization of equine h3n8 influenza viruses from pigs in China.ArchivesofVirology, 154(5):887-890.

[5] 何晶,馬偉,孫建華,等.H3N8亞型馬流感病毒HA1基因原核表達(dá)載體的構(gòu)建及表達(dá)[J].新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2013,36(1):12-15.

HE Jing, MA Wei, SUN Jian-hua, et al. (2013). Construction of Prokaryotic Expression Vector of H3N8 Subtype Equine Influenza Virus HA1 Gene of and Its Expression [J].JournalofXinjiangAgriculturalUniversity, 36(1):12-15. (in Chinese)

[6] Fouchier, R. A., Munster, V., Wallensten, A., Bestebroer, T. M., Herfst, S., & Smith, D., et al. (2005). Characterization of a novel influenza a virus hemagglutinin subtype (h16) obtained from black-headed gulls.JournalofVirology, 79(5):2,814-2,822.

[7] Guo, Y., Wang, M., Kawaoka, Y., Gorman, O., Ito, T., & Saito, T., et al. (1992). Characterization of a new avian-like influenza a virus from horses in china.Virology, 188(1):245-255.

[8] 殷震,劉景華.動(dòng)物病毒學(xué) [M].第二版. 北京:科學(xué)技術(shù)出版社,1997:704-728.

YIN Zhen, LIU Jing-hua. (1997).AnimalVirology[M]. Second Edition. Beijing: Science and Technology Press:704-728. (in Chinese)

[9] 蔣桃珍.H3N8亞型馬流感病毒的致病性研究及滅活疫苗的研制[D].武漢:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士論文,2009.

JIANG Tao-zhen. (2009).PathogenicityofEquineInfluenzaVirusH3N8subtypeanddevelopmentofinactivatedvaccineagainstEquineInfluenza[D]. PhD Dissertation. Huazhong Agricultural University, Wuhan. (in Chinese)

[10] Yamanaka, T., Niwa, H., Tsujimura, K., Kondo, T., & Matsumura, T. (2008). Epidemic of equine influenza among vaccinated racehorses in japan in 2007.JournalofVeterinaryMedicalScience, 70(6):623-625.

[11] Bryant, N., Rash, A., Lewis, N., Elton, D., Montesso, F., & Ross, J., et al. (2008). Australian equine influenza: vaccine protection in the uk.VeterinaryRecord, 162(15):491-492.

[12] 郭巍,閆研,王英原,等.新疆地區(qū)一株馬流感病毒的分離及鑒定[J].中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào),2008,30(8):584-586.

GUO Wei, YAN Yan, WANG Ying-yuan, et al. (2008). Isolation and identification of equine influenza virus in Xinjiang [J].ChineseJournalofPreventiveVeterinaryMedicine, 30(8):584-586. (in Chinese)

[13] 郭元吉,程小雯.流行性感冒及其實(shí)驗(yàn)技術(shù)[M].北京:中國三峽出版社,1997.

GUO Yuan-ji, CHENG Xiao-wen. (1997).Influenzaandexperimentaltechnology[M]. Beijing: China Three Gorges Publishing House. (in Chinese)

[14] 卡爾尼克 BW.禽病學(xué) [M].第11版. 北京:中國農(nóng)業(yè)出版社,2005:147-177.

Kalnik B.W. (2005).Virology[M]. Eleventh Edition. Beijing: Chinese Agriculture Press:147-177. (in Chinese)

[15] To, K. K. W., Tsang, A. K. L., Chan, J. F. W., Cheng, V. C. C., Chen, H., & Yuen, K. Y. (2014). Emergence of avian influenza a(h10n8) in human after a(h5,6,7,9,10 and n1,2,3,7,9): single intrusion or looming epidemic.JournalofInfection. 68(3):205-215.

[16] Chan, F. W., To, K. W., Tse, H., Jin, D. Y., & Yuen, K. Y. (2013). Interspecies transmission and emergence of novel viruses: lessons from bats and birds.TrendsinMicrobiology, 21(10):544-555.

[17] García-Sastre, A. (2012). The neuraminidase of bat influenza viruses is not a neuraminidase.ProceedingsoftheNationalAcademyofSciences, 109(46):18,635-18,636.

Fund project:Supported by NSFC(31460655)and Open project of key laboratory of Tarim animal husbandry science and technology of Xinjiang Production & Construction Corps(HS2014011)

Sequence Analysis of NA Gene of H3N8 EIV of Donkey in Southern Xinjiang

LIU Yong-hong, ZHANG Lu-yao, LI Fei, ZHAO Li

(College of Animal Science, Tarim University / Key Laboratory of Tarim Animanl Husbandry Science andTechnologyofXinjiangProduction&ConstructionCorps,AlarXinjiang843300,China)

【Objective】 In order to clarify whether donkeys were infected with EIV in Southern Xinjiang and the characteristics of NA gene of EIV.【Method】According to the sequence of NA gene in GenBank, we designed and synthesized 1 pair of primers. The NA gene was obtained by RT-PCR for the suspected cases infected with EIV in Southern Xinjiang. Then the electrophoresis analysis, gel recovery, sequencing and sequence analysis were utilized.【Result】The results showed that HA gene of A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8) strain was 1,413 bp in length, encoding 470 amino acids. The homology of the nucleotide sequence and the amino acid sequence with domestic and foreign reference strains was 75.2%~99.6%% and 80%~100% respectively. The strain with the Chinese strains 、 Kazakhstan strain India strain in the same evolutionary branching. Amino acids of glycosylation site was completely consistent with A/donkey/Xinjiang/5/2007 (H3N8), the only one strain from donkey in the GenBank database.【Conclusion】There is a donkey EIV infection in Southern Xinjiang, which may be a continuation of the domestic epidemic or might be introduced from neighboring countries. This study has certain significance for the disease prevention and control in Southern Xinjiang.

donkey; EIV; H3N8 subtype

10.6048/j.issn.1001-4330.2016.08.024

2016-03-11

國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31460655);兵團(tuán)塔里木畜牧科技重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題(HS2014011)

劉永宏(1981-),男,內(nèi)蒙古武川人,副教授,博士,研究方向?yàn)榧倚蟛±韺W(xué),(E-mail)lyhdky@126.com

趙麗(1982-),女,內(nèi)蒙古鄂爾多斯人,副教授,研究方向?yàn)閯?dòng)物傳染病與免疫病理學(xué),(E-mail)zhaolidky@126.com

S855.3

A

1001-4330(2016)08-1539-07

猜你喜歡
南疆核苷酸流感病毒
單核苷酸多態(tài)性與中醫(yī)證候相關(guān)性研究進(jìn)展
徐長風(fēng):核苷酸類似物的副作用
肝博士(2022年3期)2022-06-30 02:48:28
南疆木棉紅似火
歌海(2021年6期)2021-02-01 11:27:18
南疆最美是春天
藝術(shù)家(2020年6期)2020-08-10 08:35:28
抗甲型流感病毒中藥活性成分的提取
Acknowledgment to reviewers—November 2018 to September 2019
高原地區(qū)流感病毒培養(yǎng)的條件優(yōu)化
筑夢南疆
流感病毒分子檢測技術(shù)的研究進(jìn)展
基于HRP直接標(biāo)記的流感病毒H1N1電化學(xué)免疫傳感器
石门县| 江口县| 苏尼特左旗| 界首市| 泉州市| 榆树市| 南澳县| 东港市| 钟祥市| 建水县| 江山市| 上林县| 六枝特区| 泽库县| 安图县| 凯里市| 巴青县| 巧家县| 隆安县| 屏南县| 内丘县| 卢氏县| 岳普湖县| 湟中县| 和田县| 安塞县| 新巴尔虎左旗| 二连浩特市| 涟水县| 花莲县| 莱西市| 玛多县| 鄂托克旗| 中山市| 乡城县| 铁力市| 南溪县| 武汉市| 邹平县| 邓州市| 抚顺县|