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64位博士組團(tuán)盯上基因數(shù)據(jù)分析,能讓癌癥變得可控嗎

2016-11-26 01:06王鵬
就業(yè)與保障 2016年3期
關(guān)鍵詞:癌癥測(cè)序精準(zhǔn)

王鵬

64位博士組團(tuán)盯上基因數(shù)據(jù)分析,能讓癌癥變得可控嗎

王鵬

2月3日,已臨近新年,余偉師還在公司忙得不可開(kāi)交。下午5點(diǎn),見(jiàn)完投資人,他又匆匆趕回微軟創(chuàng)投加速器工作。目前,他和他的創(chuàng)始團(tuán)隊(duì)10多名成員都在這里辦公。賽?;蚴侨腭v微軟創(chuàng)投加速器的第7期項(xiàng)目之一。這份機(jī)會(huì)也來(lái)之不易,1400份申請(qǐng),最后只有20個(gè)項(xiàng)目成功入圍。

當(dāng)然,歷經(jīng)半年,他們不得不從這里搬走,一是因?yàn)樗麄儗奈④泟?chuàng)投加速器“畢業(yè)”,新的項(xiàng)目將入駐,二是因?yàn)楣镜暮诵膱F(tuán)隊(duì)將陸續(xù)回國(guó),他們需要更大的“戰(zhàn)場(chǎng)”。

創(chuàng)客ABC

A.他們是誰(shuí)?

這是一支跨專(zhuān)業(yè)有機(jī)整合了64位海外華人博士的技術(shù)團(tuán)隊(duì),創(chuàng)始人兼CEO余偉師曾是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院科學(xué)家,技術(shù)總監(jiān)劉湘濤是耶魯大學(xué)應(yīng)用數(shù)學(xué)博士,市場(chǎng)負(fù)責(zé)人賈洪濤是俄亥俄州立大學(xué)生物醫(yī)學(xué)博士,運(yùn)營(yíng)負(fù)責(zé)人梁萌萌是南加州大學(xué)病理生物學(xué)博士。

B.他們?cè)谧鍪裁矗?/p>

打造一個(gè)基因數(shù)據(jù)智能分析平臺(tái),為醫(yī)生、患者提供精準(zhǔn)的疾病分類(lèi)和診療建議,將癌癥轉(zhuǎn)為可控慢性病,為亞健康人群提供個(gè)性化健康管理措施。

C.融資狀況?

已完成天使輪融資,但尚未對(duì)外披露具體投資方和投資金額。

曾因“知識(shí)無(wú)用武之地”而深感寂寞

中國(guó)近年來(lái)癌癥及患病人群劇增,“我們國(guó)家每5分鐘有21人因?yàn)榘┌Y死亡,每5分鐘有35人被診斷為癌癥,我們肩上的責(zé)任還很重?!庇鄠熣f(shuō)。

十年前,還在讀碩士的余偉師就已經(jīng)開(kāi)始研究基因與疾病、基因與癌癥的關(guān)系。2005年至2010年,他先后在國(guó)際知名雜志上發(fā)表了7篇基因與遺傳疾病、基因和癌癥發(fā)生相關(guān)的論文。2011年,他進(jìn)入美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院從事博士后研究,主要研究干細(xì)胞和誘導(dǎo)干細(xì)胞分化的表觀遺傳學(xué)機(jī)制。期間他又發(fā)表了數(shù)篇具有國(guó)際影響力的文章,并獲得了美國(guó)政府近150萬(wàn)美元的個(gè)人科研經(jīng)費(fèi),以及晉升為研究員和杰出人才通道的綠卡申請(qǐng)機(jī)會(huì)。

然而十載寒窗,余偉師逐漸認(rèn)識(shí)到疾病,尤其是癌癥治療的復(fù)雜性,是他一個(gè)人每天待在實(shí)驗(yàn)室里永遠(yuǎn)也無(wú)法讀懂的世界。要想真正解決人類(lèi)面臨的這一難題,他必須走出實(shí)驗(yàn)室,和更多志同道合的專(zhuān)家們一起,充分接觸臨床,去和醫(yī)生們合作親自解決各種問(wèn)題。

由于“人種差異大”,余偉師認(rèn)為歐美基因庫(kù)案例雖然對(duì)人類(lèi)疾病的了解有著重要的作用,但對(duì)中國(guó)人參考價(jià)值有限,一種“多年的知識(shí)儲(chǔ)備無(wú)用武之地”的落寞油然而生,與此同時(shí),身邊不斷有朋友或者親屬死于癌癥的噩耗傳來(lái),回國(guó)創(chuàng)業(yè)的念頭在他心里生根發(fā)芽。

在一些聚會(huì)上,他和身邊的華人博士交流,發(fā)現(xiàn)大家都深有同感,他們都迫切的希望能將自己所學(xué)應(yīng)用到實(shí)踐中去,能幫助到那些正處于疾病痛苦中的同胞?!疤剿髦仿?,有了同伴的互相攙扶,我立刻就不感到孤單了?!?/p>

考慮到中國(guó)基因數(shù)據(jù)分析市場(chǎng)成本高、時(shí)效低,且精準(zhǔn)解析的維度欠缺。余偉師決心建立中國(guó)人自己的自動(dòng)化數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。

在美國(guó),2013年余偉師和他的4個(gè)同伴一起組建了早期團(tuán)隊(duì),最初的目的也很簡(jiǎn)單,就是想利用他們?cè)卺t(yī)學(xué)領(lǐng)域的跨學(xué)科的優(yōu)勢(shì)準(zhǔn)確高效地解析人類(lèi)基因組大數(shù)據(jù),為醫(yī)生、患者提供精準(zhǔn)的疾病分類(lèi)和診療建議。

2013年10月,余偉師團(tuán)隊(duì)接收了一份來(lái)自廣東省中山醫(yī)院的病例全基因數(shù)據(jù),這是他們的第一次團(tuán)隊(duì)協(xié)作。

接到第一單,余偉師等5人興奮得不得了,連軸轉(zhuǎn)工作了一周,在數(shù)據(jù)提供方隱去臨床診斷結(jié)果的前提下,他們通過(guò)分析該患者的基因數(shù)據(jù)最終將此病例判斷為“結(jié)腸癌”患者,并給出了藥物治療的方案。而同時(shí)參與這次基因大數(shù)據(jù)分析的另外一家國(guó)際知名機(jī)構(gòu)花了一個(gè)月的時(shí)間最終卻給出了一個(gè)“樣本出錯(cuò)”的結(jié)論。(應(yīng)余偉師要求,此處隱去該機(jī)構(gòu)名稱(chēng)。)

余偉師介紹稱(chēng),進(jìn)行基因大數(shù)據(jù)分析除了要過(guò)硬的專(zhuān)業(yè)知識(shí)和算法外,還要能夠判斷哪些信號(hào)是雜質(zhì)和噪音,“因?yàn)榘┡哉=M織和腫瘤組織并不是絕對(duì)單一的,當(dāng)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的不同學(xué)科的人交叉合作時(shí),就擁有了更強(qiáng)的辨別能力”。

64個(gè)華人博士組成“幕僚團(tuán)隊(duì)”

2014年,余偉師團(tuán)隊(duì)完成了第一階段的技術(shù)攻克,并在美國(guó)與各大癌癥中心進(jìn)行臨床測(cè)試,同時(shí)也與國(guó)內(nèi)多家知名醫(yī)院完成了技術(shù)測(cè)試。經(jīng)過(guò)短短兩年時(shí)間,當(dāng)初的5人團(tuán)隊(duì)已經(jīng)壯大成64個(gè)分別來(lái)自分子醫(yī)學(xué)、生物信息學(xué)、分子遺傳學(xué)等各個(gè)研究領(lǐng)域的國(guó)際頂尖人才。

他們利用生物信息學(xué)與云計(jì)算正在開(kāi)發(fā)出智能化、全自動(dòng)的基因數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)平臺(tái),在實(shí)現(xiàn)復(fù)雜基因數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)解析度基礎(chǔ)上,能使成本降低50%~80%。

2015年10月,余偉師放棄了在美國(guó)所獲得的一切成果,回國(guó)加入了創(chuàng)業(yè)大潮,“我們希望能夠團(tuán)結(jié)帶動(dòng)更多的科學(xué)家投入到這個(gè)事業(yè)中,幫助醫(yī)生實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)治療,將癌癥真正轉(zhuǎn)變?yōu)榭煽氐穆圆 薄?/p>

據(jù)余偉師介紹,在目前的64位國(guó)際頂尖人才中,有20多人已成為賽?;虻暮诵某蓡T,據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),團(tuán)隊(duì)核心成員在精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域發(fā)表的論文600篇之多,其中生物信息學(xué)基因數(shù)據(jù)分析相關(guān)論文200余篇。

未來(lái)核心成員會(huì)陸續(xù)回國(guó)參與到公司的全職經(jīng)營(yíng)中來(lái),賽?;蛞矠樗麄冾A(yù)留了豐厚的股權(quán)作為激勵(lì)。而其他成員多在美國(guó)各大癌癥研究機(jī)構(gòu)工作,以基因公司科學(xué)顧問(wèn)的角色繼續(xù)通力合作為賽福基因提供技術(shù)支持。

也在此時(shí),正好趕上微軟創(chuàng)投加速器招收項(xiàng)目,微軟創(chuàng)投大中華區(qū)負(fù)責(zé)人杜楓介紹稱(chēng),微軟創(chuàng)投加速器招收項(xiàng)目有三個(gè)標(biāo)準(zhǔn):一是廣闊的市場(chǎng),二是團(tuán)隊(duì)要最有可能解決這個(gè)問(wèn)題,三是技術(shù)要具有領(lǐng)先性。

“賽?;騽偤镁邆溥@三點(diǎn),所以他們可以從1400份申請(qǐng)中脫穎而出,成為了微軟創(chuàng)投加速器第7期項(xiàng)目中唯一的生物醫(yī)學(xué)方向的團(tuán)隊(duì)?!倍艞髡f(shuō)。

基因信息挖掘機(jī):從1000G中挖出幾KB的信息

目前,賽?;蛑饕獮獒t(yī)院和醫(yī)療科研單位提供基因大數(shù)據(jù)分析服務(wù),所以他們也是一家B2B的公司,“現(xiàn)在國(guó)內(nèi)有很多機(jī)構(gòu)具備了基因檢測(cè)能力,也誕生了很多基因檢測(cè)公司,但是卻缺乏專(zhuān)業(yè)的生物信息分析的團(tuán)隊(duì),我們可以直接和他們對(duì)接”。

在對(duì)接醫(yī)院方面,賽?;虻姆?wù)對(duì)象有兩個(gè),一個(gè)是給臨床醫(yī)生提供患者的個(gè)性化治療建議,另一個(gè)是基于臨床案例給醫(yī)院提供大數(shù)據(jù)樣本的分析報(bào)告。

“北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院的沈琳副院長(zhǎng)曾搜集了15對(duì)胃腸間質(zhì)瘤的樣本,這是胃癌里面非常罕見(jiàn)的一種疾病,我們幫他做了基因數(shù)據(jù)分析后,對(duì)于她未來(lái)的臨床治療起到了很大的幫助,她也特別滿意?!?/p>

在數(shù)據(jù)來(lái)源上,主要由醫(yī)院、第三方檢測(cè)機(jī)構(gòu)、體檢中心等幾方面提供。為了讓記者更形象地理解基因數(shù)據(jù)分析的難度,余偉師打了個(gè)比方,如果對(duì)一個(gè)人進(jìn)行全基因組測(cè)序,根據(jù)測(cè)序深度不同,大概會(huì)產(chǎn)生300G到1000G的內(nèi)容,而賽福基因要做的就是從1000G的內(nèi)容中挖掘出幾KB的關(guān)鍵信息,供醫(yī)院和科研機(jī)構(gòu)使用。

“當(dāng)我們生物信息團(tuán)隊(duì)將突變的基因位點(diǎn)篩查出來(lái)后,分子醫(yī)學(xué)和遺傳學(xué)的博士團(tuán)隊(duì)就發(fā)揮作用了,他們深耕于人類(lèi)疾病的不同領(lǐng)域,知曉不同的位點(diǎn)和疾病之間的關(guān)聯(lián),最終和臨床信息相結(jié)合,輔助醫(yī)生制定更精準(zhǔn)的治療方案?!庇鄠熣f(shuō)。

在余偉師看來(lái),他們團(tuán)隊(duì)強(qiáng)大的基因數(shù)據(jù)分析能力得益于團(tuán)隊(duì)成員的學(xué)科交叉,“特別是癌癥是一種復(fù)雜的基因組疾病,要想篩查出涉及疾病的關(guān)鍵位點(diǎn),就必須具備過(guò)濾基因數(shù)據(jù)噪音的能力以及對(duì)疾病信號(hào)通路的精確把握,這需要不同專(zhuān)業(yè)的頂尖人才的相互碰撞和探討交流,才能完成?!?/p>

杜楓介紹稱(chēng),基因產(chǎn)業(yè)是新興產(chǎn)業(yè),目前就像一片汪洋大海上浮出了幾個(gè)小島,剩下的大部分信息還在水下,“所以基因行業(yè)還沒(méi)有A+B一定等于C,只有A+B可能會(huì)推導(dǎo)出C”。

“基因數(shù)據(jù)分析其實(shí)就像在繪制海圖,把大洋上的島嶼一個(gè)個(gè)挖掘并連接起來(lái),怎么才能連接起來(lái)時(shí),很多人都在探索的問(wèn)題,賽?;蜃叩蒙晕⒃缫稽c(diǎn),他們將這些醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的教授和博士聯(lián)結(jié)起來(lái),其他人要繪制‘海圖’也得這么做。”杜楓說(shuō)。

構(gòu)建基因數(shù)據(jù)智能分析系統(tǒng)

在余偉師看來(lái),賽?;蚰茼樌呱匣驍?shù)據(jù)分析的商業(yè)化道路與基因檢測(cè)技術(shù)的日益成熟,成本也大幅度降低密不可分,因?yàn)檫@使普通患者基因測(cè)序成為可能。

2003年,進(jìn)行一次個(gè)人的全基因測(cè)序需要30億美金;2011年,喬布斯患胰腺癌,進(jìn)行DNA測(cè)序花費(fèi)10萬(wàn)美元,雖然價(jià)格縮水了10000倍,但依舊非常人所能承受;2015年基因測(cè)序的費(fèi)用降到了1000美金,價(jià)格再次大幅降低,參與測(cè)序的人數(shù)增加為基因數(shù)據(jù)分析提供了商業(yè)化可能。

值此契機(jī),余偉師決定在該領(lǐng)域深挖,他也看到了一個(gè)案例一個(gè)案例地去進(jìn)行基因數(shù)據(jù)分析的低效和繁瑣,為了讓基因數(shù)據(jù)更高效地實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)解析,他們正在籌劃構(gòu)建一個(gè)基因數(shù)據(jù)的智能分析系統(tǒng),醫(yī)生和科研人員在該系統(tǒng)中自助式的導(dǎo)入樣本數(shù)據(jù),利用后臺(tái)的算法模型,就可以高效地得到自己想要的分析結(jié)果。

余偉師介紹稱(chēng),利用生物信息學(xué)與云計(jì)算開(kāi)發(fā)出智能化、全自動(dòng)的基因數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)平臺(tái),使成本降低50% ~80%,能實(shí)現(xiàn)復(fù)雜基因數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)解析度。

長(zhǎng)期而言,賽福基因還希望在智能分析系統(tǒng)基礎(chǔ)上建立一個(gè)可視化系統(tǒng)及云服務(wù)端口,使醫(yī)生與科學(xué)家之間的交流效率提升到一個(gè)新的次元?!霸谶@個(gè)智能分析平臺(tái)上,我們還會(huì)對(duì)亞健康人能夠提供一些個(gè)性化的健康管理的措施,給醫(yī)藥研究院提供動(dòng)態(tài)的數(shù)據(jù)分析,加強(qiáng)精準(zhǔn)醫(yī)療在癌癥治療上的應(yīng)用?!?/p>

近兩年來(lái),世界各國(guó)政府紛紛以各種方式支持精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃發(fā)展,加速該領(lǐng)域的產(chǎn)業(yè)化。其中,基因檢測(cè)被《時(shí)代》雜志評(píng)選為“50項(xiàng)最重要發(fā)明”榜首,業(yè)內(nèi)普遍認(rèn)為精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃將催生上萬(wàn)億的市場(chǎng),其中基因檢測(cè)服務(wù)業(yè)五年內(nèi)或達(dá)到百億級(jí)。

在余偉師看來(lái),精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃處于疾病診療的風(fēng)口,將會(huì)全面推動(dòng)傳統(tǒng)醫(yī)療的變革,掀開(kāi)疾病個(gè)體化治療的新篇章?!半S著精準(zhǔn)醫(yī)療時(shí)代的開(kāi)啟,無(wú)論是B端還是C端都將前景廣闊,對(duì)此我們深信不疑?!?/p>

不過(guò),余偉師也表示看到了目前國(guó)內(nèi)市場(chǎng)的魚(yú)龍混雜,沒(méi)有出現(xiàn)相關(guān)的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),“目前賽福基因公司正在贏得國(guó)內(nèi)相關(guān)權(quán)威部門(mén)的支持,我們正在積極地與此行業(yè)的各方進(jìn)行磋商,希望能憑借我們?cè)诿绹?guó)參與精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃積累的經(jīng)驗(yàn)幫助中國(guó)在基因測(cè)序整體行業(yè)的發(fā)展貢獻(xiàn)自己的力量。”

(稿件來(lái)源:《新京報(bào)》)

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