劉燕
河南農(nóng)業(yè)職業(yè)學院牧業(yè)工程學院
ESR和 FSHβ亞基基因在華特B系豬中多態(tài)性的研究分析
劉燕
河南農(nóng)業(yè)職業(yè)學院牧業(yè)工程學院
研究分析華特B系豬、大約克豬的ESR、FSHβ亞基基因的多態(tài)性及其與繁殖性能的關系。結果表明:ESR基因在2個豬種中AA和AB基因型均占優(yōu)勢,BB基因型頻率很低,但BB基因型經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)仔較高。FSHβ亞基基因在華特B系豬中未檢測到AA基因型,BB基因型占絕對優(yōu)勢,以AB基因型產(chǎn)仔數(shù)最高,但沒有達到顯著水平。
ESRFSHβ多態(tài)性華特B系豬
華特豬配套系的育成以甘肅地方豬種八眉豬、河西豬、蘇聯(lián)大白豬、長白豬和大約克豬為育種素材。選育經(jīng)歷新品種選育、專門化品系的選育和品系間的配套選育三個階段完成。華特B系豬具有典型的瘦肉型豬體型,適應性強、繁殖率高、保姆性強,相對于華特A系、華特C系較優(yōu)。豬產(chǎn)仔數(shù)是低遺傳力性狀,到一定年齡才表現(xiàn)且只在母豬一方面表現(xiàn),還可能受到母體效應的影響,以數(shù)量遺傳學為指導的常規(guī)選擇方法所能取得的遺傳進展十分有限。如采用標記輔助選擇(MAS),則可提高選擇的準確性和遺傳進展。本文檢測ESR、FSHβ亞基基因在華特B系豬中的多態(tài)性,為進一步探討其對產(chǎn)仔數(shù)的影響,以期在華特B系群體中利用分子標記輔助選擇方法提高產(chǎn)仔數(shù)。
1.實驗材料
(1)實驗動物。華特B系豬50頭,大約克豬50頭,由甘肅臨澤新華種豬場,永登潤通原種豬場,蘭州豬場提供。采耳組織,-20℃保存,用于基因組DNA的提取。
(2)試劑。Taqase、dNTP、丙烯酰胺和Mark購于廣東東盛生物公司,限制性內(nèi)切酶PvuⅡ購于大連寶生物。其他試劑均為國產(chǎn)分析純。
2.實驗方法
(1)豬耳組織DNA的提取。采用酚-氯仿抽提法提取耳組織樣的DNA。
(2)PCR擴增。PCR引物由大連寶生物合成,ESR、FSHβ其序列分別如下:
(R1):5'-CCT,GTT,TTT,ACA,GTG,ACT,TTT,ACA,GAG-3'
(F1):5'-CAC,TTC,GAG,GGT,CAG,TCC,AAT,TAG -3'
(R2):5'-CCT,TTA,AGA,CAG,TCA,ATG,GC-3'
(F2):5'-ACT,GGT,CTA,TTC,ATC,CTC,TC-3'
PCR反應體系為 25ul:10×buffer(Mg2+15mM)2.5μl,Mg2+(25mM)1.5μl,dNTPs(10mM)0.5μl,引物(10μM)各 0.5μl,Template(100ng/μl)0.5μl,Taqase (2.5U/ul)0.5ul。ESR引物反應程序是94℃ 預變性3min;變性94℃1min,退火65℃1min,延伸72℃1min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min;FSHβ引物反應程序是95℃預變性2min,變性95℃40s,退火58℃40s,延伸72℃1min,共35個循環(huán);最后72℃延伸7min。
(3)酶切及電泳檢測。ESR基因PCR產(chǎn)物的酶切反應體系為16ul,其中PCR產(chǎn)物6ul,PvuⅡ(15U/ul)0.5ul,Buffer 2.5ul,雙蒸水7ul。37℃恒溫過夜。PCR產(chǎn)物用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,酶切產(chǎn)物用8%的聚丙烯酰胺凝膠電泳分析。
1.ESR基因和FSHβ亞基基因的多態(tài)性
(各基因型的電泳圖片)ESR基因進行PCRRFLP分析結果:121bp純合子(AA基因型);121、65、56bp雜合子(AB基因型);65bp、56bp純合子(BB基因型);在華特B系豬群體內(nèi)以AA基因型占絕對優(yōu)勢,BB基因型頻率很低。在大約克豬群體內(nèi)AA、AB基因型居多,BB基因型頻率很低。FSHβ基因PCR擴增結果出現(xiàn)500bp純合子 (AA基因型);500、220bp雜合子(AB基因型);220bp純合子(BB基因型)3種情況。在華特B系豬群體內(nèi)以BB基因型占絕對優(yōu)勢,且在華特B系豬群體內(nèi)未發(fā)現(xiàn)AA基因型,而大約克群體內(nèi)AA基因型頻率很低。
2.ESR基因和FSHβ亞基基因與繁殖性能的關系
表1 不同豬群中ESR基因對繁殖性能的影響
表2 不同豬群中FSHβ亞基基因對生產(chǎn)性能的影響
由表1可得,所檢測的2個群體ESR基因均表現(xiàn)出極端的偏態(tài)分布,華特B系豬和大約克豬樣本中BB基因型樣本太少,因此難以精確計算各基因型在產(chǎn)仔數(shù)上的差異。華特B系豬的ESR基因的AA基因型與BB基因型在頭胎總產(chǎn)仔數(shù)、頭胎產(chǎn)活仔數(shù)上無顯著差異。但在經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)、經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)上差異極顯著,AA基因型比BB基因型的經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)、經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)分別高1.8、1.1頭。AA基因型和BB基因型在斷奶重、乳頭數(shù)上差異均極顯著,且AA基因型比BB基因型斷奶重高0.46千克。大約克豬AA基因型與BB基因型在頭胎產(chǎn)活仔數(shù)上差異顯著,BB基因型與AB基因型在頭胎總產(chǎn)仔數(shù)、頭胎產(chǎn)活仔數(shù)上差異均極顯著。但在經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)、經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)上無顯著差異,這與華特B系豬相反。大約克豬ESR基因各基因型在初生重、斷奶重、乳頭數(shù)上無顯著差異。
由表2可得,F(xiàn)SHβ亞基基因在華特B系豬中產(chǎn)仔數(shù)AB基因型高于BB基因型,但沒有達到顯著水平。斷奶重AB基因型比BB基因型高0.54千克,差異顯著。BB基因型與AB基因型乳頭數(shù)差異極顯著,高0.05。FSHβ亞基基因在大約克豬中BB基因型與AA基因型在頭胎總產(chǎn)仔數(shù)、頭胎產(chǎn)活仔數(shù)上差異極顯著,分別高出2.0、1.6頭。經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù),經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)差異也極顯著,BB基因型比AA基因型的經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)、經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)分別高2.27、2.31頭。在初生重、斷奶重上BB基因型比AA基因型分別高0.39千克、1.44千克,差異極顯著。
雖有研究證明ESR基因是控制豬高產(chǎn)仔數(shù)的主效基因,與控制豬高產(chǎn)仔數(shù)的主要基因緊密連鎖,但也有報道指出,PvuⅡ酶切多態(tài)性與母豬繁殖性能之間相關性不高??赡苁怯捎谀肛i繁殖性能一方面受到各品種不同遺傳背景的影響,另一方面同時受到豬場建筑設計、飼養(yǎng)管理和氣候等因素的影響。試驗所用豬群不是飼養(yǎng)在同一規(guī)?;N豬場內(nèi),其飼養(yǎng)管理、氣候和欄舍條件等諸環(huán)境因素不一致所造成的。本研究2個群體中,ESR基因均表現(xiàn)出極端的偏態(tài)分布,BB基因型的樣本太少,但由于受樣本量的限制,本研究的結果還不能做出產(chǎn)仔數(shù)差異的準確結論。因此,加大樣本量對該性狀作進一步的研究非常必要。趙要鳳等研究,在國外豬種中FSHβ優(yōu)良基因為BB型。但我國的地方豬種中檢測不到BB基因型,地方豬種的產(chǎn)仔數(shù)一般比外國豬種的產(chǎn)仔數(shù)高,這可能是因為FSHβ的不同基因型在不同的品種中作用不同。在本研究中,華特B系豬中未檢測到FSHβ亞基基因AA基因型,且產(chǎn)仔數(shù)呈AB>BB趨勢。大約克豬的BB基因型比AA基因型頭胎產(chǎn)仔數(shù),經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)仔數(shù)分別高2.05、2.33頭,且達到極顯著水平。
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