徐俏冉 楊欣欣 張珊 王瑤 陳建軍
【摘 要】纖維素是廣泛存在于自然界的多糖類(lèi)物質(zhì),纖維素酶能有效地將纖維素分解成單糖加以利用,其在能源、紡織、飼料、食品和造紙等行業(yè)具有重要的應(yīng)用。
由于纖維素酶熱穩(wěn)定性較低、酶活力不高而不能滿足生產(chǎn)需要,纖維素酶基因的克隆及表達(dá)日益被人們重視起來(lái)。結(jié)合纖維素酶在生產(chǎn)中的應(yīng)用及市場(chǎng)化的需求,本文概括了近年來(lái)國(guó)內(nèi)外對(duì)纖維素酶基因克隆與表達(dá)的研究進(jìn)展。
【關(guān)鍵詞】纖維素 纖維素酶 基因克隆 工程菌 表達(dá)載體
引言
纖維素在人們賴(lài)以生存的地球上無(wú)處不在,是人們可以利用的可再生資源,但纖維素本身是不可以直接被人們利用的,要先把它降解為可被人利用的物質(zhì)。目前,在降解纖維素的多種方法中,生物法還是較為有效的[1],它是利用微生物代謝的產(chǎn)物纖維素酶來(lái)降解和轉(zhuǎn)化纖維素,但是在實(shí)際應(yīng)用方面存在產(chǎn)酶活性較低、轉(zhuǎn)化率不高、設(shè)備耗材超出預(yù)算等問(wèn)題,因此構(gòu)建出產(chǎn)酶量多,產(chǎn)酶活性高的纖維素酶基因工程菌對(duì)纖維素資源的有效利用和社會(huì)生產(chǎn)具有重要意義。近年來(lái),隨著分子生物學(xué)和基因工程技術(shù)的發(fā)展,對(duì)纖維素酶基因的克隆及表達(dá)研究發(fā)展迅速,纖維素酶的應(yīng)用已滲透到人們生產(chǎn)、生活的各個(gè)領(lǐng)域。
1 .纖維素
纖維素是一種多糖,它的化學(xué)簡(jiǎn)寫(xiě)分子式為(C6H10O5) n,它的熱穩(wěn)定性很好,在室溫條件下,不易降解,不易分解,一般條件下,并不發(fā)生顯著的變化[2]。以150℃為界限,溫度高到一定程度時(shí),也會(huì)發(fā)生化學(xué)反應(yīng)。纖維素與無(wú)機(jī)酸,苛性堿溶液以及強(qiáng)氧化劑均可以發(fā)生化學(xué)反應(yīng)[3]。
2 . 纖維素酶
2.1 纖維素酶的組成
纖維素酶由三部分組成,分別是:外切β-葡聚糖酶、內(nèi)切β-葡聚糖酶和β-葡萄糖苷酶,它是靠這三種酶共同作用,來(lái)發(fā)揮自己的功效的[4]。纖維素酶的最適pH一般在4.5-6.5,過(guò)酸或者過(guò)堿都可以使酶失活。纖維素酶活力還算比較穩(wěn)定,但是,目前人們發(fā)現(xiàn)了一些抑制劑,可以抑制酶的活力,比如銅離子和汞離子,而相對(duì)應(yīng)的,還有些物質(zhì)可以解除這種抑制,它就是半胱氨酸[5],我們可以有效的利用它,來(lái)最大程度的發(fā)揮酶的活力。
2.2纖維素酶的來(lái)源
纖維素酶無(wú)處不在,真菌,細(xì)菌,放線菌中都有產(chǎn)纖維素酶的菌[6]。目前,報(bào)道過(guò)的產(chǎn)纖維素酶的菌株主要集中在真菌方面,如黑曲霉Aspergillus Niger、綠色木霉Green trichoderma viride、里氏木霉Magnitude of trichoderma viride、康氏木霉Kang Shimu mildew和嗜熱毛殼菌 QM9381Bacteria QM9381, thermophilic MAO shells 等[7];細(xì)菌中被發(fā)現(xiàn)的并不多,如芽孢桿菌Bacillus、瘤胃細(xì)菌Rumen bacteria(黃化瘤胃球菌、白色瘤胃球菌等)和熱纖梭菌Thermal fiber clostridium等。
2.3 纖維素酶的作用機(jī)理
纖維素酶降解纖維素的過(guò)程中,首先纖維素酶要結(jié)合到底物上,形成酶-纖維素二元復(fù)合物,完成纖維素酶降解纖維素的第一步,即吸附[8]。由于吸附的條件不同,吸附的效果也不同。內(nèi)切葡聚糖酶先發(fā)揮作用后,外切葡聚糖酶再發(fā)揮作用,β-葡萄糖苷酶與其二者協(xié)同作用,共同將纖維素分解為葡萄糖。內(nèi)切葡聚糖酶先作用于微纖維的非結(jié)晶區(qū),將其分解成大小不等的短鏈,外切葡聚糖酶作用于這些短鏈,生成纖維二糖,最后β-葡萄糖苷酶作用于纖維二糖等,生成葡萄糖。
2.4 纖維素酶的應(yīng)用
纖維素酶在食品發(fā)酵工業(yè)、動(dòng)物飼料行業(yè)、紡織和造紙行業(yè)中都有廣泛的應(yīng)用,在石油勘探、中藥成分的提取等領(lǐng)域中也有所涉及。在酒精生產(chǎn)中,添加纖維素酶不僅可以提高啤酒的純度和啤酒生產(chǎn)的速度,而且可以保證啤酒的質(zhì)量及提高啤酒的口感[9]。在飼料中,添加纖維素酶不僅可以促進(jìn)消化,還有利于提高家畜的體重[10]。在紡織行業(yè)中,采用纖維素酶對(duì)織物進(jìn)行洗滌時(shí),其可以對(duì)纖維表層進(jìn)行有效的控制,從而使織物均勻褪色[11]。
3 .纖維素酶基因克隆及表達(dá)的研究
隨著分子生物學(xué)、遺傳工程的迅猛發(fā)展,國(guó)內(nèi)外均在嘗試應(yīng)用基因工程技術(shù)來(lái)改造和構(gòu)建高效纖維素降解菌,而且對(duì)特殊環(huán)境中的纖維素酶產(chǎn)生菌也產(chǎn)生了濃厚的興趣。這些菌具有獨(dú)特的酶學(xué)性質(zhì),擴(kuò)大了纖維素酶的應(yīng)用范圍[12]。
在20 世紀(jì)70 年代,纖維素酶基因的克隆開(kāi)始興起并蓬勃發(fā)展起來(lái)。到目前為止,人們克隆到纖維素酶的基因并不是單一的,在成千上萬(wàn)個(gè)物種中都有發(fā)現(xiàn)與收獲,其中在細(xì)菌和真菌中尤其廣泛[13]。同時(shí),克隆到的酶基因能否成功的表達(dá)也十分重要,已有文獻(xiàn)證明纖維素酶在大腸桿菌中表達(dá)是比較普遍而且高效的[14],另外,人們還在逐步尋找其他的表達(dá)載體。但是與國(guó)外相比,國(guó)內(nèi)對(duì)纖維素酶的研究還很緩慢,很多菌株因?yàn)楫a(chǎn)酶能力低或者熱穩(wěn)定性差而不能被很好的應(yīng)用。
如今,很多學(xué)者已克隆出不少的纖維素酶基因,而且其中一大部分都在大腸桿菌中進(jìn)行了表達(dá)[15]。
寧玉潔等[16]從約氏梭菌屬CJ-1菌株中克隆出基因片段Cel9C,大小為1943 bp,編碼647個(gè)氨基酸,將該基因構(gòu)建于大腸桿菌表達(dá)載體pET28a(+)中,獲得重組表達(dá)載體pET28a-Cel9C,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌菌株BL21(DE3)中進(jìn)行表達(dá)。
Kim等[17]將耐熱菌Aqu ifex aeolicus VF5中編碼耐熱內(nèi)切葡聚糖酶的基因(Cel8Y)克隆并且轉(zhuǎn)導(dǎo)入大腸桿菌XL1-Blue中,通過(guò)表達(dá)和檢測(cè),發(fā)現(xiàn)內(nèi)切葡聚糖酶在80℃時(shí)酶活最大。
李春華等[18]以CpoI and NotI限制性?xún)?nèi)切酶雙酶切衍生于質(zhì)粒pGEX的大腸桿菌表達(dá)載體pHBM625,然后將經(jīng)T4 DNA polymerase處理后的β-1, 4-內(nèi)切葡聚糖酶基因克隆至載體pHBM625中得到重組質(zhì)粒pHBM625中,最后通過(guò)平板檢測(cè)及SDS-PAGE凝膠電泳,均檢測(cè)到該基因在大腸桿菌XL10-Glod中的表達(dá)。
雖然纖維素酶克隆與表達(dá)的研究在現(xiàn)階段已經(jīng)取得了很大的進(jìn)展,但表達(dá)、分泌均較弱,并沒(méi)有在真正意義上得到高效分解纖維素的工程菌,不能大規(guī)模的應(yīng)用于生產(chǎn)[19]。由此觀之,雖然纖維素酶具有廣闊的應(yīng)用前景和良好的發(fā)展前途,但人們對(duì)纖維素的世界了解的還不夠深入透徹,有很多未知的領(lǐng)域等待我們探索和突破,另外,纖維素酶還有良好的商業(yè)價(jià)值,人們?cè)谏a(chǎn)的各個(gè)領(lǐng)域,如果能使纖維素酶發(fā)揮出應(yīng)有的功效,那將是酶工程的一項(xiàng)重大突破[20]。
4 . 展望
迄今為止,很多纖維素的潛在資源沒(méi)有被人們利用,既造成了環(huán)境污染,也浪費(fèi)了資源,并對(duì)物質(zhì)資源造成了很大的壓力[21]。有研究報(bào)道顯示,我國(guó)是農(nóng)業(yè)大國(guó),很多玉米等谷物的麥稈都被焚燒,世界的麥稈每年產(chǎn)量約40億噸,光被我國(guó)燃燒掉的就占了八分之一,如果我們可以把這些資源利用起來(lái),變廢為寶,不僅可以緩解環(huán)境的壓力,也可以很好的解決資源浪費(fèi)的問(wèn)題。很多發(fā)達(dá)國(guó)家的纖維素的利用率比我國(guó)高出了五分之一,所以,我們應(yīng)該學(xué)習(xí)他們的先進(jìn)技術(shù),努力構(gòu)建高產(chǎn)纖維素酶的基因工程菌,并把它用于生產(chǎn)實(shí)踐,解決我國(guó)纖維素資源浪費(fèi)的問(wèn)題。相信在不久的將來(lái),纖維素酶會(huì)在我們生活的各個(gè)領(lǐng)域發(fā)展壯大,將會(huì)給人們帶來(lái)巨大的經(jīng)濟(jì)效益,會(huì)給商品化社會(huì)帶來(lái)推動(dòng)作用,會(huì)更加便于人類(lèi)的生活。
參考文獻(xiàn):
[1]Sanjeev K Sharma,Krishan L Kalra,Harmeet S Grewal.Enzymatic saccharification of pretreated sunflower stalks[J].Biomass and Bioenergy,2002,23:237 -243.
[2]陳冠軍,杜宗軍,高培基.耐堿性真菌纖維素酶生產(chǎn)菌的篩選及酶學(xué)性質(zhì)的初步研究[J].工業(yè)微生物,2000,30(4):23.
[3]劉海燕,白龍,趙海波,等.纖維素酶高產(chǎn)菌的篩選鑒定及纖維素酶基因的克隆與表達(dá)[J]. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2012,17(5):92-98.
[4]Chen,H.Z.,Li,X.L.,&Ljungdahl;,L.G.(1997). Journal of bacteriology, 179,6028-6034.
[5]Michel,G.Chantalat,L.,Duee,E.,Barbeyron,T.,Henrissat,B.,Kloareg,B.,et al.(2001).Structure,9,513-525.
[6]Hahn,M.,Olsen,O.,Politz,O.,Borriss,R.,&Heinemann;,U.(1995).The Journal of biological chemistry,270,3081-3088.
[7]孟雷,陳冠軍,王怡,等.纖維素酶的多型性[J].纖維素科學(xué)與技術(shù),2002,10(2):47-55
[8]R. Kumar, C. E. Wyman. Does change in accessibility with conversion depend on both the substrate and pretreatment technology? Bioresource Technology, 2009, 100: 4193-4202.
[9]劉春芬,賀稚非,蒲海燕,等.纖維素酶及應(yīng)用現(xiàn)狀[J].糧食與油脂,2004,1:15-17.
[10]趙榮樂(lè).纖維素酶研究進(jìn)展[J].喀什師范學(xué)院學(xué)報(bào),2005,26(6):51-54.
[11]劉雨田,郭中文.β-葡聚糖與β-葡聚糖酶[J].畜禽業(yè).2000,第7期:42-43. [49] 施永泰,朱墓元.大麥β-葡聚糖酶的研究和展望[J].大麥科學(xué).2001,第1期:5-8.
[12]肖春玲.微生物纖維素酶的應(yīng)用研究微生物學(xué)雜志[J].微生物學(xué)雜志,2002,20(3):10.
[13]楊志愿,邱業(yè)先,李孝坤,等.幾株反硝化聚磷菌的篩選及其生理生化特性的鑒定[J].環(huán)境科技,2009,26(3):42-48.
[14]倪浩.黑曲霉內(nèi)、外切葡聚糖酶基因的克隆與表達(dá)[D].南京林業(yè)大學(xué),2010.
[15]Viggo Lindahl, Kari Aa, Arne Tronsmo. Nucleotide sequence of an endo-β-1,4-glucanase gene from Bacillus subtilis CK-2[J].Antonie van Leeuwenhoek, 1994,66(4): 327-332
[16]寧玉潔,闖紹闖,陳曉林,等.纖維素降解菌中葡聚糖酶基因的克隆表達(dá)及活性[J].安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2015,42(6):910-914.
[17]Kim JO, Park SR, Lim WJ, et al. Cloning and characterization of thermostable endoglucanase(Cel8Y)from the hypert thermophilic Aquifex aeolicus VF5[J]. Biophysical Research Communications, 2000, 279(2):420-426.
[18]李春華,廖貴芹,張桂敏,等.β-1,4-內(nèi)切葡聚糖酶基因的克隆及其在大腸桿菌中的表達(dá)[J].湖北大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)報(bào)),2005,27(3):275-279
[19]夏黎明,蕭慶,余世袁.碳源對(duì)固定化里氏木霉合成纖維素酶的影響[J].纖維素科學(xué)與技術(shù),1994,2(3-4):72-77
[20]張偉,龔月生,楊明明.耐熱纖維素酶產(chǎn)生菌的篩選與酶基因的克隆及表達(dá)[D].西北農(nóng)林科技大學(xué)碩士論文,2012.
[21]Mrkbak AL, Degn P, Zimmermann W. Deinking of soy bean oil based inkprinted paperwith lipases and a neutral surfactant[J].J.Biotechnol.,1999,67(2-3):229
通訊作者:陳建軍