国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

力經(jīng)PSGL-1介導ERM蛋白ITAM-like序列上磷酸化位點的暴露*

2016-06-23 03:01:49吳建華鄺曉敏劉文平方穎
關(guān)鍵詞:子域氫鍵復合物

吳建華 鄺曉敏 劉文平 方穎

(華南理工大學 生物科學與工程學院, 廣東 廣州 510006)

力經(jīng)PSGL-1介導ERM蛋白ITAM-like序列上磷酸化位點的暴露*

吳建華鄺曉敏劉文平方穎

(華南理工大學 生物科學與工程學院, 廣東 廣州 510006)

摘要:炎癥反應(yīng)階段,P-選擇素糖蛋白配體1(PSGL-1)與埃茲蛋白/根蛋白/膜突蛋白(ERM)的結(jié)合在招募脾酪氨酸激酶(Syk)并促進白細胞激活中發(fā)揮了重要作用.文中通過晶體結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),位于ERM蛋白非傳統(tǒng)的免疫受體酪氨酸活化基序(ITAM-like)上的兩個磷酸化位點(Y191和Y205)周圍存在較大的空間位阻,這將阻礙其被Src家族激酶酪氨酸磷酸化繼而招募Syk的過程.文中用拉伸分子動力學模擬的方法模擬力學環(huán)境下PSGL-1與根蛋白FERM結(jié)構(gòu)域的相互作用,構(gòu)象分析和殘基溶劑可及表面積的變化都表明,經(jīng)由PSGL-1傳導的力學信號可以介導根蛋白ITAM-like序列上磷酸化位點Y205的暴露.文中結(jié)果揭示了一條經(jīng)由PSGL-1胞內(nèi)域激活Syk的力學信號通路,并且在原子層面上對PSGL-1/ERM/Syk之間的相互作用給予了闡釋.

關(guān)鍵詞:PSGL-1;ERM蛋白;Syk;ITAM-like序列;拉伸分子動力學模擬

炎癥反應(yīng)過程中,選擇素通過與P-選擇素糖蛋白配體1 (PSGL-1)的結(jié)合介導了白細胞在內(nèi)皮細胞上的初始拴縛和快速滾動[1-2].白細胞滾動過程中,選擇素與PSGL-1的結(jié)合會引起胞內(nèi)一系列信號的傳導,包括脾酪氨酸激酶(Syk)的招募和磷酸化[3- 4],繼而把信號傳遞到下游分子并誘導整合素構(gòu)象伸長從而將其激活,促使白細胞在內(nèi)皮細胞上的緩慢滾動,最終徹底激活白細胞使其發(fā)揮免疫學功能[5-7].

作為整合素激活和白細胞活化信號傳導過程中的重要分子[8-9],Syk通常被免疫受體酪氨酸活化基序(ITAM,YxxI/Lx(6-12)YxxI/L)活化,即通過其雙重Src同源區(qū)2 (SH2 )結(jié)構(gòu)域與酪氨酸磷酸化的ITAM相結(jié)合而激活[6,8],所以ITAM序列磷酸化位點的暴露并磷酸化對于Syk的活化至關(guān)重要.而一些非傳統(tǒng)的ITAM序列(ITAM-like序列)也陸續(xù)被證實與傳統(tǒng)的ITAM序列有著相似的功能,并且在某些情況下單個酪氨酸殘基就足以引起Syk的招募[10-11].

研究表明,在血流環(huán)境中白細胞的緩慢滾動需要PSGL-1的胞內(nèi)域[7-8],PSGL-1胞內(nèi)域能夠通過埃茲蛋白/根蛋白/膜突蛋白(ERM)家族的ITAM-like序列與Syk結(jié)合并介導其激活[3,12].ERM蛋白作為橋梁分子,能夠把細胞膜上整合膜蛋白與細胞骨架之肌動蛋白連接在一起,通過介導肌動蛋白細胞骨架與細胞質(zhì)膜的連接調(diào)控信號分子的傳導[13].

鑒于PSGL-1與ERM蛋白的結(jié)合在招募Syk并促進整合素和白細胞激活中發(fā)揮的重要作用,Takai等[14]在2007年結(jié)晶出了鼠源的PSGL-1胞內(nèi)域近膜端與根蛋白FERM結(jié)構(gòu)域的復合物晶體結(jié)構(gòu),并從原子水平上對于二者之間的相互作用進行了分析.根蛋白的ITAM-like序列位于FERM結(jié)構(gòu)域中,并且包含了結(jié)合Syk分子的兩個磷酸化位點Y191和Y205.

但是通過晶體結(jié)構(gòu)的分析筆者發(fā)現(xiàn),根蛋白上的ITAM-like序列周圍存在較大的空間位阻,尤其兩個重要的磷酸化位點Y191和Y205更是被包埋在蛋白里面,這將嚴重阻礙Y191和Y205的磷酸化過程,從而阻礙ITAM-like序列對Syk的招募,所以外界擾動導致的構(gòu)象改變是必須的.

目前愈來愈多的證據(jù)表明,白細胞所處血流環(huán)境中的流體剪切力是一種非常重要的物理信號,與化學信號一起在白細胞激活過程中發(fā)揮著重要作用[15-17];但力學信號與化學信號耦合并調(diào)控下游信號通路的機理至今尚未清晰.這里,筆者猜測由PSGL-1胞內(nèi)域傳導的力學信號可能激發(fā)其近膜端所連接的ERM蛋白上ITAM-like序列的打開,為后續(xù)的磷酸化和招募Syk提供結(jié)構(gòu)構(gòu)象上的便利.為驗證上述猜想,筆者采用分子動力學模擬的方法模擬力學環(huán)境下PSGL-1與FERM蛋白的相互作用及PSGL-1/FERM復合物的構(gòu)象演變,發(fā)現(xiàn)正如實驗所測量的[14],PSGL-1與FERM存在較強的相互作用,且在該復合物解離之前,力學信號可以有效地打開ITAM-like序列進而介導其上一個重要的磷酸化位點(Y205)的暴露.這對于后續(xù)的磷酸化和Syk的結(jié)合有著重要的意義.

1材料與方法

1.1系統(tǒng)的建立

模擬體系由分子可視化操作軟件(VMD)[18]搭建,所用晶體結(jié)構(gòu)從PDB晶體庫下載,為PSGL-1胞內(nèi)近膜端與根蛋白FERM結(jié)構(gòu)域相結(jié)合的PSGL-1/FERM復合物[14](見圖1(a),PDB ID為2EMT,分辨率為0.28 nm).

圖1 PSGL-1/FERM復合物和FERM結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu)Fig.1 Crystal structures of PSGL-1/FERM complex and FERM domain

首先對PSGL-1/FERM進行坐標調(diào)整:把FERM碳端Cα原子(S313)作為固定原子,固定在原點,用于模擬ERM蛋白與細胞骨架蛋白之間穩(wěn)定的相互作用;把PSGL-1的氮端Cα原子(R402)作為拉伸原子,調(diào)整到x軸上,用于模擬PSGL-1與外界的相互作用.調(diào)整坐標后的復合物溶解于尺寸為16.56 nm×9.68 nm×9.56 nm 的TIP3水框中,按照0.152 mol/L的生理濃度加入NaCl,最終得到原子數(shù)為145 099的體系.

1.2分子動力學模擬

采用納米尺度分子動力學軟件(NAMD)[19]在CHARMM27[20]力場中進行模擬,運用埃瓦爾德粒子網(wǎng)格算法(PME)計算靜電相互作用,范德華力作用截止值設(shè)定為1.2 nm.經(jīng)過了能量最小化后,PSGL-1/FERM復合物體系接著進行了50 ns的能量平衡,并控制溫度為310 K,壓力為1.01×105Pa.在平衡過程中,PSGL-1/FERM復合物Cα原子均方根偏差(RMSD)漸趨穩(wěn)定,說明復合物在模擬的生理環(huán)境中已基本平衡(見圖2(a)).

為研究PSGL-1/FERM復合物在外力作用下的構(gòu)象變化和原子間相互作用的改變,筆者對平衡后的復合物進行3次恒速度拉伸,拉伸步長為2 fs/步,拉伸速度為0.5 nm/ns,拉伸方向為x軸正方向,虛擬原子與拉伸原子間的彈簧系數(shù)為69.48 pN/nm.每次拉伸時間不特別設(shè)定,直到PSGL-1與FERM解離為止.

1.3數(shù)據(jù)分析方法

數(shù)據(jù)分析過程中,以溶劑可及表面積(SASA)來表征拉伸過程中FERM上ITAM-like序列和活性位點的暴露程度,SASA是生物分子暴露于溶劑中的表面積,SASA越大表明分子越暴露于溶劑中,與其他分子接觸的可能性越大.氫鍵定義為:若供體原子與受體原子之間的距離小于0.35 nm且它們之間的夾角小于30°,則認為供體原子與受體原子之間存在氫鍵.氫鍵生存率(H)則定義為氫鍵在模擬過程中的累計形成時間(t1)與模擬時間(t2)之比,即:

(1)

2結(jié)果與分析

2.1靜態(tài)構(gòu)象分析

本研究的復合物中,PSGL-1胞內(nèi)域近膜端由16個氨基酸組成(編號402—417),其與根蛋白的FERM結(jié)構(gòu)域(編號1—313)形成了穩(wěn)定的構(gòu)象.FERM包含與PSGL-1以及諸多粘附分子的結(jié)合位點,由A、B、C 3個子域構(gòu)成.PSGL-1與C子域上的β5C折疊片形成了一個反向平行的β-β相互作用面,并且該接觸面主要是由氫鍵相互作用介導的[14],如圖1(a)所示. 圖1中,灰色部分為FERM結(jié)構(gòu),紅色虛線為關(guān)鍵殘基.

細胞內(nèi)游離的Syk一旦遇到傳統(tǒng)的ITAM序列或者非傳統(tǒng)的ITAM-like序列,便會與之結(jié)合,實現(xiàn)Syk的招募過程[9-11],但實現(xiàn)這種過程的前提是ITAM序列先被磷酸化.那么,靜態(tài)條件下,ITAM序列特別是其磷酸化位點能否暴露?周圍是否存在與Syk結(jié)合的構(gòu)象空間?為此,筆者對FERM的靜態(tài)晶體結(jié)構(gòu)進行了分析,發(fā)現(xiàn)ITAM-like序列(編號191—208,紅色,Tube模型)作為鉸鏈區(qū)把子域B和C連接起來,其上的兩個磷酸化位點Y191和Y205(黃色,licorice模型)卻分別被B子域和C子域包埋起來(見圖1(b)).可以想象,由于空間位阻效應(yīng),即使ERM蛋白與Syk在細胞內(nèi)相遇,若其磷酸化位點不暴露的話,ITAM-like序列是很難被磷酸化的.靜態(tài)條件下的這種包埋結(jié)果提示:力或許在ITAM-like序列磷酸化并招募Syk過程中發(fā)揮著重要作用. 因此筆者擬采用分子動力學模擬的方法觀察復合物在沒有外力作用和有外力作用情況下的動態(tài)變化.

2.2PSGL-1/FERM復合物的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性

筆者首先對系統(tǒng)進行了50 ns的平衡,此時無任何外力作用.通過對PSGL-1/FERM復合物重原子的RMSD分析可以看出,在10 ns之后該復合物已經(jīng)基本穩(wěn)定,如圖2(a)所示.

晶體結(jié)構(gòu)分析表明PSGL-1/FERM接觸面上的氫鍵相互作用主導了復合物的形成[14],那么復合物在平衡過程中的高度穩(wěn)定是否也與這些氫鍵穩(wěn)定性有關(guān)?為此,筆者對接觸面處的氫鍵數(shù)目及其生存率進行了分析,發(fā)現(xiàn)在平衡過程中不僅接觸面間的氫鍵數(shù)目保持了較高的穩(wěn)定性,基本維持在8個左右(見圖2(b)),且靜態(tài)分析中觀察到的重要氫鍵[14]均得到了保留. 表1列舉了氫鍵生存率排名前10位的氫鍵,其中TYR410、VAL412 和HSD408 所貢獻的氫鍵均被證明對復合物的穩(wěn)定性有著重要的意義,而ARG405則是突變實驗所驗證的重要殘基[14].上述結(jié)果表明,在動態(tài)平衡中,復合物不僅保留了晶體結(jié)構(gòu)靜態(tài)觀察到的氫鍵相互作用,且結(jié)合較牢固,因此可對復合物進一步展開拉伸分子動力學模擬.

圖2 平衡過程中PSGL-1/FERM復合物的RMSD和氫鍵的時間歷程Fig.2 Time-courses of RMSD and H bond number during PSGL-1/FERM equilibrium

表1平衡過程中氫鍵生存率排名前10位的氫鍵

Table 1The top ten H bonds with their survival ratio detected in equilibrium

排名PSGL-1殘基供體原子FERM殘基受體原子氫鍵生存率/%1TYR410NILE248O88.702TYR410OILE248N88.403VAL412NARG246O66.154TYR410OHHSD288ND163.015HSD408OPHE250N45.606ARG413NH1SER243O43.527HSD408NPHE250O40.788ARG405NH1ASP252OD235.999ARG405NH2ASP252OD134.8610ARG405NH1ASP252OD132.73

2.3恒速度拉伸過程中的PSGL-1/FERM復合物

為了解外力對蛋白分子相互作用的影響及觀察復合物在外力作用下的構(gòu)象變化,筆者對平衡后的復合物進行了3次恒速度拉伸,計算分析拉伸過程中拉力和接觸面氫鍵數(shù)目的變化,結(jié)果大致相同,其時間歷程如圖3所示.圖3(a)-(c)分別示出了3次SMD中拉力的變化,其中每一個力譜分別代表彼此獨立的模擬事件;圖3(d)-(f)分別示出了3次SMD中接觸面氫鍵個數(shù)的變化.拉伸過程的前20 ns左右,拉力隨時間不斷上升,但接觸面的氫鍵個數(shù)卻類似前面的平衡態(tài)保持相對穩(wěn)定;但拉伸進行到20 ns以后,伴隨著拉力的突然下降,氫鍵個數(shù)急劇下降,最終下降為0,表明復合物已基本解離,解離時間集中在20~29 ns之間,解離力集中在250~300 pN之間.

拉力促使復合物的突然解離,其中伴隨著怎樣的構(gòu)象變化?為了回答這個問題,筆者對拉伸過程中PSGL-1/FERM復合物的結(jié)構(gòu)變化進行了細致分析,發(fā)現(xiàn)在3次恒速度拉伸過程中,復合物都是先解折疊后解離.這里展示其中一次拉伸過程中的構(gòu)象演化(見圖4). 圖4(a)-(d)分別代表SMD進行到0、12、17和27 ns時FERM結(jié)構(gòu)域的構(gòu)象變化. ITAM-like序列(紅色,Tube模型)在拉伸過程中發(fā)生暴露.在拉伸的初始階段,FERM的α1C螺旋(紫色,NewRibbons模型)和α螺旋(藍色,New-Ribbons模型)都保持著螺旋狀態(tài)(見圖4(a));但拉伸進行到12 ns左右時α螺旋開始發(fā)生解折疊(見圖4(b));當α螺旋完全解折疊后,拉力繼續(xù)上升,一旦克服了能量障礙,α1C螺旋也接著發(fā)生部分解折疊(見圖4(c)、(d)),拉力能使α螺旋發(fā)生完全解折疊,卻不足以使α1C螺旋也發(fā)生完全解折疊.隨著局部結(jié)構(gòu)的解折疊,拉力持續(xù)上升至250~300 pN,此時復合物不敵外力而發(fā)生解離.

圖3 3次SMD過程中拉力和氫鍵的時間歷程Fig.3 Time-courses of force and H bond number in three SMD

2.4磷酸化位點Y205的暴露

2.4.1構(gòu)象分析

PSGL-1與FERM解離前的解折疊過程一方面驗證了PSGL-1與FERM復合物的牢固結(jié)合,另一方面也提示該解折疊過程可能有利于ITAM-like序列的打開以及其上磷酸化位點的暴露.通過對3次拉伸過程中ITAM-like序列及其磷酸化位點的模擬軌跡進行分析發(fā)現(xiàn):在PSGL-1/FERM復合物的構(gòu)象演變過程,FERM上的ITAM-like序列隨著解折疊的進行逐步被打開(見圖4).拉伸前,ITAM-like序列像一條蜷曲的繩子一樣,包埋在B子域和C子域之間并把B子域和C子域連接起來(見圖4(a));隨著拉伸的進行,C子域逐漸遠離B子域,此時ITAM-like序列像繩子一樣被“拉直”并被“抽離”出來,在復合物解離前,拉伸時間越長,拉力越大,ITAM-like序列被拉得越直,拉得越開,在溶劑中的暴露程度越大(見圖4(b)-(d)).

同時,原本包埋在FERM中的磷酸化位點Y205隨著解折疊的進行也不斷被暴露,與ITAM-like序列類似,在復合物解離前,拉伸時間越長,拉力越大,Y205的暴露程度越大(見圖5(a)-(d),分別代表SMD進行到0、10、20 和30 ns時FERM結(jié)構(gòu)域的構(gòu)象變化).3次SMD均能觀察到ITAM-like序列(紅色,Tube模型)和Y205(黃色,Licorice模型)的暴露,卻不能觀察到Y(jié)191(黃色,Licorice模型)的暴露,由始至終,Y191一直被包埋在蛋白質(zhì)里面,并且朝向都向內(nèi)(見圖5).

圖4 SMD過程中FERM結(jié)構(gòu)域的構(gòu)象變化Fig.4 Conformational changes of FERM domain during SMD

圖5 SMD過程中磷酸化位點Y205的暴露Fig.5 Exposition of phosphorylation site Y205 during SMD

2.4.2SASA值分析

為了探明外力對ITAM-like序列、Y191和Y205暴露程度的影響,以半徑為0.14 nm的水分子作為探針分子,對三者在靜態(tài)、無外力動態(tài)平衡過程及有外力拉伸過程的SASA值進行計算和跟蹤分析.在靜態(tài)的晶體結(jié)構(gòu)中,ITAM-like序列、Y191和Y205的SASA值分別為6.308、0.032和0.395 nm2,表明靜態(tài)條件下ITAM-like序列及其磷酸化位點周圍確實存在較大空間位阻.

圖6展示的是50 ns平衡和3次恒速度拉伸中ITAM-like序列、Y191和Y205的SASA時間歷程.可以看出,無外力作用的平衡過程中三者的SASA值都基本處于平均值上下,波動幅度不大,說明平衡過程中三者并未發(fā)生暴露(見圖6(a)、(e)、(i)).而它們在3次恒速度拉伸時SASA值的時間歷程則表現(xiàn)了很大的區(qū)別:ITAM-like序列(見圖6(b)-(d))和Y205(見圖6(j)-(l))的SASA值都有明顯的增大,前者從最初的8.00 nm2最大能增加到13.00 nm2左右,后者從最初的0.35 nm2最大能增加到1.80 nm2左右,且波動幅度加?。坏玒191的SASA值相對變化不大,一直保持在0.18 nm2以下(見圖6(f)-(h)).

筆者進一步對三者平衡及恒速度拉伸過程的SASA值進行統(tǒng)計分析,用平均值和標準誤差表示,發(fā)現(xiàn):ITAM-like序列在平衡及拉伸過程的值分別為(7.703 2±0.034 2) nm2和(9.379 0±0.075 5) nm2,SASA增加約22%,u檢驗結(jié)果為P<0.01,兩者具有極顯著的統(tǒng)計學差異;Y205的SASA值分別為(0.391 2±0.007 0) nm2和(0.683 9±0.021 3) nm2,SASA增加近75%,兩者之間統(tǒng)計學差異極其顯著;Y191的SASA值分別為(0.047 9±0.001 6) nm2和(0.042 0±0.002 3) nm2,雖然兩者之間差異有統(tǒng)計學意義(0.01

以上結(jié)果顯示,力是促使ITAM-like序列磷酸化并招募Syk的重要條件:血流環(huán)境下,PSGL-1胞外區(qū)不斷受到流體剪應(yīng)力和選擇素的作用,并通過胞內(nèi)域把力學信號傳遞給ERM蛋白,使原本包埋在蛋白里的ITAM-like序列特別是Y205發(fā)生暴露,增大了其被磷酸化并與Syk結(jié)合的可能性,為ERM蛋白招募Syk提供了條件.

圖6 平衡和SMD過程中SASA的時間歷程Fig.6 Time-courses of SASAs in equilibrium and three SMD

3討論

ITAM最初被定義為T細胞受體、B細胞受體和Fc受體胞質(zhì)尾信號鏈的共同序列.如今,YxxL/Ix(6-12)YxxL/I序列在許多受體和跨膜蛋白的胞內(nèi)區(qū)被發(fā)現(xiàn),并在下游的信號傳導中扮演著關(guān)鍵的角色[21].當受體受刺激以后,ITAM序列通常先被Src家族激酶酪氨酸磷酸化,然后含有SH2結(jié)構(gòu)域的蛋白(主要是Syk酪氨酸激酶家族)會結(jié)合到磷酸化的ITAM上[22-23],所以ITAM序列磷酸化位點的暴露對于啟動下游信號至關(guān)重要.PSGL-1的胞內(nèi)域缺乏傳統(tǒng)的ITAM序列,但可以通過其胞內(nèi)近膜端與帶有非傳統(tǒng)的ITAM-like序列的ERM蛋白結(jié)合而招募Syk[3,12].同時PSGL-1又是一個力學傳感器,能轉(zhuǎn)導外部血流的力學信號,而目前對于力如何與化學信號耦合在PSGL-1/ERM招募Syk中的作用尚不清楚.因此,筆者采用分子動力學模擬的方法,通過比較PSGL-1/FERM復合物平衡過程與拉伸過程中接觸面殘基的相互作用和構(gòu)象變化,希望在原子水平上再現(xiàn)血流環(huán)境所呈遞的力學影響,探明力學信號在ERM蛋白招募Syk中的作用和尋找可能的分子結(jié)構(gòu)機制.

晶體結(jié)構(gòu)分析表明,PSGL-1與ERM蛋白結(jié)合是比較牢固的,且在整個動態(tài)平衡過程中始終保持了較高的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性(見圖2(a))和氫鍵生存率(見表1),氫鍵數(shù)目也十分保守(見圖2(b)),從一個側(cè)面證明PSGL-1/ERM復合物在信號傳導過程中的重要作用.無論在靜態(tài)晶體結(jié)構(gòu)還是動態(tài)平衡過程中,ERM蛋白ITAM-like序列上兩個磷酸化位點Y191和Y205都是包埋在FERM里面的(見圖1(b),圖6(a)、(e)、(i)),由于空間位阻效應(yīng),即使Syk與之相遇也很難實現(xiàn)對其的磷酸化過程.然而在外力作用下,復合物構(gòu)象不再穩(wěn)定,ERM蛋白會發(fā)生一個先解折疊、后解離的過程(見圖4).在解折疊過程中ITAM-like序列和Y205會隨著拉伸的進行逐漸被暴露(見圖4、5),相應(yīng)地,ITAM-like序列和Y205的SASA也顯著增大(見圖6),說明拉力會有效促進ITAM-like序列和Y205的暴露,為磷酸化和招募Syk提供了可能.

PSGL-1通過其ERM蛋白結(jié)合區(qū)與ERM蛋白FERM結(jié)構(gòu)域的C子域相結(jié)合[14],所以在恒速度拉伸過程中力首先經(jīng)由PSGL-1傳遞至C子域,使其逐漸遠離B子域,而ITAM-like序列作為連接B子域和C子域的鉸鏈,伴隨著C子域的遠離逐漸像繩子一樣被“拉直”被“抽離”出來,最終很大程度地暴露于溶劑中(見圖4).Y205位于ITAM-like序列上,被C子域包埋,并且比較靠近PSGL-1/FERM結(jié)合區(qū),拉力使C子域在拉伸過程“打散”,導致了Y205的暴露(見圖5).構(gòu)象分析和SASA變化都表明,Y191始終被包埋在蛋白里面,這很可能是因為Y191的朝向一直向內(nèi)并遠離PSGL-1/FERM結(jié)合區(qū),加上其周圍存在比較復雜的構(gòu)象環(huán)境,使力學信號很難傳遞到Y(jié)191使之暴露.

4結(jié)語

本研究提出了一個力-化學耦合過程:在炎癥發(fā)生過程中,選擇素/PSGL-1的結(jié)合介導白細胞在內(nèi)皮細胞上的快速滾動,并通過PSGL-1胞內(nèi)域把力學信號傳導給ERM蛋白,使原本包埋在FERM的ITAM-like序列特別是磷酸化位點Y205逐步暴露,為其磷酸化并與Syk的結(jié)合提供了最大的空間可能.本研究揭示了一條經(jīng)由PSGL-1胞內(nèi)域激活Syk的力學信號通路,并且在原子層面上對于PSGL-1/ERM/Syk之間的相互作用給予了闡釋,這為PSGL-1/ERM/Syk介導的下游信號的深入研究以及基于三者結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計和篩選提供了重要參考.

參考文獻:

[1]LEY K,LAUDANNA C,CYBULSKY M I,et al. Getting to the site of inflammation:the leukocyte adhesion cascade updated [J]. Nature Reviews Immunology,2007,7(9):678-689.

[2]WALCHECK B,MOORE K L,MCEVER R P,et al. Neutrophil-neutrophil interactions under hydrodynamic shear stress involve L-selectin and PSGL-1. a mechanism that amplifies initial leukocyte accumulation of P-selectin in vitro [J]. Journal of Clinical Investigation,1996,98(5):1081.

[3]URZAINQUI A,SERRADOR J M,VIEDMA F,et al. ITAM-based interaction of ERM proteins with Syk me-diates signaling by the leukocyte adhesion receptor PSGL-1 [J]. Immunity,2002,17(4):401-412.

[4]ABBAL C,LAMBELET M,BERTAGGIA D,et al. Lipid raft adhesion receptors and Syk regulate selectin-depen-dent rolling under flow conditions [J]. Blood,2006,108(10):3352-3359.

[5]WANG H-B,WANG J-T,ZHANG L,et al. P-selectin primes leukocyte integrin activation during inflammation[J]. Nature Immunology,2007,8(8):882-892.

[6]ZARBOCK A,ABRAM C L,HUNDT M,et al. PSGL-1 engagement by E-selectin signals through Src kinase Fgr and ITAM adapters DAP12 and FcRγ to induce slow leukocyte rolling [J]. The Journal of Experimental Medicine,2008,205(10):2339-2347.

[7]MINER J J,XIA L,YAGO T,et al. Separable requirements for cytoplasmic domain of PSGL-1 in leukocyte rolling and signaling under flow [J]. Blood,2008,112(5):2035-2045.

[8]YAGO T,SHAO B,MINER J J,et al. E-selectin engages PSGL-1 and CD44 through a common signaling pathway to induce integrin alphaLbeta2-mediated slow leukocyte rol-ling [J]. Blood,2010,116(3):485-494.

[9]ZARBOCK A,LOWELL C A,LEY K. Spleen tyrosine kinase Syk is necessary for E-selectin-induced alpha(L)beta(2) integrin-mediated rolling on intercellular adhesion molecule-1 [J]. Immunity,2007,26(6):773-783.

[10]SUZUKI-INOUE K,FULLER G L,GARCíA,et al. A novel Syk-dependent mechanism of platelet activation by the C-type lectin receptor CLEC-2 [J]. Blood,2006,107(2):542-549.

[11]UNDERHILL D M,ROSSNAGLE E,LOWELL C A,et al. Dectin-1 activates Syk tyrosine kinase in a dynamic subset of macrophages for reactive oxygen production [J]. Blood,2005,106(7):2543-2550.

[12]SERRADOR J M,URZAINQUI A,ALONSO-LEBRERO J L,et al. A juxta-membrane amino acid sequence of P-selectin glycoprotein ligand-1 is involved in moesin binding and ezrin/radixin/moesin-directed targeting at the trailing edge of migrating lymphocytes [J]. European Journal of Immunology,2002,32(6):1560-1566.

[13]POLESELLO C,PAYRE F. Small is beautiful:what flies tell us about ERM protein function in development [J]. Trends in Cell Biology,2004,14(6):294-302.

[14]TAKAI Y,KITANO K,TERAWAKI S I,et al. Structural basis of PSGL-1 binding to ERM proteins [J]. Genes to Cells,2007,12(12):1329-1338.

[15]ALON R,DUSTIN M L. Force as a facilitator of integrin conformational changes during leukocyte arrest on blood vessels and antigen-presenting cells [J]. Immunity,2007,26(1):17-27.

[16]SCHAFF U Y,YAMAYOSHI I,TSE T,et al. Calcium flux in neutrophils synchronizes beta2 integrin adhesive and signaling events that guide inflammatory recruitment [J]. Annals of Biomedical Engineering,2008,36(4):632-646.

[17]NEHA D,ITSUKYO Y,ARI N,et al. Migrational gui-dance of neutrophils is mechanotransduced via high-affinity LFA-1 and calcium flux [J]. Journal of Immuno-logy,2011,187(1):472-481.

[18]HUMPHREY W,DALKE A,SCHULTEN K. VMD:vi-sual molecular dynamics [J]. Journal of Molecular Graphics,1996,14(1):33-38.

[19]PHILLIPS J C,BRAUN R,WANG W,et al. Scalable molecular dynamics with NAMD [J]. Journal of Computational Chemistry,2005,26(16):1781-1802.

[20]MACKERELL A D,BASHFORD D,BELLOTT M,et al. All-atom empirical potential for molecular modeling and dynamics studies of proteins [J]. The Journal of Physical Chemistry B,1998,102(18):3586-3616.

[21]ABRAM C L,LOWELL C A. The expanding role for ITAM-based signaling pathways in immune cells [J]. Science's STKE :Signal Transduction Knowledge Environment,2007,2007(377):re2.

[22]BERTON G,MOCSAI A,LOWELL C A. Src and Syk kinases:key regulators of phagocytic cell activation [J]. Trends in Immunology,2005,26(4):208-214.

[23]FüüTTERER K,WONG J,GRUCZA R A,et al. Structural basis for Syk tyrosine kinase ubiquity in signal transduction pathways revealed by the crystal structure of its regulatory SH2 domains bound to a dually phosphorylated ITAM peptide [J]. Journal of Molecular Biology,1998,281(3):523-537.

Exposition of Phosphotyrosine Site on ITAM-like Motif of ERM Proteins Mediated by Force Through PSGL-1

WUJian-huaKUANGXiao-minLIUWen-pingFANGYing

(School of Biological Science and Engineering, South China University of Technology, Guangzhou 510006, Guangdong, China)

Abstract:P-selectin glycoprotein ligand 1 (PSGL-1) engaged by ezrin-radixin-moesin (ERM) proteins plays an important role in recruiting spleen tyrosine kinase (Syk) and activating leukocyte in the process of inflammatory response.Firstly, the crystal structure of radixin FERM domain indicates that the steric effect on ITAM-like motif and phosphorylation sites (Y191 and Y205) can hamper their phosphorylation by Src family tyrosine kinase and their combination with Syk.Then, steered molecular dynamics (SMD) simulation is carried out to explore the interaction between the complex of PSGL-1 juxtamembrane peptide and radixin FERM domain under force load.Both conformation analysis and solvent accessible surface variant show that the mechanical signal transmitting through PSGL-1 cytoplasmic region can mediate the exposition of phosphotyrosine site Y205 on ITAM-like motif of radixin.The results of this study present a mechanical signal pathway from PSGL-1 cytoplasmic region to Syk and expound the interaction mechanism of PSGL-1/ERM/Syk at atomic level.

Key words:PSGL-1; ERM protein; Syk;ITAM-like motif; steered molecular dynamics

收稿日期:2015- 09- 07*基金項目: 國家自然科學基金資助項目(31170887,11272125,11432006)

Foundation items: Supported by the National Natural Science Foundation of China (31170887,11272125,11432006)

作者簡介:吳建華(1959-) ,男,博士,教授,博士生導師,主要從事細胞與分子生物力學研究.E-mail:wujianhua@scut.edu.cn ? 通信作者: 方穎(1966-),女,副教授,主要從事細胞與分子生物力學研究.E-mail:yfang@scut.edu.cn

中圖分類號:Q66

doi:10.3969/j.issn.1000-565X.2016.03.018

猜你喜歡
子域氫鍵復合物
教材和高考中的氫鍵
基于鏡像選擇序優(yōu)化的MART算法
電子學報(2022年2期)2022-04-18 14:42:24
基于子域解析元素法的煤礦疏降水量預(yù)測研究
煤炭工程(2021年7期)2021-07-27 09:34:20
BeXY、MgXY(X、Y=F、Cl、Br)與ClF3和ClOF3形成復合物的理論研究
柚皮素磷脂復合物的制備和表征
中成藥(2018年7期)2018-08-04 06:04:18
一種基于壓縮感知的三維導體目標電磁散射問題的快速求解方法
物理學報(2018年10期)2018-06-14 08:48:48
黃芩苷-小檗堿復合物的形成規(guī)律
中成藥(2018年3期)2018-05-07 13:34:18
二水合丙氨酸復合體內(nèi)的質(zhì)子遷移和氫鍵遷移
銥(Ⅲ)卟啉β-羥乙與基醛的碳氫鍵活化
鐵氧化物-胡敏酸復合物對磷的吸附
抚州市| 新乐市| 封丘县| 重庆市| 七台河市| 玉山县| 元氏县| 高青县| 延川县| 兴城市| 楚雄市| 大安市| 五华县| 修文县| 永登县| 棋牌| 鄂伦春自治旗| 太白县| 霍山县| 通化市| 阿拉善左旗| 梓潼县| 加查县| 尉氏县| 鸡东县| 屏边| 奉贤区| 梨树县| 乌苏市| 宣恩县| 九龙城区| 三穗县| 南昌市| 沙田区| 镇康县| 黔南| 正镶白旗| 枝江市| 鹰潭市| 定州市| 察哈|