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23株耐碳青霉烯類腸桿菌科細菌耐藥基因分析

2016-05-10 06:54:56劉萍閆雪苗張堅磊穆紅
山東醫(yī)藥 2016年24期
關(guān)鍵詞:烯酶烯類克雷伯

劉萍,閆雪苗,張堅磊,穆紅

(1天津市第一中心醫(yī)院,天津300192;2天津醫(yī)科大學)

23株耐碳青霉烯類腸桿菌科細菌耐藥基因分析

劉萍1,閆雪苗2,張堅磊1,穆紅1

(1天津市第一中心醫(yī)院,天津300192;2天津醫(yī)科大學)

目的 分析耐碳青霉烯類腸桿菌科細菌(CRE)的耐藥情況及其耐藥基因,為臨床防治CRE感染提供依據(jù)。方法 收集23株CRE,采用全自動微生物分析系統(tǒng)行菌株鑒定和藥敏試驗,采用改良Hodge試驗檢測碳青霉烯酶表型,PCR擴增和基因測序技術(shù)檢測其耐藥相關(guān)基因(包括blaKPC、blaNDM、blaOXA、blaVIM、blaIMP)及分布。結(jié)果 23株CRE中,肺炎克雷伯菌11株,大腸埃希菌7株,陰溝腸桿菌2株,產(chǎn)酸克雷伯桿菌2株,枸櫞酸桿菌1株。藥敏試驗結(jié)果顯示,對碳青霉烯類抗生素亞胺培南的耐藥率為95.65%,對美羅培南的耐藥率為86.95%;23株菌株均對哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、頭孢哌酮/舒巴坦耐藥,耐藥率為100%;對阿米卡星的耐藥率為65.21%,對環(huán)丙沙星的耐藥率為86.96%,對氨曲南的耐藥率為91.30%。改良Hodge試驗陽性16株、陰性7株。PCR法檢出blaKPC型基因6株、blaNDM型基因6株、blaOXA型基因9株、blaVIM型基因2株,未檢出blaIMP型基因。結(jié)論 23株CRE對多種抗生素耐藥率均較高,其主要耐藥基因型為OXA、KPC、NDM、VIM型碳青霉烯酶基因。

碳青霉烯酶腸桿菌科細菌;藥物敏感試驗;耐藥基因

碳青霉烯類抗菌藥物(如亞胺培南、美羅培南等)是β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物,具有抗菌譜廣、抗菌活性強等特點。但近年來由于碳青霉烯類抗菌藥物的濫用,導致其耐藥菌株廣泛蔓延,尤其耐碳青霉烯類腸桿菌科細菌(CRE)的出現(xiàn),使碳青霉烯類抗菌藥物作為抗腸桿菌科細菌用藥受到?jīng)_擊。CRE的耐藥機制極為復雜,已在世界范圍內(nèi)引起廣泛關(guān)注[1,2]。2010年1月~2015年2月,我們分離了23株不重復的CRE,并檢測其耐藥相關(guān)基因?,F(xiàn)分析結(jié)果,旨在為臨床防治CRE感染提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料 收集同期天津市第一中心醫(yī)院從臨床送檢標本中分離出的23株CRE,不包括同一患者、同一部位、同一時期分離的重復菌株。細菌標本來源:痰液、尿液、膽汁、引流液、腹水、咽拭子及靜脈血。試劑及儀器:Premix Taq、DNA Marker(DL-2000),日本TaKaRa公司;Vitek-2 Compact全自動微生物分析系統(tǒng),法國生物梅里埃公司;ABI7500 PCR儀,美國ABI公司;電泳儀、凝膠成像分析系統(tǒng),美國Bio-Rad公司。

1.2 實驗方法

1.2.1 菌株鑒定和藥敏試驗 收集所有菌株,參照《全國臨床檢驗操作規(guī)程》,采用Vitek-2 Compact全自動微生物分析系統(tǒng)進行細菌分離、鑒定。同時對菌株進行藥敏試驗,觀察其對哌拉西林、哌拉西林/舒巴坦、頭孢哌酮/舒巴坦、頭孢他啶、亞胺培南、美羅培南、阿米卡星、環(huán)丙沙星、氨曲南的耐藥情況。質(zhì)控菌株為大腸埃希菌ATCC25922。

1.2.2 碳青霉烯酶表型檢測 采用改良Hodge試驗。使用無菌生理鹽水將大腸埃希菌ATCC25922菌懸液調(diào)至0.5麥氏濁度,1∶10稀釋后接種于M-H瓊脂平板,干燥3~10 min,在平板中心貼敷含10 μg厄他培南的紙片,用接種環(huán)挑取3~5個待測菌株從紙片邊緣向平板邊緣劃線,長度20~25 mm,35 ℃溫箱孵育16~20 h。若待測菌產(chǎn)碳青霉烯酶,其接種線與大腸埃希菌菌ATCC25922抑菌環(huán)交界處會產(chǎn)生向抑菌圈內(nèi)增強生長的現(xiàn)象,即改良Hodge試驗陽性;反之則為陰性。陽性質(zhì)控株為Hodge(+)肺炎克雷伯菌,陰性質(zhì)控菌株為肺炎克雷伯菌ATCC700603。

1.2.3 細菌耐藥相關(guān)基因檢測 收集細菌接種至血瓊脂平板,置于孵箱內(nèi)35 ℃過夜,分離培養(yǎng)獲得單個菌落。挑取單個菌落,加入50 μL無菌雙蒸水混勻,100 ℃沸水浴10 min,裂解細菌釋放DNA,12 000 r/min離心5 min,檢測上清液OD260/OD280,計算DNA含量,所得上清液分裝并-20 ℃保存?zhèn)溆?。根?jù)GenBank數(shù)據(jù)庫收錄的序列設計引物,擴增碳青霉烯酶基因片段,包括blaKPC、blaNDM、blaOXA、blaVIM、blaIMP基因。擴增引物:blaKPC:上游引物5′-TGTCACTGTATCGCCGTC-3′,下游引物5′-CTCAGTGCTCTACAGAAAACC-3′,片段長度900 bp;blaNDM:上游引物5′-GCAGCTTGTCGGCCATGCGGGC-3′,下游引物5′-GGTCGCGAAGCTGAGCACCGCAT-3′,片段長度782 bp;blaOXA:上游引物5′-GCGTGGTTAAGGATGAACAC-3′,下游引物5′-CATCAAGTTCAACCCAACCG-3′,片段長度438 bp;blaVIM基因:上游引物5′-GTTTGGTCGCATATCGCAAC-3′,下游引物5′-AATGCGCAGCACCAGGATAG-3′,片段長度389 bp;blaIMP:上游引物5′-GAAGGCGTTTATGTTCATAC-3′,下游引物5′-GTACGTTTCAAGAGTGATGC-3′,片段長度587 bp。反應體系為25 μL,引物終濃度分別為blaKPC、blaVIM、blaIMP為0.3 μmol/L,blaNDM為0.4 μmol/L,blaOXA為0.5 μmol/L,模板量為1 μL。擴增條件:95 ℃預變性5 min,95 ℃變性45 s、60 ℃退火45 s、72 ℃延伸1 min,共35個循環(huán),最后72 ℃延伸8 min。將擴增出的序列送上海立菲生物技術(shù)有限公司北京分公司測序,結(jié)果經(jīng)美國國家生物技術(shù)信息中心行基本局部對比搜索工具(Blast)比對。

2 結(jié)果

2.1 菌株鑒定及藥敏試驗 本研究共收集CRE 23株,其中肺炎克雷伯菌11株、大腸埃希菌7株、陰溝腸桿菌2株、產(chǎn)酸克雷伯桿菌2株、枸櫞酸桿菌1株。藥敏試驗結(jié)果顯示,對碳青霉烯類抗生素亞胺培南耐藥22株、中介1株,耐藥率為95.65%;對美羅培南耐藥20株、中介3株,耐藥率為86.95%;23株菌株均對哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、頭孢哌酮/舒巴坦耐藥,耐藥率為100%;對阿米卡星耐藥15株,耐藥率為65.21%;對環(huán)丙沙星耐藥20株,耐藥率為86.96%;對氨曲南耐藥21株,耐藥率為91.30%。

2.2 碳青霉烯酶表型 23株CRE中,改良Hodge試驗陽性16株、陰性7株,陽性率為69.56%。

2.3 細菌耐藥相關(guān)基因 23株CRE均擴增出陽性條帶。其中blaOXA型基因9株,陽性率為39.13%;blaKPC型基因6株,陽性率為26.09%;blaNDM型基因6株,陽性率為26.09%;blaVIM型基因2株,陽性率為8.70%;未擴增出blaIMP型基因。擴增出的序列經(jīng)Blast軟件(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)比對,證實為KPC、NDM、OXA、VIM型碳青霉烯酶基因。各菌株耐藥基因型分布見表1。

表1 23株CRE耐藥基因型分布(株)

注:“-”表示該菌株無對應的耐藥基因型。

3 討論

近年來,隨著廣譜抗菌藥物的廣泛使用,細菌耐藥性尤其是多重耐藥性給抗感染治療帶來巨大困難,已成為全球關(guān)注的重要公共衛(wèi)生問題之一。CRE已有許多國家和地區(qū)報道,我國某些地區(qū)也出現(xiàn)過耐碳青霉烯類藥物的肺炎克雷伯菌暴發(fā)流行。其耐藥機制主要有產(chǎn)生碳青霉烯酶、主動外排系統(tǒng)活躍、產(chǎn)生ESBLs或AmpC酶、外膜蛋白的缺失或數(shù)量減少,其中產(chǎn)碳青霉烯酶是主要耐藥機制[3,4]。

本研究從臨床送檢標本中分離出23株CRE,其中肺炎克雷伯菌11株、大腸埃希菌7株,與紀明宇等[5]報道的耐藥菌株流行情況基本一致。藥敏試驗結(jié)果顯示,對碳青霉烯類抗生素亞胺培南的耐藥率為95.65%,對美羅培南的耐藥率為86.95%;對頭孢菌素類抗生素頭孢他啶、頭孢哌酮/舒巴坦、半合成青霉素類抗生素哌拉西林全部耐藥;對阿米卡星的耐藥率為65.21%;對環(huán)丙沙星的耐藥率為86.96%,對氨曲南的耐藥率為91.30%。表明23株CRE均表現(xiàn)為多重耐藥且耐藥率均較高。

改良Hodge試驗是美國臨床實驗室標準化協(xié)會(CLSI)推薦的碳青霉烯酶表型檢測方法[6,7]。改良Hodge試驗基于產(chǎn)酶菌株對美洛培南或厄他培南的耐藥,是CLSI推薦的檢測碳青霉烯酶表型的惟一篩查方法。本研究23株CRE,改良Hodge試驗陽性16株。其陽性菌株較少的原因可能與某些菌株的碳青霉烯酶產(chǎn)量較低有關(guān)。

目前,在腸桿菌科細菌中,已發(fā)現(xiàn)的碳青霉烯酶主要是A、B、D類酶[8]。A類碳青霉烯酶水解碳青霉烯類、頭孢菌素類、青霉素類和氨曲南等抗菌藥物,包括SME、IMI、NMC、GES和KPC型等,其中KPC型最多[9]。KPC型碳青霉烯酶可水解碳青霉烯酶類抗菌藥物的β-內(nèi)酰胺酶,迄今為止全球已發(fā)現(xiàn)13個亞型[10]。我國自2007年起陸續(xù)有腸桿菌科細菌產(chǎn)KPC型碳青霉烯酶的報道,且主要為產(chǎn)KPC-2型[11]。本研究23株CRE菌株中,有7株攜帶blaKPC基因,可見KPC型碳青霉烯酶基因檢出率較高。這7株菌均對碳青霉烯酶類、青霉素類、頭孢菌素類和氨曲南等抗菌藥物耐藥,其耐藥機制可能與A類碳青霉烯酶的水解機制有關(guān)。B類酶包括IMP、VIM和NDM等金屬酶[12,13],其活性位點有Zn2+,能滅活青霉素類、頭孢菌素類和碳青霉烯酶類抗生素,對氨曲南無水解活性。本研究23株CRE中,2株攜帶blaVIM基因,均為陰溝腸桿菌;6株攜帶blaNDM基因,4株為大腸埃希菌、1株為肺炎克雷伯菌、1株為產(chǎn)酸克雷伯菌;均對碳青霉烯類抗菌藥物耐藥,只有1株產(chǎn)酸克雷伯菌對氨曲南敏感,其他均耐藥。在腸桿菌科細菌中發(fā)現(xiàn)D類酶中的OXA型酶,且不同細菌產(chǎn)OXA型酶亦不相同[14]。該類酶的底物譜狹窄,不能水解廣譜頭孢菌素和氨曲南,對亞胺培南的親合力較高[15]。但水解效能較低,其耐藥性表現(xiàn)有賴于膜通透性降低等其他耐藥機制的協(xié)同作用[16,17]。本研究檢測到9株OXA型酶菌株。這些菌株對碳青霉烯類、頭孢菌素類、青霉素類和氨曲南以及氟喹諾酮類等抗菌藥物均呈現(xiàn)耐藥趨勢。

本院23株CRE的耐藥基因主要為KPC型、NDM型和OXA型碳青霉烯酶基因,為我院CRE院內(nèi)感染的防控提供了依據(jù)。

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國家臨床重點??平ㄔO項目(2013-544)。

穆紅(E-mail: tjmuhong@sina.com)

10.3969/j.issn.1002-266X.2016.24.035

R37

B

1002-266X(2016)24-0091-03

2015-08-10)

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