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DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因多態(tài)性與自身免疫性疾病關(guān)系的研究進展

2016-04-06 01:34:12姚承佼鐘曉武黃翠平青玉鳳周京國
山東醫(yī)藥 2016年4期
關(guān)鍵詞:DNA甲基化單核苷酸多態(tài)性

姚承佼,鐘曉武,2,黃翠平,青玉鳳,周京國,2

(1川北醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院,四川南充 637007;2川北醫(yī)學(xué)院風(fēng)濕免疫研究所)

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·綜述·

DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因多態(tài)性與自身免疫性疾病關(guān)系的研究進展

姚承佼1,鐘曉武1,2,黃翠平1,青玉鳳1,周京國1,2

(1川北醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院,四川南充 637007;2川北醫(yī)學(xué)院風(fēng)濕免疫研究所)

摘要:DNA甲基化是最常見的表觀遺傳修飾形式,在調(diào)控基因表達、維持基因組穩(wěn)定中起著極其重要的作用。DNA甲基轉(zhuǎn)移酶是催化并維持這一過程的一類酶,其單核苷酸多態(tài)性可導(dǎo)致DNA甲基轉(zhuǎn)移酶構(gòu)型、功能異常,進而影響基因組DNA甲基化水平,并通過多種機制導(dǎo)致自身免疫性疾病的發(fā)生、發(fā)展。本文以系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、免疫性血小板減少癥等常見自身免疫性疾病為例,重點闡述DNA甲基轉(zhuǎn)移酶單核苷酸多態(tài)性與免疫性疾病易感性的關(guān)系。

關(guān)鍵詞:DNA甲基化;DNA甲基轉(zhuǎn)移酶;單核苷酸多態(tài)性;自身免疫性疾病

自身免疫性疾病是由自身免疫反應(yīng)所導(dǎo)致相應(yīng)組織、器官損傷或功能障礙的一系列疾病,其病因不明,現(xiàn)普遍認為是環(huán)境、遺傳、基因表達共同作用的結(jié)果。人類基因組計劃、單核苷酸多態(tài)性(SNP)計劃和單倍型圖譜計劃等深入研究發(fā)現(xiàn),機體本身的遺傳因素與復(fù)雜性疾病的發(fā)生、發(fā)展有著重要的作用,復(fù)雜性疾病的易感性及個體差異主要是由基因組SNP所致。DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)基因多態(tài)性、DNA甲基化異常與自身免疫性疾病有著密切關(guān)系。本文就當前對于DNMTs基因多態(tài)性的生物學(xué)作用及其與自身免疫性疾病中的關(guān)系作一綜述。

1DNMTs的特點及作用方式

DNA甲基化是常見的表觀遺傳學(xué)修飾形式,指生物體在不改變堿基序列的前提下,利用DNMTs的催化作用,將S-腺苷甲硫氨酸的甲基供體轉(zhuǎn)移到胞嘧啶5-碳分子上形成5-甲基化胞嘧啶[1]。DNA甲基化主要發(fā)生在二核苷酸胞嘧啶(CpG)的胞嘧啶,70%~80%的CpG位點發(fā)生DNA甲基化修飾,位于5′端啟動子區(qū)的CpG島(CpG富集區(qū)域)是非甲基化的[2]。DNA甲基化與基因表達負相關(guān),高甲基化抑制表達,低甲基化促進表達,一定程度的DNA低甲基化可造成免疫細胞的異?;钴S。DNA甲基化有維持甲基化和從頭甲基化兩種方式。兩種DNA甲基化反應(yīng)分別由不同DNMTs催化完成。

DNMTs是負責(zé)催化并維持DNA甲基化的一類酶,這種維持作用可通過細胞增殖穩(wěn)定傳遞給子代。目前發(fā)現(xiàn)的DNMTs共五種:DNMT1、DNMT2、DNMT3A、DNMT3B、DNMT3L。DNMT1負責(zé)維持甲基化[3],基因位于染色體19p13.2,由40個外顯子拼接而成,C端為催化區(qū)域,N端為蛋白識別區(qū)域。DNMT2為天門冬氨酸t(yī)RNA的甲基轉(zhuǎn)移酶,具有微弱的DNA甲基轉(zhuǎn)移酶活性。DNMT3A和DNMT3B基因分別位于2p23.3和20q11.2,兩者結(jié)構(gòu)域相似,負責(zé)從頭合成甲基化[4],DNMT3A負責(zé)修飾裸露DNA,DNMT3B負責(zé)核小體核心部位DNA甲基化。DNMT3L缺少C端催化活性區(qū)域,沒有單獨的催化活性,可作為調(diào)節(jié)因子與DNMT3相互作用提高前者的催化活性[5,6]。DNMTs在生物體生長發(fā)育不同時期、不同細胞表達不同,其表達異常與系統(tǒng)性紅斑狼瘡T/B淋巴細胞激活、系統(tǒng)性硬化癥的成纖維細胞表型異常以及抑癌基因高甲基化關(guān)系密切[7~9],可通過多途徑參與自身免疫性疾病、腫瘤、心腦血管疾病等的發(fā)病[10]。然而,DNMTs作為DNA甲基化的催化物,其本身也受到DNA甲基化作用的調(diào)控。Fatemi等[11]發(fā)現(xiàn),相對于非甲基化的底物,DNMT1對半甲基化底物的活性要高7~100倍。在DNA甲基化過程中,DNMT家族相互協(xié)調(diào),共同維持機體正常DNA甲基化狀態(tài),DNMT1是DNMT3啟動CPG島新甲基化的基礎(chǔ),DNMT3同時使甲基化提高到正常水平。

2DNMTs基因多態(tài)性

SNP是在基因組水平上單個核苷酸變異引起的DNA序列多態(tài)性。哺乳動物SNP中T取代C占一半以上,可能因為5-甲基化胞嘧啶可自發(fā)脫氨基形成胸腺嘧啶。研究發(fā)現(xiàn),人體內(nèi)的DNMTs共檢測到100多種不同的SNP現(xiàn)象,其中DNMT3B基因啟動子區(qū)域-149位點T取代C突變,可使DNMT3B的活性增加約30%[12];DNMT3B-579位點G取代T可增加DNMT3B酶活性[13];DNMT3B基因啟動子區(qū)域-448位點A取代G相比基因啟動子區(qū)域-283T取代C可使DNMT3B酶活性增加大于2倍;DNMT3B基因啟動子區(qū)域-283位點T攜帶者酶活性遠遠低于C攜帶者。同時研究還發(fā)現(xiàn),SNP存在種族和地域分布差異,如DNMT3B基因啟動子區(qū)域-149位點SNP與高加索人結(jié)直腸癌易感性密切相關(guān),而此位點與中國人結(jié)直腸癌患病無明顯相關(guān)性[14]。

3DNMTs基因多態(tài)性與自身免疫性疾病

3.1系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)SLE是一種大量的自身抗體產(chǎn)生誘發(fā)自身免疫反應(yīng),攻擊靶器官引起全身多臟器受損的自身免疫性疾病。SLE患者DNMT1活性較正常人群下降60%。徐金華等[15]研究發(fā)現(xiàn),SLE患者DNMT1內(nèi)含子7的21397位CC純合子較正常人明顯增加,分析認為低甲基化的胞嘧啶不能自發(fā)地脫氨基轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶,導(dǎo)致終產(chǎn)物三維構(gòu)型變化而影響DNMT1的催化活性,繼而進一步影響胞嘧啶脫氨基作用,如此惡性循環(huán)造成DNA低甲基化。DNA低甲基化可能通過以下機制致?。孩僖餋D70、CD11a、IL-4、IL-6、LFA-1等異常表達,激活自身反應(yīng)性T淋巴細胞,促進B淋巴細胞活化[16];②激活的自身反應(yīng)性T淋巴細胞可介導(dǎo)巨噬細胞被大量殺傷,導(dǎo)致自身抗體增加、免疫復(fù)合物沉積[15,17];③激活人類內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(HERV)序列,激發(fā)T和B記憶淋巴細胞產(chǎn)生抗DNA抗體致病[18,19];④誘導(dǎo)失活的X染色體CD40L基因高表達,促進B淋巴細胞活化,是女性易患SLE的重要原因之一[20]。由此推斷,DNMTs的SNP降低其催化活性,導(dǎo)致DNA低甲基化可能成為SLE發(fā)病的觸發(fā)點。Park等[21]研究發(fā)現(xiàn),DNMT1基因SNP在正常人和SLE患者中的分布并沒有明顯差異,DNMT1基因SNP與SLE沒有明確聯(lián)系。徐金華和Byung兩個實驗結(jié)果在中國人和韓國人中產(chǎn)生了截然相反的結(jié)論。同樣相反的結(jié)果也出現(xiàn)在DNMT1基因單核苷酸多態(tài)性對中國、高加索、歐洲女性乳腺癌的相關(guān)分析中,兩者相關(guān)性分別為相關(guān)、相關(guān)、無關(guān)[22]。分析認為這些相反的結(jié)論產(chǎn)生可能由于種族差異、實驗誤差、病例差異等造成。目前,DNMTs基因SNP與SLE易感性的相關(guān)研究及其在不同人種中的分布、作用還有待進一步深入研究,以闡明SLE發(fā)病機制,為尋找治療SLE的新途徑提供線索。

3.2類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)RA是以關(guān)節(jié)滑膜炎為主的自身免疫性疾病,最終可出現(xiàn)關(guān)節(jié)的強直、畸形、毀損[23]。研究發(fā)現(xiàn),RA患者T淋巴細胞DNMTs催化活性及DNA甲基化水平均遠遠低于正常人群,提示DNMTs、DNA低甲基化和RA之間具有一定相關(guān)性[24]。Nam等[25]研究顯示,DNMT3B基因啟動子區(qū)域-283C>T突變在RA患者及正常人群中分布沒有顯著差異,RA患者283T比例明顯高于283C,283T攜帶者關(guān)節(jié)毀損早于283C攜帶者。故認為283T突變可能造成DNMT轉(zhuǎn)錄及催化活性降低造成DNA低甲基化水平。DNA低甲基化對RA關(guān)節(jié)的破壞可概括如下:①Thl/Th2細胞間分化呈Th1極化趨勢,Thl所分泌致炎因子如IFN-γ、IL-1β、TNF-α、IL-17A等基因啟動子區(qū)域的DNA甲基化水平低于健康人群,致炎因子表達增多,激活局部或全身炎癥反應(yīng)[26];②滑膜成纖維細胞基因啟動子區(qū)低甲基化導(dǎo)致滑膜成纖維細胞表型改變,發(fā)生生長及凋亡異常并最終導(dǎo)致關(guān)節(jié)損壞[27];③對本病關(guān)節(jié)損壞具有決定作用的是NF-kappa B,其轉(zhuǎn)錄起始區(qū)域DNA低甲基化,增強其表達,可參與RA患者的關(guān)節(jié)損害過程[28]。目前,關(guān)于DNMTs基因SNP現(xiàn)象與RA關(guān)系的研究尚無報道,故無法確定其是否具有地域特征及人種差異。繼續(xù)深入研究兩者的相關(guān)性將為深入了解RA的發(fā)生發(fā)展及判斷預(yù)后提供重要的線索。

3.3免疫性血小板減少癥(ITP)ITP是一種獲得性自身免疫性疾病,其特征為血小板減少(<100×109/L)和血小板特異性自身抗體產(chǎn)生。其病因不明,目前普遍認為基因和環(huán)境因素均對疾病發(fā)生發(fā)展有重要作用[29]。研究證實,ITP患者DNA甲基化水平遠低于正常人群,DNMT3B、DNMT3A的mRNA表達顯著低于對照組[30]。Chen等[31]研究發(fā)現(xiàn),DNMT3B基因啟動子區(qū)域-149位點堿基突變對DNMT3B表達無明顯影響。Shaheen等[32]在研究DNMT3B -149位點堿基突變與埃及兒童的ITP易感性的相關(guān)性中,得出了與Chen等的研究相同的結(jié)果。Zhao等[33]研究顯示,DNMT3B基因啟動子區(qū)域-579 G>T突變在ITP患者及健康對照組中分布無顯著差異。而Khorshied等[13]研究表明,DNMT3B啟動子區(qū)域-579堿基突變TT基因型在ITP患者中顯著高于正常對照組,統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)埃及兒童TT攜帶者增加了3倍ITP患病率。Jung等[34]也發(fā)現(xiàn),DNMT3B-579G>T基因型具有地域分布差異,這與Zhao等的研究結(jié)果一致,G等位基因在中國、韓國、美國正常人群中的比例分別為11.5%、20%、61.6%,埃及人與美國人相似,與中國、韓國人相差較大。上述SNP現(xiàn)象出現(xiàn)的地域、人種和疾病易感性差異原因尚不明確,有待進一步深入研究。

綜上所述,自身免疫性疾病是涉及多機制、多因素、累及多器官的系統(tǒng)性疾病。DNMTs異常表達可導(dǎo)致DNA低甲基化,參與到激活T淋巴細胞、炎性因子釋放,自身免疫反應(yīng)激活等。針對DNMTs基因SNP與自身免疫性疾病還有許多問題亟待解決:細胞因子異常釋放,地域差異、人種差異等都是具有挑戰(zhàn)性的工作。關(guān)于自身免疫性疾病與DNMTs基因SNP現(xiàn)象相關(guān)性的研究尚在起步階段,DNMTs基因SNP在痛風(fēng)、強直性脊柱炎、干燥綜合征等免疫性疾病中的研究仍是空白,深入的研究有望為免疫性疾病的臨床檢查、新的治療靶點提供重要依據(jù)。

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(收稿日期:2015-09-16)

中圖分類號:R593

文獻標志碼:A

文章編號:1002-266X(2016)04-0091-04

doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2016.04.036

通信作者:周京國(E-mail: jgzhou@nsmc.edu.cn)

基金項目:國家自然科學(xué)基金資助項目(81272047);四川省教育廳資助科研項目(15ZB0197);南充市科技支撐項目(14A0061);川北醫(yī)學(xué)院科研發(fā)展計劃博士科研啟動基金(CBY14-QD-07)。

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