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遼寧省某種豬場氟烷基因的檢測

2016-01-05 05:39:52趙世偉張守純
新農(nóng)業(yè) 2015年6期
關(guān)鍵詞:純合子凝膠電泳瓊脂糖

趙世偉 張守純

生活水平的提高,導(dǎo)致消費(fèi)者對優(yōu)質(zhì)豬肉的要求越來越高,豬肉品質(zhì)主要受到遺傳與環(huán)境效應(yīng)綜合作用的影響。目前,豬肉品質(zhì)已經(jīng)成為豬種選育的重要指標(biāo)。氟烷基因(Halothane,Hal)是導(dǎo)致豬應(yīng)激綜合癥的一個主效基因,而豬應(yīng)激綜合癥直接導(dǎo)致PSE肉或DFD肉的產(chǎn)生。為此,國內(nèi)外的研究人員對氟烷基因作了細(xì)致、深入研究,以降低或消除豬應(yīng)激綜合癥導(dǎo)致養(yǎng)豬業(yè)的損失,從而提高經(jīng)濟(jì)效益,為消費(fèi)者提供更多的優(yōu)質(zhì)豬肉。

研究人員通過對氟烷基因cDNA序列的進(jìn)一步分析,發(fā)現(xiàn)該基因的1843位點(diǎn)的堿基發(fā)生了突變(“C”→“T”),而該堿基的突變導(dǎo)致該位點(diǎn)密碼子編碼的氨基酸由精氨酸變成了半胱氨酸,使得Ca2+釋放通道的結(jié)構(gòu)發(fā)生了變化,功能也出現(xiàn)了異常。當(dāng)豬受到應(yīng)激時,Ca2+會大量的釋放,引起肌肉持續(xù)收縮產(chǎn)生應(yīng)激綜合征。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn),該位點(diǎn)堿基的突變使得該基因的限制性酶切識別位點(diǎn)由HalN(-5GCG↓C 3-)變?yōu)镠aln(-5 GTGCT↓G 3-)。

用HhaⅠ酶對該位點(diǎn)酶切,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析后能觀察到3種帶型,分別為基因型HalNHalN的顯性純合子帶型、基因型HalNHaln的雜合子帶型以及基因型HalnHaln的隱性純合子帶型,其中基因型為HalnHaln的豬為應(yīng)激敏感豬。在種豬場氟烷基因的檢測中,采用PCR-RFLP技術(shù),既廉價又能準(zhǔn)確的檢測出Haln的存在,準(zhǔn)確率可達(dá)100%,檢測樣本只需采集種豬的少量血液和肌肉組織等。

1 材料與方法

1.1 主要儀器和試劑

PCR基因擴(kuò)增儀(杭州博日

科技有限公司),電泳槽DYCZ

-25D、電泳儀DYY-10C(北京

六一儀器公司),2×PCR Mast

erMix(康為世紀(jì)生物科技有限

公司),HhaⅠ酶、氟烷基因引

物序列(上海生工生物工程有限

公司):F(5-TCCAGTTT

GCCACAGGCCA-3)、R(

5-ATTCACCGGATGG

AGTCTCTGAG-3)。

1.2 材料

遼寧省某種豬場312頭種豬的耳組織(綠豆粒大?。?。

1.3 方法

本試驗使用經(jīng)典的酚—氯仿法提取312頭種豬耳組織的總基因組DNA,提取完成的總基因組DNA充分溶解于滅菌去離子水中后,于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3.1 Hal基因PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系(20微升)10微升 2×PCR MasterMix,2微升豬耳組織的總基因組DNA,上游引物和下游引物各1微升,6微升超純?nèi)ルx子滅菌水。Hal基因PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5分鐘,30次循環(huán)(94℃,45秒;58℃,45秒;72℃,45秒),最后72℃10分鐘。Hal基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,檢測結(jié)果為陽性的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行酶切。

1.3.2 酶切反應(yīng)體系 (15微升)HhaⅠ酶1微升,10×Buffer 1.5微升,Hal基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物10微升,滅菌去離子水2.5微升。在37℃水浴中孵育4小時后,酶切產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

2 結(jié)果與分析

豬基因組總DNA1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果顯示,本試驗提取的基因組總DNA純度較高,且濃度較大(見圖1)。1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測的Hal基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物條帶大小約為659bp(見圖2),與目的條帶一致,而且無非特異性條帶的出現(xiàn)。

Hal基因酶切產(chǎn)物的電泳結(jié)果存在3種帶型(見圖3),即基因型為HalNHalN的顯性純合子帶型(2條帶:493bp、166bp)、基因型為HalNHaln的雜合子帶型(3條帶:659bp、493bp和166bp)以及基因型為HalnHaln的隱性純合子帶型(1條帶:659bp)。本試驗檢測的312頭種豬中基因型為HalnHaln的隱性純合子3頭,基因型為HalNHaln的雜合子34頭,其余均為HalNHalN的顯性純合子。含有Haln基因的種豬頭數(shù)占檢測豬群的11.9%,Haln基因頻率為6.4%。

3 討論與結(jié)論

在養(yǎng)殖過程中,基因型為HalNHalN的顯性純合子不表現(xiàn)應(yīng)激綜合征,基因型為HalnHaln的隱性純合子表現(xiàn)出應(yīng)激綜合征,而基因型為HalNHaln的雜合子,則部分表現(xiàn)為應(yīng)激綜合征。因此,在養(yǎng)殖過程中簡單的通過應(yīng)激綜合征的表現(xiàn)來決定種豬的選留并不能從根本上淘汰Haln基因,而本試驗采用的檢測技術(shù)能從分子水平準(zhǔn)確的判斷種豬的選留,保障養(yǎng)豬業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益。

由于本豬場的種豬大部分為引進(jìn)豬種,說明在引種的過程中引入Haln基因,該基因在后續(xù)的擴(kuò)繁中將會直接影響該種豬場的經(jīng)濟(jì)效益,需要及時淘汰攜帶Haln基因的種豬。并建立完善的種豬繁育體系,生產(chǎn)高品質(zhì)、高性能的商品豬,為消費(fèi)者提供更優(yōu)質(zhì)的豬肉。

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