葉飛++姚長宇++張欣
摘 要:從吉林市左家林地土壤中分離得到一株纖維素酶產(chǎn)生菌,由形態(tài)觀察和18S rDNA序列分析,該菌株為真菌,屬散囊菌綱( Uncultured Eurotiomycetes),命名為JN510。該菌產(chǎn)生纖維素酶活力為2.32IU/mL,具有進(jìn)一步研究價值。
關(guān)鍵詞:纖維素酶;菌種篩選;鑒定;酶活力
中圖分類號: Q936 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A DOI:10.11974/nyyjs.20151132001
纖維素是農(nóng)作物秸稈的主要成分之一,也是地球上含量最為豐富的可降解生物質(zhì),其為葡萄糖聚合物,以β-1,4糖苷鍵聚合。它的降解與轉(zhuǎn)化是生物圈碳素循環(huán)與生物能傳遞的重要環(huán)節(jié)。利用微生物對纖維素進(jìn)行降解,對于自然界生物能源的利用具有重要意義。世界各國均積極開展對纖維素降解菌的研究[1]。東北地區(qū)作為我國的糧食主產(chǎn)區(qū),每年產(chǎn)生大量富含纖維素的農(nóng)業(yè)秸稈,傳統(tǒng)的焚燒污染環(huán)境且造成大量生物質(zhì)浪費。
本試驗從吉林市左家林地土壤中分離出一株纖維素降解菌,由菌絲、菌落形態(tài)以及16S rDNA初步鑒定為散囊菌綱( Uncultured Eurotiomycetes)。其具有較強(qiáng)纖維素酶產(chǎn)酶活性,對于纖維素的降解轉(zhuǎn)化具有積極意義,菌種具有進(jìn)一步研究價值。
1 材料與方法
1.1 試驗材料與試劑
1.1.1 試驗材料
土壤樣品,采自吉林省吉林市左家地區(qū)林地;化學(xué)試劑均為分析純,購于北京化學(xué)試劑廠;羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)購自生工生物工程(上海)有限公司。Biospin凝膠回收試劑盒,購自BioFlux公司;
1.1.2 培養(yǎng)基
富集培養(yǎng)基:MgSO·7H2O 4 0.1g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.1g, K2HPO4 1.0g, MnSO4 5×10-4g,CMC-Na 10.0g,蛋白胨10.0g,酵母膏10.0g,水1000ml,自然pH,121℃滅菌30min。
剛果紅篩選培養(yǎng)基:KNO3 2.0g,MgSO4 0.5g,KH2PO4 1.0g,NaCl 1.0g,Na2HPO4 1.0g,蒸餾水500ml,加熱溶解后加入CMC-Na 20.0g、瓊脂20.0g、剛果紅0.2g充分溶解后,蒸餾水定容至1000ml,HCl調(diào)pH直至達(dá)到7.0~7.2,121℃滅菌30min,搖勻后倒平板。
纖維素鈉篩選培養(yǎng)基:CMC-Na 5.0g,蛋白胨10.0g,酵母提取物5.0g,瓊脂12.0g,,水 1000ml,121℃滅菌30min,搖勻后到平板。
產(chǎn)酶培養(yǎng)基:Na2HPO4 3.0g,NH4NO3 0.8g,CaCl2 0.5g,ZnSO40.01g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01g,MgSO4·7H2O 0.5g,MnSO4·H2O 0.01g,CMC-Na 10.0g,蛋白胨1.0g,酵母膏1.0g, 水1000ml,HCl調(diào)pH值7.0~ 7.2,121℃滅菌30min,搖勻后到平板。
PDA培養(yǎng)基:馬鈴薯200g,去皮切成小塊,用蒸餾水1000ml小火沸煮30min,8層紗布過濾,濾液補(bǔ)水至1000ml,調(diào)pH6.5。
1.2 試驗方法
1.2.1 樣品采集與菌種分離
于左家地區(qū)林地,取腐殖質(zhì)表層土壤5g土樣于三角瓶中,加入50ml無菌水,震蕩5min,至分散均勻。取5ml懸液于50ml富集培養(yǎng)基,28℃,80r/min震蕩培養(yǎng)5~7d。取富集培養(yǎng)液按10-1、10-2、10-3、10-4、10-5做系列稀釋,涂布于剛果紅篩選培養(yǎng)基,靜置30min后,28℃倒置培養(yǎng),分離有明顯透明水解圈的菌落。若菌落重疊可劃線分離菌株。
1.2.2 菌株纖維素降解能力測定
將分離獲得的菌株,液體培養(yǎng)后,按10-1、10-2、10-3、10-4、10-5做系列稀釋后涂布于剛果紅篩選培養(yǎng)基,靜置30min后,28℃倒置培養(yǎng),待菌落直徑1.0~5.0mm,取下培養(yǎng)基,于1%剛果紅溶液浸泡1h,棄去剛果紅溶液,于1mol/L NaCl溶液浸泡0.5h,棄去NaCl溶液,觀察并測量水解圈大小。
1.2.3 纖維素酶活力測定
采用DNS法(3,5-二硝基水楊酸法)測定纖維素酶活力 [2]。酶活力定義為:1min內(nèi)催化纖維素水解生成1μmol葡萄糖所需的酶量為1IU。
1.2.4 菌株表型特征鑒定
取無菌水一滴至于干凈玻片,接種環(huán)挑取少許菌絲涂布,風(fēng)干固定,顯微觀察菌株形態(tài)。
1.2.5 菌株的18S r DNA鑒定
CTAB法提取菌株基因組DNA,分析18S r DNA進(jìn)行軍中鑒定。PCR反應(yīng)體系(50μL):dd H2O 34.0μL,10×buffer 5.0μL,d NTP4.0μL,F(xiàn)P2μL,RP2μL,Taq酶 1μL,模板DNA 2μL。引物序列:FP 5'-ATTGGAGGGCAAGTCTGGTG-3';RP 3' –CCGATCCCTAGTCGGCATAG-5'。PCR反應(yīng)條件:94℃,5min;94℃變性1min,60℃退火1min,72℃延伸1min,35個循環(huán); 72℃,10min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,送至英濰捷基公司測序。序列于GeneBank由BLAST進(jìn)行序列同源性分析,確定菌種屬。
2 結(jié)果與分析
2.1 菌株的分離和纖維素降解能力初步鑒定結(jié)果
由剛果紅篩選培養(yǎng)基水解圈初步判斷,實驗分離得到多種具有纖維素降解能力的菌株。其中3種疑似真菌類菌株,具有較為明顯纖維素降解能力。
取這3種菌株,于剛果紅篩選培養(yǎng),用1%剛果紅溶液浸泡后1mol/L NaCl溶液浸泡脫色,測量水解圈大小,結(jié)果見表1。由表1可知,1號菌水解圈直徑/菌落直徑為8.8,遠(yuǎn)高于2號菌和3號菌。初步表明,1號菌具有較明顯纖維素降解能力。
2.2 菌株的纖維素酶活力測定結(jié)果
取1號菌、2號菌、3號菌,DNS法測定纖維素酶活力,結(jié)果見圖1。由圖1可知,在3種菌株中,1號菌纖維素酶活力最高,為2.32IU/mL。將1號菌命名為JN510。由纖維素酶活力判斷,其具有進(jìn)一步研究的價值。
2.3 JN510菌株表型特征鑒定結(jié)果
JN510菌株于PDA培養(yǎng)基28℃下培養(yǎng),生長快速。3d后呈白色絨毛狀氣生菌絲;繼續(xù)培養(yǎng),菌落轉(zhuǎn)為綠褐色;繼而顏色逐漸加深。菌落毛絨狀。鏡檢結(jié)果見圖2。
2.4 18S rDNA序列分析結(jié)果
JN510菌株基因組 DNA進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖電泳,結(jié)果見圖3。由圖可知,引物對18S r DNA 序列擴(kuò)增效果良好,擴(kuò)增片段約500bp。
回收片段,送英濰捷基公司測序。獲得序列經(jīng)GeneBank比對,該菌種與序列號為EU368286.1的Uncultured Eurotiomycetes具有99%的親緣關(guān)系,結(jié)合文獻(xiàn)所列形態(tài)學(xué)特征的描述,將其鑒定為散囊菌綱(Uncultured Eurotiomycetes)[3,4]。
3 討論
吉林市左家地區(qū)林地腐殖質(zhì)表層土壤中存在大量可以降解纖維素的纖維素酶產(chǎn)生菌。其可應(yīng)用于生物化工過程,如秸稈發(fā)酵生產(chǎn)燃料乙醇等工藝。這些菌對于富含纖維素的的轉(zhuǎn)化利用以及農(nóng)業(yè)秸稈回收利用具有重要意義。
纖維素酶包括β-葡萄糖苷酶、內(nèi)切葡聚糖酶、外切葡聚糖酶。3者協(xié)同作用降解纖維素生成葡萄糖。不同菌種產(chǎn)生上述3種酶的濃度與活力不同。雖然自然界中纖維素降解菌種類較多,但是秸稈等生物質(zhì)中的纖維素往往與木質(zhì)素、脂質(zhì)等交聯(lián)存在。使得自然界中纖維素降解菌的降解能力不理想,降低了秸稈等富含纖維素生物質(zhì)的開發(fā)利用。因此可以考慮構(gòu)建不同纖維素降解菌,以及纖維素降解菌與木質(zhì)素降解菌等降解菌的混合菌系。以此來轉(zhuǎn)化纖維素,提高降解效率。
本實驗獲得的纖維素降解菌JN510具有較強(qiáng)纖維素降解能力,具有良好的開發(fā)前景,值得進(jìn)一步研究。
參考文獻(xiàn)
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作者簡介:葉飛(1978-),男,副教授,主要從事應(yīng)用微生物學(xué)研究。
農(nóng)業(yè)與技術(shù)2015年21期