徐 鄭,竇全亮,賈瑞鵬,朱佳庚
膀胱癌是泌尿系統(tǒng)常見的惡性腫瘤之一,是我國死亡率列于前10 位的腫瘤之一。膀胱癌的發(fā)病與多種因素相關,其中環(huán)境因素如吸煙[1]、接觸化工產(chǎn)品、慢性感染、一些藥物(如環(huán)磷酞胺、非那西汀等)及遺傳因素被認為是導致膀胱癌的重要因素[2-4]。
研究顯示人類基因組廣泛存在的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)被證實與包括膀胱癌在內(nèi)的多種腫瘤的發(fā)生相關[5]。微小RNA(microRNA,miRNA)是一類長度為21 ~23 nt的非編碼單鏈,進化上高度保守。其主要通過靶向mRNA,降解靶mRNA 或從轉錄后水平抑制其翻譯,從而阻斷靶蛋白質(zhì)的形成。研究顯示miRNA 參與個體發(fā)育、器管形成、細胞增殖、分化和細胞凋亡等生物學過程[6]。此外,近年來研究顯示在包括腫瘤[7]、心血管系統(tǒng)疾病等多種疾病的發(fā)生過程中均可以觀察到miRNA 的異常表達[8]。有研究顯示前體區(qū)的SNP 與多種腫瘤的發(fā)生相關,其中miR-196a2 前體區(qū)rs11614913 T >C 多態(tài)位點與多種腫瘤的發(fā)生相關,miRNA-499 前體區(qū)的多態(tài)性位點rs3746444 亦被證實與多種腫瘤的發(fā)生相關,上述2個miRNA 前體的SNP 位點與中國人群中膀胱癌發(fā)生的相關性研究報道少見[9-11]。本研究擬采用病例對照探討miRNA 前體區(qū)rs3746444(miRNA-499)及rs11614913(miRNA-196a2)多態(tài)性位點與膀胱癌發(fā)生的相關性。
1.1 研究對象 選取2010 年1 月至2013 年12 月在我院就診并經(jīng)臨床病理診斷為膀胱癌的患者283例為膀胱癌組,其中男性218 例,女性65 例,平均年齡(66.31±13.78)歲。同期選取接受健康體檢的283 人為正常對照組,其中男性217 例,女性66 例。平均年齡(65.90±13.85)歲。正常對照組經(jīng)體檢結果顯示為正常,且無泌尿系統(tǒng)疾病史?;颊呒皩φ战M研究對象均為南京及周邊地區(qū)人群,在地理分布上無差異,均為漢族。膀胱癌組與對照組性別、年齡、吸煙、飲酒等因素的差異無統(tǒng)計學意義(P >0.05),2 組具有可比性。本研究通過醫(yī)院倫理學委員會批準,研究對象均清楚和同意該研究,并簽署知情同意書。
1.2 病理診斷 病理標本由本院泌尿外科醫(yī)師于手術中取出,同時取周圍淋巴結與易被侵犯的遠端淋巴結行病理分析,病理分析由我院病理科醫(yī)師協(xié)助完成。膀胱癌依腫瘤大小(T)、淋巴結(N)和遠處部位有淋巴結轉移(M)(TNM)對腫瘤患者進行臨床Ⅰ~Ⅳ分期;依腫瘤細胞的分化程度進行分級(高分化、中分化及低分化)。
1.3 基因組DNA 提取及檢測 受試者均抽取外周血3 mL,EDTA-K2抗凝,全血經(jīng)500×g 離心5 min后,去血清后在剩下的細胞中加入300 μL 人紅細胞裂解液,混勻震蕩3 min 溶解紅細胞,10 000×g 離心30 s,沉淀白細胞,-80 ℃凍存?zhèn)溆?采用GoldMag全血基因組DNA 提取試劑盒(購自西安金磁納米生物技術有限公司),按照試劑盒說明書的操作步驟提取基因組DNA?;蚪MDNA 濃度和純度采用NanoDrop2000c 型蛋白核酸檢測儀(購自美國Thermo公司)進行分析。
1.4 基因分型 從NCBI 數(shù)據(jù)庫獲取2 個基因多態(tài)性位點的序列(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/),使用Genotyping Tools 和Massarray Assay Design 軟件(Sequenom 公司)設計待測SNP位點的PCR 擴增引物和單堿基延伸引物(由上海英駿生物公司合成),并對各樣本進行2 個位點對應的Massarray SNP 檢測,檢測過程依MassARRAY?分子量陣列技術工作站標準程序進行,主要過程包括:PCR 擴增、SAP 實驗、單堿基延伸PCR 實驗、樹脂純化、芯片點樣、質(zhì)譜分析、實驗結果分析與整理。實驗由陜西佰美基因股份有限公司協(xié)助完成。
1.5 統(tǒng)計學分析 采用SPSS 11.0 統(tǒng)計軟件進行分析。計量資料以均數(shù)±標準差()表示,組間比較采用兩獨立樣本t 檢驗;計數(shù)資料以頻數(shù)和率表示,組間比較采用χ2檢驗,以P≤0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。多態(tài)性位點的基因型與患病風險的關系分析采用二元Logistic 回歸分析,以OR 及95%CI表示相對風險度。
2.1 Hardy-Weinberg 平衡檢驗 對照組基因型進行Hardy-Weinberg 平衡檢驗,結果顯示2 個位點均符合Hardy-Weinberg 平衡(P >0.05),提示樣本來自一個穩(wěn)定的群體。
2.2 基因多態(tài)性位點與腫瘤病理特征的相關性
將膀胱癌組依腫瘤的病理特征(腫瘤分期、周圍淋巴結轉移、遠端淋巴結轉移及腫瘤的分化程度)進行分組。χ2檢驗結果顯示在不同分化程度的腫瘤分組中2 個位點的基因型差異有統(tǒng)計學意義(P <0.05)。見表1。
表1 rs11614913 及rs3746444 與膀胱癌病理參數(shù)的頻數(shù)分布[n(%)]Table 1 Frequency distribution of rs11614913,rs3746444 and clinicopathological parameters of bladder cancer n(%)
2.3 基因多態(tài)性位點基因型的分布 2 個位點的基因分型分布,經(jīng)多因素Logistic 回歸分析,在調(diào)整了性別、年齡、吸煙和飲酒因素后,結果顯示rs11614913位點的各基因型在2 組中分布差異有統(tǒng)計學意義(χ2=15.077,P <0.001),其中TT 基因型在病例組中的頻率顯著低于對照組,差異有統(tǒng)計學差異(P <0.05)。rs3746444 位點的各基因型在2 組中分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=5.107,P=0.078),但回歸分析發(fā)現(xiàn)GG 基因型在病例組中分布顯著高于對照組,組間差異有統(tǒng)計學意義(P <0.05)。見表2。
表2 rs11614913 及rs3746444 多態(tài)性與膀胱癌發(fā)病風險的Logistic 回歸分析Table 2 Logistic regression analysis on the association of rs11614913 and rs3746444 to the risk of bladder cancer
MicroRNA 基因多態(tài)性與腫瘤的相關性已被廣泛關注,其中rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)2 個位點是近年來研究的熱點。在中國人群中,Yuan 等[12]對rs11614913 位點與肺癌的相關性進行了探討,結果發(fā)現(xiàn)rs11614913 C 等位基因與肺癌的危險性增加有關。此外,Hu 等[13]的研究亦發(fā)現(xiàn)rs11614913 C 等位基因與中國婦女乳腺癌的危險性增加有關。本研究基于南京地區(qū)漢族人群,發(fā)現(xiàn)rs11614913 TT 基因型與膀胱癌的發(fā)生呈現(xiàn)負相關,與上述在中國人群中其他類型腫瘤的結果相一致。Hoffman 等[14]對該多態(tài)性位點的等位基因的功能進行了研究,結果顯示rs11614913C 等位基因與miR-196a2 的低表達量相關,進而影響了其調(diào)控靶基因的能力,影響DNA 損傷后應答的效率。此外,He 等[9]薈萃分析結果顯示,亞洲人群中rs11614913 TT 與腫瘤發(fā)生呈負相關(TT vs CC:OR=0.80,95%CI:0.73 ~0.88;TT vs CC+CT:OR=0.85,95%CI:0.80 ~0.92)。上述研究結果均與本研究結果一致。
MiRNA-499 rs3746444 基因多態(tài)性與腫瘤的相關性已經(jīng)廣泛研究。薈萃分析結果顯示該位點與腫瘤的發(fā)生相關[9,11,15];在中國人群中亦有研究發(fā)現(xiàn)該基因多態(tài)性與肝癌的發(fā)生相關[16];還有研究顯示該位點在亞洲人群中呈現(xiàn)相關性[17-18];而在歐洲人群中未顯示有相關性[19]。此外,功能研究亦顯示miRNA-499 可以和c-MET mRNA 結合并降低其表達,進而促進細胞的凋亡并抑制細胞的增殖[20]。本研究結果顯示rs3746444GG 基因型與膀胱癌的發(fā)生相關,與上述的研究結果相一致。
本研究還將膀胱癌組依腫瘤的病理特征進行分組,對上述基因多態(tài)性位點的基因型分布進行了χ2檢驗,結果顯示上述2 個位點的基因型分布頻率在腫瘤分期、周圍淋巴結轉移及遠端淋巴結轉移的分組中差異無統(tǒng)計學意義。然而,在不同分化程度的腫瘤分組中2 個位點的基因型分布頻率差異有統(tǒng)計學意義。本研究所探討的2 個多態(tài)性位點已被證明有生物學功能,與腫瘤的發(fā)生相關,但與腫瘤分化的相關性還未見相關報道,因此該結果還需進一步研究探討。此外,本研究所納入的病例數(shù)相對較少,因此進行分化程度分組后統(tǒng)計學效應較弱,rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)與腫瘤分化程度相關的結論還有待于更大樣本的研究來進一步證實。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)基因多態(tài)性與膀胱癌的發(fā)生相關,2 個位點的基因多態(tài)性與腫瘤的分化程度相關,相關分子機制還需進一步的研究證實。
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