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p53 抑癌基因電化學(xué)阻抗傳感器研究*

2015-03-26 07:59杜芳靜胡曉琴李曉霞
傳感器與微系統(tǒng) 2015年1期
關(guān)鍵詞:癌基因堿基探針

杜芳靜,胡曉琴,宋 珂,李曉霞

(延安大學(xué) 化學(xué)與化工學(xué)院,陜西 延安716000)

0 引 言

電化學(xué)DNA 傳感器(elctrochemical DNA sensor)是將探針DNA 固定在電極表面上,通過檢測電化學(xué)信號進(jìn)行分析的器件。此類傳感器具有簡單、靈敏、快速、低成本及低能耗等特點(diǎn),在疾病診斷、環(huán)境檢測和食品安全等領(lǐng)域有著重要的應(yīng)用價值和廣闊的應(yīng)用前景[1~3]。p53 抑癌基因(p53-DNA)是生物體內(nèi)一種抑制細(xì)胞轉(zhuǎn)變癌細(xì)胞的基因,可誘導(dǎo)細(xì)胞生長阻滯,細(xì)胞凋亡,細(xì)胞分化以及DNA 修復(fù)[4]。目前已報(bào)道p53-DNA 的分析方法有電化學(xué)法[5~7]、光學(xué)法[8]和免疫法[9]。電化學(xué)阻抗(elctrochemical impedance spectroscopy,EIS)技術(shù)是利用小幅度交流電壓或電流對電極擾動,測量體系對擾動跟隨情況的電化學(xué)響應(yīng)的測量方法,該方法具有頻率范圍廣、對體系擾動小等特點(diǎn),是研究電極過程動力學(xué)、電極表面現(xiàn)象等的重要工具[10,11]。

本文基于電化學(xué)阻抗技術(shù)構(gòu)建了一種檢測p53-DNA的電化學(xué)傳感器,將末端帶巰基的探針p53-DNA 固定于金電極表面,根據(jù)傳感器結(jié)合前后電子轉(zhuǎn)移阻抗值的變化,對目標(biāo)p53-DNA 進(jìn)行了分析與測定。該傳感器制備簡單、靈敏高,且無需標(biāo)記,易于操作,可用于不同序列DNA 的研究。

1 實(shí)驗(yàn)部分

1.1 儀器與試劑

CHI660E電化學(xué)工作站(上海辰華);Q5200B超聲儀(江蘇昆山);HG—9140A 電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱(上海精宏設(shè)備);電極系統(tǒng):Au 為工作電極,Ag/AgCl 電極為參比電極,Pt 為對電極。

鐵氰化鉀和亞鐵氰化鉀(西安化學(xué)試劑廠);單鏈DNA(上海生工)序列參見文獻(xiàn)[5];單鏈DNA 儲備液:用pH 7.0,10 mmol/L PBS 緩沖溶液配制;5.0 mmol/L K3[Fe(CN)6]-5.0 mmol/L K4[Fe(CN)6;檢測液:用pH 7.4,0.10 mol/L PBS-0.10 mol/L NaCl 配制;實(shí)驗(yàn)用水均為Millipore Milli—Q 超純水(大于18.2 MΩ·cm)。

1.2 實(shí)驗(yàn)方法

首先將Au 進(jìn)行預(yù)處理[12]。將5 μL 5.0 μmol/L 探針p53-DNA 溶液滴涂在處理好的Au 表面,4 ℃固定12 h,然后用10 mmol/L PBS(pH 7.0)和超純水沖洗,以除去吸附的探針;用5.0 μL,1.0 mmol/L MCH 封閉1 h,得到p53-DNA傳感器,4 ℃冰箱中保存待用。將5.0 μL 不同濃度目標(biāo)p53-DNA 滴加到p53-DNA 傳感器上,37 ℃雜交反應(yīng)1 h。在5.0 mmol/L/L K3[Fe(CN)6]-5.0 mmol/L K4[Fe(CN)6]檢測液中進(jìn)行測定,根據(jù)傳感器雜交前后電子轉(zhuǎn)移阻抗值的變化分析信號,對目標(biāo)p53-DNA 進(jìn)行定量檢測。

2 結(jié)果與討論

2.1 傳感器的電化學(xué)表征

圖1 為不同修飾電極在檢測液中的循環(huán)伏安圖。曲線a 為裸 Au 電極上的循環(huán)伏安曲線,結(jié)果發(fā)現(xiàn),[Fe(CN)6]3-/4平衡電對的電位差為80 mV。探針p53-DNA 自組裝到Au 電極表面后,由于DNA 的磷酸骨架帶負(fù)電荷,阻礙荷負(fù)電的[Fe(CN)6]3-/4-的電子傳遞,峰電位差ΔE 明顯增大且峰電流降低(曲線b)。當(dāng)封閉劑MCH 占據(jù)了電極表面未結(jié)合的位點(diǎn)(曲線c),峰電位差繼續(xù)增大且峰電流也繼續(xù)降低。探針DNA 與目標(biāo)DNA 雜交之后形成雙鏈DNA 結(jié)構(gòu)(曲線d),峰電位差達(dá)到最大,峰電流降到最低。以上結(jié)果表明:探針DNA 通過巰基自組裝作用固定在電極表面,構(gòu)建的p53-DNA 傳感器與目標(biāo)p53-DNA 發(fā)生了雜交反應(yīng)。

圖2 為不同電極的電化學(xué)阻抗圖??梢钥闯?,曲線a為裸金電極的阻抗,半圓較小,其電子傳遞阻抗Ret值為73.2 Ω。當(dāng)探針DNA 固定到電極表面后,[Fe(CN)6]3-/4-電子傳遞受阻,電子傳遞阻抗Ret值增大到3 846 Ω。MCH封閉后,電子傳遞阻抗Ret值繼續(xù)增大,說明MCH 在電極表面上形成致密的自組裝膜,使得[Fe(CN)6]3-/4-電子傳遞變得更加困難。當(dāng)雜交反應(yīng)形成DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu),進(jìn)一步阻礙了[Fe(CN)6]3-/4在電極表面的電子傳遞,因此,其電子傳遞阻抗Ret值達(dá)到9 271 Ω。阻抗法與循環(huán)伏安法表征的結(jié)果一致,說明DNA 傳感器制備成功,并可以用于目標(biāo)p53-DNA 的檢測。

圖1 不同電極在5.0 mmol/L[Fe(CN)6]3-/4-溶液中的循環(huán)伏安圖(cProbe DNA=5.0 mol/L,cTarget DNA=1.0 mol/L)Fig 1 Cyclic voltammograms of different electrodes in 5.0 mmol/L M[Fe(CN)6]3-/4-solution(cProbe DNA=5.0 mol/L,cTarget DNA=1.0 mol/L)

圖2 不同電極在5.0 mmol/L[Fe(CN)6]3-/4-溶液中的阻抗圖Fig 2 Impedance diagram of different electrodes in 5.0 mmol/L[Fe(CN)6]3-/4-solution

2.2 實(shí)驗(yàn)條件的選擇

為了獲得更高的靈敏度,首先考察了各種電化學(xué)參數(shù)對傳感器的影響。首先研究了不同的電化學(xué)技術(shù)對靈敏度的影響,將制備好的傳感器放入5×10-7mol/L,1×10-6mol/L兩種不同濃度目標(biāo)p53-DNA 溶液中,分別采用電化學(xué)阻抗法、微分脈沖伏安法和方波伏安法進(jìn)行測定,實(shí)驗(yàn)結(jié)果說明使用電化學(xué)阻抗法測定靈敏度更高。因此,選用電化學(xué)阻抗法對目標(biāo)p53-DNA 進(jìn)行測定。圖3 為探針DNA 不同固定時間與傳感器雜交前后電化學(xué)阻抗變化值的關(guān)系曲線,可以看出,隨著固定時間從8 h 增加到12 h,電子傳遞電阻值Ret逐漸增大,12 h 之后Ret值呈緩慢降低,說明探針固定12 h 趨于飽和。因此,實(shí)驗(yàn)選擇探針固定時間為12 h。

圖3 探針固定時間對傳感器響應(yīng)信號的影響Fig 3 Effect of immobilization time of probe on response signal of sensor

考察了雜交溫度和雜交時間對傳感器測定的影響,結(jié)果表明:雜交溫度達(dá)到37 ℃時,電化學(xué)阻抗響應(yīng)信號是最大的(圖4(a)),37 ℃之后呈下降的趨勢,說明在較高溫度時,DNA 變性導(dǎo)致DNA 分子由穩(wěn)定的雙螺旋結(jié)構(gòu)松解為無規(guī)則線性結(jié)構(gòu),不利于雜交[13],所以,選擇37 ℃為最佳雜交溫度。圖4(b)顯示了當(dāng)雜交時間達(dá)到1 h 時,Ret值最大,繼續(xù)增加雜交時間,其Ret值變化較小,因此,選擇DNA 雜交時間為1 h。

圖4 雜交溫度和雜交時間對響應(yīng)信號的影響Fig 4 Effect of hybridization temperature and time on response signal

2.3 分析性能

在上述優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)條件下,利用制備好的傳感器對一系列不同濃度的目標(biāo)p53-DNA 進(jìn)行定量測定。圖5 為傳感器在不同濃度目標(biāo)p53-DNA 溶液中的電化學(xué)阻抗圖。電子傳遞電阻Ret與目標(biāo)p53-DNA 濃度在1×10-8~1×10-6mol/L 范圍內(nèi)呈線性關(guān)系(見附圖),線性回歸方程為Ret(Ω)=37.74+4.666 7 C(C(mol/L)),相關(guān)系數(shù)為0.995 5,其檢出限為3.0×10-9mol/L(S/N=3)。對5.0×10-8mol/L的目標(biāo)p53-DNA 做11 次平行測定,相對標(biāo)準(zhǔn)偏差為3.8%。比較發(fā)現(xiàn),本文方法測定線性范圍較文獻(xiàn)[7]寬,測定方法較文獻(xiàn)[5]更簡單。

2.4 選擇性

利用制備好的DNA 傳感器對完全互補(bǔ)p53-DNA、單堿基錯配序列p53-DNA 和三堿基錯配序列p53-DNA 進(jìn)行測定。結(jié)果表明:傳感器識別互補(bǔ)p53-DNA,其響應(yīng)信號電子傳遞電阻Ret值為9 989 Ω,與單堿基錯配p53-DNA 反應(yīng)后,Ret值為4 495 Ω,與三堿基錯配p53-DNA 反應(yīng)后,Ret值為2 297 Ω,分別為完全互補(bǔ)的DNA 雜交信號的45%和23%。說明該傳感器能夠區(qū)分完全互補(bǔ)序列、單堿基錯配序列和三堿基錯配序列DNA,具有良好的選擇性。

3 結(jié) 論

圖5 傳感器檢測不同濃度目標(biāo)DNA 的電化學(xué)阻抗圖(插圖為電子傳遞電阻Ret vs 目標(biāo)p53-DNA 濃度)Fig 5 Electrochemical impedance diagram of biosensor detect different target DNA concentrations(Insert:Plots of the difference of electron transfer resistance(Ret)vs logarithmic of target p53-DNA concentration)

本文基于電化學(xué)阻抗技術(shù)構(gòu)建了一種檢測p53-DNA的電化學(xué)傳感器,該傳感器可以檢測完全互補(bǔ)DNA 的范圍是1.0×10-8~1.0×10-6mol/L,具有操作簡單、無需標(biāo)記、靈敏度高的優(yōu)點(diǎn),可以用于其它DNA 序列的檢測。

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