何新菊,裴詩恩,陳德福,劉詩詠,鐘愛國
(臺州學(xué)院 醫(yī)藥化工學(xué)院, 浙江 臺州 318000)
左炔諾孕酮藥理活性的密度泛函研究
何新菊,裴詩恩,陳德福,劉詩詠,鐘愛國
(臺州學(xué)院 醫(yī)藥化工學(xué)院, 浙江 臺州 318000)
采用密度泛函理論的DFT/B3LYP/6-311+G(d,p)方法和基組, 對左炔諾孕酮藥物分子的紫外-可見光譜(UV-Vis),紅外光譜(IR), 核磁共振(1HNMR)吸收光譜進(jìn)行了理論模擬和指認(rèn)。自然電荷(NBO)值計算表明,左炔諾孕酮分子活性最強(qiáng)的部位連有碳碳叁鍵的碳上的羥基,很可能是其發(fā)揮藥理活性的親電和親核反應(yīng)中心。
左炔諾孕酮;密度泛函理論;電子光譜
口服避孕藥自20 世紀(jì)50 年代誕生以來,一直被世界各國婦女認(rèn)為是最有效的、可逆的、方便的避孕方式而被廣泛應(yīng)用[1]。魯賓復(fù)方口服避孕藥左炔諾孕酮炔雌醇片含有 84個粉紅色的含左炔諾孕酮0.15 mg和0.03 mg炔雌醇的活性片(active)和7個白色的惰性片(inert,無激素)[2],其中起主要作用的是左炔諾孕酮和炔雌醇。左炔諾孕酮是應(yīng)用較廣的一種口服避孕藥。炔諾孕酮為白色或類白色的結(jié)晶性粉末;無臭,味微苦。在氯仿中溶解,在乙醇中微溶,在丙酮中略溶,在水中不溶。熔點(diǎn)為202~208 ℃。它可以抑制排卵并阻止孕卵著床,同時使宮頸黏液濃度增大,阻止精子前進(jìn)。服用左炔諾孕酮可能會造成輕微的嘔吐、惡心,以及女性下次月經(jīng)周期不規(guī)則。
2005年,何淑明等探討了左炔諾孕酮宮內(nèi)緩釋系統(tǒng)治療子宮腺肌病的臨床療效[1,3]。左炔諾孕酮與炔雌醇可組合成復(fù)合片或三相片,有抑制排卵作用,也可用于治療月經(jīng)不調(diào),子宮功能性出血及子宮內(nèi)膜異位癥等。但也容易引起月經(jīng)周期不規(guī)則,頭痛、胸悶[4,5]。本文選用密度泛函方法,在優(yōu)化結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上, 并利用密度泛函理論,對其易發(fā)生的反應(yīng)部位進(jìn)行了理論預(yù)測,取得了有意義結(jié)果。
圖1 左炔諾孕酮分子C21H28O2結(jié)構(gòu)和編號Fig.1 Structure and atomic number
用密度泛函理論(DFT)在B3LYP/6-311+G(d. p)水平上對左炔諾孕酮藥物分子進(jìn)行基態(tài)全優(yōu)化,在優(yōu)化得到的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)上,采用Freq方法進(jìn)行了頻率分析,結(jié)果表明所有簡諧振動頻率全部為正值,表明其計算結(jié)果是可信的。本項目的全部計算在 PC機(jī)上完成。左炔諾孕酮(Levonorgestre, C21H28O2)的分子結(jié)構(gòu)和原子編號如圖1所示。通過HOMO/LUMO可以近似地判斷出它的反應(yīng)性,這個理論主要是基于雙分子反應(yīng)的分子軌道理論觀察得出的三個條件:不同分子的占用軌道相互排斥;不同分子的相異電荷互相吸引;一個分子的占用軌道和另一個分子的未占軌道之間的作用導(dǎo)致相互吸引,尤其是HOMO和LUMO之間。據(jù)此,前線軌道理論將兩種反應(yīng)物的反應(yīng)性簡化為HOMO和LUMO的判斷。
2.1 幾何結(jié)構(gòu)和紫外吸收光譜
標(biāo)題分子藥物別名:D-甲炔諾酮、左旋18-甲炔諾酮、左旋甲基炔諾酮、左旋甲基炔諾孕酮、左旋甲炔諾酮。用gaussian 09 W程序, 在B3LYP/ STO -3G水平上進(jìn)行優(yōu)化計算, 得到了左炔諾孕酮的鍵長和部分鍵角值。優(yōu)化的結(jié)果顯示,正常的C-C單鍵的鍵長( 0.154~0.162 nm), C-O單鍵(0.120~0.143 nm), C=O雙鍵(0.121~0.123 nm), O-H(0.094~1.500 nm), C=C (1.324 nm), 碳碳叁鍵(1.201 nm)。列出的優(yōu)化后分子的部分鍵長數(shù)據(jù)表明, 這些鍵長均為正常值; C6-C13-C16-C18-C17-C14與C1-C4-C11-C13-C6-C2原子組成的六元環(huán)夾角均在 109.0°附近,而C16-C19-C21-C22-C20-C18環(huán)夾角在 110°~124° 附近,C1-C2-C7-C8-C3雜環(huán)夾角均在99°~106° 附近,除C3受連接的碳碳叁鍵影響外,其余角度沒有發(fā)生明顯的扭曲變形。分子中的支鏈與環(huán)有明顯的扭轉(zhuǎn)而沒有處在同一平面,這樣的結(jié)構(gòu)受位阻效應(yīng)小,將有利于藥物分子發(fā)揮官能團(tuán)的優(yōu)勢作用。
用TD DFT/B3LYP/6-311+G(d,p)方法,模擬標(biāo)題分子(圖2)。 分子在320 nm 處顯示了紫外吸收峰,屬于電子從最高占據(jù)軌道(HOMO)躍遷到最低空軌道(LUMO),這與實驗UV-Vis圖譜在327 nm處有最強(qiáng)吸收基本吻合。
圖 2 左炔諾孕酮分子紫外-紫外可見光譜Fig.2 Ultraviolet visible spectroscopy
2.2 NBO電荷
優(yōu)化后得到了左炔諾孕酮原子的 NBO電荷分布。由于O原子的電負(fù)性比C原子大,C原子的電負(fù)性比 H原子大。因此, 在左炔諾孕酮分子中,2個O原子(- 0.199 e,-0.264 e)均帶有凈的負(fù)電荷,C原子中除C1、C3、C18、C22外均帶有凈的負(fù)電荷(-0.030 e ~ -0.177 e),而C1連有四個碳,C3連有3個碳和一個氧,C18連碳(有雙鍵),C22為碳氧雙鍵,所以C1、C3、C18、C22(0.048 e ~ 0.203 e) 均帶有凈的正電荷。H原子均帶有正電荷。由于主環(huán)上的C原子大都帶負(fù)電,致使四個碳環(huán)均帶負(fù)電,具有較強(qiáng)的親水性。在由電荷控制的反應(yīng)中, 原子的負(fù)電荷越多, 其受親電試劑進(jìn)攻的可能性越大; 反之, 原子的正電荷越多,由于O原子的電負(fù)性比C原子大,C原子的電負(fù)性比H原子大。因此,在炔雌醇分子中,2個O原子(- 0.215 e,-0.236 e)均帶有凈的負(fù)電荷,C原子中除C1、C3、C20外均帶有凈的負(fù)電荷(-0.003 e ~-0.223 e),而C1連有四個碳,C3連有3個碳和一個氧,C20連有C=O雙鍵,所以C1、C3、C20(0.031 e ~ 0.093 e)均帶有正電荷。H原子均帶有正電荷。由于主環(huán)上的C原子大都帶負(fù)電,致使四個碳環(huán)均帶負(fù)電,具有較強(qiáng)的親水性。由在電荷控制的反應(yīng)中, 原子的負(fù)電荷越多, 其受親電試劑進(jìn)攻的可能性越大[5];反之, 原子的正電荷越多, 則受親核試劑進(jìn)攻的可能性也越大,因此推測C=O上的O44-OH上的O10原子和烷基上的 C5原子很有可能是親電反應(yīng)的作用點(diǎn)。受親核試劑進(jìn)攻的可能性也越大,因此推測C=O上的O23-OH上的O10原子很有可能是親電反應(yīng)的作用點(diǎn)。
2.3 紅外光譜和核磁共振吸收譜
紅外吸收光譜對研究分子的結(jié)構(gòu)、化學(xué)鍵、表征和鑒別物質(zhì)等有十分重要的作用。在結(jié)構(gòu)優(yōu)化的基礎(chǔ)上, 在相同的計算水平上計算了左炔諾孕酮的振動紅外光譜。左炔諾孕酮有 51個原子,對應(yīng)有147個振動模式。理論計算所得到的部分特征振動頻率(0~4 000 cm-1)及其紅外強(qiáng)度;在圖3中出現(xiàn)了左炔諾孕酮的特征峰值750cm-1(碳碳叁鍵的彎曲振動),3 690 cm-1(O-H,伸縮),2 373 cm-1(碳碳叁鍵,伸縮)1 803 cm-1(C=C,伸縮),在低頻率范圍內(nèi)(1 362~1 699 cm-1)還出現(xiàn)較多吸收峰,這主要由于碳環(huán)的H原子特征指紋區(qū)。炔雌醇分子有 46個原子,對應(yīng)有132個振動模式。理論計算所得到的部分特征振動頻率(0~4 000 cm-1)及其紅外強(qiáng)度列于圖3中,出現(xiàn)了炔雌醇的特征峰值3 690 cm-1(O-H,伸縮),2 373 cm-1(碳碳叁鍵,伸縮),1 763 cm-1(苯環(huán),面內(nèi)伸縮), 755 cm-1(碳碳叁鍵的彎曲振動)在頻率(730~1 381 cm-1)還出現(xiàn)較多吸收峰,這主要由于碳環(huán)的H原子的特征指紋區(qū)。
采用DFT理論模擬并指認(rèn)左炔諾孕酮分子的1HNMR(見圖4)。核磁共振譜的峰特點(diǎn)較好地與其實驗值吻合起來,也進(jìn)一步驗證了計算的準(zhǔn)確性。
圖3 左炔諾孕酮分子的紅外吸收模擬光譜Fig. 3 Prediction of infrared absorption spectra
圖4 左炔諾孕酮的核磁共振模擬譜Fig.4 Prediction of 1HNMR spectrum
2.4 極性和反應(yīng)活性
偶極矩和在正辛醇-水體系的分配系數(shù)(P)是用來表示藥物親脂性或疏水性的重要物理參數(shù)。左炔諾孕酮(LNG)為全合成的強(qiáng)效孕激素,是消旋炔諾孕酮的光學(xué)活性體,活性比炔諾孕酮強(qiáng)1倍,約為炔諾酮的100倍。為此,劑量比炔諾孕酮可減半,不良反應(yīng)也減少。左炔諾孕酮主要作用于下丘腦和垂體,使月經(jīng)中期FSH和LH水平的高峰明顯降低或消失,卵巢不排卵,有明顯的抗雌激素活性,比炔諾酮強(qiáng)10倍左右,幾乎不具有雌激素活性。能使宮頸粘液變稠阻礙精子穿透。對子宮內(nèi)膜轉(zhuǎn)化顯左炔諾孕酮示極強(qiáng)的孕激素活性,可使子宮內(nèi)膜變薄,內(nèi)膜上皮細(xì)胞呈低柱形,分泌功能不良,不利于孕卵著床。LNG也有一定雄激素活性和蛋白同化作用,口服或皮下注射均可抑制排卵。我們使用Gaussian 09W程序計算獲得左炔諾孕酮和炔雌醇分子的偶極矩分別為(2.9370 D)和(0.7731 D),為弱極性。左炔諾孕酮的脂水分配系數(shù) LogP=3.06,炔雌醇的脂水分配系數(shù) logP=4, 這表明左炔諾孕酮和炔雌醇為親脂性分子。在有機(jī)化學(xué)中,特別對芳香族化合物,確定各個原子位置在親電或親核取代反應(yīng)的相對活性是一個重要的問題。已經(jīng)提出了各種理論指標(biāo),如電荷密度分布,定域能方法等。前線軌道理論認(rèn)為,最高已占分子軌道上的電子在各個原子上有一定的電荷密度分布,這個分布的大小次序決定親電試劑進(jìn)攻各個原子位置的相對難易程度,即親電反應(yīng)最易發(fā)生在HOMO最大電荷密度的原子上;與此類似,親核反應(yīng)在各個原子上發(fā)生的相對次序由LUMO的電荷密度分布決定,親核試劑最易進(jìn)攻LUMO電荷密度最大的原子。由此可知,在左炔諾孕酮中,連有碳碳叁鍵的碳上的羥基與C=O起藥理與毒理的作用,在炔雌醇中,連有碳碳叁鍵的碳上的羥基與苯環(huán)上的羧基起毒理與藥理的作用。
采用密度泛函理論的DFT/B3LYP/6-311+G(d,p)方法和基組, 對左炔諾孕酮藥物分子(Levonorgestre, C21H28O2)的紫外-可見光譜(UV-Vis),紅外光譜(IR),核磁共振(1HNMR)吸收光譜進(jìn)行了理論模擬和指認(rèn)。
(1)幾何優(yōu)化表明, 左炔諾孕酮具有穩(wěn)定的分子構(gòu)型和良好的疏水參數(shù),紅外光譜表征與官能團(tuán)吻合較準(zhǔn)確,核磁共振與其實驗值基本符合;
(2)通過NBO電荷分布以及前線軌道分析, 我們推測左炔諾孕酮分子活性最強(qiáng)的部位連有碳碳叁鍵的碳上的羥基,左炔諾孕酮將主要通過這種方式來發(fā)揮其毒理和藥理作用。
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Density Functional Theory Study of Pharmacological Activity of Levonorgestrel
HE Xin-jv,PEI SHI-eng,CHEN De-fu, LIU Shi-yong, ZHONG Ai-guo
(College of Chemical Engineering and Pharmacy, Taizhou University, Zhejiang Taizhou 318000,China)
Using density functional theory DFT/B3LYP/6-311 + G (d, p) method and basis set, levonorgestrel’s electronic spectra of UV-Vis spectroscopy, IR spectroscopy, 1HNMR spectrum and fluorescence spectroscopy were theoretically simulated and identified. Natural charge calculation shows that the hydroxyl on C atom of carbon-carbon triple bond may play the pharmacological activity center of electrophilic and nucleophilic reaction.
levonorgestrel;density functional theory;electronic spectra
TQ 624.1
A
1671-0460(2015)09-2097-03
浙江省大學(xué)生科技創(chuàng)新項目(2014R428015)和國家級大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計劃(201510350015)資助。
2015-03-20
何新菊(1991-),女,廣西賀州人,臺州學(xué)院高分子材料專業(yè),研究方向:從事高分子研究工作。E-mail:2804006737@qq.com。