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全國海水浴場及經(jīng)濟貝類中腺病毒的分布

2014-10-27 05:37:14明紅霞樊景鳳梁玉波關(guān)道明
海洋學(xué)報 2014年2期
關(guān)鍵詞:浴場貝類腺病毒

明紅霞,樊景鳳*,梁玉波,關(guān)道明

(1.國家海洋局 國家海洋環(huán)境監(jiān)測中心,遼寧 大連116023)

1 引言

海洋作為生活污水的重要蓄積地為胃腸道病毒(enteric viruses)提供了天然的棲息場所,隨著沿海城市人口的增長,浴場海水和海產(chǎn)品的病毒污染已日益受到關(guān)注,因娛樂用水和貝類引發(fā)的病毒性急性胃腸炎報道在國內(nèi)外屢見不鮮[1],如1988年上海暴發(fā)的一起因食用毛蚶而造成的大范圍甲肝病毒事件,造成了31萬人感染[2]。

人類腸道腺病毒(Ad V40/Ad V41),屬于腺病毒F亞屬,是全球急性胃腸炎疾病中最流行的病原體之一,全年均可發(fā)生,且無季節(jié)差異[3]。由于腺病毒的核酸為雙股DNA,因此,在自然水體中比RNA胃腸道病毒對紫外線的抵抗能力強[4]。正因如此,其陽性檢出率和含量比其他胃腸道病毒要高一些,在有些環(huán)境樣品中甚至比諾如病毒還高[5],尤其是當(dāng)常規(guī)細(xì)菌學(xué)指標(biāo)低于管理標(biāo)準(zhǔn)時,該病毒仍然能被檢測出來[6]。此外,腺病毒在環(huán)境樣品中與甲肝病毒、戊肝病毒、人類特異性噬菌體Bactericidesf ragilityHSP40的污染均相關(guān)[7]。因此,美國環(huán)保局已經(jīng)提出將其作為病毒污染的候選指示物,以此來執(zhí)行常規(guī)的水質(zhì)監(jiān)測[8],同時越來越多的研究證明,腺病毒也可以作為貝類體內(nèi)病毒污染的指示物[9]。

由于腺病毒40和41在細(xì)胞培養(yǎng)過程中很難觀測到噬斑,因此,細(xì)胞培養(yǎng)方法不適合于該病毒的檢測[10]。分子生物學(xué)方法,如PCR技術(shù)以其特異性和敏感性等優(yōu)勢,在海水和貝類等環(huán)境樣品人類胃腸道病毒的檢測中得到廣泛應(yīng)用。本研究以全國主要海水浴場表層海水和沿海省市主要增養(yǎng)殖區(qū)經(jīng)濟貝類為研究對象,以腺病毒為胃腸道病毒指示物,選用實時定量PCR(real-time PCR)技術(shù)對其污染進(jìn)行定量檢測,旨在反映人類胃腸道病毒在這兩種主要傳播介質(zhì)中的污染現(xiàn)狀,同時為近岸海域生態(tài)管理提供科學(xué)依據(jù)。

2 材料與方法

2.1 樣品的采集

于2007年8月游泳高峰期,選取全國重點沿海省市10個有代表性的海水浴場,從北至南依次是河北北戴河老虎石浴場(BDH)、大連金石灘浴場(JST)、山東煙臺金石灘浴場(YT)、青島第一海水浴場(QD)、江蘇連云港連島浴場(LYG)、浙江寧波松蘭山浴場(NB)、福建廈門黃厝浴場(XM)、廣東深圳大小梅沙浴場(SZ)、廣西北海銀灘浴場(BH)和海南三亞亞龍灣浴場(SY)(圖1a),分別在距岸邊100 m和1 000 m處采集10 L表層海水。

選取海水浴場布站的9個省份和天津市(無海水浴場)10個省市的主要海水貝類增養(yǎng)殖區(qū),共布設(shè)45個站位,采集162份經(jīng)濟貝類樣品,其中包括蚶類[毛蚶(Scapharcasubcrenata)、泥蚶(Arcagranosa)等],蛤蜊類[中國蛤蜊(Mactrachinensis)、四角蛤蜊(Mactraquadrangularis)、青蛤(Cyclinasinensis)、菲律賓蛤仔(Ruditapesphilippinarum)等],蟶類[縊蟶(Sinonovaculaconstricta)、長竹蟶(Solenstrictus)等],牡蠣類[近江牡蠣(Cr assostrearivul aris)、緣齒牡蠣(Dendostreacrenulif era)、太 平 洋 牡 蠣 (Crassostrea gigas)等],貽貝類[翡翠貽貝(Per naviridis)、紫貽貝(Mytilusedulis)]和扇貝類[櫛孔扇貝(ChlamysFarreri)、蝦夷盤扇貝(Patinopectenyessoensis)、海灣扇貝(Ar gopectenirradians)等]。冷藏空運回實驗室,凍存?zhèn)錂z,站位布設(shè)如圖1b所示。

2.2 病毒的回收

由于海水和貝類樣品中的病毒含量比較低,所以在進(jìn)行定量檢測之前必須先對其進(jìn)行濃縮回收。

圖1 我國重點海水浴場(a)及貝類增養(yǎng)殖區(qū)(b)調(diào)查站位

水樣中病毒的回收采用超濾法:10 L海水先經(jīng)濾紙過濾除雜質(zhì),再分別經(jīng)孔徑為0.8μm和0.2μm的濾膜過濾,用Millipore裝置(Millipore Pellicon Mini TFF,截留相對分子質(zhì)量為100×103)將10 L海水濃縮到100 mL左右后用Centricon Plus-70超濾管將水樣濃縮到350μL左右,凍存?zhèn)錂z[11]。

貝類樣品中病毒的回收方法:首先用勻漿器把貝類組織攪碎,取20 g加入等體積的甘氨酸緩沖液(p H 9.0),調(diào)整p H至7.2,震蕩30 min;于4℃5 000 g離心15 min,取上清;4℃10 000 g離心1 h,取上清;4℃140 000 g超速離心1.5 h,取沉淀,用1 mL的磷酸鹽緩沖液(PBS)(p H 7.4)重懸,以沉淀溶解為宜。為去除貝類組織中蛋白質(zhì)對后續(xù)反應(yīng)的影響,向懸液中加入等體積氯仿,震蕩15 min,然后4 000 g離心30 min,收集上層液相即為病毒抽提樣,約500μL。

2.3 Taq Man探針法real-time PCR技術(shù)檢測貝類樣品中的腺病毒

2.3.1 核酸提取

用Viral Nucleic Acid Extraction KitⅡ(Gene Aid)進(jìn)行水樣和貝類樣品中病毒DNA的提取,操作程序按照說明書進(jìn)行,最后溶解于50μL DNA-free水中,待檢。

2.3.2 引物設(shè)計

以腺病毒Ad V40為標(biāo)準(zhǔn)病毒株,根據(jù)其六鄰體(hexon,形成病毒衣殼20個體面的主要蛋白)設(shè)計外引物Ad1和Ad2[11],構(gòu)建質(zhì)粒,同樣根據(jù)六鄰體區(qū)設(shè)計內(nèi)引物 AD3和 AD4,探針 ADP[12],建立real-time PCR方法。引物和探針由寶生物工程(大連)有限公司合成,具體信息如表1所示。

表1 腺病毒real-time PCR的引物和探針信息

2.3.3 腺病毒質(zhì)粒的構(gòu)建

以Ad V40為標(biāo)準(zhǔn)品構(gòu)建質(zhì)粒:首先采用外引物Ad1和Ad2進(jìn)行PCR擴增,切下瓊脂糖凝膠中的目的條帶,用凝膠回收試劑盒進(jìn)行純化,得到482 bp的DNA片段。然后用p MD○R 19-T載體將純化后的片段連接到大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞上,經(jīng)轉(zhuǎn)化和藍(lán)白斑篩選后,用載體引物(RV-M和 M13-47)擴增驗證目的片段,采用高純度質(zhì)粒提取試劑盒(天根)提取質(zhì)粒,測定吸光度值,計算重組質(zhì)粒的拷貝數(shù)。

2.3.4 Taq Man探針法real-time PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立

用EASY-Dillution將已知拷貝數(shù)的重組質(zhì)粒作10倍系列梯度稀釋,將標(biāo)準(zhǔn)DNA稀釋至終濃度為107~100copies/μL,建立探針法real-time PCR。根據(jù)每個反應(yīng)管內(nèi)熒光信號到達(dá)設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)(Ct值)最小而熒光增加值(ΔRn)較大的原則,確定最佳引物濃度為0.2μmol/L,探針濃度為0.15 μmol/L。反應(yīng)體系為20μL:PremixExTaqTM(2×)10.0μL;PCR上游引物AD3(10μmol/L)0.4μL;下游引物 AD4(10μmol/L)0.4μL;熒光探針 ADP(3 μmol/L)1.0μL;ROX Reference DyeⅡ(50×)0.4μL;DNA模板1.0μL;dd H2O(滅菌雙蒸水)6.8μL,每個樣品設(shè)置兩個平行。優(yōu)化后的反應(yīng)程序采用三步法:95℃10 s;58℃15 s;62℃1 min,40 cycles。利用實時定量PCR儀(7500 ABI公司)SDS軟件獲得標(biāo)準(zhǔn)曲線及其相應(yīng)數(shù)據(jù)。

2.3.5 Real-time PCR靈敏度、特異性和重復(fù)性測試

為檢測Taq Man探針法real-time PCR方法的靈敏度,將質(zhì)粒逐級稀釋,檢測其靈敏度。

為檢測Taq Man探針法real-time PCR引物和探針的特異性,在操作過程中用上述引物和探針同時進(jìn)行脊髓灰質(zhì)炎病毒Ⅰ型疫苗株、甲肝病毒疫苗株、輪狀病毒和星狀病毒的c DNA擴增,用磷酸鹽緩沖液(PBS)作為陰性對照。

為檢測Taq Man探針法real-time PCR的重復(fù)性,分兩次重復(fù)檢測同一濃度的標(biāo)準(zhǔn)品106copies/μL,即每次實驗均用此標(biāo)準(zhǔn)品作為模板,各設(shè)6個平行,比較兩次結(jié)果Ct值的標(biāo)準(zhǔn)差。

2.3.6 樣品中腺病毒的定量測定

通過預(yù)實驗測定樣品的濃度范圍,從而確定標(biāo)準(zhǔn)品的稀釋范圍。取海水和貝類樣品的DNA為模板,采用已建立的探針法real-time PCR定量檢測20份表層海水和162份貝類樣品中的腺病毒。每個樣品設(shè)置兩個重復(fù),實驗同時設(shè)置陰性對照,擴增標(biāo)準(zhǔn)曲線。

2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計

應(yīng)用Fisher exact test軟件,分析腺病毒的污染在離岸100 m和1 000 m處是否有差別,取95%的置信區(qū)間。

3 結(jié)果

3.1 Taq Man探針法real-time PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備

以起始模板數(shù)(CO)的對數(shù)為X軸,以臨界循環(huán)數(shù)為Y軸,建立實時定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線。經(jīng)擴增,當(dāng)DNA重組質(zhì)粒在5.187×106~5.187×102copies/μL范圍內(nèi)時曲線的相關(guān)性最好,相關(guān)系數(shù)(R2)=0.996 3,斜率為-3.028(有效范圍-3.0~-3.5),陰性對照無擴增,符合樣品測定的要求(圖2)。

3.2 Real-time PCR方法的靈敏度、特異性和重復(fù)性試驗

經(jīng)測定,本研究建立的real-time PCR方法至少能檢測到51 copies病毒。

以脊髓灰質(zhì)炎病毒、甲肝病毒、輪狀病毒和星狀病毒4種常見胃腸道感染病毒的c DNA為模板,檢測real-time PCR方法的特異性,結(jié)果均無信號擴增,說明引物和探針特異性良好,后續(xù)由該方法測定的腺病毒結(jié)果可靠。

Real-time PCR方法的重復(fù)性測試結(jié)果如表2所示,兩組重復(fù)實驗測得5.187×106copies/μL標(biāo)準(zhǔn)品的Ct值標(biāo)準(zhǔn)差分別為0.087和0.082,說明本研究建立的real-time PCR方法重復(fù)性良好。

3.3 樣品中腺病毒的檢測

經(jīng)超濾法濃縮后,采用優(yōu)化的real-time PCR方法檢測全國10個海水浴場表層海水,結(jié)果有5個浴場受到了腺病毒污染,20份水樣中有7份樣品呈腺病毒陽性,陽性檢出率為35%,其濃度范圍為1.1×107~2.8×107copies/L,具體含量如表3所示。應(yīng)用Fisher exact test軟件分析腺病毒的污染與離岸距離的遠(yuǎn)近(100 m和1 000 m)之間相關(guān)性,結(jié)果二者差異不顯著(表4)。

表3 中國近岸20份海水樣品的Taq Man real-time PCR檢測結(jié)果

應(yīng)用優(yōu)化的real-time PCR方法對162份貝類樣品中腺病毒進(jìn)行分析,結(jié)果得到19份陽性樣品,其陽性檢出率為11.7%,貝類組織中腺病毒含量為2.4×104~3.1×105copies/g,與Costafreda等[13]檢測的蛤蜊體內(nèi)甲肝病毒含量(103~105copies/g)相近。全國10個重點沿岸省市除河北省和天津市外,其余8個省份主要增養(yǎng)殖區(qū)的經(jīng)濟貝類均被腺病毒污染。在選取的6種經(jīng)濟貝類樣品中,除蚶類外其余5種均被腺病毒污染,其中牡蠣的陽性檢出率最高(為29.4%),其次是蟶類(為15.8%)(表5)。

表4 離岸100 m和1 000 m距離處海水中腺病毒陽性之間的相關(guān)性分析

表5 全國10個沿海省市162份貝類的腺病毒定量檢測結(jié)果

4 討論

環(huán)境中的腸道腺病毒主要通過糞-口途徑進(jìn)入人體,在海水浴場娛樂(如游泳、劃船等)時接觸了受腺病毒沾污的海水,生食或食用烹調(diào)不當(dāng)?shù)娜静《镜暮.a(chǎn)品,都有可能造成胃腸炎疾病的感染[14]。雖然腺病毒已經(jīng)在環(huán)境樣本中被普遍檢測到[15—16],但是在我國海水浴場和貝類樣品中的相關(guān)報道并不多見。前期,我們在主要游泳季節(jié)(5—10月),采用普通PCR技術(shù)分析結(jié)果表明,大連星海浴場表層海水中四種胃腸道病毒污染比較普遍,且8月份游泳高峰期最為嚴(yán)重,以腺病毒污染為首[17]。用同樣的方法檢測了8月份我國主要增養(yǎng)殖區(qū)經(jīng)濟貝類,結(jié)果顯示腺病毒的污染也比較普遍[18]。為全面掌握腺病毒的污染程度,本研究在前期定性檢測的基礎(chǔ)上對腺病毒進(jìn)行了定量檢測。

全國10個海水浴場20份水樣中腺病毒的含量為1.1×107~2.8×107copies/L,高于Fong等[18]檢測到的美國某浴場和污水處理廠中腺病毒污染濃度(5.35×105和1.15×106copies/L)。由此可見,目前污水處理方法不足以去除其中的病毒粒子。通過比較娛樂者較密集的離岸100 m處和較稀疏的離岸1 000 m處腺病毒的分布與含量發(fā)現(xiàn),雖然前者陽性檢出率比后者高(表3),但是二者無顯著差別(見表4)。分析可能是由于潮汐、風(fēng)浪等作用將病毒的污染范圍進(jìn)一步擴大,同時也反映了腺病毒在水環(huán)境中存活的時間較長,這一結(jié)果與指示細(xì)菌的分布有所不同[20]。

有關(guān)貝類體內(nèi)甲肝病毒和諾如病毒的real-time PCR檢測比較多[21—22],但是腺病毒的相關(guān)報道卻很少,目前僅見Engelska[23]對牡蠣和貽貝體內(nèi)腺病毒35型污染情況進(jìn)行分析。自貝類傳播的微生物疾病被第一次報道以來,全世界因食用貝類而造成的胃腸炎疾病屢見不鮮[24]。在本次受檢的162份貝類樣品中,牡蠣的陽性檢出率最高(表5),這一結(jié)果與國外臨床調(diào)查結(jié)果一致[25]。美國每年有3 300萬例食物傳播疾病,其中8%由生食牡蠣引起,在因食用貝類而造成的胃腸炎疾病案例中牡蠣占了44%[26]。由此可見,牡蠣具有較強的攜帶病毒的能力。牡蠣是我國重要的海產(chǎn)貝類,除了能夠富集甲肝、諾如病毒等病毒外,還能富集副溶血性弧菌等病原菌[27],此外,還可能同時攜帶幾種不同的病原體[28],然而我國乃至世界沿海城市素有生食牡蠣的習(xí)慣,在本次調(diào)查中,牡蠣中腺病毒含量達(dá)2.4×104~1.1×105copies/g,由于目前的檢測方法尚未標(biāo)準(zhǔn)化,導(dǎo)致目前國內(nèi)外食品衛(wèi)生安全中尚未對胃腸道病毒這一重要病原體作出安全閾值規(guī)定[29],因此,為保障食品安全,消費者在食用雙殼貝類時,一定要充分煮熟;同時建議管理者盡快將胃腸道病毒指標(biāo)檢測規(guī)范化并列入《海水貝類衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)》[28]。

在本次調(diào)查的10個沿海省市中,除天津市外其余省份的海水浴場或經(jīng)濟貝類均有不同程度的污染,尤其是山東、遼寧和浙江3個省份,其海水浴場和貝類增養(yǎng)殖區(qū)同時受到了腺病毒的污染,可見這3個省份近岸海水中糞便污染是一個比較普遍的現(xiàn)象。如果游泳者在被污染的海水浴場活動,或消費者食用被污染的貝類,都有可能造成感染。另有報道稱,感染者及其攜帶者的糞便中病毒含量高達(dá)108~1010copies/g[30],一旦感染者的糞便未經(jīng)適當(dāng)處理排入環(huán)境中,就有可能造成循環(huán)污染。

本研究采用real-time PCR方法,對我國主要海水浴場表層海水和海水增養(yǎng)殖區(qū)經(jīng)濟貝類中腺病毒的污染進(jìn)行了定量檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn),腺病毒在這兩個主要傳播介質(zhì)中存在普遍,且污染含量較高。人類腸道腺病毒可以很好地指示糞便污染,可以幫助公眾預(yù)警病毒在人群中的暴發(fā)流行[31]。為管理部門制定娛樂用水以及貝類食品安全標(biāo)準(zhǔn)提供可靠的依據(jù)。

5 結(jié)論

(1)采用 Taq Man 探針法real-time PCR技術(shù),分析全國10個海水浴場表層海水中腸道腺病毒的污染,其陽性檢出率為35%,污染濃度為1.1×107~2.8×107copies/L;離岸100 m處和1 000 m處腺病毒的污染分布及濃度沒有顯著差異。

(2)采用 Taq Man 探針法real-time PCR技術(shù),分析全國10個省市162份經(jīng)濟貝類中腺病毒的陽性檢出率為11.7%,污染濃度為2.4×104~3.1×105copies/g,10個省市中有8個省市檢出腸道腺病毒,6種經(jīng)濟貝類中,牡蠣富集病毒的能力最強。

(3)在調(diào)查的10個省市中,山東、遼寧和浙江3省的海水浴場和主要經(jīng)濟貝類均受到了腺病毒的污染,說明這3個省份近岸糞便的污染普遍。人類腸道腺病毒可以很好地指示糞便污染,幫助公眾預(yù)警病毒在人群中的暴發(fā)流行。

致謝:感謝中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制段招軍研究員為本研究提供病毒陽性樣本!

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