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一種新的海洋微藻病毒絲氨酸蛋白酶基因的克隆表達(dá)及其活性分析

2014-10-27 05:37:34李麗華邱健健蔡藝欽于鵬劉靜雯
海洋學(xué)報(bào) 2014年8期
關(guān)鍵詞:絲氨酸宿主蛋白酶

李麗華,邱健健,蔡藝欽,于鵬,劉靜雯*

(1.集美大學(xué) 食品與生物工程學(xué)院,福建 廈門361021;2.福建省高校食品微生物與酶工程技術(shù)研究中心,福建 廈門361021)

1 引言

海洋微藻類病毒廣泛分布于自然海域。病毒的裂解是導(dǎo)致浮游植物死亡和種群數(shù)量減少的主要因素之一,并控制著浮游植物群落的多樣性和豐度[1]。病毒和宿主在不斷相互作用過程中,通過相互競爭并協(xié)同進(jìn)化以防止自身的滅亡[2]。從阻止病毒DNA的注入到干擾病毒DNA的復(fù)制、RNA轉(zhuǎn)錄以及子代病毒的形成,宿主進(jìn)化出了一系列的防御機(jī)制來破壞病毒的感染系統(tǒng)。相應(yīng)地,為了實(shí)現(xiàn)自身的最大增殖,病毒也形成許多策略逃避宿主的防御系統(tǒng),如在感染宿主后,病毒將自身基因組攜帶的基因或是從上個(gè)宿主細(xì)胞中獲得的基因整合到宿主基因組中——即基因橫向轉(zhuǎn)移,這些基因表達(dá)的蛋白能夠阻止宿主細(xì)胞凋亡、抑制細(xì)胞內(nèi)激酶的降解、刺激細(xì)胞生長,從而為自身復(fù)制創(chuàng)造便利條件[1,3]。

海洋球石藻Coccolithophores是一類生活于海洋中的單細(xì)胞微型浮游植物,廣泛分布在世界范圍的近海和大洋水域中,尤其是亞極地較高緯度海區(qū)的優(yōu)勢種類,也是該海域典型的赤潮種。大量研究證實(shí)病毒感染是終止球石藻Emilianiahuxleyi赤潮的一個(gè)重要因素[4]。目前已分離到十多株海洋球石藻病毒,均為雙鏈DNA病毒,已被確定為雙鏈DNA病毒科中的一個(gè)新屬——Coccolithovirus[5—6]。對海洋球石藻病毒(E.huxleyivirus)Eh V86基因組測序注釋結(jié)果發(fā)現(xiàn),該基因組包含472個(gè)編碼基因,其中85%的基因被預(yù)測為編碼膜蛋白,但其確切功能未知,僅有約14%的基因在數(shù)據(jù)庫中具有功能歸屬[7]。該病毒編碼的功能基因主要包括:參與細(xì)胞氧化還原反應(yīng)的硫氧還蛋白(Trx)基因、構(gòu)成病毒顆粒的基本組成單元的主要外殼蛋白(MCP)基因和介導(dǎo)鞘脂類物質(zhì)代謝的鞘脂類物質(zhì)合成基因(SBP)等[7]。另外一些基因編碼的蛋白酶可能與病毒吸附、宿主識(shí)別、Caspase介導(dǎo)的凋亡途徑、信號級聯(lián)通路、活性氧的調(diào)控、成熟病毒組裝和釋放等功能緊密相關(guān)[7]。目前,在Eh V86基因組中,有5種被預(yù)測為編碼絲氨酸蛋白酶的基因,分別為ehv021、ehv361、ehv447、ehv151和ehv160,其中ehv021、ehv151和ehv160被預(yù)測為胰蛋白酶超家族[7—8]。微陣列分析這些基因的轉(zhuǎn)錄情況表明,除了ehv361外,所有病毒編碼的絲氨酸蛋白酶均在感染過程中表達(dá)[7—8]。但絲氨酸蛋白酶基因的表達(dá)與病毒感染之間的相互關(guān)聯(lián)尚不清楚。

絲氨酸蛋白酶(serine proteinase,Sp)是一類以絲氨酸為活性中心的重要的蛋白水解酶,廣泛存在于動(dòng)物、植物、細(xì)菌、病毒、真菌中,參與生命的各種反應(yīng)如蛋白質(zhì)翻譯后的加工、細(xì)胞分裂、病原體感染、宿主的防御、組織降解及細(xì)胞凋亡等,它們通過對蛋白酶原的激活或抑制而起調(diào)節(jié)因子作用[9]。研究發(fā)現(xiàn)ATP依賴的絲氨酸蛋白酶具有一個(gè)保守的生理功能,即作為分子伴侶,不僅起到水解的作用,還具有蛋白組裝及蛋白復(fù)合體降解等功能[10],從而介導(dǎo)一系列控制熱激反應(yīng)、噬菌體的生命周期和細(xì)胞程序性死亡(PCD)等過程的蛋白質(zhì)的降解[11—12]。有些致病性真菌在感染宿主過程中自身分泌的內(nèi)源性蛋白酶包含有絲氨酸蛋白酶以破壞宿主細(xì)胞正常的生理代謝功能,同時(shí)也刺激宿主應(yīng)激性地產(chǎn)生絲氨酸蛋白酶作為信號分子誘導(dǎo)宿主防御系統(tǒng)基因的表達(dá),從而對抗病原菌的侵染[13]。海洋微藻類病毒與其宿主是否也存在類似的相互作用尚未見報(bào)道。目前報(bào)道的絲氨酸蛋白酶有很多,諸如參與植物器官衰老的植物絲氨酸蛋白酶[14],也有利用基因工程技術(shù)克隆表達(dá)的微生物絲氨酸蛋白酶,如稻瘟病原菌絲氨酸蛋白酶[13],以研究其結(jié)構(gòu)與功能。

本研究以海洋球石藻E.huxleyi病毒Eh V99B1為研究對象。從Eh V99B1基因組中克隆Sp基因,對該基因序列進(jìn)行系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析,并于大腸桿菌中進(jìn)行重組表達(dá)及活性分析,為進(jìn)一步研究Eh V99B1-Sp在微藻病毒與宿主相互作用過程中的調(diào)節(jié)作用及其功能與應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

2 材料與方法

2.1 實(shí)驗(yàn)材料

2.1.1 海藻和病毒

實(shí)驗(yàn)用海洋球石藻Emilianiahuxleyi株系為Eh-BOF92;病毒株為Eh V99B1,均分離自挪威海域,由挪威卑爾根大學(xué)生物系Gunnar教授贈(zèng)送。

2.1.2 菌種與試劑

TaqDNA聚合酶、T4DNA連接酶、核酸內(nèi)切酶EcoR I和NotI均購自Ta Ka Ra公司產(chǎn)品,p MD19-T載體購自碧云天生物技術(shù)研究所,DNA凝膠回收試劑盒和質(zhì)粒提取試劑盒為TIANGEN公司產(chǎn)品,大腸桿菌菌株Top10、E.coilBL21和p ET32a表達(dá)載體均為本實(shí)驗(yàn)室保存,瓊脂糖為西班牙進(jìn)口分裝,測序由廣州英駿生物技術(shù)有限公司完成,鯉魚肌肉絲氨酸蛋白酶(MBSP)抗體由集美大學(xué)生物工程學(xué)院曹敏杰教師實(shí)驗(yàn)室自制,其余試劑均為進(jìn)口分裝或國產(chǎn)分析純。

2.2 實(shí)驗(yàn)方法

2.2.1 引物設(shè)計(jì)

根據(jù)GenBank上報(bào)道的Eh V86病毒基因組的絲氨酸蛋白酶序列,采用GeneDoc軟件和Primer Premier5.0軟件設(shè)計(jì)引物。本實(shí)驗(yàn)所用引物為:

F∶5’-CGGAATTCATTTCAAGAGTATTGGCAGT CG-3’(劃線部分為EcoR I酶切位點(diǎn));R∶5’-ATTGCGGCCGCTTATTGTATGTGATTCGTT -3’(劃線部分為NotI酶切位點(diǎn))。

2.2.2 病毒DNA的提取

采用CTAB法提取病毒基因組DNA[15]。

2.2.3 Eh V99B1-Sp基因的PCR擴(kuò)增

以提取的病毒基因組DNA為模板,在25μL反應(yīng)體系中(無菌dd H2O 7.5μL,Taq預(yù)混液12.5 μL,模板3μL,引物F和R各1μL)進(jìn)行PCR,反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性3 min,95℃ 30 s,50℃ 60 s,72℃90 s,擴(kuò)增30個(gè)循環(huán),72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠檢測,使用DNA凝膠回收試劑盒回收。

2.2.4 感受態(tài)細(xì)胞的制備

制備方法參照《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南(第3版)》[16]。

2.2.5 Eh V99B1-Sp基因的克隆

(1)T克隆的構(gòu)建

按照T載體:PCR產(chǎn)物=1∶5~8的比例,取回收的PCR產(chǎn)物4μL,T載體1μL和T4DNA ligest solutionⅠ5μL混合,于16℃連接16 h。

(2)轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞

將10μL T克隆連接產(chǎn)物加入到200μL的感受態(tài)細(xì)胞中,冰浴30 min,42℃熱激90 s,冰浴2 min。加入到含有800μL LB培養(yǎng)基(1%蛋白胨,0.5%酵母膏,1%NaCl,p H 7.0)的試管中混勻,37℃培養(yǎng)1 h。取未離心菌液200μL涂布含氨芐青霉素(終濃度為0.1 mg/mL)的LB固體平板(1%蛋白胨,0.5%酵母提 取 物,1%NaCl,p H 7.0,預(yù)先涂有40μL 20 mg/mL的X-gal與4μL 200 mg/mL的IPTG),同時(shí)將剩余菌液于8 000 r/min離心1 min,分別取上清、沉淀各200μL涂布平板(同上),于37℃倒置培養(yǎng)約12 h。

(3)重組質(zhì)粒p MD19-T-Eh V99B1-Sp的篩選與鑒定

用滅菌的牙簽挑取白斑,接種于含有氨芐青霉素(終濃度0.1 mg/mL)的LB液體培養(yǎng)基中37℃搖床上振蕩培養(yǎng)約12 h。質(zhì)粒小量抽提試劑盒提取質(zhì)粒,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測確定重組質(zhì)粒。重組質(zhì)粒經(jīng)PCR和雙酶切驗(yàn)證,雙酶切采用20μL體系:10×H buffer 2μL,0.1%BSA 2μL,EcoRI 1μL,NotI 1 μL,重組質(zhì)粒14μL,37℃反應(yīng)3.5 h,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測;陽性克隆送至廣州英駿生物技術(shù)有限公司測序。

2.2.6 Eh V99B1-Sp生物信息學(xué)分析

利用DNAStar、Blast等軟件對測序結(jié)果進(jìn)行分析并預(yù)測其一級結(jié)構(gòu);利用MEGA4.1分析軟件建立系統(tǒng)進(jìn)化樹;然后再利用GeneDoc、Clustal X、Raswin等軟件和http//www.expasy.ch/tools/protparam.html、http//espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/index.php、http//swissmodel.expasy.org等在線軟件對其二級和三級結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測,并利用Ex PASy網(wǎng)站的Prot Scale程序分析蛋白疏水性結(jié)構(gòu)(http://us.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl)、蛋白質(zhì)跨膜結(jié)構(gòu)(http://www.ch.embnet.org/soft ware/TMPRED-for m.html)及信號肽區(qū)域(http://www.cbs.dtu.dk/services/Signal P/)。

2.2.7 p ET32a-Eh V99B1-Sp重組質(zhì)粒的構(gòu)建

提取p MD19-T-Eh V99B1-Sp克隆質(zhì)粒和表達(dá)載體p ET32a,用EcoRI及NotI分別對p MD19-TEh V99B1-Sp克隆質(zhì)粒和表達(dá)載體p ET32a進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物用DNA凝膠回收試劑盒回收,T4 DNA ligest sol ution I對回收產(chǎn)物進(jìn)行連接(連接反應(yīng)為10μL體系:回收目的基因4μL,p ET32a載體1μL,T4DNA ligest sol utionI 5μL,于16℃連接16 h);轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞大腸桿菌Top10,提取質(zhì)粒,進(jìn)行PCR和酶切鑒定;陽性重組表達(dá)質(zhì)粒(p ET32a-Eh V99B1-Sp)轉(zhuǎn)化E.coliBL21(過程同1.2.5.2),進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證(挑取固體平板上的單菌落,重懸于20μL無菌水中,100℃煮沸10 min,離心取上清;取3μL上清作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性3 min,95℃30 s,50℃60 s,72℃90 s,擴(kuò)增30個(gè)循環(huán),72℃延伸10 min,PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

2.2.8 重組菌株(BL21/p ET32a-Eh V99B1-Sp)的活性檢測

將陽性重組菌(BL21/p ET32a-Eh V99B1-Sp)和實(shí)驗(yàn)對照菌株(BL21/p ET32a)分別接種于含有氨芐青霉素(終濃度0.1 mg/mL)的1%脫脂牛奶平板(包括1%脫脂奶粉,1%瓊脂溶于蒸餾水),37℃培養(yǎng)24 h,觀察菌落水解情況。

2.2.9 p ET32a-Eh V99B1-Sp在E.ColiBl21誘導(dǎo)表達(dá)

將陽性重組菌株(BL21/p ET32a-Eh V99B1-Sp)和實(shí)驗(yàn)對照菌株(BL21/p ET32a)分別接種于含有氨芐青霉素(終濃度0.1 mg/mL)的LB液體培養(yǎng)基中(包括1%蛋白胨、0.5%酵母膏、1%Na Cl,p H 7.0),37℃ 振蕩培養(yǎng)至OD600達(dá) 到 0.7 左 右,從IPTG 濃度(0.3 mmol/L、0.5 mmol/L、0.8 mmol/L、1.0 mmol/L)、誘導(dǎo)溫度(18℃、25℃、30℃、37℃)和誘導(dǎo)時(shí)間(3 h、5 h、7 h、10 h、12 h)等三方面進(jìn)行表達(dá)條件優(yōu)化,離心收集菌體并重懸于PBS中,超聲波破碎,4℃、12 000 r/min離心,將沉淀重懸于等體積的PBS中,分別取全細(xì)胞、上清和沉淀進(jìn)行SDS-PAGE。

2.2.10 重組蛋白 Eh V99B1-Sp的純化和 Westernbloting檢測

經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)后的菌體經(jīng)超聲波破碎,4℃、15 000 r/min離心20 min,取上清過 Ni-NATagarose柱,用含250 mmol/L咪唑的洗脫緩沖液洗脫目的蛋白(參照Qiagen公司鎳離子親和層析柱操作說明),SDS-PAGE檢測目的蛋白的純度。用 Western-bloting檢測目的蛋白的特異性,Western-bloting中所用的一抗為鯉魚肌肉絲氨酸蛋白酶(MBSP),稀釋比例1∶100,二抗為辣根過氧化物酶標(biāo)記的兔抗鼠Ig G,稀釋比例1∶200,用DAB顯色。

3 結(jié)果

3.1 Eh V99B1-Sp的擴(kuò)增

以Eh V99B1基因組為模板,PCR擴(kuò)增獲得大小約為1 110 bp的DNA片段(GenBank,登陸號:KC161207)。構(gòu)建p ET32a-Eh V99B1-Sp重組表達(dá)載體并轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21,PCR和雙酶切鑒定結(jié)果如圖1。

圖1 Eh V99B1-Sp重組載體雙酶切產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Fig.1 Agarose gel electrophoresis of the digest product of the p ET32a-Sp recombinant plasmid Lane

3.2 Eh V99B1-Sp基因的分子生物學(xué)特征

3.2.1 Eh V99B1-Sp的同源性比對及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析

多重同源性比對發(fā)現(xiàn):該克隆片段與GenBank中Eh V86分離株(登陸號:NC_007346)的同源性為95%,氨基酸序列的同源性為97%,而與其他物種的Sp氨基酸序列同源性僅為28%~32%。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果顯示,Eh V之間的Sp自成一支且與Ctenocephalidesf elis貓櫛首蚤的距離最近,與其他種類從低級至高級越來越遠(yuǎn)(見圖2)。

3.2.2 Eh V99B1-Sp生化特性和結(jié)構(gòu)分析

用在線軟件分析表明,該基因編碼的蛋白質(zhì)有368個(gè)氨基酸,相對分子量約為39.6 k Da,理論等電點(diǎn)(pI)為6.255,其包含36個(gè)堿性氨基酸,33個(gè)酸性氨基酸,115個(gè)疏水性氨基酸,128個(gè)極性氨基酸??缒そY(jié)構(gòu)分析該蛋白是一個(gè)二次跨膜蛋白,具有典型的LTAGHC(組氨酸活性位點(diǎn)區(qū)域)和AICNGDSGGPLF(絲氨酸活性位點(diǎn)區(qū)域)兩個(gè)絲氨酸蛋白酶水解催化活性位點(diǎn)的氨基酸基序;其二級結(jié)構(gòu)中包含2個(gè)α螺旋,15個(gè)β折疊(見圖3a)。

圖2 基于Eh V99B1-Sp和GeneBank中其他9種物種Sp氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic inference tree based on the amino acid sequences of Sp from different organisms in GenBank

以物種blackrat(PDB登錄號:1ANE)為模板預(yù)測Eh V99B1-Sp的三級結(jié)構(gòu),兩個(gè)物種的絲氨酸蛋白酶的三級結(jié)構(gòu)都具有一個(gè)疏水口袋(活性部位),AICNGDSGGPLF位于該酶催化活性部位的核心位置,其周圍的α螺旋和β折疊區(qū)域展開形成口袋結(jié)構(gòu),His87、Asp187和Ser245組成催化三聯(lián)體結(jié)構(gòu)(見圖3b)。

3.3 p ET32a-Eh V99B1-Sp的活性檢測

在1%脫脂牛奶平板上,對照BL21-p ET32a不形成降解牛奶的水解圈,而 BL21-p ET32a-Eh V99B1-Sp則降解牛奶形成明顯的水解圈,表明其分泌的蛋白酶具有生物學(xué)活性(見圖4)。

3.4 p ET32a-S p在E.coli BL21中的表達(dá)及純化的電泳檢測

p ET32a表達(dá)載體融合了Trx和His標(biāo)簽蛋白,標(biāo)簽的大小為20.5 k Da,目的基因表達(dá)的蛋白在39.5 k Da左右,融合蛋白的預(yù)計(jì)分子量約為60 k Da。通過優(yōu)化誘導(dǎo)表達(dá)條件,最終用終濃度為0.5 mmol/L的IPTG在18℃誘導(dǎo)10 h獲得了高效表達(dá),可溶性蛋白占總蛋白的23.4%。經(jīng)Ni-NATagarose親和層析獲得純化的重組蛋白(見圖5a)。

3.5 Western-bloting檢測目的蛋白的特異性

取少量純化蛋白和未誘導(dǎo)菌體蛋白(陰性對照)進(jìn)行SDS-PAGE,電轉(zhuǎn)移至NC膜。用鯉魚肌肉MBSP作為一抗,HRP標(biāo)記的兔抗鼠Ig G作為二抗,DAB顯色后在預(yù)期大?。?0 k Da)處可見清晰染色條帶,分子量為60 k Da(見圖5b),表明重組表達(dá)蛋白為絲氨酸蛋白酶。

4 討論

絲氨酸蛋白酶是一類以絲氨酸為活性中心的重要的蛋白水解酶,在生物有機(jī)體中發(fā)揮著重要的生理作用,具有廣泛的研究和應(yīng)用價(jià)值[9]。絲氨酸蛋白酶超家族成員具有多種多樣的生理功能,在機(jī)體很多致病過程以及細(xì)胞內(nèi)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等方面起著重要作用。在長期的進(jìn)化過程中,絲氨酸蛋白酶氨基酸序列產(chǎn)生了很大的差異,絲氨酸蛋白酶超家族成員的某些蛋白質(zhì)序列的相似度甚至低于20%,但該蛋白質(zhì)的活性結(jié)構(gòu)域卻極其保守,都具有一個(gè)類似于口袋狀的核心催化結(jié)構(gòu)域 Asp-His-Ser[17]。由于絲氨酸蛋白酶在結(jié)構(gòu)上的微小變化,導(dǎo)致其在功能上的進(jìn)化。本實(shí)驗(yàn)從Eh V99B1中克隆獲得了Eh V99B1-Sp基因,表達(dá)產(chǎn)物經(jīng)Western-bloting檢測,顯示純化獲得的蛋白為絲氨酸蛋白酶,分子量大小與預(yù)期的相符合,生物信息學(xué)分析與其他物種的Sp蛋白的同源性很低,只有28%~32%,但其蛋白結(jié)構(gòu)域中也保留了LTAGHC和AICNGDSGGPLF兩個(gè)非常保守的水解酶催化活性位點(diǎn)的氨基酸基序。說明球石藻病毒的Sp在結(jié)構(gòu)與功能上與其他物種之間存在著一定的差異,可能是絲氨酸蛋白酶家族的一個(gè)新成員。

圖3 Eh V99B1-Sp蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測圖Fig.3 Predictions of the structures of Eh V99B1-Sp.

圖4 1%脫脂牛奶平板檢測重組菌BL21-p ET32a-Eh V99B1-Sp的蛋白酶酶活Fig.4 Analysis of Eh V99B1-Sp protease activity on the 1%degreased milk plate

基因橫向轉(zhuǎn)移是指遺傳物質(zhì)從一個(gè)生物體轉(zhuǎn)移到另一個(gè)不同的生物體中,或者單個(gè)細(xì)胞內(nèi)部的細(xì)胞器之間進(jìn)行遺傳物質(zhì)的交流,生物個(gè)體之間進(jìn)行遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移沒有親緣關(guān)系以及方向的界限[18]?;驒M向轉(zhuǎn)移現(xiàn)象廣泛存在于噬菌體、真核病毒以及一些普通的轉(zhuǎn)導(dǎo)粒子。大量的研究表明病毒能夠利用基因橫向轉(zhuǎn)移影響宿主的新陳代謝、免疫能力和分布情況,最為典型的例子要屬藍(lán)藻病毒,其基因組攜帶有來自宿主的光合作用基因(如psbA和psbD),這些基因在強(qiáng)光下可誘導(dǎo)表達(dá),被認(rèn)為是在藍(lán)藻病毒裂解周期中用于延長光合作用效應(yīng)來維持該病毒質(zhì)子泵系統(tǒng)的運(yùn)轉(zhuǎn)[19],類似的現(xiàn)象也在痘病毒和Mi mi病毒中被發(fā)現(xiàn)[20—21]。另外,研究發(fā)現(xiàn)海洋紅細(xì)菌Rhodobacter和玫瑰桿菌Rosebacterlitor alis的普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)子可以作為載體將宿主基因包裹在其病毒顆粒內(nèi),通過洋流橫向轉(zhuǎn)移給其他生態(tài)系統(tǒng)的細(xì)菌,促使同一類群細(xì)菌基因組協(xié)同進(jìn)化[22—23]。因此,基因橫向轉(zhuǎn)移現(xiàn)象其實(shí)質(zhì)是宿主與病毒相互作用的結(jié)果。在Eh V基因組中存在7個(gè)預(yù)測編碼SBP關(guān)鍵催化酶的基因,這些基因不存在于其他已知的病毒中,但是存在于宿主基因組中,證實(shí)SBP基因在病毒和真核生物之間進(jìn)行了橫向轉(zhuǎn)移[24]。本研究獲得的Eh V99B1-Sp基因與宿主的Sp基因同源性只有34.2%,因此,我們推測該病毒的Sp基因并非從宿主細(xì)胞直接通過基因橫向轉(zhuǎn)移獲得,而可能是在長期進(jìn)化過程中由病毒自身攜帶或者從其他生物逐步轉(zhuǎn)移而來。

圖5 p ET32a-Eh V99B1-Sp重組蛋白表達(dá)的SDS-PAGE分析及 Western-blot分析Fig.5 Analysis of p ET32a-Eh V99B1-Sp fusion protein expressed in E.coli by SDS-PAGE and Western-blot

大量的研究證實(shí)絲氨酸蛋白酶具有促進(jìn)細(xì)胞凋亡的作用[12—14]。Eh V感染可以誘導(dǎo)宿主細(xì)胞PCD并伴隨著Metacaspase的高活性表達(dá),而且PCD被認(rèn)為可能是該病毒調(diào)控其宿主死亡的重要方式[25]。絲氨酸蛋白酶不僅可以作為內(nèi)切酶對肽鏈中部起催化作用,還具有切除靶蛋白鏈末端氨基酸殘基的功能[10]。Eh V99B1的全基因組已經(jīng)測序[26],我們對Eh V99B1中另外3種假定的蛋白酶(ehv109類似于半胱氨酸蛋白酶,ehv133ATP依賴的絲氨酸蛋白酶水解亞基,ehv349半胱氨酸蛋白酶)進(jìn)行胰凝乳蛋白酶酶切位點(diǎn)預(yù)測,發(fā)現(xiàn)這3種蛋白酶中有兩種蛋白酶被預(yù)測存在胰凝乳蛋白酶酶切位點(diǎn),且分值大于0.5,表明這兩種假定的蛋白酶可能被Eh V99B1-Sp進(jìn)行特異的切割。同時(shí),生物信息分析顯示Eh V99B1-Sp是一個(gè)二次跨膜蛋白,因此,其可能作為信號通路中的一個(gè)調(diào)節(jié)因子參與Metacaspase酶原的激活,從而參與宿主細(xì)胞PCD進(jìn)程。另外,系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果顯示,Eh V99B1-Sp與Ctenocephalidesf elis絲氨酸蛋白酶的同源性較高,而C.f elis絲氨酸蛋白酶可以通過蛋白酶水解切割受體蛋白,使其構(gòu)象發(fā)生改變,從而介導(dǎo)受體的定位和激活,進(jìn)而啟動(dòng)跨膜信號轉(zhuǎn)導(dǎo)級聯(lián)通路[25],進(jìn)一步為我們的觀點(diǎn)提供了證據(jù)。而且有趣的是,Eh V感染宿主過程中伴隨著神經(jīng)酰胺的合成,而蛋白酶酶原的激活與神經(jīng)酰胺介導(dǎo)的凋亡途徑緊密相關(guān)[7]。神經(jīng)酰胺作為神經(jīng)鞘脂類物質(zhì)的主要成員之一,是機(jī)體調(diào)節(jié)各種細(xì)胞活動(dòng)重要的第二信使,其在胞內(nèi)的合成水平能夠影響多種細(xì)胞活動(dòng),特別是細(xì)胞凋亡和生長抑制活動(dòng)[27]。因此,絲氨酸蛋白酶作為迄今已知的最大的蛋白酶家族之一,在神經(jīng)酰胺的合成過程中可能發(fā)揮重要的作用。

絲氨酸蛋白酶是一類重要的蛋白水解酶,人們對其結(jié)構(gòu)和功能已經(jīng)進(jìn)行了深入的研究,并有不少種類的絲氨酸蛋白酶已應(yīng)用于醫(yī)藥等領(lǐng)域。在這些研究成果的基礎(chǔ)上人們可以通過絲氨酸蛋白酶基因的克隆、重組、表達(dá)以及蛋白互作等技術(shù)有效提高其產(chǎn)量,為絲氨酸蛋白酶的應(yīng)用提供了新的思路。Eh V99B1-Sp在大腸桿菌中的高表達(dá)可能與下面兩個(gè)因素有關(guān):第一,低溫條件下誘導(dǎo)能夠降低蛋白的合成速度,促進(jìn)蛋白質(zhì)的正確折疊。第二,Eh V99B1-Sp獲得可溶性表達(dá)可能是由于其N端融合了Trx標(biāo)簽,幫助表達(dá)蛋白形成二硫鍵,從而使蛋白溶解性及活性得到增強(qiáng)。采用革蘭氏陰性大腸桿菌BL21(蛋白酶缺陷型)作為受體菌,證實(shí)克隆基因的表達(dá)產(chǎn)物具有明顯的蛋白酶活性。我們用胰蛋白酶的特異性底物Boc-Phe-Ser-Arg-MCA 和 Boc-Leu-Lys-Arg-MCA 分 析Eh V99B1-Sp的底物特異性,結(jié)果顯示 Boc-Phe-Ser-Arg-MCA和 Boc-Leu-Lys-Arg-MCA 不能被 該酶分解,表明該酶可能是不具有胰蛋白酶特性的絲氨酸蛋白酶。本研究結(jié)果為進(jìn)一步探討Eh V99B1-Sp在球石藻病毒與宿主相互作用過程中的調(diào)節(jié)作用以及該病毒Sp的功能與應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。

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