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MGMT基因啟動(dòng)子甲基化與非小細(xì)胞肺癌關(guān)系的meta分析

2014-09-09 02:13:30房念珍谷俊東魏慧君尤嘉琮周清華
中國肺癌雜志 2014年8期
關(guān)鍵詞:癌基因洗液甲基化

房念珍 谷俊東 魏慧君 尤嘉琮 周清華

肺癌是目前發(fā)病率最高的惡性腫瘤,其死亡率在男性為第一位,女性為第二位。根據(jù)新近的流行病學(xué)資料顯示,每年全球肺癌新發(fā)病例高達(dá)120萬人,死亡病例約為100萬人[1]。肺癌已成為對(duì)人類生存構(gòu)成極大威脅的惡性腫瘤之一。近年來研究發(fā)現(xiàn)抑癌基因啟動(dòng)子甲基化與肺癌的發(fā)生有關(guān),如P16基因、MGMT基因、APC基因等,但由于各個(gè)研究樣本量較小,統(tǒng)計(jì)效能較低,說服力不強(qiáng),因此本研究采用meta分析的方法對(duì)MGMT基因啟動(dòng)子甲基化與非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)的相關(guān)性進(jìn)行了探討。

1 材料與方法

1.1 文獻(xiàn)檢索 計(jì)算機(jī)檢索Medline、EMBASE、CNKI及萬方等數(shù)據(jù)庫,收集公開發(fā)表的涉及MGMT基因啟動(dòng)子甲基化與NSCLC關(guān)系的臨床研究。檢索語種為英語和漢語,分別以“MGMT”、“l(fā)ung cancer”、“l(fā)ung carcinoma”、“non-small cell lung carcinoma”、“methylation”為主題詞和自由詞,檢索Medline和EMBASE英文數(shù)據(jù)庫;以“肺癌”“非小細(xì)胞肺癌”“肺腫瘤”“MGMT”基因,“甲基化”為關(guān)鍵詞或題名檢索CNKI和萬方等中文數(shù)據(jù)庫。

1.2 文獻(xiàn)納入標(biāo)準(zhǔn) ①研究對(duì)象經(jīng)病理學(xué)或細(xì)胞學(xué)診斷為NSCLC患者;②MGMT基因啟動(dòng)子檢測(cè)采用甲基化特異PCR方法;③研究結(jié)果提供癌組織與對(duì)照正常組織、血清、支氣管灌洗液的甲基化率。

1.3 數(shù)據(jù)提取 由兩名研究人員分別對(duì)納入的研究進(jìn)行相關(guān)數(shù)據(jù)提取,包括一般資料如文題、作者、期刊雜志、研究所在地區(qū)等;數(shù)據(jù)構(gòu)成:包括NSCLC患者癌組織、正常肺組織、血漿及支氣管灌洗液中MGMT基因啟動(dòng)子甲基化的發(fā)生率及甲基化模式。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 以NSCLC患者癌組織與對(duì)照正常組織MGMT基因啟動(dòng)子甲基化率的優(yōu)勢(shì)比(odds ratio, OR)為統(tǒng)計(jì)指標(biāo)。首先進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性檢驗(yàn),無統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性采用固定效應(yīng)模型合并數(shù)據(jù),存在統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性則采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。所有統(tǒng)計(jì)分析采用Stata 11.0軟件完成,雙側(cè)P≤0.05認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 檢索結(jié)果 檢索相關(guān)數(shù)據(jù)庫,最初檢索到相關(guān)文獻(xiàn)137篇,其中包括126篇英文文獻(xiàn),11篇中文文獻(xiàn)。嚴(yán)格依據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn),進(jìn)一步仔細(xì)閱讀摘要及全文后剔除122篇,最終有13篇文獻(xiàn)符合要求并納入本meta分析(圖1)。13篇文獻(xiàn)中中文文獻(xiàn)3篇,英文文獻(xiàn)10篇,原始研究均提供了較為完整的數(shù)據(jù)資料(表1)。

2.2 不同組織甲基化率比較 納入本meta分析研究中NSCLC患者癌組織中甲基化的發(fā)生率為38%(95%CI:23%-53%);NSCLC患者正常肺組織、血漿和支氣管灌洗液中MGMT基因啟動(dòng)子甲基化率分別為16%(95%CI:5%-27%)、23%(95%CI: 10%-34%)和39%(95%CI:23%-55%)。

2.3 異質(zhì)性檢驗(yàn) 以肺癌中組織中MGMT基因啟動(dòng)子甲基化率的優(yōu)勢(shì)比OR為效應(yīng)兩,進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性檢驗(yàn)。肺癌組織與血漿比較I2=41.4%,P=0.16;肺癌組織與正常肺組織比較I2=14.9%,P=0.37;肺癌組織與支氣管灌洗液比較I2=0.0%,P=0.89,均不存在統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性,統(tǒng)計(jì)分析均采用固定效應(yīng)模型。

2.4 MGMT基因啟動(dòng)子甲基化與肺癌發(fā)生關(guān)系 以患者正常肺組織為參照,肺癌中組織中MGMT基因啟動(dòng)子甲基化率的優(yōu)勢(shì)比OR=3.98(95%CI: 2.71-5.84, P<0.05);以患者血漿為參照,肺癌中組織中MGMT基因啟動(dòng)子甲基化率的優(yōu)勢(shì)比OR=1.88(95%CI: 1.16-3.05, P<0.05);以患者支氣管灌洗液為參照,肺癌中組織中MGMT基因啟動(dòng)子甲基化率OR=2.05(95%CI: 0.88-4.78, P>0.05)(圖2)。

2.5 敏感性分析 將納入研究的每一篇文獻(xiàn)逐一進(jìn)行踢出,評(píng)估單一研究對(duì)本meta分析結(jié)果的影響,結(jié)果顯示OR值置信區(qū)間始終變動(dòng)范圍在1.53-2.81之間,始終大于1。因此,本meta分析對(duì)納入研究中的單一數(shù)據(jù)不敏感,結(jié)論性質(zhì)穩(wěn)定。

2.6 發(fā)表偏倚的評(píng)估 根據(jù)Egger線性回歸法及Begg漏斗圖法(圖3)評(píng)估發(fā)表偏倚(t=1.55, P>0.05),提示研究結(jié)果不存在發(fā)表偏倚。

3 討論

肺癌為目前發(fā)病率最高的實(shí)體腫瘤,每年全球新發(fā)病例高達(dá)120萬,嚴(yán)重威脅人類的健康。目前肺癌的確切發(fā)病原因并不完全清楚,可能與遺傳背景和后天因素有關(guān)。遺傳背景包括性別、種族、家族腫瘤病史等,后天已知肺癌發(fā)生的危險(xiǎn)因素包括吸煙、環(huán)境污染、感染等。近年來研究發(fā)現(xiàn)抑癌基因的失活和癌基因的活化是肺癌發(fā)生的重要因素之一,抑癌基因失活的一個(gè)重要原因?yàn)楸碛^遺傳修飾改變,包括組蛋白甲基化、乙?;?、抑癌基因啟動(dòng)子甲基化和染色體重塑等[11]。其中抑癌基因啟動(dòng)子甲基化是目前研究的較為透徹的一種與肺癌發(fā)生有關(guān)的表觀遺傳修飾機(jī)制,抑癌基因啟動(dòng)子區(qū)CpG島中的胞嘧啶在甲基化轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferase, DNMT)的作用下發(fā)生甲基化,從而抑制基因轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物與該基因的啟動(dòng)子區(qū)域結(jié)合,導(dǎo)致該基因沉默,繼而導(dǎo)致抑癌基因表達(dá)下調(diào),促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖分裂,形成惡性轉(zhuǎn)化。

圖 1 文獻(xiàn)篩選流程圖Fig 1 Flow chart showing study selection procedure. NSCLC: non-small cell lung cancer

表 1 納入研究的基本特征Tab 1 General characteristics of the included studies

圖 2 非小細(xì)胞肺癌患者癌組織與自身對(duì)照組織MGMT基因啟動(dòng)子甲率的森林圖Fig 2 Forest plot of the methylation rate in MGMT promoter between cancer tissue and autologous controls in non-small cell lung cancer(NSCLC) patients

圖 3 Begg漏斗圖法評(píng)估發(fā)表偏倚Fig 3 Publication bias evaluation by Begg funnel plot

MGMT基因編碼產(chǎn)物為6-甲基鳥嘌呤DNA甲基轉(zhuǎn)移酶,該基因?yàn)镈NA損傷修復(fù)基因,對(duì)損傷的DNA可以進(jìn)行修復(fù),進(jìn)而阻止染色體的進(jìn)一步損傷[11]。該基因全長為170 kDa,包含有5個(gè)外顯子,編碼一個(gè)由207個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì),該蛋白為DNA損傷修改的重要成分之一。已有研究顯示[7],在多種腫瘤組織中MGMT基因的表達(dá)水平下調(diào),提示該基因的失活與多種腫瘤的發(fā)生有關(guān)。近年來的研究顯示,該基因的啟動(dòng)子區(qū)域CpG島甲基化是導(dǎo)致該基因表達(dá)降低的一個(gè)重要原因。但各研究由于樣本量較小,研究結(jié)果存在一定的差異,本研究采用meta分析的循證醫(yī)學(xué)方法對(duì)MGMT基因啟動(dòng)子甲基化與NSCLC發(fā)生的關(guān)系進(jìn)行了匯總分析,研究結(jié)果顯示與正常肺組織和血漿比較,肺癌中MGMT基因啟動(dòng)子甲基化率增高(P<0.05),提示MGMT啟動(dòng)子甲基化與肺癌的發(fā)生可能存在相關(guān)性。

在本研究中,我們對(duì)NSCLC患者癌組織和正常肺組織、血漿和支氣管灌洗液中的MGMT基因啟動(dòng)子甲基化發(fā)生情況進(jìn)行了循證醫(yī)學(xué)分析,結(jié)果提示MGMT基因啟動(dòng)子甲基化普遍存在于NSCLC患者癌組織中;但在患者的正常肺組織和血漿中,該基因的甲基化率較低,說明癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化與MGMT基因啟動(dòng)子甲基化密切相關(guān),該基因的失活在NSCLC的發(fā)生過程中可能起重要作用,同時(shí)也提示甲基化轉(zhuǎn)移酶抑制劑可能在治療NSCLC當(dāng)中扮演重要角色。

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