保永明 劉念 張琪慧 何佳遙 董愛榮
摘要 [目的]篩選對咪草煙具有降解作用的高效鄉(xiāng)土菌株。[方法]對采自黑龍江省哈爾濱市郊區(qū)的對咪草煙具有降解作用的多種菌株進(jìn)行了分離、篩選及鑒定。[結(jié)果]篩選得到3株菌: CX白、CX紅和CX黃,其降解率分別為 58.98%、38.82% 和13.19%,其中降解效果最好的CX白屬于革蘭氏陽性的芽孢桿菌屬(Bacillus sp.)。[結(jié)論]為咪草煙高效降解菌的田間實(shí)際應(yīng)用和產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)提供了參考。
關(guān)鍵詞 咪草煙;降解菌;高效液相色譜;鑒定
中圖分類號 S482.4 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A 文章編號 0517-6611(2014)20-06707-02
Screening and Identification of One Efficient Imazethapyrdegrading Bacterium
BAO Yongming,DONG Airong et al
(Northeast Forestry University,Harbin, Heilongjiang 150040)
Abstract [Objective] The aim was to screen one efficient imazethapyrdegrading bacterium. [Method] Some imazethapyrdegrading bacterium strains which were collected from Harbin suburb of Heilongjiang were isolated, screened and identified. [Result] Three degradation strains were selected, containing CXwhite, CXred and CXyellow. The degradation rates of CXwhite, CXred and CXyellow were 58.98%, 38.82% and 13.19%, respectively. Using the DNAExtracted kit, the DNA of CXwhite were extracted and amplified by PCR. The CXwhite which could degrade imazethapyr efficiently belonged to Bacillus sp. [Conclusion] The research results lay theoretical basis for field application and industrial production of imazethapyrdegrading bacterium.
Key words Imazethapyr;Degrading bacteria;HPLC;Identification
除草劑咪草煙因具殺草譜廣、活性高、選擇性強(qiáng)等特點(diǎn),是我國大豆產(chǎn)區(qū)用于雜草防治的重要農(nóng)藥。咪草煙在土壤中半衰期長,自然降解緩慢[1],隨著使用年限的增加,殘留咪草煙會污染農(nóng)田土壤,對后茬敏感作物產(chǎn)生藥害,并導(dǎo)致大豆田輪作困難。此外,殘留咪草煙還可通過雨水滲透,對農(nóng)田周圍水源造成污染,經(jīng)食物鏈富集,亦可對人和其他哺乳動物的健康構(gòu)成潛在危害[2]。目前全國大豆每年種植面積近700萬hm2,其中黑龍江省大豆種植面積約占全國的60%,因而咪草煙使用量巨大。鑒于此,筆者分離并鑒定了對咪草煙具有降解作用的高效鄉(xiāng)土菌株,以期填補(bǔ)該領(lǐng)域的空白并為后續(xù)田間實(shí)際應(yīng)用和產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)提供參考。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 培養(yǎng)基。
基礎(chǔ)培養(yǎng)基:硝酸銨1.00 g,硫酸鎂(MgSO4·7H2O)0.50 g,硫酸銨0.50 g,磷酸二氫鉀0.50 g,酵母膏0.05 g,磷酸氫二鉀1.50 g,水1 L,pH 7.0。
富集培養(yǎng)基:蛋白胨10.0 g,氯化鈉1.00 g,磷酸氫二鉀1.00 g,水1 L,葡萄糖1.00 g,pH 7.0。
Tonomura無碳培養(yǎng)基:硫酸銨1.00 g,硫酸鎂(MgSO4·7H2O)0.50 g,磷酸氫二鉀1.50 g,硝酸鈉1.00 g,氯化鈣0.05 g,硫酸亞鐵0.02 g,水1 L。
牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基:牛肉膏3.00 g,蛋白胨10.00 g,瓊脂20.00 g,氯化鈉5.00 g,水1 L,pH 7.0~7.2。
1.1.2 藥劑與試劑。
500 ml 5%咪草煙水劑(豆施樂);咪草煙原藥(純度99.99%);DV810A細(xì)菌DNA提取試劑盒[寶生物工程(大連)有限公司];Quick Taq HS DyeMix PCR試劑(廣東廣州美津生物技術(shù)有限公司);溶菌酶(100 mg/L)Rnase。
1.2 方法
1.2.1 土樣的采集。
采用生物學(xué)統(tǒng)計(jì)法[3]。在黑龍江省哈爾濱市郊區(qū)的大豆和玉米田地進(jìn)行多點(diǎn)隨機(jī)取樣,共采取土樣5份,用無菌聚乙烯膜袋保存樣品,在-4 ℃冰箱保存。
1.2.2 菌株的分離和馴化。
分別稱取待測土樣10.00 g,經(jīng) 105 ℃ 烘干 8 min,置于干燥器中,待冷卻后稱質(zhì)量,計(jì)算土壤含水量。稱取相當(dāng)于 10.00 g 干土的濕土,加入盛有 90 ml富集培養(yǎng)基的250 ml三角瓶中,加咪草煙至100 mg/L,置于 30 ℃、180 r/min搖床培養(yǎng)24 h。移取培養(yǎng)液10 ml接入90 ml新鮮富集培養(yǎng)基,提高咪草煙至200 mg/L,置于 30 ℃、180 r/min搖床培養(yǎng)24 h。上述步驟循環(huán)操作[4],直至咪草煙濃度為500 mg/L。將培養(yǎng)液接入分離培養(yǎng)基(咪草煙濃度為500 mg/L,無碳源),繼續(xù)培養(yǎng)7 d,之后用基礎(chǔ)培養(yǎng)基,每隔7 d移種1次,咪草煙濃度仍為500 mg/L,14 d后再將富集所得菌液用平板劃線純化[5],保存對咪草煙有降解作用的細(xì)菌。
1.2.3 菌株對咪草煙降解率的測定。
用接種針挑取初篩出的保存于斜面的各培養(yǎng)菌種,加10 ml無菌水,輕刮斜面制成菌懸液,分別接種到已知除草劑濃度為500 mg/L的30 ml Tonomura無碳培養(yǎng)基中。以不加任何菌株的 Tonomura無碳-咪草煙培養(yǎng)基作為空白對照,30 ℃恒溫?fù)u床黑暗振蕩培養(yǎng)3 d后,再靜置培養(yǎng)10 min,得純培養(yǎng)液[6]。
量取純培養(yǎng)液10 ml于無菌離心管中,10 000 r/min離心5 min,取上清液,加入250 ml分液漏斗中,同時向分液漏斗中加入上清液2倍體積的二氯甲烷,劇烈振蕩10 min,加入氯化鈉至飽和,再劇烈振蕩2 min,室溫下靜置,使有機(jī)相與水相分離,重復(fù)2次,合并有機(jī)相經(jīng)無水硫酸鈉干燥后,收集到250 ml圓底燒瓶中,在旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀上35 ℃濃縮近干,然后在常溫下吹干,用色譜甲醇定容至2 ml,待測[7]。
1.2.4 高效液相色譜檢測條件。
色譜柱:250 mm涂有ZORBAX SBC18的不銹鋼柱,內(nèi)徑4.6 mm;檢測波長254 nm;流速0.9 ml/min;柱溫40 ℃;進(jìn)樣量20 μl;流動相為甲醇的醋酸水溶液,甲醇∶水∶冰乙酸=38∶58∶4(V/V/V),保留時間約為8.54 min。采用Agilent1100液相色譜儀,配紫外檢測器(VWD,色譜工作站)[8]。
1.2.5 高效降解菌的基因組DNA提取及系統(tǒng)發(fā)育分析。
1.2.5.1 基因組DNA提取。采用TaKaRa MiniBEST Bacteria Genomic DNA Extraction Kit Ver.3.0試劑盒對高效菌株進(jìn)行DNA提取。
1.2.5.2 瓊脂糖膠電泳。對提取的DNA進(jìn)行凝膠電泳,以便確定是否成功提取得到DNA以及DNA的純度是否達(dá)到要求[9]。
1.2.5.3 PCR擴(kuò)增。對目的DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以提高純度方便測序。采用Quick Taq HS DyeMix作為PCR試劑,該產(chǎn)品為預(yù)混了DNA polymerase(Taq DNA Polymerase)、PCR反應(yīng)用Buffer、dNTP Mixture的2×預(yù)混PCR試劑。將其分裝到離心管中,加入模板DNA和引物,即可進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系體積為50 μl[10],引物為細(xì)菌16S通用引物,27f:AGAGTTTGATCMTGGCTCAG;1492r:GGTTACCTTGTTACGACTT。
電泳檢測擴(kuò)增產(chǎn)物,若產(chǎn)物純度達(dá)標(biāo),將PCR產(chǎn)物送公司測序。
2 結(jié)果與分析
2.1 菌株的分離
以500 mg/L的咪草煙濃度馴化14 d后,篩選到3種革蘭氏陽性細(xì)菌菌株: CX白、CX紅、CX黃,在培養(yǎng)基上外觀分別呈現(xiàn)白色、紅色和黃色。
2.2 降解率的測定
由表1可知,菌株CX黃、CX紅、CX白對甲胺磷的平均降解效率分別達(dá)到 13.19%、38.82%和58.98%,其中CX白效果最好。
2.3 高效降解菌CX白的基因組DNA提取及系統(tǒng)發(fā)育分析 由圖1和圖2可知,MCY1是降解咪草煙的高效菌株CX白,與Bacillus屬的megaterium種最接近,可信度為98%。據(jù)此可初步鑒定,試驗(yàn)組分離得到的咪草煙高效降解菌是革蘭氏陽性的芽孢桿菌屬(Bacillus sp.)細(xì)菌。
3 討論
試驗(yàn)結(jié)果表明,在黑龍江省本土確實(shí)存在能夠降解除草劑咪草煙的高效菌株,因此,在黑龍江省應(yīng)用微生物降解除草劑咪草煙具有一定的可行性,為除草劑降解找到一條可實(shí)踐的新途徑。該菌株進(jìn)入田間實(shí)際應(yīng)用,將會極大地消除田間殘留農(nóng)藥對環(huán)境及農(nóng)作物生長的不良影響,在一定程度上提高農(nóng)作物產(chǎn)量,并減小農(nóng)藥殘留對人畜健康和安全的潛在影響。
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