于 娟,饒華祥,李 紅,盧囡囡,易 虎,趙生倉(cāng)
自1983年以來(lái),乙型流感病毒按其抗原特性和基因特征分為兩大譜系:Yamagata系和Victoria系[1-2]。同甲型流感毒一樣,乙型流感病毒也是依靠病毒外膜蛋白,特別是血凝素的重鏈HA1基因的變異,改變抗原特性來(lái)逃避抗體已有免疫保護(hù),從而不斷導(dǎo)致流感的流行[3]。
青海省自2009年甲型H1N1流感疫情爆發(fā)后,乙型流感一直處于低流行水平,直到2011年出現(xiàn)上升趨勢(shì)。本研究首次對(duì)青海省乙型流感分離株HA1基因變異情況進(jìn)行系統(tǒng)研究,以便在分子水平上了解其變異特點(diǎn)和規(guī)律,及時(shí)發(fā)現(xiàn)變異株,為流感流行起到預(yù)警作用。通過(guò)與WHO北半球推薦疫苗株進(jìn)行比較,了解目前疫苗株對(duì)青海省人群的保護(hù)效果,為流感的預(yù)防和控制提供參考。
1.1標(biāo)本和毒株來(lái)源 采集2011年1月至2012年12月青海省流感監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院的流感樣病例的鼻咽拭子5302份,采用MDCK細(xì)胞對(duì)流感病毒進(jìn)行分離培養(yǎng),血凝試驗(yàn)(HA)和血凝抑制試驗(yàn)(HI)對(duì)流感病毒進(jìn)行鑒定,具體步驟見參考文獻(xiàn)[3]。
1.2病毒RNA提取 采用德國(guó)Qiagen Rneasy Mini Kit(74104),按照試劑盒中操作手冊(cè)所提供的方法提取病毒RNA。
1.3RT-PCR 使用德國(guó)Qiagen One-step RT-PCR kit (210212),美國(guó)Promega RNase Inhibitor(277470),HA1基因RT-PCR上游引物:5’- GAAGGCAATAATTGTACT-3’,下游引物:5’- ACCAGCAATAGCTCCGAA -3’[4](均為大連寶生物公司合成),加入提取的5 μL RNA模板,參照試劑盒中說(shuō)明書配制成25 μL體系,按以下條件進(jìn)行PCR擴(kuò)增:60 ℃1 min,42 ℃10 min,50 ℃30 min,95 ℃15 min,(94 ℃30 s,50 ℃30 s,72 ℃1 min)35 cycles,72 ℃10 min。
1.4PCR產(chǎn)物純化及核苷酸序列測(cè)定 使用德國(guó)Qiagen MinElute PCR Purification Kit (28006)對(duì)RT-PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化,純化后產(chǎn)物采用美國(guó) AB公司BigDye Terminator v1.1 kit (4337450),參照試劑盒說(shuō)明書配制成20 μL體系,按以下條件進(jìn)行測(cè)序PCR擴(kuò)增:96 ℃1 min,(96 ℃10 s,50 ℃5 s,60 ℃4 min)25 cycles。測(cè)序產(chǎn)物采用Qiagen DyeEx 2.0 Spin Kit (63204)進(jìn)行純化后在ABI3500基因分析儀上進(jìn)行測(cè)序,具體操作方法參照儀器操作說(shuō)明。
1.5序列分析 采用DNA Star 5.0 MegAlign和MEGA 4.0軟件將分離株與近10年WHO推薦的疫苗株、Yamagata 系和Victoria 系代表株以及同期其他地區(qū)分離株進(jìn)行HA1基因特征分析。核苷酸序列采用MEGA 4.0自帶的Clustal W軟件進(jìn)行比對(duì),NJ法(鄰接法)構(gòu)建基因進(jìn)化樹,Bootstrap檢驗(yàn)重復(fù)值設(shè)定為1000,以上序列均來(lái)自GenBank。
2.1流感毒株流行情況 2011年青海省共分離流感毒株35株,其中Victoria系乙型毒株17株,占48.57%,Yamagata系乙型毒株15株,占42.86%, H3亞型2株,占5.71%,新甲H1亞型毒株1株,占2.86%。2012年青海省共分離流感毒株85株,其中Victoria系乙型毒株34株,占40.00%,Yamagata系乙型毒株3株,占3.53%,H3亞型36株,占42.35%,新甲H1亞型毒株12株,占14.12%??傮w來(lái)說(shuō),青海省2011年上半年Yamagata系作為優(yōu)勢(shì)流行株在人群中廣泛流行,下半年活動(dòng)逐漸減弱,12月份Victoria系毒株活動(dòng)逐漸加強(qiáng),在2012年4月份之前為優(yōu)勢(shì)流行株,之后H3亞型代替Victoria系毒株成為優(yōu)勢(shì)流行株。
2.2血凝素HA1基因進(jìn)化樹分析 從基因進(jìn)化樹可以看出,2011-2012年青海省乙型流感毒株主要分為Victoria系和Yamagata系兩個(gè)進(jìn)化分支,且相同或相近年份分離株聚集成簇。2011年青海省Victoria系乙型分離株B/Qinghaichengdong/1223/2011和B/Qinghaichengzhong/2115/2011與同期廣東分離株親緣關(guān)系較近,B/Qinghaichengdong/1410/2011與2010年廣東、北京、寧波分離株親緣關(guān)系較近,以上毒株與2009-2011年WHO推薦疫苗株B/Brisbane/60/2008親緣關(guān)系較遠(yuǎn),未處于同一進(jìn)化分支;2011年底和2012年的Victoria系乙型分離株與2009-2011年WHO推薦疫苗株B/Brisbane/60/2008及2012年湖州分離株親緣關(guān)系較近,處于同一分支??梢钥闯?,所有分離株已逐漸遠(yuǎn)離Victoria系代表株B/Victoria/2/87及以往WHO推薦疫苗株:B/Hongkong/330/2001(2002-2004)和B/Malaysia/2506/2004(2006-2008)。2011年青海省Yamagata系乙型分離株與2011-2012年WHO推薦疫苗株B/Wisconsin/01/2010及同期廣東分離株處于同一分支,親緣關(guān)系較近,但已逐漸遠(yuǎn)離以往Yamagata系代表株B/Yamagata/16/88及以往WHO推薦疫苗株:B/Shanghai/361/2002(2004-2006和B/Florida/4/2006(2006-2008)(見圖1)。
2.3Victoria系分離株HA1基因分析
2.3.1核苷酸同源性分析 本研究測(cè)得Victoria系分離株HA1基因984 bp,青海本地分離株間同源性為85.8%~98.9%,本地分離株與2009-2011年WHO推薦疫苗株B/Brisbane/60/2008同源性為88.6%~95.7%。
2.3.2核苷酸推導(dǎo)的氨基酸位點(diǎn)差異比較 與2009-2011年WHO推薦疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,2011年青海省Victoria系分離株的氨基酸變異位點(diǎn)有L58P,I146V,N171D,L303I,Y309D,A317S,P322S,其中I146V,N171D位于抗原決定簇;2012年分離株的氨基酸變異位點(diǎn)有N123D,I146V,Q264H,P322S,其中N123D,I146V位于抗原決定簇(見表1)??梢钥闯觯琁146V變異發(fā)生在所有青海分離株中,其余氨基酸位點(diǎn)變異不具有普遍性,呈散在性分布。糖基化位點(diǎn)分析后,發(fā)現(xiàn)P322S使得分離株在320位增加了一個(gè)糖基化位點(diǎn)。
圖1 乙型流感病毒血凝素HA1 基因進(jìn)化樹
2.3Yamagata系分離株HA1基因分析
2.3.1核苷酸同源性分析 本研究測(cè)得Yamagata系分離株HA1基因990 bp,本地分離株間同源性為97.6%~99.8%,本地分離株與2011-2012年WHO推薦疫苗株B/Wisconsin/01/2010同源性為97.7%~99.3%。
2.3.2核苷酸推導(dǎo)的氨基酸位點(diǎn)差異比較 與2011-2012年WHO推薦疫苗株B/Wisconsin/01/2010相比,2011年青海省Victoria系分離株的氨基酸變異位點(diǎn)有N116K,D196N,D232N,L267V,其中N116K,D196N位于抗原決定簇,發(fā)生在所有青海分離株中,其余位點(diǎn)變異不具有普遍性,呈散在性分布。經(jīng)過(guò)糖基化位點(diǎn)分析,發(fā)現(xiàn)B/Qinghaidatong/220/2011與疫苗株相比發(fā)生了D232N變異,使其在232位增加了一個(gè)糖基化位點(diǎn);所有青海分離株均發(fā)生了D196N變異,使分離株在196位增加了一個(gè)糖基化位點(diǎn),位于抗原決定簇。
表1 Victoria系乙型流感毒株HA1基因重要氨基酸變異位點(diǎn)比較
目前發(fā)現(xiàn)乙型流感病毒僅發(fā)生抗原性漂移,而不發(fā)生像甲型流感病毒那樣的抗原性轉(zhuǎn)變,因此,乙型流感常常在人群中僅引起一些局部和中等程度的流行。盡管流感病毒的抗原性經(jīng)常不斷地發(fā)生變異,但并非所有的變異株都具有流行病學(xué)意義。
表2 Yamagata系乙型流感毒株HA1基因重要氨基酸變異位點(diǎn)比較
乙型流感病毒HA1基因的第70~ 90位和110~ 210位氨基酸參與病毒抗原決定簇的構(gòu)成,此其間氨基酸變異會(huì)導(dǎo)致病毒抗原性改變[4]。作為一個(gè)具有代表性的新變種,它必須在HA1區(qū)蛋白分子上有4個(gè)以上氨基酸序列發(fā)生了替換,而且替換必須涉及到2~3個(gè)抗原決定簇位點(diǎn)[5]。對(duì)2011-2012年青海省分離到的乙型流感毒株HA1區(qū)核苷酸序列及推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn),Victoria系分離株與2009-2011年WHO推薦疫苗株B/Brisbane/60/2008同源性為88.6%~95.7%,氨基酸替換數(shù)在2~5個(gè),有1-2個(gè)參與構(gòu)成抗原決定簇。Yamagata系與2011-2012年WHO推薦疫苗株B/Wisconsin/01/2010HA1區(qū)相比較同源性為97.7%~99.3%,氨基酸替換數(shù)在2-3個(gè),有2個(gè)參與構(gòu)成抗原決定簇??梢钥闯觯琕ictoria系與Yamagata系分離株均已發(fā)生了一定變異,但尚沒有發(fā)生病毒抗原漂移。值得注意的是Yamagata系分離株均在196位增加了一個(gè)糖基化位點(diǎn),糖基化位點(diǎn)的增加或減少對(duì)病毒抗原性及其他生物特性均有一定的影響,尤其發(fā)生在抗原決定簇附近的糖基化會(huì)影響抗體的結(jié)合,我們應(yīng)密切關(guān)注其對(duì)分離株的影響。
研究發(fā)現(xiàn),流感疫苗對(duì)人體的免疫保護(hù)效果取決于流行株與疫苗株之間的抗原匹配程度,匹配程度越高,免疫保護(hù)效果越好。由于2009-2011年WHO推薦疫苗株B/Brisbane/60/2008對(duì)2011為Victoria系代表株,青海地區(qū)人群中對(duì)Victoria系流感病毒已形成了一定的免疫屏障,使得2011年初Victoria株的流行減弱,而人群中的Yamagata系病毒株抗體水平較低,使得Yamagata系毒株活動(dòng)逐漸加強(qiáng),成為優(yōu)勢(shì)流行株,提示B/Brisbane/60/2008對(duì)2011年青海地區(qū)人群沒有起到很好的保護(hù)作用。2011-2012年WHO推薦流感疫苗B/Wisconsin/01/2010為Yamagata系代表株,且與2011年青海Yamagata系分離株親緣關(guān)系較近,能夠?qū)θ巳寒a(chǎn)生較好保護(hù)作用,使得2011年Yamagata系株在下半年流行逐漸減弱,但造成Victoria系株在2011年12月份至2012年4月份活動(dòng)逐漸增強(qiáng),成為優(yōu)勢(shì)流行株,這與其他地區(qū)報(bào)道的2011-2012年乙型流感病毒流行趨勢(shì)基本一致[6]。
在免疫系統(tǒng)選擇壓力下,乙型流感病毒必將不斷發(fā)生變異以逃避宿主體內(nèi)已有抗體的免疫保護(hù),其在下一個(gè)流行季節(jié)會(huì)發(fā)生怎樣的基因變異,還有待進(jìn)一步的流感監(jiān)測(cè)工作及基因特性分析,需加強(qiáng)流感病原學(xué)監(jiān)測(cè),及時(shí)發(fā)現(xiàn)新的乙型流感病毒變異株。
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