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假單胞桿菌BS1 轉(zhuǎn)座突變及高產(chǎn)生物表面活性劑突變株初步篩選

2014-01-14 04:39:38侯巨梅韓巍國(guó)莉玲劉銅王彥杰
生物技術(shù)通報(bào) 2014年5期
關(guān)鍵詞:假單轉(zhuǎn)座子突變體

侯巨梅 韓巍 國(guó)莉玲 劉銅 王彥杰

(1. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心,大慶 163319;2. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)農(nóng)學(xué)院植物病理與應(yīng)用微生物研究所,大慶 163319;3. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)生命學(xué)院,大慶 163319)

生物表面活性劑(Biosurfactant)是從生物來(lái)源分離得到的一類具有降低表面張力、穩(wěn)定乳化、增加泡沫穩(wěn)定性等表面特性的物質(zhì),通常有親水基和親油基兩部分[1,2]。生物表面活性劑的表面活性與化學(xué)合成的表面活性劑相當(dāng),但具有可生物降解的優(yōu)點(diǎn),因而不會(huì)造成環(huán)境危害[3-5]。但是生物表面活性劑自被發(fā)現(xiàn)至今,由于受到較高生產(chǎn)成本的限制,只有少數(shù)產(chǎn)品走向市場(chǎng),大多數(shù)產(chǎn)品仍處于試驗(yàn)階段,并沒(méi)有進(jìn)行規(guī)?;a(chǎn)。特別是野生發(fā)酵菌株生物表面活性劑的產(chǎn)量非常有限,發(fā)酵生產(chǎn)的成本較高,導(dǎo)致其經(jīng)濟(jì)效益低于化學(xué)合成表面活性劑,最終降低其市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力[6,7]。

本研究小組在前期的工作中,從大慶的油井口分離、篩選到一株性能較好產(chǎn)生物表面活性劑的菌株,并通過(guò)生化指標(biāo)和16S rRNA 鑒定為假單胞桿菌BS1[8],雖然通過(guò)發(fā)酵條件的優(yōu)化產(chǎn)生物表面活性劑的產(chǎn)量有明顯的提高,但是要應(yīng)用于生產(chǎn)實(shí)際中還存在一定的距離。因此本研究以假單胞桿菌BS1為始發(fā)菌,利用轉(zhuǎn)座突變技術(shù)構(gòu)建假單胞桿菌BS1突變體,篩選高產(chǎn)表面活性劑突變株,旨在為進(jìn)一步應(yīng)用于生產(chǎn)實(shí)踐及探索其分子代謝途徑奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 菌株與質(zhì)粒 野生型菌株假單胞桿菌BS1 為供試菌株,保存于植物病理與應(yīng)用微生物研究所。大腸桿菌(E.coli)RR1(含轉(zhuǎn)座子Tn917 的載體pTV1-OK)由美國(guó)Florida 大學(xué)Crowley 教授惠贈(zèng)。

1.1.2 培養(yǎng)基和緩沖液 LB 培養(yǎng)基(g/L):胰化蛋白胨10,酵母提取物5,氯化鈉10,瓊脂18。緩沖液和高滲溶液:0.1 mol/L 磷酸二氫鈉(pH7.0)溶液為緩沖液,加入0.8 mol/L 甘露醇為高滲溶液。SMM原生質(zhì)體穩(wěn)定液(mol/L):蔗糖0.5、MgC120.02,順丁烯二酸0.02,調(diào)pH6.5。融合劑:40%聚乙二醇(PEG-4000)的SMM 溶液。溶菌酶液用SMM 溶液配制,終濃度為1 mg/mL,過(guò)濾除菌備用。原生質(zhì)再生培養(yǎng)基:SMM 溶液加1.5% 瓊脂。產(chǎn)生物表面活性劑的發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):硝酸鈉1.5,硫酸銨1.5,磷酸氫二鉀1.0,硫酸鎂0.5,氯化鉀0.5,硫酸亞鐵0.01,氯化鈣0.002,蒸餾水1 000 mL,液體石蠟5%,pH7.0。

1.2 方法

1.2.1 抗生素敏感性檢測(cè) 供試菌株假單胞桿菌BS1 為始發(fā)菌,分別涂布在含(0、5、10、15 和20 μg/mL)紅霉素(Erm)的LB 培養(yǎng)基上,于37℃培養(yǎng)24 h,確定假單胞桿菌BS1 對(duì)紅霉素最敏感濃度。

1.2.2 質(zhì)粒轉(zhuǎn)化 將供試菌株假單胞桿菌BS1 在固體LB 培養(yǎng)基上,于37℃活化24 h 后,挑取單菌落置于LB 培養(yǎng)基中于37℃、180 r/min 振蕩培養(yǎng)箱中培養(yǎng),當(dāng)生長(zhǎng)至菌懸液OD600=0.8 時(shí),離心收集菌體。菌體用磷酸緩沖液沖洗后懸浮于10 mL SMM 溶液中,然后加入10 mL 溶菌酶,混勻后于37℃保溫30 min,然后用4 000 r/min 離心10 min,棄上清液,用高滲緩沖液洗滌除酶,然后將原生質(zhì)體懸浮于200 μL 高滲緩沖液中。加入1 μg 質(zhì)粒pTV1-OK 和1.8 mL 40% PEG 溶液,置36℃水浴保溫處理2 min,4 000 r/min 離心10 min,收集菌體,將沉淀充分懸浮于2 mL SMM 溶液中,將原生質(zhì)體涂布于原生質(zhì)再生平板上(含50 μg/mL Kan,10 μg/mL Erm),28℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)4 d。挑取從平板上長(zhǎng)出的菌落,即為含質(zhì)粒pTV1-OK 的菌體。

1.2.3 轉(zhuǎn)座誘變和突變體庫(kù)構(gòu)建 挑取含質(zhì)粒pTV1-OK 的轉(zhuǎn)化菌株,接種于LB 培養(yǎng)液中(50 μg/mL Kan 和10 μg/mL Erm)中,28℃搖床中培養(yǎng)(180 r/min)24 h 后取50 μL 于10 mL LB 溶液中置于41℃水浴過(guò)夜。培養(yǎng)液按1∶100 稀釋后涂布于Erm 單抗平板上進(jìn)行培養(yǎng)。將長(zhǎng)出的菌落分別點(diǎn)在Erm 單抗平板以及Erm、Kan 雙抗平板的對(duì)應(yīng)位置,挑取在雙抗平板上未長(zhǎng)而在Erm 單抗平板上長(zhǎng)出的菌落,即為轉(zhuǎn)座的菌株。按以上方法進(jìn)行多次誘導(dǎo),并將轉(zhuǎn)座子接入含有Erm 的LB 中進(jìn)行穩(wěn)定性培養(yǎng),然后轉(zhuǎn)入甘油中保存,構(gòu)建假單胞桿菌BS1 轉(zhuǎn)座突變體庫(kù)。

1.2.4 誘變突變體驗(yàn)證 將假單胞桿菌BS1 和突變體轉(zhuǎn)接到新鮮的LB 中培養(yǎng),收集菌體,提取基因組,根據(jù)Tn917 序列已報(bào)道的引物Tn1:5'-AACGACGAAACTGGCTAA-3' 和Tn2:5'-AGATGGAGCTGTCGACTCAC-3' 進(jìn) 行PCR 反 應(yīng)[9]。PCR 反 應(yīng) 體 系(25 μL):Premix Taq 12.5 μL,DNA 模 板1 μL, 引 物Tn1 和 Tn2 各1 μL,ddH2O 9.5 μL。 PCR 擴(kuò)增條件:94℃ 5 min;94℃ 1 min,52℃ 30 s,72℃ 2 min,共30 個(gè)循環(huán);72℃ 10 min。PCR 反應(yīng)后進(jìn)行1.0%瓊脂糖電泳檢測(cè)。

1.2.5 高產(chǎn)表面活性劑突變體的篩選 將假單胞桿菌BS1 和轉(zhuǎn)座突變體在牛肉膏蛋白胨斜面上活化24 h 后,用無(wú)菌水配制成菌懸液(107cfu);然后以3%的接種量將菌懸液接種于產(chǎn)生物表面活性劑的發(fā)酵培養(yǎng)基,置于30℃、180 r/min 振蕩培養(yǎng)箱中培養(yǎng)7 d 后,4 000 r/min 離心10 min 收集上清液,進(jìn)行乳化(E24)性能測(cè)定,測(cè)定方法參考文獻(xiàn)[10]。假單胞桿菌BS1 為對(duì)照,試驗(yàn)重復(fù)3 次,數(shù)據(jù)采用DPS7.05 分析。

2 結(jié)果

2.1 供試菌株對(duì)抗生素敏感性檢測(cè)

供試菌株假單胞桿菌BS1 分別接種于含有0、5、10、15 和20 μg/mL 紅霉素的LB 培養(yǎng)基上。結(jié)果(圖1)顯示,假單胞桿菌BS1 在5 μg/mL 紅霉素的LB 培養(yǎng)基上生長(zhǎng)被部分抑制,在10 μg/mL 紅霉素的LB 培養(yǎng)基上生長(zhǎng)能夠完全被抑制,因此10 μg/mL 紅霉素被確定為最佳篩選轉(zhuǎn)座突變體的濃度。

圖1 供試菌株對(duì)紅霉素敏感性檢測(cè)

2.2 突變體的獲得

用pTV1-OK 質(zhì)粒對(duì)原生質(zhì)進(jìn)行轉(zhuǎn)化,在含有10 μg/mL 紅霉素和50 μg/mL 卡那霉素的原生質(zhì)體再生平板上長(zhǎng)出3 個(gè)菌株,通過(guò)反復(fù)轉(zhuǎn)接抗性平板培養(yǎng),最終獲得3 株能夠在雙抗平板上穩(wěn)定生長(zhǎng)的菌株,這表明3 株轉(zhuǎn)化子含有pTV1-OK 質(zhì)粒(圖2)。挑取其中一個(gè)陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子進(jìn)行誘導(dǎo)轉(zhuǎn)座突變后,獲得了在雙抗平板上未長(zhǎng)而在Erm 單抗平板上對(duì)應(yīng)位置長(zhǎng)出的菌落(圖3),結(jié)果表明在誘導(dǎo)過(guò)程中,溫敏型的pTV1-OK 質(zhì)粒在41℃下過(guò)夜時(shí)不能復(fù)制,產(chǎn)生丟失,使菌株不能夠產(chǎn)生Kan 抗性,但是轉(zhuǎn)座子可以發(fā)生跳躍而插入到細(xì)菌的基因組,因此可以在Erm 單抗平板生長(zhǎng)。通過(guò)多次轉(zhuǎn)化試驗(yàn)一共獲得650個(gè)轉(zhuǎn)座突變體。

圖2 pTV1-OK 質(zhì)粒轉(zhuǎn)化

2.3 突變體PCR檢測(cè)

圖3 轉(zhuǎn)座突變體的挑選

通過(guò)提取菌株假單胞桿菌BS1 及其5 個(gè)隨機(jī)挑取的轉(zhuǎn)座突變株的總DNA,根據(jù)已知引物,對(duì)5 個(gè)突變株進(jìn)行了PCR 檢測(cè)。結(jié)果(圖4)顯示,所有突變株均能擴(kuò)增出Tn917 中一段基因的片段(1 779 bp),與預(yù)期片段大小一致,表明Tn917 已成功插入基因組中,而野生菌沒(méi)有擴(kuò)增出相應(yīng)的條帶,說(shuō)明在出發(fā)菌中沒(méi)有Tn917 的插入。

圖4 PCR 驗(yàn)證Tn917 的插入

2.4 高產(chǎn)表面活性劑突變株篩選

通過(guò)對(duì)隨機(jī)挑取的24 株轉(zhuǎn)座突變體的乳化(E24)性能測(cè)定,發(fā)現(xiàn)大部分轉(zhuǎn)座突變體與供試菌株的值相差不大,其中突變體T12 的E24 值達(dá)到67%,明顯高于野生菌株,結(jié)果(圖5)表明獲得一株高產(chǎn)生物表面活性劑的突變體。

3 討論

圖5 野生菌株和轉(zhuǎn)座突變體的乳化(E24)性能測(cè)定

生物表面活性劑由微生物代謝產(chǎn)生,其種類繁多、結(jié)構(gòu)復(fù)雜,是一類由脂肪鏈和肽鏈組成的具有兩親結(jié)構(gòu)的微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物——微生物脂肽。由于其特殊的分子結(jié)構(gòu)和多種生物學(xué)功能,微生物脂肽在醫(yī)藥、食品、化妝品及微生物采油等多個(gè)領(lǐng)域中有重要的應(yīng)用前景[11,12]。據(jù)報(bào)道,由紫紅諾卡氏菌(Nocardia rhodochrous)產(chǎn)生的海藻糖脂用于地下砂石中石油的回收,其回收率可提高30%[13]。從大慶油田分離的枯草芽孢桿菌(Bacillus subtitles)ZW-3 可產(chǎn)生的脂肽生物表面活性劑,當(dāng)使用于采油時(shí)可提高采收率912%。但是由微生物來(lái)生產(chǎn)表面活性劑普遍存在發(fā)酵步驟繁雜、產(chǎn)量低、成本高等特點(diǎn),成為其應(yīng)用的瓶頸。

假單胞桿菌BS1 是從大慶油田分離的一株產(chǎn)鼠李糖脂的菌株,前期試驗(yàn)通過(guò)對(duì)培養(yǎng)碳源、接種量、溫度、pH 值、鹽濃度和培養(yǎng)基裝液量的條件的優(yōu)化,使其鼠李糖脂產(chǎn)生量有明顯的提高,但是相對(duì)工業(yè)要求,其產(chǎn)量相對(duì)較低,在應(yīng)用上還有一定的距離。為了更好的開發(fā)和利用該菌株,創(chuàng)建高效、高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)的假單胞桿菌BS1 品系成為擬要解決的問(wèn)題。

轉(zhuǎn)座誘變育種是利用轉(zhuǎn)座子隨機(jī)插入基因組方式引起基因的突變而獲得一系列的重組子,通過(guò)篩選重組子獲得符合育種目標(biāo)的菌株。它不僅具有速度快、收效大、方法簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn),而且能夠有效改善菌種特性、提高產(chǎn)品質(zhì)量和簡(jiǎn)化工藝條件等特點(diǎn)。因此目前許多優(yōu)良的微生物菌株是通過(guò)此方法獲得的。例如,Koch[14]利用轉(zhuǎn)座子誘變Pseudomonas aevuginosa 獲得了提高二倍產(chǎn)量的生物表面活性劑突變株。吳慧玲[15]利用雙親接合的方法將含有Tn5轉(zhuǎn)座子的質(zhì)粒導(dǎo)入丁香假單胞菌大豆致病變種中,篩選出一株產(chǎn)冠菌素比出發(fā)菌高21 倍突變株。齊勇[16]通過(guò)轉(zhuǎn)座誘導(dǎo)方法,建立了攜帶轉(zhuǎn)座子Tn917的巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium1301)突變體庫(kù),通過(guò)生物測(cè)試法篩選出產(chǎn)細(xì)胞分裂素比野生型菌株顯著提高突變體B1301-22。本研究也利用轉(zhuǎn)座突變獲得了650 個(gè)突變體庫(kù),通過(guò)對(duì)隨機(jī)挑取的24個(gè)突變體的乳化性能測(cè)定,發(fā)現(xiàn)其中一株乳化性能比野生型有顯著提高。乳化性能是測(cè)定生物表面活性劑含量指標(biāo)之一,這說(shuō)明試驗(yàn)可能獲得一株高產(chǎn)表面活性劑的突變株,同時(shí)也表明轉(zhuǎn)座突變能夠快速、有效創(chuàng)建高產(chǎn)生物表面活性劑假單胞桿菌BS1新品系,為利用該菌株進(jìn)行工業(yè)化生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。

4 結(jié)論

本研究利用轉(zhuǎn)座誘變方法成功突變了假單胞桿菌BS1,構(gòu)建了含650 個(gè)轉(zhuǎn)座突變體庫(kù),結(jié)合PCR技術(shù)證明了Tn917 質(zhì)粒成功插入該菌基因組中。通過(guò)對(duì)隨機(jī)挑取的24 個(gè)轉(zhuǎn)座突變體的E24 值測(cè)定,獲得一株乳化性能好的突變株,其E24 值高達(dá)67%。

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