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基于H原子和O原子代謝的葡萄糖有氧氧化解析

2013-12-03 07:24夏循禮余英才
生物學(xué)雜志 2013年4期
關(guān)鍵詞:生物化學(xué)底物有氧

夏循禮,余英才

(江西中醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)教研室,南昌330004)

普通高?!渡锘瘜W(xué)》教材中的糖代謝,歷來(lái)是生物化學(xué)課程教學(xué)的重要章節(jié),其中的葡萄糖有氧氧化途徑更是必須牢固掌握的知識(shí)點(diǎn)。關(guān)于葡萄糖有氧氧化過(guò)程,目前國(guó)內(nèi)外主要的生物化學(xué)教材[1-9]基本上專注于葡萄糖酵解途徑、丙酮酸氧化脫羧、乙酰CoA三羧酸循環(huán)等三個(gè)階段的具體反應(yīng),以及有哪些遞氫體,脫下了多少H原子,通過(guò)電子傳遞鏈-氧化磷酸化產(chǎn)生了多少ATP,如何通過(guò)有機(jī)酸脫羧產(chǎn)生CO2等;而對(duì)葡萄糖分子有氧氧化過(guò)程中遞氫體攜帶的H原子的來(lái)源、葡萄糖徹底氧化消耗了多少個(gè)O原子及其來(lái)源等,沒(méi)有給予必要的關(guān)注和闡釋。對(duì)這兩個(gè)問(wèn)題進(jìn)行適度的解讀,不僅可以深化對(duì)葡萄糖有氧氧化過(guò)程的把握,明晰葡萄糖有氧氧化途徑不僅僅只是葡萄糖分子徹底分解代謝為CO2和H2O并合成ATP[10-12],還有葡萄糖和O2以外的物質(zhì)提供H原子和O原子參與該代謝途徑;而且可以拓展對(duì)于生命活動(dòng)中生物體小分子(如H2O、Pi、以及酶蛋白的輔助因子等)重要作用的直接感悟[13-15]。

1 葡萄糖有氧氧化途徑全過(guò)程解析

葡萄糖有氧氧化途徑的全部反應(yīng)過(guò)程及其遞氫體上H原子的來(lái)源和CO2的原子來(lái)源解析如下:為了便于簡(jiǎn)潔易讀,所有催化反應(yīng)的酶都省略,ATP的生成與消耗、與遞氫相關(guān)的輔助因子則寫(xiě)入反應(yīng)過(guò)程。具體反應(yīng)見(jiàn)下表一葡萄糖有氧氧化反應(yīng)過(guò)程(第一列):

從反應(yīng)⑷開(kāi)始,1分子葡萄糖分解為2分子3-磷酸甘油醛,后面的反應(yīng)是以1分子3-磷酸甘油醛發(fā)生的反應(yīng)進(jìn)行計(jì)算的,涉及到遞氫體攜帶的H原子、脫羧反應(yīng)帶走的C原子和反應(yīng)消耗的O原子計(jì)算時(shí),需要按×2倍計(jì)算。

表1 葡萄糖有氧氧化過(guò)程及基于H原子與O原子代謝的解析Table 1 Glucose aerobic oxidation pathway and its analysis based on H metabolism and O metabolism

反應(yīng)⑸實(shí)際的反應(yīng)過(guò)程可能分為兩步,第一步為3-磷酸甘油醛與NAD+加入1個(gè)H2O發(fā)生氧化反應(yīng)生成3-磷酸甘油酸和NADH+H+;第二步為3-磷酸甘油酸的羧基(-COOH)再與Pi發(fā)生一種形成酸酐鍵(Pi和-COOH之間)的反應(yīng),即產(chǎn)生1,3-二磷酸甘油酸和1個(gè)H2O(這個(gè)H2O“補(bǔ)”回第一步反應(yīng)中消耗的H2O,所以整個(gè)反應(yīng)過(guò)程“沒(méi)有”看到H2O參與),該酸酐鍵就是即將發(fā)生底物水平磷酸化的那個(gè)高能磷酸鍵。

反應(yīng)⑻脫去1分子H2O①,在反應(yīng)⑾中“補(bǔ)”回來(lái)參與生成檸檬酸,所以反應(yīng)⑻和反應(yīng)⑾中加H2O(+H2O)與失H2O(-H2O)不涉及H原子和O原子的引入與脫去。

反應(yīng)⑽消耗1分子HSCoA②,在反應(yīng)⑾中生成1分子HSCoA“補(bǔ)”回來(lái)。

反應(yīng)⑿實(shí)際過(guò)程分為兩步,檸檬酸脫H2O③(-H2O)生成順烏頭酸,順烏頭酸再加H2O③(+H2O)生成異檸檬酸,不涉及H原子和O原子的引入與脫去。

反應(yīng)⒂實(shí)際過(guò)程可能分為兩步,Pi+GDP反應(yīng)生成GTP和H2O,H2O與琥珀酰CoA反應(yīng)生成琥珀酸和HSCoA④。HSCoA④從琥珀酰CoA脫下來(lái),“補(bǔ)”回反應(yīng)⒁中消耗的HSCoA④,生成的H2O的H和O進(jìn)入琥珀酰CoA的相應(yīng)部位生成琥珀酸。

反應(yīng)⒄加入1分子H2O⑤,來(lái)自于細(xì)胞內(nèi)線粒體基質(zhì)。

反應(yīng)⒅生成的草酰乙酸,“補(bǔ)”回反應(yīng)⑾消耗的草酰乙酸。

所以,葡萄糖有氧氧化全過(guò)程的反應(yīng)為(為了如實(shí)反映整個(gè)反應(yīng)過(guò)程,只進(jìn)行同類項(xiàng)合并,反應(yīng)式兩邊相同項(xiàng)保留):

從上述反應(yīng)式可以看出,1個(gè)葡萄糖C6H12O6分子進(jìn)行徹底的物質(zhì)代謝產(chǎn)生了12對(duì)H原子,6個(gè)CO2分子。其他情況包括消耗 2ATP、2Pi、4ADP、4HSCoA、2(Pi+GDP)、4H2O,生成 2ADP、4ATP、4HSCoA、2GTP、2H2O。

2 基于H原子代謝的葡萄糖有氧氧化途徑解析

基于H原子代謝的葡萄糖有氧氧化途徑解析見(jiàn)表一的H原子代謝(第2列):

底物分子磷酸化,如反應(yīng)⑴葡萄糖磷酸化為6-磷酸葡萄糖、反應(yīng)⑶6-磷酸果糖磷酸化為1,6-二磷酸果糖,是ATP的1個(gè)磷酸基(-H2PO3)與底物交換1個(gè)H原子,其結(jié)果是底物分子失去1個(gè)H原子。

反應(yīng)⑸產(chǎn)生的NADH+H+脫去的2個(gè)H,直觀表現(xiàn)為1個(gè)來(lái)自3-磷酸甘油醛,1個(gè)來(lái)自磷酸Pi。根據(jù)上述“反應(yīng)⑸實(shí)際的反應(yīng)過(guò)程可能分為兩步”的分析,NADH+H+的2個(gè)H的真實(shí)來(lái)源更可能是環(huán)境(細(xì)胞液)中的H2O(而這個(gè)消耗的H2O在3-磷酸甘油酸與Pi反應(yīng)生成1,3-二磷酸甘油酸和H2O時(shí)“還”回去了)。Pi與3-磷酸甘油酸生成1,3-二磷酸甘油酸和H2O時(shí)由3-磷酸甘油酸“歸還”了一個(gè)H原子,生成H2O的另一個(gè)H原子由Pi的-OH提供,所以實(shí)際上反應(yīng)⑸從Pi的-OH引入了1個(gè)H原子

底物水平磷酸化生成ATP的反應(yīng),如反應(yīng)⑹1,3-二磷酸甘油酸生成3-磷酸甘油酸、反應(yīng)⑼磷酸烯醇式丙酮酸生成丙酮酸生成ATP,從底物分子反應(yīng)前后來(lái)看實(shí)際是“底物分子去磷酸化”,是底物的1個(gè)磷酸基(-H2PO3)與ADP交換1個(gè)H原子,底物分子得到1個(gè)H原子。

反應(yīng)⑽產(chǎn)生的NADH+H+脫去的2個(gè)H來(lái)自于丙酮酸,由輔助因子硫辛酸脫下來(lái)依次傳遞給FAD和NAD+,HSCoA的H原子和-SCoA結(jié)合到丙酮酸的不同部位形成乙酰CoA。

如同反應(yīng)⑽的分析,反應(yīng)⒁產(chǎn)生的NADH+H+脫去的2個(gè)H來(lái)自α-酮戊二酸,由輔助因子硫辛酸脫下來(lái)依次傳遞給 FAD和 NAD+,HSCoA的 H原子和-SCoA結(jié)合到α-酮戊二酸的不同部位形成琥珀酰CoA。

如前分析“反應(yīng)⒂實(shí)際過(guò)程可能分為兩步”,反應(yīng)⒂中琥珀酰CoA和H2O(H2O來(lái)自于Pi和GTP)發(fā)生反應(yīng)生成琥珀酸,H2O中的H原子進(jìn)入琥珀酰CoA的相應(yīng)部位生成琥珀酸,從而引入2個(gè)H原子。

反應(yīng)⒄延胡索酸和1分子H2O生成蘋(píng)果酸,從而引入2個(gè)H原子。

整個(gè)葡萄糖有氧氧化過(guò)程共產(chǎn)生6×2=12對(duì)H原子,即5×2=10對(duì)NADH+H+,1×2=2對(duì)FADH2,分別為反應(yīng)⑸產(chǎn)生的NADH+H+,反應(yīng)⑽產(chǎn)生的NADH+H+,反應(yīng)⒀產(chǎn)生的NADH+H+,反應(yīng)⒁產(chǎn)生的NADH+H+,反應(yīng)⒃產(chǎn)生的FADH2,反應(yīng)⒅產(chǎn)生的NADH+H+;葡萄糖分子C6H12O6只有6對(duì)H原子,其余的6對(duì)H原子分別來(lái)自:反應(yīng)⑴和⑶底物分子磷酸化并反應(yīng)⑹和⑼底物分子去磷酸化共得到2個(gè)H原子,反應(yīng)⑸從Pi得到2個(gè)H原子,反應(yīng)⒂從H2O(Pi+GDP)引入4個(gè)H原子,反應(yīng)⒄從H2O引入4個(gè)H原子。

所以,基于H原子代謝的葡萄糖有氧氧化全過(guò)程反應(yīng)為:

從上述反應(yīng)式可以看出,1分子C6H12O6進(jìn)行徹底的物質(zhì)代謝產(chǎn)生了12對(duì)H原子。除了C6H12O6分子的12個(gè)H原子外,其他關(guān)于葡萄糖或者葡萄糖分解中間物上的H原子的消耗和引入情況為:2次ATP對(duì)底物分子磷酸化消耗2個(gè)H原子(-2H),2×2ADP的底物分子去磷酸化引入2×2個(gè)H原子(+4H),2×Pi引入1×2個(gè)H原子(+2H),2×H2O(Pi+GDP)引入2×2個(gè)H原子(+4H),2×H2O引入2×2個(gè)H原子(+4H),共引入12個(gè)H原子(-2+4+2+4+4)。引入H原子的來(lái)源包括底物分子去磷酸化、Pi和H2O。

3 基于O原子代謝的葡萄糖有氧氧化途徑解析

基于O原子代謝的葡萄糖有氧氧化途徑解析見(jiàn)表一的H原子代謝(第3列):

反應(yīng)⑸中3-磷酸甘油醛生成1,3-二磷酸甘油酸引入1個(gè)O原子,如前面“反應(yīng)⑸實(shí)際的反應(yīng)過(guò)程可能分為兩步”的分析,3-磷酸甘油醛與H2O反應(yīng)生成3-磷酸甘油酸(引入1個(gè)O原子),3-磷酸甘油酸的羧基(-COOH)再與Pi發(fā)生一種形成酸酐鍵(Pi和-COOH之間)的反應(yīng),即產(chǎn)生1,3-二磷酸甘油酸和1個(gè)H2O,這個(gè)H2O“補(bǔ)”回第一步反應(yīng)中消耗的H2O(但是它的O原子來(lái)自于Pi的-OH)。所以反應(yīng)⑸引入的O原子來(lái)自于 Pi。

反應(yīng)⒂中琥珀酰CoA接受H2O(Pi+GDP)的1個(gè)O生成琥珀酸,從而引入1個(gè)O原子。

反應(yīng)⒄延胡索酸和1分子H2O生成蘋(píng)果酸,從而引入1個(gè)O原子。

綜合以上基于O原子代謝的葡萄糖有氧氧化途徑各反應(yīng),共產(chǎn)生6對(duì)H原子,即5對(duì)NADH+H+和1對(duì)FADH2,進(jìn)入線粒體上的電子傳遞鏈氧化共需消耗6個(gè)O原子,生成6個(gè)H2O;3次有機(jī)酸脫羧生成3個(gè)CO2共需要消耗6個(gè)O原子。以1分子個(gè)葡萄糖有氧氧化來(lái)計(jì)算,生成H2O和CO2需要消耗(6+6)×2=24個(gè)O原子。1分子葡萄糖C6H12O6自身含有6個(gè)O原子被消耗,電子傳遞鏈上12對(duì)H氧化消耗12個(gè)O原子(由細(xì)胞呼吸的6個(gè)O2提供),余下的6個(gè)O原子來(lái)源于:反應(yīng)⑸中3-磷酸甘油醛生成1,3-二磷酸甘油酸引入1×2=2個(gè)O原子,反應(yīng)⒂中琥珀酰CoA生成琥珀酸引入1×2=2個(gè)O原子,反應(yīng)⒄延胡索酸生成蘋(píng)果酸引入1×2=2個(gè)O原子。

所以,基于O原子代謝的葡萄糖有氧氧化全過(guò)程反應(yīng)為:

C6H12O6+2Pi+10NAD++2ADP+2(Pi+GDP)+2FAD+2H2O→10(NADH+H+)+2ATP+6CO2+2GTP+2FADH2

10(NADH+H+)+2FADH2+6O2→12H2O(6O2通過(guò)細(xì)胞呼吸從體外吸入提供)

從上述反應(yīng)式可以看出,1分子葡萄糖C6H12O6進(jìn)行徹底氧化產(chǎn)生12對(duì)H原子,6個(gè)CO2分子,12對(duì)H原子進(jìn)入電子傳遞鏈氧化消耗6O2生成12H2O并偶聯(lián)生成36-38ATP。除了葡萄糖C6H12O6分子自身所帶的6個(gè)O原子外,其他關(guān)于葡萄糖或者葡萄糖分解中間物上的O原子的引入情況為:反應(yīng)⑸2×Pi引入2個(gè)O原子(+2O),反應(yīng)⒂2×H2O(Pi+GDP)引入2個(gè)O原子(+2O),反應(yīng)⒄2×H2O引入2個(gè)O原子(+2O),共引入6個(gè)O原子(2+2+2)。引入O原子的來(lái)源包括Pi和H2O。

4 總結(jié)

綜合以上三個(gè)部分分別針對(duì)整個(gè)葡萄糖有氧氧化全過(guò)程、基于H原子代謝的葡萄糖有氧氧化過(guò)程和基于O原子代謝的葡萄糖有氧氧化過(guò)程的解析,我們可以做出如下結(jié)論:

1)葡萄糖有氧氧化途徑是一個(gè)復(fù)雜、系統(tǒng)的過(guò)程,并不僅僅只有葡萄糖分子被分解代謝為CO2,脫下的H進(jìn)入電子傳遞鏈,最終轉(zhuǎn)化為熱能(維持體溫)和化學(xué)能ATP(供生命活動(dòng)所需)并生成H2O。在整個(gè)過(guò)程中,有12個(gè)進(jìn)入電子傳遞鏈的H原子來(lái)自于葡萄糖分子以外的ADP、Pi、Pi+GDP和H2O;有機(jī)酸脫羧產(chǎn)生CO2的O原子有6個(gè)來(lái)自于葡萄糖分子以外的Pi、Pi+GDP和H2O。

2)1個(gè)葡萄糖分子有氧氧化凈生成36-38ATP,其中葡萄糖及其分解代謝的中間產(chǎn)物磷酸化(消耗ATP)和底物水平磷酸化(生成ATP)凈生成4ATP(含三羧酸循環(huán)過(guò)程產(chǎn)生的2GTP),其余32-34ATP全部為24個(gè)H原子(12對(duì)H原子)以電子傳遞鏈-氧化磷酸化形式合成。而葡萄糖分子只有12個(gè)H原子,另外12個(gè)H原子由反應(yīng)途徑中的其他物質(zhì)提供,即葡萄糖有氧氧化途徑產(chǎn)生的ATP不全部是葡萄糖自己的“功勞”。

3)葡萄糖及其分解代謝的中間產(chǎn)物組成整個(gè)有氧氧化途徑的主線,另外的12個(gè)H原子和6個(gè)O原子由其他物質(zhì)(如Pi、Pi+GDP和H2O等)在不同時(shí)期、不同的反應(yīng)中引入到各種中間產(chǎn)物上,然后分別參與有機(jī)酸脫羧和遞氫體脫H并進(jìn)入電子傳遞鏈,完成整個(gè)葡萄糖有氧氧化過(guò)程。

4)葡萄糖有氧氧化途徑含有一個(gè)主要過(guò)程-三羧酸循環(huán),在三羧酸循環(huán)過(guò)程中含有多次H原子引入和O原子引入的反應(yīng)。因此,在含有三羧酸循環(huán)的代謝,如脂肪酸氧化供能和氨基酸分解的α-酮酸氧化供能,類似葡萄糖有氧氧化途徑的這種情況同樣存在。

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