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侵染加工番茄的BBWV2的分子鑒定及田間檢測(cè)

2013-11-02 14:16:34張建云許文博劉升學(xué)黃家風(fēng)
關(guān)鍵詞:蠶豆病株侵染

張建云,許文博,劉升學(xué),黃家風(fēng)

(1石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院/新疆綠洲農(nóng)業(yè)病蟲害治理與植保資源利用自治區(qū)普通高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,石河子832003;2大連市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,大連116036)

蠶豆病毒屬(Fabavirus)病毒由多種蚜蟲以非持久性方式傳播,具有廣泛的寄主范圍,對(duì)許多經(jīng)濟(jì)重要的農(nóng)作物及園藝植物造成嚴(yán)重危害[1]。病毒粒體球形,由大、小2種衣殼蛋白組成;基因組由兩條正單鏈 RNA 分子-RNA1(6.0kb)和 RNA2(3.6 kb)組成,采用多聚蛋白翻譯策略。由RNA1編碼的1個(gè)多聚蛋白被進(jìn)一步加工形成5個(gè)功能蛋白,即輔助因子(Co-Pro)、解旋酶(Hel)、蛋白酶(Pro)、基因連鎖蛋白(VPg)和依賴于RNA的RNA聚合酶(Pol)。由RNA2編碼的1個(gè)多聚蛋白被進(jìn)一步加工形成3個(gè)功能蛋白,即運(yùn)動(dòng)蛋白(MP)和2個(gè)衣殼蛋白(LCP和SCP)[2]。

目前認(rèn)為,該屬有4個(gè)種,即蠶豆萎蔫病毒1(Broad bean wilt virus 1,BBWV1)、蠶豆萎蔫病毒2(Broad bean wilt virus 2,BBWV2)、野芝麻輕花葉病毒(Lamium mild mosaic virus,LMMV)和龍膽花葉病毒(Gentian mosaic virus,GeMV)[3]。而曾經(jīng)報(bào)導(dǎo)的廣藿香輕花葉病毒(Patchouli mild mosaic virus,Pat-MMV)和薇甘菊花葉病毒(mikania micrantha mosaic virus,MMMV)在第9次國(guó)際病毒分類委員會(huì)的報(bào)告中將其分別列為BBWV2的1個(gè)株系和GeMV的1個(gè)分離物[2]。與Comoviridae科內(nèi)豇豆花葉病毒屬(Comovirus)和蠕傳病毒屬(Nepovirus)相比,F(xiàn)abaviruses分子生物學(xué)的研究起步很晚,直到1998年末,日本學(xué)者才報(bào)道了BBWV2日本分離物的基因組全序列[4]。國(guó)內(nèi)戚益軍等[5]于2000年首次獲得BBWV2中國(guó)分離物的基因組全序列,目前已有越來(lái)越多的BBWV1和BBWV2被克隆和測(cè)序。BBWV1和BBWV2除了基因組序列有差異,其抗原表位分屬不同的血清型[6]。從發(fā)生分布來(lái)看,BBWV1主要分布于歐洲、美洲等,對(duì)辣椒、蠶豆、菠菜等造成危害。BBWV2主要分布于東亞,侵染辣椒、蠶豆及一些中草藥[1,7],在我國(guó)迄今尚未分離到BBWV1。

加工番茄是新疆重要的經(jīng)濟(jì)作物,但是病毒病的發(fā)生與危害一直是影響其產(chǎn)量的重要因素。隨著農(nóng)產(chǎn)品貿(mào)易的增強(qiáng)、耕作制度的改變和傳毒介體的多樣化,田間病毒癥狀及發(fā)生危害日趨復(fù)雜,已有多種病毒被鑒定出來(lái),如黃瓜花葉病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、番茄花葉病毒(Tomato mosaic virus,ToMV)、馬鈴薯 Y 病毒(Potato virus Y,PVY)、馬鈴薯 M 病毒(Potato virus M,PVM)、中國(guó)番茄黃化曲葉病毒(Tomato yellow leaf curl Chi-na virus,TYLCCNV),其中CMV和ToMV通常以復(fù)合侵染的方式在田間造成危害[8-11]。

本研究通過(guò)RT-PCR、克隆和測(cè)序?qū)μ镩g病株上發(fā)生的BBWV2進(jìn)行了分子鑒定,并通過(guò)ELISA對(duì)田間病株的發(fā)生情況進(jìn)行了調(diào)查,旨在為該病害防治提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1病毒來(lái)源

用于病毒種類分子鑒定的23個(gè)田間病株于2009年采自石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院試驗(yàn)站晚播加工番茄;用于ELISA檢測(cè)的田間病株于2010-2011年采自石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院試驗(yàn)站和石河子蔬菜所。

1.1.2供試抗血清

BBWV2的單克隆抗體由浙江大學(xué)生物技術(shù)研究所周雪平教授惠贈(zèng)。

辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記山羊抗小鼠IgG購(gòu)自北京博奧森生物技術(shù)有限公司。

酶標(biāo)板(costar 3590)購(gòu)自美國(guó)Corning公司,酶標(biāo)儀為日本BIO-RAD Model 550型。

1.2 方法

1.2.1總RNA提取

參照改良的LiCl方法[12]提取加工番茄病株總RNA。

1.2.2 RT-PCR擴(kuò)增、克隆和序列測(cè)定

1)以病株的總RNA作為模板,用蠶豆病毒屬(Fabavirus)的兼并引物 Fab5′R1F和Fab5′R1R[13]對(duì)病株總RNA進(jìn)行RT-PCR,選取代表病株P(guān)CR產(chǎn)物進(jìn)行克隆、測(cè)序。

2)根據(jù)已測(cè)序列及GenBank中登錄的BBWV2的RNA1序列保守區(qū)設(shè)計(jì)了3對(duì)引物對(duì)XJ14-1基因組RNA1進(jìn)行分段RT-PCR。

3)根據(jù)基因庫(kù)中已登陸B(tài)BWV2的RNA2核苷酸序列設(shè)計(jì)了1對(duì)引物R2F-1F和R2F-1R,對(duì)基因組RNA2部分序列進(jìn)行RT-PCR。

4)將PCR產(chǎn)物分別克隆到載體pMD18-T vector(TaKaRa,Japan)上,選擇PCR和酶切鑒定均為陽(yáng)性的克隆。

委托上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測(cè)序。所用引物序列見表1。

表1 用于擴(kuò)增BBWV2基因組RNA1和RNA2的引物Tab.1 Primers used for amplifying of RNA1and RNA2of BBWV2

1.2.3序列分析

測(cè)序結(jié)果提交NCBI進(jìn)行BLAST檢索。

利用軟件DNAStar 5.02和DNAMAN Version 5.2.2進(jìn)行序列分析。

多序列比較采用DNAStar clustal W方法,系統(tǒng)進(jìn)化樹使用 MEGA5.0(Amazon Inc.Masatoshi Nei and Sudhir Kumar,USA)程序進(jìn)行構(gòu)建。

1.2.4抗原制備

將田間采集的病株葉片在研缽中磨碎,用0.1 mol/L磷酸緩沖液 (pH 7.5)按1∶10的比例稀釋,4000r/min離心5min,吸取上清液備用;同時(shí)以加工番茄健康葉片提取液作陰性對(duì)照。

1.2.5 ELISA檢測(cè)

采用間接ELISA方法,用稀釋的待測(cè)抗原包被微量反應(yīng)板16-18h,封閉后,加適量稀釋的已知單克隆抗體,反應(yīng)后再加適當(dāng)濃度的酶標(biāo)抗體,經(jīng)TMB底物反應(yīng)顯色,加2mol/L硫酸終止。然后在BIORAD Model 550型酶標(biāo)儀上,于490nm處,以空白對(duì)照孔調(diào)零后測(cè)各孔OD值,以P/N>2.1作為陽(yáng)性判斷標(biāo)準(zhǔn)(P為待測(cè)樣品OD值,N為陰性對(duì)照OD值)。每個(gè)樣品設(shè)3次重復(fù)。

2 結(jié)果與分析

2.1 田間病株BBWV2的RT-PCR檢測(cè)

用蠶豆病毒屬(Fabavirus)的兼并引物Fab5′R1F和Fab5′R1R對(duì)23個(gè)病株進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,19個(gè)病株擴(kuò)增到預(yù)期大小的約400bp的DNA片段(圖1)。

選取其中 XJ7-5、XJ7-6、XJ7-9和 XJ14-1的PCR產(chǎn)物分別回收、克隆和序列測(cè)定,得到目標(biāo)片段的核苷酸(nucleotide,nt)序列分別為391、390、392和390 nt;4個(gè)序列之間的同源性為95.1%~98.2%。

基因庫(kù)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)檢索結(jié)果表明,4個(gè)序列均與蠶豆萎蔫病毒2(BBWV-2)基因組RNA1組分5′末端第11位核苷酸開始的390~392 nt序列同源性最高,說(shuō)明經(jīng)RT-PCR檢測(cè),具有大小約400bp片段的田間病株均被BBWV2侵染。

圖1 感病加工番茄樣品蠶豆病毒屬病毒的RT-PCR檢測(cè)Fig.1 RT-PCR amplification of Fabavirus from processing tomato samples showing viral symptom

2.2 病毒分離物XJ14-1基因組RNA1和RNA2的測(cè)序及同源性比較

為了更多了解侵染加工番茄的BBWV2的基因組信息,根據(jù)上述檢測(cè)結(jié)果,選取病株XJ14-1,對(duì)其病毒分離物基因組RNA1和RNA2進(jìn)行克隆與測(cè)序。首先對(duì)基因庫(kù)中已登陸B(tài)BWV2的RNA1核苷酸序列進(jìn)行比對(duì),設(shè)計(jì)了3對(duì)引物對(duì)基因組RNA1進(jìn)行分段擴(kuò)增(表1),結(jié)果如圖2所示。

圖2顯示:利用R1F-1F和R1F-1R引物擴(kuò)增到約1.2kb的特異性片斷;用 R1F-31F和 R1F-31R引物擴(kuò)增到約1.5kb的特異性片斷;用R1F-32F和R1F-32R引物擴(kuò)增到約1.7kb的特異性片斷。

將各目標(biāo)片段克隆、測(cè)序,得到核苷酸序列分別為1185、1517、765nt(該片段部分序列未被測(cè)出),再將這3個(gè)序列與之前測(cè)得的390nt拼接,獲得基因組RNA1組分5′末端第11位核苷酸開始的的3659個(gè)核苷酸。再將該序列與基因庫(kù)中已登陸的BBWV2的RNA1進(jìn)行序列比對(duì),結(jié)果見表2。

由表2可知:它與韓國(guó)RP3分離物的同源性最高,達(dá)到94%,與其它BBWV2的同源性在76.6%~89.7%,與BBWV1的RNA1的同源性僅為54.1%。

根據(jù)基因庫(kù)中已登陸B(tài)BWV2的RNA2核苷酸序列設(shè)計(jì)了1對(duì)引物R2F-1F和R2F-1R對(duì)基因組RNA2部分序列進(jìn)行了RT-PCR、克隆和測(cè)序,獲得1300nts的核苷酸序列結(jié)果見圖3。將該序列與基因庫(kù)中已登陸的BBWV2的RNA2進(jìn)行序列比對(duì),結(jié)果見表2。

由表2可知:該序列與韓國(guó)K分離物的同源性最高,達(dá)到94%,而與韓國(guó)RP3分離物的同源性為83.4%,與其它BBWV2的同源性為76.6%~86.3%,與BBWV1的RNA2的同源性很低,僅為48%。

表2 病毒分離物XJ14-1與其它蠶豆萎蔫病毒核苷酸序列相似性比較Tab.2 Comparison of nucleotide sequence identities of RNA1and RNA2between XJ14-1and other Fabavirus

圖2 XJ14-1基因組RNA1的分段擴(kuò)增Fig.2 Amplification of the XJ14-1genome segment RNA1

2.3 田間病株BBWV2的ELISA檢測(cè)

在明確加工番茄可被BBWV2侵染的基礎(chǔ)上,利用BBWV2的單克隆抗體對(duì)田間采集的不同品種(品系)加工番茄病株進(jìn)行了ELISA檢測(cè),結(jié)果見表3。

表3顯示,20個(gè)品種都能檢測(cè)到BBWV2,陽(yáng)性率為20%~100%。257個(gè)供試病株,有137個(gè)病株檢測(cè)到BBWV2,總陽(yáng)性率為53.3%。由此說(shuō)明,田間病株帶毒率達(dá)到53.3%,并且供試20品種(品系)都可被BBWV2侵染。

圖3 XJ14-1基因組RNA2的分段擴(kuò)增Fig.3 Amplification of the XJ14-1genome segment RNA2

表3 田間病株BBWV2的ELISA檢測(cè)結(jié)果Tab.3 Detection of field samples showing viral symptom by ELISA

續(xù)表3

3 結(jié)論與討論

1)有關(guān)蠶豆萎蔫病毒在新疆的最早危害始于1994年,由周俊等研究[14],他們從表現(xiàn)斑駁的番茄病株上分離到1種球狀病毒,通過(guò)對(duì)病毒的癥狀特征、寄主范圍、衣殼蛋白氨基酸組成等初步判斷該病毒為蠶豆萎蔫病毒(BBWV),卻不能明確病毒種類是BBWV1還是BBWV2。蠶豆病毒屬(Fabavirus)的兼并引物既能作為檢測(cè)引物從病株上檢測(cè)該屬病毒,又能通過(guò)RT-PCR擴(kuò)增的片段大小有效區(qū)分該屬3種病毒(BBWV1、BBWV2和 GeMV)[13]。

本研究利用該對(duì)引物通過(guò)RT-PCR從23個(gè)加工番茄病株上檢測(cè)出19株被病毒侵染,然后通過(guò)對(duì)其中1個(gè)病毒分離物XJ14-1的基因組RNA1和RNA2進(jìn)行測(cè)序及序列比對(duì),結(jié)果表明XJ14-1的基因組與GenBank中登錄的BBWV2都具有高的序列同源性,而與BBWV1的同源性卻很低,因此從分子水平明確新疆加工番茄受到BBWV2的侵染。

2)利用BBWV2的單克隆抗體對(duì)田間不同品種(品系)加工番茄病株進(jìn)行ELISA檢測(cè),結(jié)果顯示:田間病株帶毒率達(dá)53.3%,且供試20品種(品系)都可被BBWV2侵染;所得數(shù)據(jù)表明,BBWV2在田間發(fā)生普遍,是危害新疆加工番茄的主要病毒之一。

由于BBWV2寄主分布很廣,我國(guó)已先后在多種豆科植物及百脈草、紫云英、辣椒等多種植物上發(fā)現(xiàn)有該病毒侵染[15]。這些寄主有的是BBWV2的越冬寄主,有的是橋梁寄主,它們?yōu)椴《局芏鴱?fù)始的循環(huán)危害提供了場(chǎng)所及棲息地。因此,對(duì)該病毒在新疆的發(fā)生情況還需進(jìn)行更廣泛的調(diào)查分析。

[1]Ferrer R M,F(xiàn)erriol I,Moreno P,et al.Genetic variation and evolutionary analysis of broad bean wilt virus 2[J].Archives Virology,2011,156(8):1445-1450.

[2]Sanfacon H,Iwanami T,Karasev A V,et al.Virus taxonomy,ninth report of the international committee on the taxonomy of viruses[M].London:Elsevier Academic Press,2011,881-899.

[3]Dong S W,Xiang H Y,Shang Q X,et al.Complete genomic sequence analysis reveals a novel fabavirus infecting cucurbits in China[J].Archives Virology,2012,157(3):597-600.

[4]Nakamura S,Iwai T,Honkura R.Complete nucleotide sequence and genomic organization of Broad bean wilt virus 2[J].Ann Phytopathol Soc Jpn,1998,64:565-568.

[5]Qi Y J,Zhou X P,Li D B.Complete Nucleotide Sequence and Infectious cDNA Clone of the RNA1of a Chinese I-solate of Broad Bean Wilt Virus 2[J].Virus Genes,2000,20(3):201-207.

[6]Murphy F A,F(xiàn)auquet C M,Bishop D H L,et al.Virus Taxonomy:Classification and Nomenclature of Viruses.Sixth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses[M].Vienna:Springer-Verlag,1995,341-347.

[7]Ferriol I,Ruiz-Ruiz S,Rubio L.Detection and absolute quantitation of Broad bean wilt virus 1(BBWV-1)and BBWV-2by real time RT-PCR [J].Journal of Virological Methods,2011,177(2):202-205.

[8]許文博,都業(yè)娟,黃家風(fēng).加工番茄CMV與ToMV的ELISA檢測(cè)及其相關(guān)性分析[J].石河子大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2009,27(2):199-201.

[9]姜玉霞,向本春,安仙麗.新疆加工番茄上番茄花葉病毒的分子鑒定[J].新疆農(nóng)業(yè)科學(xué),2008,45(3):484-489.

[10]都業(yè)娟,許文博,向本春,等.侵染新疆加工番茄的中國(guó)番茄黃化曲葉病毒DNA-A的基因組特征[J].植物病理學(xué)報(bào),2011,41(4):393-398.

[11]崔燕華,向本春.新疆加工番茄頂端葉片黃化現(xiàn)象的初步研究[J].石河子大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版.2011,29(4):425-431.

[12]常波,向本春,劉升學(xué),等.加工番茄條斑壞死病原黃瓜花葉病毒外殼蛋白基因的克隆和序列分析[J].石河子大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2006,24(4):410-414.

[13]Ferrer R M,Luis-Arteaga M,Guerri J,et al.Detection and identification of species of the genus Fabavirus by RT-PCR with a single pair of primers[J].Journal of Virological Methods,2007,144(1-2):156-160.

[14]周俊,尹玉琦,崔星明,等.蠶豆萎蔫病毒-新疆番茄分離株的鑒定[J].中國(guó)病毒學(xué),1994,9(4):327-331.

[15]周雪平,余永杰,戚益軍.蠶豆萎蔫病毒ELISA檢測(cè)系統(tǒng)建立及其應(yīng)用[J].植物病理學(xué)報(bào),1996,26(4):347-352.

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