廖啟洪 李麗敏 劉怡仱 余洪立 孟 曉 呂 程 潘柳吟 梁志東
廣西壯族自治區(qū)柳州市人民醫(yī)院,廣西 柳州 545006
應(yīng)用PCR方法檢測(cè)DYS287位點(diǎn)多態(tài)性
廖啟洪 李麗敏 劉怡仱 余洪立 孟 曉 呂 程 潘柳吟 梁志東
廣西壯族自治區(qū)柳州市人民醫(yī)院,廣西 柳州 545006
目的:調(diào)查廣西瑤族、壯族、漢族群體中DYS287基因位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性分布。方法:采用聚合酶鏈反應(yīng)結(jié)合瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)方法對(duì)132例白褲瑤族、149例壯族、172例漢族樣本DYS287位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè)分析。結(jié)果:三個(gè)民族人群均未發(fā)現(xiàn)插入YAP+個(gè)體。結(jié)論:獲得廣西白褲瑤族、壯族、漢族群體DYS287基因座的遺傳學(xué)數(shù)據(jù),為這三種民族遺傳關(guān)系的分析、法醫(yī)學(xué)鑒定及該民族的起源提供了一定的遺傳背景資料。
PCR;DYS287;多態(tài)性
Y染色體Alu多態(tài)性(即YAP)是一個(gè)應(yīng)用廣泛,而且具有較高價(jià)值的位點(diǎn)。檢測(cè)不同群體中YAP+率可以研究不同群體間的遺傳關(guān)系和遷徙歷史[1-2]。2010年以來,我們應(yīng)用PCR方法對(duì)廣西瑤族、壯族和漢族人群進(jìn)行Y染色體DYS287位點(diǎn)多態(tài)性檢測(cè)分析,現(xiàn)報(bào)道如下。
1.1 對(duì)象 根據(jù) “知情同意原則”,隨機(jī)分別抽取廣西瑤族男性132例、壯族男性149例3代內(nèi)無族外通婚彼此間無親緣關(guān)系的靜脈血2ml,乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝,同樣取漢族彼此間無親緣關(guān)系男性172例血樣。
1.2 DNA提取 采用傳統(tǒng)的酚-氯仿法抽提基因組DNA,溶于TE中,標(biāo)化為10~20mg/L,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3 PCR擴(kuò)增及瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) YAP-1 5′-CAG GGG AAG ATA AAG AAA TA-3′YAP-2 5′-ACTGCTAAA AGG GGA TGG AT-3′,25μl反應(yīng)體系中包含基因組DNA 25-40ng,0.12μmol/L引物,2.0 mmol/L dNTP,2.5 mmol/LMgCl,0.5U Taq DNA聚合酶。PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性2min,然后在94℃變性1min,59℃退火1min,72℃延伸1min條件下循環(huán)30次,最后于72℃延伸10min,產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
Y染色體DYS287位點(diǎn)瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果見圖1。YAP+個(gè)體的PCR擴(kuò)增片段為455bp,YAP-個(gè)體的PCR擴(kuò)增片段為150bp。本組456例廣西瑤族、壯族和漢族研究男性個(gè)體均未發(fā)現(xiàn)YAP+擴(kuò)增產(chǎn)物。
DYS287位點(diǎn)是位于人類Y染色體長(zhǎng)臂(Yq11)的一個(gè)Alu序列插入多態(tài),屬于Y—SNP位點(diǎn)。不同人群中的YAP多態(tài)性是由于人類在不斷的遷移過程中,人類祖先中攜帶Alu元件的群體與不攜帶Alu的群體發(fā)生基因交流造成的[3]。Y染色體為父系遺傳,除開長(zhǎng)臂和短臂末端的擬常染色體區(qū)在減數(shù)分裂中與X染色體發(fā)生重組外,其余的大部分Y特異區(qū)不發(fā)生重組,而是以單倍體形式由父?jìng)鹘o子,能夠忠實(shí)記錄了父系進(jìn)化的歷史。
國內(nèi)外研究表明DYS287位點(diǎn)是研究不同群體間遺傳結(jié)構(gòu)的較理想的遺傳標(biāo)記,各民族各地區(qū)YAP陽性率存在著明顯的差異。例如日本人群YAP+平均率達(dá)42%[4];非洲黑人中YAP+頻率高達(dá)79%,歐洲人群中YAP+只有4%-11%[5-6];國內(nèi)藏族、土族、彝族和普米族人群表現(xiàn)出很高的YAP陽性率,塔吉克族、白族、基諾族、仫佬族、毛南族和山東漢族也有YAP陽性,鄂溫克族、鄂倫春族、達(dá)斡爾族、黎族、傣族、拉祜族、佤族、等少數(shù)民族均沒有發(fā)現(xiàn)YAP陽性個(gè)體,表現(xiàn)出西北和南部較高,東北和中部地區(qū)則偏低的趨勢(shì)。
我們應(yīng)用PCR方法對(duì)廣西壯族男性DYS287位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行了檢測(cè),沒有發(fā)現(xiàn)YAP+個(gè)體,與陳陽等研究報(bào)道相一致[7]。我們以同樣的方法對(duì)廣西漢族、瑤族男性DYS287位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行了檢測(cè),結(jié)果漢族、瑤族YAP+頻率均為0,這與云南漢族[7]結(jié)果一致。
中國少數(shù)民族眾多,壯族和瑤族只是其中的一元,僅用DYS287位點(diǎn)對(duì)這兩個(gè)民族的篩查頻率不足以分析其遺傳關(guān)系和起源提供足夠證據(jù),但能夠提供有價(jià)值的線索,為壯、瑤兩個(gè)民族群體遺傳關(guān)系的分析、法醫(yī)學(xué)鑒定及群體的起源提供了一定的遺傳背景資料。
[1]周瑞霞,安黎哲,伊琳,等.甘肅3個(gè)特有少數(shù)民族回族和漢族DYS287DYS19的遺傳多態(tài)性研究[J].蘭州大學(xué)學(xué)報(bào),2006,42(2):38-42.
[2]石宏,董永利,李衛(wèi)翔,等.中國云南25個(gè)少數(shù)民族Y染色體DYS287位點(diǎn)的地理多態(tài)性[J].中國科學(xué):C輯,2002,32(4):373.
[3]文普帥,溫有鋒,席煥久,等.西藏藏族DYS287位點(diǎn)多態(tài)性研究.Medical Journal of the Chinese people’s Armed Police.2007,18(2):89-90.
[4]Hammer MF,Spurdle AB,Karafet T,et al.The geographic distribution of human Y chromosome variation.Genetics,1997,145(3):787-805.
[5]Spurdle AB,Hammer MF,Jenkins T.The Y-Alu polymer.-phism in southern African populations and its relationship to other Y-specific polymouphisms[J].Am JHum Genet,1994,54(2):319-330.
[6]Hammer MF,Horai S.Y chromosomal DNA variation and the peopling of Japan[J].Am JHum Genet,1995,56(4):951-962.
[7]陳陽,褚嘉祐,俞建昆,等.中國28個(gè)民族群體Y染色體DYS287位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性[J].中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報(bào),2006,28(2);196-201.
Polymorphism s of DYS287 locus in Yao and Zhuang and Han in Guangxi
LIAO Qihong,LILimeng,LIU Yiling,YU Hongli,MENG Xiao,LV Cheng,PAN Liuyin LIANG ZHidong The people’s hospital of Liuzhou,GuangXi,Liuzhou 545006,China
Objective:To study the polymorphisms of DYS287 locus ofmale Han and Zhuang and Yao nationality in Guangxi.Methods:The polymorphisms of DYS287 locus inmale 172 Han and 149 Zhuang and 135 Yao were analyzed by PCR and agarose gel electrophoresis.Results:With YAP+were not found in three population.Conclusion:The genetic data of DYS287 locus ofmale Han and Zhuang and Yao nationality in have been obtained,and theymight be useful in studies of population origin,relationship between populations,and forensic applications.
PCR;DYS287;polymorphisms
R739
A
1007-8517(2013)11-0030-02
2013.03.08)
廣西衛(wèi)生廳基金項(xiàng)目(Z2007303)。
廖啟洪 (1964~),主任技師,研究方向優(yōu)生遺傳。