南方醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生與熱帶醫(yī)學(xué)學(xué)院生物統(tǒng)計(jì)學(xué)系(510515) 陳方堯 段重陽(yáng) 張惠風(fēng) 陳平雁
樣本量估計(jì)及其在nQuery和SAS軟件上的實(shí)現(xiàn)*
——率的比較(三)
南方醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生與熱帶醫(yī)學(xué)學(xué)院生物統(tǒng)計(jì)學(xué)系(510515) 陳方堯 段重陽(yáng) 張惠風(fēng) 陳平雁△
*:教育部重點(diǎn)課題(DIA070113)
△通訊作者:陳平雁
2.1.1 差異性檢驗(yàn)
2.1.1.1 兩樣本率比較的 Pearson χ2檢驗(yàn)(估計(jì)樣本量或檢驗(yàn)效能)
方法:Machin 和 Campbell(1987)〔7〕、Fleiss 等(1980)〔8〕提出樣本量估計(jì)是建立在大樣本正態(tài)逼近基礎(chǔ)上的,其公式為,
更一般地,對(duì)于非平衡設(shè)計(jì),若兩組樣本量的比例為n2:n1=γ,即n2= γn1,有
〔例2-9〕某一持續(xù)四周的III期臨床試驗(yàn),欲驗(yàn)證一種H2阻滯劑新藥治療急性風(fēng)疹的臨床效果,采用平行安慰劑對(duì)照、平衡設(shè)計(jì)。根據(jù)以往研究報(bào)道,接受安慰劑治療的患者四周后治愈率為45%,預(yù)期本新藥的四周后治愈率為65%,如果檢驗(yàn)效能設(shè)置為95%,試估計(jì)每組所需樣本量。
nQuery Advisor 7.0實(shí)現(xiàn):設(shè)定檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05;采用雙側(cè)檢驗(yàn),即s=2;檢驗(yàn)效能取1-β=95%,π1=0.45,π2=0.65。
在nQuery Advisor 7.0主菜單選擇:
Goal:Make Conclusion Using:⊙Proportions
Number of Groups:⊙Two
Analysis Method:⊙Test
方法框中選擇:Chi-square test to compare two proportions Compute power or sample size。
在彈出的樣本量估計(jì)窗口將各參數(shù)值鍵入,如圖2-19所示,結(jié)果為n=158。
SAS9.2軟件實(shí)現(xiàn):
%macro PTT0(a,s,p1,p2,power);
圖2-19 nQuery Advisor 7.0關(guān)于例2-9樣本量估計(jì)的參數(shù)設(shè)置與計(jì)算結(jié)果
SAS運(yùn)行結(jié)果:
圖2-20 SAS9.2關(guān)于例2-9樣本量估計(jì)的參數(shù)設(shè)置與計(jì)算結(jié)果
2.1.1.2 兩樣本率比較的Pearson χ2檢驗(yàn)(估計(jì)其中一個(gè)總體率)
方法:根據(jù)式(2-20),在設(shè)定兩組中其中一組的總體率、檢驗(yàn)效能以及樣本量的條件下,可反推出另一組總體率的預(yù)期值。例如,在例2-9中,若已知安慰劑組的治愈率為45%,并設(shè)定檢驗(yàn)效能為95%,每組的樣本量為90,那么只有在試驗(yàn)組的總體治愈率達(dá)到71.1%以上的假設(shè)前提下,才能保證該試驗(yàn)的檢驗(yàn)效能在95%以上。
nQuery Advisor 7.0的顯示結(jié)果見圖2-21,SAS過(guò)程從略。
圖2-21 nQuery Advisor 7.0關(guān)于例2-9估計(jì)其中一個(gè)總體率的參數(shù)設(shè)置與計(jì)算結(jié)果
2.1.1.3 兩樣本率比較的Yates校正χ2檢驗(yàn)
方法:Fleiss(1980)〔8〕提出應(yīng)用校正因子來(lái)近似Fisher確切概率法,在式(2-22)所得樣本量的基礎(chǔ)上進(jìn)行校正,其計(jì)算公式為:
式中,n是由式(2-22)所得樣本量,π1和π2分別是兩總體率,顯然根據(jù)式(2-24)得到的樣本量比式(2-22)大,根據(jù)其反推出的檢驗(yàn)效能則相應(yīng)較低。
〔例2-10〕以例2-9為例,應(yīng)用基于Yates校正的方法估計(jì)樣本量。
nQuery Advisor 7.0實(shí)現(xiàn):設(shè)定檢驗(yàn)水準(zhǔn) α=0.05;雙側(cè)檢驗(yàn),即s=2;檢驗(yàn)效能取1-β=95%,π1=0.45,π2=0.65。
在nQuery Advisor 7.0主菜單選擇:
方法框中選擇:Chi-square test(continuity corrected)Compute power or sample size。
在彈出的樣本量估計(jì)窗口將各參數(shù)值鍵入,如圖2-22所示,結(jié)果為n=168,較之例2-9用非校正方法求得的樣本量158例顯然要大一些。
圖2-22 nQuery Advisor 7.0關(guān)于例2-10樣本量估計(jì)的參數(shù)設(shè)置與計(jì)算結(jié)果
SAS9.2軟件實(shí)現(xiàn):
SAS運(yùn)行結(jié)果:
圖2-23 SAS9.2關(guān)于例2-10樣本量估計(jì)的參數(shù)設(shè)置與計(jì)算結(jié)果
2.1.1.4 兩樣本率比較的Yates校正χ2檢驗(yàn)(估計(jì)其中一個(gè)總體率)
方法:根據(jù)式(2-20),在設(shè)定兩組中一組的總體率、檢驗(yàn)效能以及樣本量的條件下,可反推出另一組總體率的預(yù)期值。例如,在例2-10中,若已知安慰劑組的治愈率為45%,并設(shè)定檢驗(yàn)效能為95%,每組的樣本量為90,那么只有在試驗(yàn)組的總體治愈率達(dá)到72.1%以上的假設(shè)前提下,才能保證該試驗(yàn)的檢驗(yàn)效能在95%以上。
nQuery Advisor 7.0的顯示結(jié)果見圖2-24。SAS過(guò)程從略。
圖2-24 nQuery Advisor 7.0關(guān)于例2-10樣本量估計(jì)的參數(shù)設(shè)置與計(jì)算結(jié)果
2.1.1.5 Fisher確切概率檢驗(yàn)
方法:Fleiss(1981)〔9〕、Chernick 和 Liu(2002)〔2〕等提出樣本量估計(jì)公式為:給定所有陽(yáng)性例數(shù)m的條件效能β(θ/j)與m的概率p(j)乘積和。
式中L=max(0,m-n2),U=min(n2,m),n、m、k、n1、n2的含義見表2-3;在給定m的條件下:k的條件分布是比值比θ=p1q2/p2q1的函數(shù),qi=1-pi,有
能函數(shù)為β(θ|m)
表2-3 確切概率檢驗(yàn)的資料形式
〔例2-11〕以例2-9為例,應(yīng)用基于Fisher確切概率的方法估計(jì)樣本量。
在nQuery Advisor 7.0主菜單選擇:
方法框中選擇:Fisher's exact test。
在彈出的樣本量估計(jì)窗口將各參數(shù)值鍵入,如圖2-25所示,結(jié)果為n=166。
圖2-25 nQuery Advisor 7.0關(guān)于例2-11樣本量估計(jì)的參數(shù)設(shè)置與計(jì)算結(jié)果
SAS9.2軟件實(shí)現(xiàn):
SAS運(yùn)行結(jié)果:
圖2-26 SAS9.2關(guān)于例2-11樣本量估計(jì)的參數(shù)設(shè)置與計(jì)算結(jié)果