張佳卉 王力榮等
摘 要:果實糖、酸含量及其比例是評價桃果實品質(zhì)的重要指標(biāo)。主要綜述桃果實糖、酸代謝關(guān)鍵酶和糖、酸QTLs的定位和候選基因研究進展。桃果實糖、酸代謝基本途徑關(guān)鍵酶有蔗糖合成酶、蔗糖酸性轉(zhuǎn)移酶、山梨醇氧化酶、山梨醇脫氫酶、NADP+-蘋果酸酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶、檸檬酸合酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶等;通過遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和連鎖分析已定位到多個糖、酸組分QTLs,絕大多數(shù)位于第1、3、4、5、6、8連鎖群;通過關(guān)鍵酶編碼基因與QTLs共座位方法,分離到一系列候選基因。結(jié)合桃基因組測序數(shù)據(jù),總結(jié)調(diào)控桃果實糖、酸性狀的可能候選基因。針對目前桃糖、酸基因定位研究中存在的問題,展望實現(xiàn)桃果實糖、酸基因定位和單個基因克隆的新方法。
關(guān)鍵詞: 桃; 糖; 酸; QTLs;
中圖分類號:S662.1 文獻標(biāo)志碼:A 文章編號:1009-9980?穴2013?雪04-0688-09
據(jù)世界糧農(nóng)組織統(tǒng)計,2011年我國桃栽培面積有76.73萬hm2,產(chǎn)量1153萬t,占世界面積和產(chǎn)量的48.86%和53.55%,位居世界第1位(FAOSTAT: http://faostat.fao.org/)。
品質(zhì)是商品果的核心[1],但果實品質(zhì)性狀多為數(shù)量性狀,遺傳調(diào)控機制復(fù)雜,難以把握其遺傳規(guī)律。因此在育種上果實品質(zhì)無法在較短時間內(nèi)取得快速有效的改良,限制育種進程[2]。研究表明,在近20 a里,歐美等國家桃消費量并無增長趨勢,主要原因是桃品質(zhì)育種進程緩慢,品質(zhì)未能更好地滿足消費者需求[3]。因此,品質(zhì)改良是目前桃育種的主要方向之一。桃果實內(nèi)在品質(zhì)主要有糖、酸、糖/酸、可溶性固形物、維生素C含量以及香氣等[1],其中糖、酸含量及糖酸比是決定果實口感的主要因素[4-7]。由此,從分子水平上闡明桃果實糖、酸遺傳機理,了解種質(zhì)資源的糖、酸遺傳特性,對培育高品質(zhì)桃品種具有重大意義。
1 桃果實糖、酸組分
桃果實可溶性糖主要有蔗糖(約占可溶性糖的54%~75%)、葡萄糖(9%~21%)、果糖(3%~25%)、山梨醇(4%~11%)等[6]。山梨醇是主要的光合產(chǎn)物[8],并且果實風(fēng)味在很大程度上取決于山梨醇轉(zhuǎn)化為其它糖的類型[9]。但在果實成熟時山梨糖醇含量卻很低。桃果實中主要有機酸有蘋果酸(約占總酸的50%~60%)、檸檬酸(20%~25%)和奎寧酸(20%~25%)[10],此外還有含量極少的莽草酸 [11-12]。
1.1 桃果實糖、酸組分與品質(zhì)
研究證明,糖酸比大于20、含酸量在0.4%以下、pH大于4的桃品種以甜風(fēng)味為主;糖酸比在10以下、含酸量大于0.4%以上、pH值小于3的桃品種風(fēng)味酸[2]。從各組成因素而言,甜度與檸檬酸、莽草酸含量及糖酸比有關(guān),口感與總糖、蔗糖、山梨醇和蘋果酸含量以及蘋果酸和檸檬酸比例有關(guān)[13]。果實香氣可能與奎寧酸和莽草酸有關(guān)。奎寧酸和莽草酸是芳香物質(zhì)合成途徑之一—莽草酸途徑的中間產(chǎn)物[12],這2種有機酸可能直接轉(zhuǎn)化為芳香化合物或參與芳香化合物的合成從而間接影響果實香氣。桃果實各個化學(xué)組分之間有一定的關(guān)系,即糖、酸含量之間存在相關(guān)性[14]。這些組分的相關(guān)性,可能是因為糖或酸在代謝上相互聯(lián)系,即糖、酸各組分在果實成熟過程中和成熟后的代謝途徑相互交聯(lián)。
1.2. 果實糖、酸組分代謝關(guān)鍵酶
DeJong等[15]認(rèn)為桃果實發(fā)育過程可分為3個階段:第I階段,果實細(xì)胞快速分裂階段;第II階段,果實生長緩慢,內(nèi)果皮開始硬化,為硬核期;第III階段,果實細(xì)胞快速膨大的生長階段。在果實發(fā)育的第I階段,蔗糖合酶(Sucrose synthase, SS)和蔗糖酸性轉(zhuǎn)移酶(Acid invertase, AI)以及山梨醇脫氫酶(Sorbitol dehydrogenase, SDH)和山梨醇氧化酶(Sorbitol oxidase, SOX)都具有活性[16-18],說明初期山梨醇可能被轉(zhuǎn)化為蔗糖和葡萄糖。Lo Bianco(2002)觀察到SS、AI、SOX、SDH的活性與生長速率只在果實發(fā)育的第I、III階段存在顯著相關(guān)性[19],而Yamada等[20]通過檢測編碼這些酶的基因表達情況也發(fā)現(xiàn)SDH僅在第I、III階段表達。說明在果實發(fā)育過程中,這些酶催化蔗糖和山梨醇分解,一部分為果實發(fā)育提供能量,另一部分分解為其他貯存物質(zhì)如葡萄糖、有機酸等。因此,這些酶參與調(diào)控果實大小和品質(zhì)[19,21]。
在酸組分代謝方面,依賴于NAD+的蘋果酸酶(NAD+-ME)在果實從第I階段向第II階段轉(zhuǎn)變時,活性顯著下降,而在果實膨大期到成熟期該酶的活性又恢復(fù)到果實發(fā)育初期時的活性;依賴于NADP+的蘋果酸酶,在果實發(fā)育第I階段、第III階段活性增強;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)在第III階段活性有短暫的略微下降;檸檬酸合酶(CS)在第III階段活性顯著增加;磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)(催化草酰乙酸轉(zhuǎn)化為磷酸烯醇式丙酮酸)活性在果實發(fā)育初期顯著增加,在果實膨大后期其活性達發(fā)育初期的50倍,果實成熟采摘后PEPCK活性更高[22]。這些結(jié)果表明第I和第III階段是有機酸代謝旺盛期,發(fā)生一系列有機酸的合成和降解的過程,影響果實的最終糖酸含量。
綜上,蔗糖合成酶,蔗糖酸性轉(zhuǎn)移酶,山梨醇氧化酶,山梨醇脫氫酶,依賴于NADP+的蘋果酸酶,檸檬酸合酶等是決定果實品質(zhì)的關(guān)鍵酶,推測與糖、酸轉(zhuǎn)移有關(guān)的載體和質(zhì)子泵在果實品質(zhì)決定中扮演著重要角色。
1.3 桃果實糖、酸含量影響因素
桃果實糖、酸組分及其代謝過程比較復(fù)雜,受遺傳因素、生理、環(huán)境條件和栽培措施等多方面的影響。
王力榮[23]、吳本宏等[24]研究認(rèn)為油桃基因型可溶性固形物和總糖高于普通桃。王力榮[23]研究表明油桃和蟠桃基因具有增大果實固形物的作用。王力榮[23]、吳本宏等[24]、Wen等[25]研究表明油桃基因型的可滴定酸含量高于普通桃。因此基因型對桃和油桃的糖、酸含量具有重要影響[26]。此外,成熟期、光照、溫度、水分供應(yīng)和其他栽培措施等也可能影響桃果實的糖、酸含量[27-32]。
影響桃果實糖、酸含量的因素較多,但遺傳因素扮演重要角色。因此利用分子生物學(xué)手段發(fā)掘調(diào)控桃果實糖、酸含量的關(guān)鍵酶,闡明桃果實糖信號、激素信號與外界環(huán)境信號之間的聯(lián)系和調(diào)控,有機酸的跨膜運輸和載體蛋白的調(diào)控機制,為提高果實品質(zhì)提供理論依據(jù)。
2 桃果實糖、酸QTLs研究
目前在桃上已構(gòu)建多個遺傳連鎖圖譜,通過這些圖譜,定位到多個糖、酸QTLs,并分離到部分QTLs的候選基因。
2.1 桃遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
2.2 桃果實糖、酸QTLs
目前已經(jīng)定位的糖、酸相關(guān)的QTLs,絕大多數(shù)位于LG1、3、4、5、6、8,有機酸相關(guān)的QTLs主要位于LG5頂端的D基因區(qū)域,但目前尚不明確該區(qū)域內(nèi)影響有機酸和總酸含量是一因多效引起,還是因為多個QTLs成簇的結(jié)果。SSC QTLs在LG1、3、4、5、6有分布,且所報道的QTLs中,主要在LG2、4、6上,蔗糖QTLs在LG3、4、5、6、7都有報道,但LG5上最多,且某些QTL在不同定位群體都能夠被檢測到;葡萄糖QTLs在LG 1、4、5、6、7、8都被檢測到,但主要分布在LG4。另外,果糖QTLs主要分布在LG4,位置與很多SSC的 QTLs重合,這可能意味著LG4存在調(diào)控果糖和SSC含量的QTL或者QTL簇;山梨醇、檸檬酸、草莽酸、蘋果酸和奎寧酸所檢測到的QTLs數(shù)目都比以上其他性狀少,并發(fā)現(xiàn)某些報道的位點所解釋的表型變異都較高,如山梨醇在LG6上的QTL解釋75.1%的表型變異,檸檬酸在LG5的QTLs解釋81.7%的表型變異,蘋果酸在LG5在多個群體中都被檢測到解釋很大比例的表型變異,奎寧酸在LG6有2個解釋表型變異率較高的位點(35.1%和43.1%),草莽酸主要在LG3。這些解釋較大表型變異的QTL 區(qū)域,特別是在多個群體中都被檢測到,可能存在著調(diào)控這一性狀的關(guān)鍵基因[2,44,49-50]。
2.3 桃果實糖、酸QTLs的精細(xì)定位與候選基因
Ebenezer等[41]通過分子標(biāo)記和候選基因圖譜與其他圖譜對比分析,將候選基因類比錨定到其他圖譜上,以此推斷并驗證這些圖譜上已定位到的QTL的候選基因。通過與T×E圖譜對比,在LG5頂端D基因區(qū)域,相應(yīng)的基因是過氧化氫酶(Catalase,Cat)基因位點Cat1。通過與Dirlewanger等[40]利用‘ Ferjalou JalousiaבFantasia構(gòu)建的圖譜對比,發(fā)現(xiàn)在LG6上定位到的與SSC和鮮果重有關(guān)的QTLs對應(yīng)的候選基因有丙氨酸-乙醛酸氨基轉(zhuǎn)移酶基因(Alanine-glyoxylate aminotransferase, AGAT)、C端磷酸化酶樣結(jié)構(gòu)域基因(C-terminal domain phosphatase-like,CDPTL)、超氧化物歧化酶基因(Superoxide dismutase, SOD)、堿性螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋轉(zhuǎn)錄因子(BZIP transcription factor, bZIP)和谷氨酸葡萄糖-6-磷酸合成轉(zhuǎn)移酶基因(Glutamine-fructose-6-phosphate transaminase, C-PPN);LG4定位到的SSC和果糖含量QTLs[2]相應(yīng)的候選基因是倍半萜烯環(huán)化酶基因(Sesquiterpene cyclase, SeCy)、S-腺苷甲硫氨酸-2-甲基萘醌甲基轉(zhuǎn)移酶基因(S-adenosylmethionine: 2-demethylmenaquinone methyltransferase, SAMM)和甘油磷酰二酯酶基因(glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, GDPPDE)。這些候選基因在基因克隆和功能研究中有一定的參考價值。
2.4 桃全基因組測序
3 討 論
桃果實品質(zhì)提升主要是糖、酸含量及其比例的改良。目前通過連鎖分析已定位到多個糖、酸性狀相關(guān)QTLs,并在一些區(qū)域篩到相應(yīng)候選基因;部分QTLs對某一糖、酸組分貢獻率較大,推測這個區(qū)域可能存在調(diào)控果實糖、酸含量的重要基因。這類QTLs的存在說明糖、酸組分可能受若干主效基因和多個微效基因的調(diào)控,因此可通過篩選主效QTLs進行品質(zhì)改良。在第5連鎖群頂部定位到低酸位點(D位點),在多個研究中都被檢測到[44,53,55],說明其可能普遍存在于桃群體中;該位點存在蘋果酸、蔗糖、檸檬酸、pH和可滴定酸相關(guān)的QTLs;研究發(fā)現(xiàn)D基因位點可降低有機酸含量和增加蔗糖含量[44],對提高糖酸比十分有利,在育種上有重要價值,應(yīng)給予重視。
目前的研究在一定程度上推動了對桃果實品質(zhì)遺傳機制的認(rèn)識,但也存在一定的問題。一是連鎖分析選用兩個親本雜交的群體作為研究對象,體現(xiàn)的是兩個等位基因之間的差異,基因的廣度窄,導(dǎo)致所構(gòu)圖譜多態(tài)性低,較大比例的標(biāo)記在后代群體中表現(xiàn)為單一同態(tài)[3,56]。不能充分了解種質(zhì)資源群體的糖酸遺傳背景,不利于調(diào)控品質(zhì)的優(yōu)異等位基因的發(fā)掘,限制了種質(zhì)資源的運用價值。桃起源于我國,種質(zhì)資源豐富,其中野生資源可能存在調(diào)控糖酸和抗性的優(yōu)異等位基因。如吳本宏測定野生種和栽培種的雜交后代果實中主要糖、酸含量,結(jié)果顯示雜交后代糖、酸含量具有明顯超親現(xiàn)象,說明野生桃基因組中可能存在提高受體栽培種糖、酸含量的QTLs[11]。所以通過高世代回交將野生種質(zhì)中的優(yōu)異基因?qū)氲絻?yōu)良栽培種中,不僅可獲得抗病性強的栽培種,還可獲得高糖、酸含量的優(yōu)異栽培種。二是未實現(xiàn)調(diào)控糖、酸性狀基因的克隆。基因克隆和功能分析是對基因進一步運用的基礎(chǔ)。目前已鑒定到某些標(biāo)記與調(diào)控糖、酸的關(guān)鍵QTLs緊密連鎖,但這些標(biāo)記可能僅在某兩個親本間存在多態(tài)性,而在其它品種上不存在多態(tài)性,因此不能作為選擇標(biāo)記對基因型進行有效選擇。目前,在水稻上,通過基因克隆,研究基因序列在種質(zhì)資源中的變異,根據(jù)這些變異設(shè)計一套相應(yīng)的功能標(biāo)記作為選擇標(biāo)記,可在育種中對某一基因型進行檢測[57]。該方法在桃分子育種中有可借鑒之處。綜上,連鎖分析結(jié)果在桃育種上的應(yīng)用十分有限。
4 展 望
桃基因組測序數(shù)據(jù)和功能基因注釋信息的公布極大地推動桃基因定位和克隆的進展。目前通過桃基因組測序和基因注釋,共預(yù)測有27852個編碼蛋白和非編碼RNA的基因[58]。因此,對于某一個糖、酸QTL,可參考QTL所在標(biāo)記區(qū)間內(nèi)的基因組注釋信息而獲得候選基因,再驗證候選基因,篩選目的基因,實現(xiàn)單基因的精細(xì)定位和克隆。這在一定程度上克服林木生長周期長而不易構(gòu)建高世代群體進行基因圖位克隆的缺點。
關(guān)于桃果實糖、酸QTLs研究中存在的基因廣度窄的問題,目前提出的基于連鎖不平衡(Linkage disequilibrium, LD)的關(guān)聯(lián)分析(Association analysis),根據(jù)基因歷史重組事件鑒定可能存在的重要農(nóng)藝性狀QTLs位點的方法或有一定的可行性[59]。進行關(guān)聯(lián)分析的最大優(yōu)點是無需構(gòu)建專門的作圖群體,以來自不同生態(tài)群的地方品種組成的自然群體和野生資源等為材料,不受傳統(tǒng)遺傳群體的“兩親本范圍”限制;可檢測到群體內(nèi)大多數(shù)的等位基因,增加基因研究廣度;若結(jié)合種質(zhì)資源基因組測序數(shù)據(jù),構(gòu)建高密度單核型圖譜,基因定位可精確到單基因水平[60-61]。如Huang等[62]通過測序517個栽培稻品種,發(fā)現(xiàn)360萬個SNP,利用性狀與SNP關(guān)聯(lián)研究秈稻亞種14個農(nóng)藝性狀,發(fā)現(xiàn)其中6個位點與目前已克隆的基因極其靠近。我們首次將關(guān)聯(lián)分析引入桃基因定位研究,通過104份中國桃地方品種,53對多態(tài)性李屬SSR引物,關(guān)聯(lián)定位到桃果實近核處顏色、果肉顏色、黏離核、需冷量、盛花期、果實硬度、成熟期和果實發(fā)育期等性狀的QTLs[63],研究結(jié)果與前人連鎖分析結(jié)果一致,說明關(guān)聯(lián)分析方法在桃基因定位中具有可行性。此外,目前提出的轉(zhuǎn)錄組測序和表觀遺傳研究,可對現(xiàn)有基因組數(shù)據(jù)作一定補充。轉(zhuǎn)錄組分析可獲得多個涉及糖、酸代謝的基因,這些基因可為單QTL的定位和克隆提供參考。在實現(xiàn)基因克隆之后,可通過研究基因-基因互作或者表觀遺傳信息,探究基因表達調(diào)控機制,從分子水平了解糖、酸含量調(diào)控機制,并運用于糖、酸的分子育種,實現(xiàn)高品質(zhì)桃新品種的選育。
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