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癌癥數(shù)據(jù)玩家

2013-04-29 00:44:03
快公司 2013年6期
關鍵詞:布什骨髓瘤多發(fā)性

凱西·朱斯蒂(Kathy Giusti)在1996年被查出患有多發(fā)性骨髓瘤。作為一家大型制藥公司的全球運營主管,這種絕癥缺乏治療藥物的事實讓朱斯蒂害怕極了。從那時開始,她著手創(chuàng)立了多發(fā)性骨髓瘤研究基金會(Multiple Myeloma Research Foundation)。約翰·奎肯布什(John Quackenbush)是丹娜·法伯癌癥研究所(Dana-Farber Cancer lnstitute)計算生物學中心主任,同時是提供基因研究工具的GenoSpace公司的CEO。本刊資深編輯琳達·蒂斯勒(Linda Tischler)就他們兩位在癌癥研究方面的最新合作事宜進行了采訪。

FC:凱西,病情好些了嗎?

朱斯蒂:很慶幸,我現(xiàn)在處于病情緩解期。你知道,“緩解期”對于癌癥患者來說意義非常,尤其是對像我一樣患了多發(fā)性骨髓瘤的人。不過,也不能輕視復發(fā)的可能性。

FC:基金會的工作對你抗擊病魔是否有所幫助?

朱斯蒂:15年來,我們籌募到225億美元資金,完成了骨髓瘤基因組的測序,還對23種藥物進行過45項試驗——其中有6種已經(jīng)通過美國食品藥品管理局(FDA)的批準——我們的研究成果使多發(fā)性骨髓瘤患者的生存時限延長了一倍。我現(xiàn)在服用的萬珂(Velcade)和雷利米得(Revlimid),便是我們協(xié)助開發(fā)的藥物。更慶幸的是,我的同卯雙胞胎妹妹為我捐獻了匹配的干細胞,這樣的結合治療確實很有幫助。

奎肯布什:其實還得益于你曾是制藥行業(yè)人士,知道什么有用、什么沒有。很多時候,關鍵就在于能夠找到問題所在,然后有針對性地去解決。

朱斯蒂:不過,首當其沖的難題仍是,研究數(shù)據(jù)不會向研究中心和公司之外的人公開。

奎肯布什:研究行業(yè)里有條“潛規(guī)則”,就是大家不愿意分享研究數(shù)據(jù),不愿意數(shù)據(jù)讓能有效利用它的人得到。大家并不是共同尋求解決方案的伙伴。朱斯蒂:患者們要是知道內幕,可能會極度擔憂。這個行業(yè)里的激勵機制可以說是徹底崩壞了。

FC:激勵機制指的是什么?

奎肯布什:在學術研究領域,激勵機制包括發(fā)表和宣傳成果,以及擁有研發(fā)資金,所以,共享數(shù)據(jù)會削弱你的權益和名聲。而從商業(yè)角度來說,就看是誰申請的專利、誰能先把藥物推上市場和誰的專利權時限最長。大家心里都明白,自己研究的患者數(shù)量不夠多——尤其是對于罕見的癌癥——但就是害怕分享數(shù)據(jù)。結果就是,發(fā)表出來的一大堆垃圾文章在臨床治療上根本毫無作用。研究范圍已經(jīng)夠小了,加上你無法接觸到其他研究者的研究對象和數(shù)據(jù),所以想要借鑒成果十分困難。

朱斯蒂:在開展CoMMpass研究項目時(該項目為期10年,由50家腫瘤醫(yī)院采集和分析來自1000名多發(fā)性骨髓瘤患者的基因數(shù)據(jù),同時基于每位病人獨特的基因標記對他們實施靶向治療)最大的困難是,如果想要參與的話,你得愿意放棄知識產(chǎn)權。因此,在尋求同意合作的醫(yī)學研究中心時,我們碰到很多麻煩。不過,社區(qū)的研究中心倒是不用發(fā)表和出版成果,他們已經(jīng)開始登記。

FC:與此同時,約翰也在建立研究組織,讓研究人員可以安心地分析基因和臨床上的原始數(shù)據(jù)。

奎肯布什:我們和凱西初次接觸的時候,正好碰到兩個難題。一是人類基因序列的數(shù)據(jù)太龐大了——一個人的基因包含了30億個堿基對(DNA螺旋的組成模塊),如此龐大的數(shù)據(jù)可不是Excel表格能夠搞定的。二是基因有獨特性,每個人的基因都不一樣。這就體現(xiàn)了生物學研究的吊詭:我們需要匿名者的數(shù)據(jù),可是,一旦我有了你的基因,你就不再是匿名的了。當然,如果我知道你是誰、接受著什么治療方案、能追蹤患者若干年,那么基因的價值就更大。所以,我們需要對數(shù)據(jù)加密,以便研究人員只提取他們需要的信息,以一種安全的方式,就像在銀行里那樣。

朱斯蒂:我們花了兩年時間,積累了極好的原始數(shù)據(jù),可是如果大家用不到,有什么意義?我們需要將數(shù)據(jù)集中到一個系統(tǒng)里,讓研究人員、臨床醫(yī)師和生物信息專家都用得著。最后,當我們找到GenoSpace公司時,他們的人晾奇地說,“老天,你們所做的一切真是不可思議。”

朱斯蒂:約翰總是以病人為中心,也很樂意探討我們面臨的障礙。這太重要了,我們相信力量正轉向患者—方??喜际玻何覀儸F(xiàn)在還只是測試版,龐大的數(shù)據(jù)還在處理中。

朱斯蒂:這個夏末或是初秋,項目將正式啟動。

FC:需要怎樣的機制去鼓勵腫瘤中心的參與?

朱斯蒂:紐約西奈山醫(yī)院多發(fā)性骨髓瘤項目主任認為,我們的舉措能幫助形成更有利、更公平的科研環(huán)境,讓許多研究中心有希望達到丹娜法伯或是梅奧診所(Mayo Clinic)那樣的高水平。

奎肯布什:另外,我們還發(fā)現(xiàn),癌癥不只是特定組織的病變,它是分子水平的病變。如果能得到正確的突變,那么對付骨髓瘤的藥物也將可能用來對付結腸癌,或是乳腺癌。

朱斯蒂:在骨髓瘤里我們發(fā)現(xiàn)了BRAF基因(正是它的突變引發(fā)癌癥),讓人驚訝的是在黑色素瘤里也發(fā)現(xiàn)了它。這立刻掀起了關于骨髓瘤基因組和黑色素瘤基因組的討論。這是腫瘤研究的一大進步:問題已不再囿于癌癥種類,關鍵還在于基因。

奎肯布什:兩三年后,全國將會有成千上萬的患者變成龐大數(shù)據(jù)庫的一部分,成為推動創(chuàng)新研究的力量。我們當前要做的,就是掃屋迎客,激勵更多的疾病研究者參與進來,不是么?朱斯蒂:沒錯。想想我們正在打造的網(wǎng)絡,不斷開展的交流,真是讓人激動萬分。

FC:有遭遇過挫折嗎?

朱斯蒂:噢,太多了,簡直是噩夢。我一直說,先行者最大的付出就是把道路鋪平。

奎肯布什:回顧歷史,每次科學革命背后都有一個驅動力,那就是數(shù)據(jù)。從哥白尼到量子力學,數(shù)據(jù)一直在推動著創(chuàng)新。

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