游荷花,沈敬華(山西醫(yī)科大學(xué)汾陽學(xué)院病免教研室,汾陽 0300;內(nèi)蒙古醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)教研室)
Myo5a,是肌球蛋白的重鏈12條(MYH12),染色體定位為:15q21。肌球蛋白為一種馬達(dá)蛋白,能將化學(xué)能轉(zhuǎn)化為機(jī)械能,參與包括肌肉收縮、胞質(zhì)分裂、胞飲作用、趨化性、信號(hào)傳導(dǎo)及靶向小泡運(yùn)輸?shù)仍趦?nèi)的多種細(xì)胞活動(dòng),在細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)運(yùn)輸中發(fā)揮重要作用。肌球蛋白共分為18類(I-XⅧ ),Myo5a屬于這個(gè)大家族中的第五個(gè)家族MyosinⅤ中的一員。最近的實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)Myo5a可能與一些腫瘤的發(fā)生有關(guān)[1]。為進(jìn)一步研究Myo5a與腫瘤的關(guān)系,本研究設(shè)計(jì)構(gòu)建4個(gè)Myo5a末端特異性小片段的原核表達(dá)重組質(zhì)粒PGEX-4T-3/Myo5a,并進(jìn)行了一系列鑒定,為研究Myo5a的作用提供研究工具。
DNA模板 Myo5a,PGEX-4T-3原核表達(dá)載體,DH5α大腸桿菌菌株均為本室保存。T4DNA連接酶,BamHⅠ、XhoⅠ等 DNA限制性內(nèi)切酶均為Takara公司產(chǎn)品。膠回收試劑盒和質(zhì)粒小量提取試劑盒是AXYGEN公司產(chǎn)品。
據(jù)GenBank的人Myo5a基因全序列,設(shè)計(jì)了4對(duì)引物來擴(kuò)增Myo5a羧基端4個(gè)大小100 bp左右的小片斷(見表1)。其中上游引物設(shè)計(jì)含有BamHⅠ的酶切位點(diǎn),下游引物設(shè)計(jì)含有XhoⅠ的酶切位點(diǎn)。4個(gè)小片斷被分別命名為 down1、down2、down3、down4。
冰上將 0.5 μl 的 Myo5a DNA 模板,2 μl 的down1 引物,1 μl的 dNTP,0.5 μl的 DNA 聚合酶(Vent酶),5 μl的緩沖液,41 μl的雙蒸水構(gòu)成 50 μl體系加入PCR管中。先預(yù)變性:95℃2 min,然后變性:95℃15 s,后退火50℃30 s,后延伸:72℃45 s,此三步循環(huán)30次。最后4℃保溫。
擴(kuò)增down2、down3、down4重復(fù)以上操作即可,只是PCR體系中的引物換作對(duì)應(yīng)引物,退火溫度down4與down1相同,均為50℃。down2、down3退火溫度為54℃。
1.5 %瓊脂糖凝膠電泳鑒定被擴(kuò)增產(chǎn)物。得到所需擴(kuò)增片段后使用RCR純化試劑盒提純DNA。
用BamHⅠ和XhoⅠ雙酶切先前得到的4個(gè)PCR產(chǎn)物和PGEX-4T-3質(zhì)粒載體,膠回收試劑盒純化酶切后的產(chǎn)物。之后在4℃冰箱用T4 DNA連接酶將4個(gè)Myo5a基因小片段與PGEX-4T-3質(zhì)粒載體按適宜比例相連接過夜。取連接反應(yīng)液分別轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH 5α感受態(tài)細(xì)胞,后將菌液均勻涂布于含氨芐青霉素的LB培養(yǎng)基平皿上,37℃培養(yǎng)12-16 h。
1.5.1 PCR鑒定陽性重組質(zhì)粒 從上述四種LB培養(yǎng)基上每種隨機(jī)挑取數(shù)個(gè)菌落,做好標(biāo)記之后分別接種LB液體培養(yǎng)基中(其中含氨芐青霉素),劇烈振搖,37℃培養(yǎng)過夜。第2天從各管中分別取菌液以對(duì)應(yīng)引物做PCR反應(yīng)。經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳作PCR產(chǎn)物鑒定,能擴(kuò)增出對(duì)應(yīng)Myo5a特異性小基因片段者為陽性重組質(zhì)??寺?。
1.5.2 酶切鑒定陽性重組質(zhì)粒 用質(zhì)粒小量提取試劑盒對(duì)經(jīng)PCR篩選、鑒定正確的陽性重組質(zhì)粒克隆提取重組質(zhì)粒DNA,然后用BamHⅠ和XhoⅠ進(jìn)行雙酶切,鑒定目的基因是否插入載體中,酶切產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定。
北京諾塞基因組研究中心有限公司使用雙脫氧鏈終止法全自動(dòng)測(cè)序儀對(duì)PCR鑒定及酶切鑒定均正確的重組質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序。
以人Myo5a基因全序列為模板,用PCR技術(shù)擴(kuò)增出與預(yù)期大小一致四對(duì)約100 bp左右的DNA片段,結(jié)果見圖1。
2.2.1 重組質(zhì)粒的PCR鑒定 對(duì)LB平皿上隨機(jī)挑取的菌落進(jìn)行PCR擴(kuò)增鑒定,結(jié)果見圖2。
2.2.2 重組質(zhì)粒的酶切鑒定 圖3是先選取了PGEX-4T-3/Myo5a-down3重組質(zhì)粒的4個(gè)陽性克隆提取質(zhì)粒后,4個(gè)陽性克隆分別經(jīng)BamHⅠ/XhoⅠ雙酶切后,瓊脂糖凝膠電泳鑒定得到了圖中2-5泳道中的結(jié)果,1泳道為雙酶切空載體PGEX-4T-3作對(duì)照的結(jié)果。1泳道位置略低于重組質(zhì)粒,且無小片段DNA釋放,2-5泳道有150 bp左右DNA小片段釋放。圖4是其余三種重組質(zhì)粒也各選取四個(gè)陽性克隆經(jīng)BamHⅠ/XhoⅠ雙酶切的結(jié)果。1-4泳道為PGEX-4T-3/Myo5a-down1的雙酶切的結(jié)果,均有130 bp左右DNA小片段釋放。5-8泳道為PGEX-4T-3/Myo5a-down2的雙酶切的結(jié)果,均有100 bp左右 DNA小片段釋放。9-12泳道為PGEX-4T-3/Myo5a-down4的雙酶切的結(jié)果,最后兩泳道有小片段釋放。9,10兩泳道無小片段釋放,說明這兩個(gè)陽性克隆不正確。
將鑒定正確的重組質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果證明其基因序列與預(yù)計(jì)的DNA基因序列完全一致。證明down1、down2、down3、down4基因片段已被成功克隆到PGEX-4T-3載體中,即四種重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
Myo5a是由頭部、頸部、尾部三個(gè)功能部位組成,構(gòu)成一“Y”字形結(jié)構(gòu)。其中尾部較短,頸部較長,而與運(yùn)輸物質(zhì)有關(guān)的是尾部頂端的位點(diǎn)[2]。MyosinⅤ的頸部區(qū)域較長,大約24 nm[3],因而步子比較大。最近研究表明,MyosinⅤ類蛋白在無中間絲的情況下,運(yùn)動(dòng)“步伐”會(huì)變大、同時(shí)速度也會(huì)變快,提示中間絲網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)所形成的黏滯力有可能阻礙了細(xì)胞器間的運(yùn)輸[4]。實(shí)驗(yàn)證明,提純的腦肌球蛋白Va在電鏡下看到是雙頭聚合體[5]。研究發(fā)現(xiàn),老鼠肌球蛋白Ⅴ免疫缺陷時(shí)表現(xiàn)為皮膚顏色變淡,受影響的老鼠還會(huì)出現(xiàn)嚴(yán)重的神經(jīng)問題,幾周后就會(huì)死亡,分析認(rèn)為皮膚顏色變淡是因?yàn)楹谏仡w粒從黑色素細(xì)胞到發(fā)光毛發(fā)運(yùn)輸?shù)娜睋p所致[6-8]。這表明肌球蛋白Ⅴ在黑色素運(yùn)輸中是很重要的。也有實(shí)驗(yàn)證實(shí)人類“Griscelli病”是因?yàn)镸yosinⅤ基因突變導(dǎo)致了輕色素沉著,共濟(jì)失調(diào)以及各種免疫缺陷和神經(jīng)系統(tǒng)的癥狀[9]。因此推斷認(rèn)為肌球蛋白Ⅴ在細(xì)胞內(nèi)主要負(fù)責(zé)有被小泡和黑色素等微粒的運(yùn)輸,當(dāng)這種馬達(dá)發(fā)生故障時(shí)就會(huì)導(dǎo)致神經(jīng)系統(tǒng)或免疫系統(tǒng)等方面的疾?。?0]。近幾年又發(fā)現(xiàn)Myo5a與一些腫瘤的發(fā)生可能有關(guān)。
本實(shí)驗(yàn)用PCR克隆擴(kuò)增出4個(gè)Myo5a末端基因片段的蛋白編碼序列,用BamHⅠ和XhoⅠ進(jìn)行雙酶切后,將此片段插入原核表達(dá)載體pGEX-4T-3,構(gòu)建重組 子 PGEX-4T-3/Myo5a-down1,PGEX-4T-3/Myo5adown2,PGEX-4T-3/Myo5a-down3,PGEX-4T-3/Myo5adown4。先后用PCR、限制性酶切和基因測(cè)序來證實(shí)得到的是我們所需的重組質(zhì)粒,為后續(xù)研究Myo5a的作用提供研究工具,從而可以深入研究非常規(guī)肌球蛋白在腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移中的作用及其調(diào)控分子機(jī)制。
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山西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2013年2期