劉實(shí)
?學(xué)術(shù)爭(zhēng)鳴?
理解致癌性iPS重編程并用iPS細(xì)胞篩選抗癌藥
劉實(shí)
編者按 劉實(shí)博士關(guān)于iPS可能致癌性的探討,以及關(guān)于用iPS細(xì)胞進(jìn)行抗癌藥物篩選的提議,也許能夠給研究iPS細(xì)胞的學(xué)者一些啟示。當(dāng)然,無(wú)論是肯定還是否定劉實(shí)博士的觀點(diǎn),都需要有更多的實(shí)驗(yàn)來(lái)支持,而且也許在短時(shí)間內(nèi)不能得到一個(gè)結(jié)論。正如胚胎干細(xì)胞一樣,對(duì)其誘導(dǎo)生成的神經(jīng)干細(xì)胞是否在移植到患者身上后具有足夠的安全性,一直是Geron公司和FDA之間多年?duì)幾h的焦點(diǎn)。秉承“百花齊放、百家爭(zhēng)鳴”的原則,本刊愿意為干細(xì)胞領(lǐng)域的學(xué)者提供一個(gè)交流、溝通、爭(zhēng)鳴的平臺(tái),目的是為了更好地促進(jìn)干細(xì)胞事業(yè)的發(fā)展,從而為人類提供更多的健康服務(wù)。
在過(guò)去七年里誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPS細(xì)胞)被寄予很大的希望[1]。這主要是因?yàn)閕PS細(xì)胞曾被描述為與胚胎干細(xì)胞“不可區(qū)別”而可作為胚胎干細(xì)胞的“道德”替代物[2-3],更有一些報(bào)告甚至聲稱產(chǎn)生“不致癌”的iPS細(xì)胞[4]。
從一開始筆者就指出iPS細(xì)胞是錯(cuò)誤編程的干細(xì)胞,或者更明確而言,是與自然產(chǎn)生癌細(xì)胞相比的人造癌細(xì)胞[5-6]。筆者觀點(diǎn)的形成首先是基于查閱文獻(xiàn)而揭示一些重編程因子與癌癥的關(guān)聯(lián),另外更發(fā)現(xiàn)一些證據(jù)表明所謂的“不致癌”iPS細(xì)胞有致癌危險(xiǎn)。例如,筆者對(duì)山中伸彌發(fā)表在《科學(xué)》雜志的“不致癌”iPS細(xì)胞論文的[4]直接批評(píng)[7]導(dǎo)致他發(fā)表改錯(cuò)[8]并“感謝”指出的一些錯(cuò)誤。此后不久,山中伸彌研究組發(fā)表了論文描述其曾被認(rèn)為“安全”的iPS細(xì)胞具有“安全性的變異”[9]。
不幸的是,即使有對(duì)可靠批評(píng)的證實(shí),而且還有2008年發(fā)表在《干細(xì)胞與發(fā)育》經(jīng)過(guò)同行評(píng)審的世界首篇關(guān)于iPS細(xì)胞的綜述[10],但至今仍有很多iPS研究者不明白為何iPS細(xì)胞有癌性。有研究者試圖用蛋白[11]或RNA[12]來(lái)產(chǎn)生iPS細(xì)胞,盡管這些分子是一些致癌性重編程因子的下游產(chǎn)物因而用它們并不能去取iPS重編程內(nèi)在的致癌性[13-14]。更滑稽的是,一些研究還通過(guò)消除腫瘤抑制因子來(lái)提高iPS重編程的“效率”[15]。
筆者試圖在主流雜志上發(fā)表一篇闡述iPS重編程產(chǎn)生癌細(xì)胞可能機(jī)制的論文,但沒(méi)有雜志愿意發(fā)表這一獨(dú)特觀點(diǎn)。不過(guò)這篇論文還是發(fā)表在《邏輯生物學(xué)》[16]并上了一把“鎖”以保護(hù)其知識(shí)產(chǎn)權(quán)。與此同時(shí),相關(guān)專利申請(qǐng)也在反復(fù)寫作和修改,以便收集更多的證據(jù)來(lái)支持iPS細(xì)胞是癌細(xì)胞的判定和建立一個(gè)用iPS細(xì)胞篩選抗癌藥的基礎(chǔ)[17]。
對(duì)專利待批的用iPS細(xì)胞篩選抗癌藥的發(fā)明進(jìn)行詳細(xì)的介紹將超過(guò)本信的篇幅限制。但是,指明iPS重編程的重大危險(xiǎn)在于它通過(guò)引起代謝突變而把正常代謝變?yōu)樾律锎x產(chǎn)生癌細(xì)胞[17]這點(diǎn)很重要。這種致癌性代謝可通過(guò)各種表觀遺傳途徑實(shí)現(xiàn)。因此,只是避免基因組的重組[18-20]是不可能產(chǎn)生期望中的“安全”iPS細(xì)胞[21]。
對(duì)于iPS細(xì)胞真實(shí)特性透徹理解(見http://im1. biz/iPS.htm的不完全列表)的忽視導(dǎo)致了一個(gè)巨大錯(cuò)誤:相信iPS重編程是一個(gè)可以逆轉(zhuǎn)發(fā)育時(shí)鐘的技術(shù)而可將已分化成熟細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)槎嗄艿呐咛ゼ?xì)胞[22]。因此,認(rèn)識(shí)iPS細(xì)胞與胚胎干細(xì)胞不同[23]和與自然癌細(xì)胞相似[24]是很重要的。
如果正確理解iPS細(xì)胞的發(fā)現(xiàn)過(guò)程,或許會(huì)更易理解將癌性iPS細(xì)胞描述為“不致癌”還“道德的”胚胎干細(xì)胞替代物的欺騙。聽山中伸彌的諾貝爾講座[25],筆者驚詫山中伸彌為何沒(méi)意識(shí)到他的技術(shù)員報(bào)告的雄鼠“懷孕”(長(zhǎng)腫瘤)實(shí)際上是降低膽固醇的藥具有致癌轉(zhuǎn)化作用。他不合邏輯的理解不僅使他能在“頂尖”雜志快速發(fā)表大量不實(shí)發(fā)現(xiàn),而且還得了一個(gè)錯(cuò)誤的諾貝爾獎(jiǎng)[26]。
然而,把那些高影響的論文放在一邊,還原到實(shí)踐的專利或?qū)@暾?qǐng)可能會(huì)顯示更多真相而不是忽悠。從這點(diǎn)出發(fā),有趣的是山中伸彌雖然已得到產(chǎn)生iPS細(xì)胞原始方法的美國(guó)專利[27],卻還提出了另外兩個(gè)選擇安全iPS細(xì)胞的專利申請(qǐng)[28-29]。這表明,作為iPS細(xì)胞之父,山中伸彌對(duì)用他的原始iPS重編程產(chǎn)生安全iPS細(xì)胞已失去信心。我懷疑[30]他的新方法是否真能選出“安全”的iPS細(xì)胞。
另一方面,快速產(chǎn)生的種類繁多iPS細(xì)胞或許為研究癌癥生物學(xué)一些重要方面提供了黃金機(jī)會(huì)并可能導(dǎo)致發(fā)現(xiàn)有效除根的抗癌藥。因?yàn)閕PS重編程不只是與一些癌變轉(zhuǎn)化有“重疊”或“并行”[31-33],實(shí)際上對(duì)贅生物的最基本過(guò)程——誘導(dǎo)致癌性代謝[16-17]作了貢獻(xiàn)。而這些由iPS重編程導(dǎo)致的致癌性代謝突變很可能是贅生物細(xì)胞特有的。因此,能有效抑制或殺死iPS細(xì)胞的藥可能是廣譜但又很少甚至沒(méi)有副作用的抗癌藥。
所以,讓我們一起努力將iPS細(xì)胞用到最好的用途,解密迷惑的癌癥生物學(xué)和發(fā)現(xiàn)有效的抗癌藥。
1 Takahashi K, Yamanaka S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by de fi ned factors[J]. Cell, 2006, 126(4):663-676.
2 Wernig M, Meissner A, Foreman R, et al. In vitro reprogramming of fi broblasts into a pluripotent ES-cell-like state[J]. Nature, 2007, 448(7151):318-324.
3 Okita K, Ichisaka T, Yamanaka S. Generation of germlinecompetent induced pluripotent stem cells[J]. Nature, 2007, 448(7151):313-317.
4 Aoi T, Yae K, Nakagawa M, et al. Generation of pluripotent stem cells from adult mouse liver and stomach cells[J]. Science, 2008, 321(5889):699-702.
5 Liu SV. IPS cells are man-made cancer cells[J]. Logical Biology, 2008, 8(1):16-18.
6 Liu SV. Further evidence that iPS cells are man-made cancer cells[J]. Logical Biology, 2008, 8(1):66-68.
7 Liu SV. The Final Blow-up of the Induction and Reprogramming Claim for iPS CellsJ]. Logical Biology, 2008,8(1): 57-61.
8 Aoi T, Yae K, Nakagawa M, et al. Erratum:Generation of pluripotent stem cells from adult mouse liver and stomach cells[J]. Science, 2008, 321(5889):641.
9 Miura K, Okada Y, Aoi T, et al. Variation in the safety of induced pluripotent stem cell lines[J]. Nat Biotechnol, 2009, 27(8):743-745.
10 Liu SV. iPS cells:a more critical review[J]. Stem Cells Dev, 2008, 17(3):391-397.
11 Zhou H, Wu S, Joo JY, et al. Generation of induced pluripotent stem cells using recombinant proteins[J]. Cell Stem Cell, 2009, 4(5):381-384.
12 Warren L, Ni Y, Wang J, et al. Feeder-free derivation of human induced pluripotent stem cells with messenger RNA[J]. Sci Rep, 2012, 2:657.
13 Zhang WK, Zhang JJ, Liu SV. Are generation 2 iPS cells really safe[J]? Logical Biology, 2009, 9(1):12-13.
14 Liu SV. Some concerns about protein-induced pluripotent stem cells (piPSCs)[J]. Logical Biology, 2009, 9(1):16-18. 15 Hong H, Takahashi K, Ichisaka T, et al. Suppression of induced pluripotent stem cell generation by the p53-p21 pathway[J]. Nature, 2009, 460(7259):1132-1135.
16 Zhang WK. Cancer Cell Formation by iPS Techniques: Mechanisms and Testing ApproachesJ].Logical Biology, 2009, 9(1):22-41.
17 Liu SV. Using cells reprogrammed with oncogenic factors for screening anti-neoplastic agents:US, 20120196311[P]. 2012-08-02.
18 Okita K, Nakagawa M, Hyenjong H, et al. Generation of mouse induced pluripotent stem cells without viral vectors[J]. Science, 2008, 322(5903):949-953.
19 Macarthur CC, Fontes A, Ravinder N, et al. Generation of human-induced pluripotent stem cells by a nonintegrating RNA Sendai virus vector in feeder-free or xeno-free conditions[J]. Stem Cells Int, 2012, 2012:564612.
20 Yu J, Hu K, Smuga-Otto K, et al. Human induced pluripotent stem cells free of vector and transgene sequences[J]. Science, 2009, 324(5928):797-801.
21 Liu SV. Cancer risk may still present in episomally transfomed iPSCs[J]. Logical Biology, 2009, 9(1):14-15.
22 Nobel Foundation The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2012N/OL http://www.nobelprize.org/ nobel_prizes/medicine/laureates/2012/, 2012.
23 Liu SV. IPS cells versus ES cells[J]. Logical Biology, 2008, 8(2):47-48.
24 Liu SV. Distinguishing cancerous iPSCs from ESCs[J]. Top Watch, 2009, 4(1):20-23.
25 Yamanaka S. Nobel Leture:A winding road to pluripotencyN/OL]. http://www.nobelprize.org/ nobel_prizes/medicine/laureates/2012/yamanaka-lecture. html, 2012.
26 Liu SV. No Nobel Prize for Yamanaka's unproven claims[J]. Top Watch, 2012, 5(1):10-13.
27 Okita K, Takahashi K, Yamanaka S. Somatic cell reprogramming by retroviral vectors encoding Oct3/4. Klf4, c-Myc and Sox2:US, 8129187[P]. 2012-03-06.
28 Yamanaka S, Takayuk T. Selection method of induced pluripotent stem cells:JP, 201102790[P]. 12011-10-03.
29 Yamanaka S, Ohnuki M. Method of selecting safe pluripotent stem cells:JP, 20120171717[P]. 2012-07-05.
30 Liu SV. Understanding iPSCs by dissecting Yamanaka's patent disclosures[J]. Logical Biology, 2012, 12(2):69-73.
31 Suvà ML, Riggi N, Bernstein BE. Epigenetic reprogramming in cancer[J]. Science, 2013, 339(6127): 1567-1570.
32 Zhang J, Nuebel E, Daley GQ, et al. Metabolic Regulation in Pluripotent Stem Cells during Reprogramming and Self-Renewal[J]. Cell Stem Cell, 2012, 11(5):589-595.
33 Riggs JW, Barrilleaux BL, Varlakhanova N, et al. Induced pluripotency and oncogenic transformation are related processesJ]. Stem Cells Dev, 2013, 22(1):37-50.
2013-04-19)
(本文編輯:李少婷)
10.3877/cma.j.issn.2095-1221.2013.02.011
美國(guó)北卡峰頂市雄鷹分子醫(yī)學(xué)研究所
劉實(shí),Email:SVL8EPA@gmail.com
劉實(shí). 理解致癌性iPS重編程并用iPS細(xì)胞篩選抗癌藥[J/CD].中華細(xì)胞與干細(xì)胞雜志:電子版, 2013, 3(2): 106-107.