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LAMP技術(shù)診斷豬支原體肺炎的應(yīng)用研究

2012-03-13 10:39夏偉李鵬
關(guān)鍵詞:豬鼻病料肺臟

夏偉,李鵬

(1.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)動物科技學(xué)院,大慶163319;2.哈爾濱維科生物技術(shù)開發(fā)公司)

豬氣喘病又稱為豬支原體肺炎(Mycoplasma hyopneumoniae of swine,MPS),它是由肺炎支原體(Mycopl asma hy op neumoni ae,Mhp)引起的一種慢性接觸性呼吸道傳染病[1]。我國已將該病列入二類動物疫病。Mhp可通過空氣傳染,很難隔離和阻斷傳播途徑,且豬群的感染率很高。Mhp感染豬后,引起豬呼吸道上皮纖毛細胞的脫落,成為誘導(dǎo)疾病,特別是其他免疫缺陷性疾病發(fā)生的重要因子,從而使得疫苗的免疫效力減弱或引起免疫失敗,在全世界流行十分廣泛,是危害養(yǎng)豬業(yè)最嚴重的疾病,給養(yǎng)豬業(yè)造成嚴重經(jīng)濟損失[2]。

目前豬支原體體外分離培養(yǎng)和鑒定具有一定的困難,所以在發(fā)展中國家及我國臨床條件有限的地區(qū)建立一種簡單、快速的診斷方法就尤為重要[3],雖然現(xiàn)在該病有很多診斷方法,但是都需要較高的實驗室條件,因此在臨床上建立一種簡單、快速的診斷方法具有重要實踐意義[3]。2000年,Notomi等[4]提出的一種新的核酸擴增技術(shù)——環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(LAMP),它是一種通過設(shè)計四條特異性引物來鑒定目的基因的方法,而且它還是一種快速、簡便、準確和廉價的基因擴增法,在全世界很多發(fā)展中國家和臨床條件有限的地方被廣泛的應(yīng)用。研究主要應(yīng)用建立的豬肺炎支原體LAMP診斷方法[5]對從黑龍江省多個地區(qū)養(yǎng)豬場所采集的患豬呼吸道病的肺臟病料和健康豬鼻拭子進行檢測,試圖了解該法在豬支原體肺炎臨床診斷中的可行性,了解黑龍江省主要養(yǎng)豬密集地區(qū)的豬支原體肺炎發(fā)病情況,并進一步分析其流行病學(xué)規(guī)律,為黑龍江豬呼吸道病防治提供科學(xué)依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 主要試劑

Bst DNA聚合酶購自NEB生物技術(shù)有限公司;LA taq酶、dNTP+、DNA Marker 2000、pMD18-T載體購自大連寶生物工程有限公司;凝膠回收試劑盒、基因組DNA提取試劑盒,加拿大BBI公司產(chǎn)品,其他化學(xué)試劑均為國產(chǎn)分析純。

1.2 待檢病料處理和模板DNA提取

待檢病料是從黑龍江省不同地區(qū)多個養(yǎng)豬場采集或送檢的患呼吸道病豬肺臟病料及健康豬鼻拭子等。待檢豬的肺臟置于-20℃保存。將TE緩沖液按1∶10加入組織中,研磨成懸液,裝入滅菌的1.5mL Effendorf管中,于-20℃反復(fù)凍融三次,在高速冷凍離心機上,以3 000 r·min-1,離心10min,取上清250μL備用。鼻拭子以0.5mL緩沖液洗下,加0.5%SDS及0.2 g·L-1蛋白酶K,55℃水浴2 h,酚:氯仿抽提,冷乙醇沉淀DNA并以10 uL溶解,純化后的DNA于-80℃保存。以上均可用基因組DNA提取試劑盒按照說明書操作。

1.3 引物設(shè)計與合成

根據(jù)GenBank中Mh核苷酸序列(AF540381),利用Oligo6.71軟件設(shè)計了4條特異性引物,并由上海生物工程有限公司合成,均稀釋到10 pmol·μL-1,其引物如表1:

表1 豬肺炎支原體LAMP引物Table 1 Swinemycoplasma hyopneumoniae LAMP primer

1.4 LAMP擴增最佳反應(yīng)體系(表2)

反應(yīng)體系配制好后瞬時離心,放入水浴鍋60℃下反應(yīng)60min、85℃反應(yīng)5min即可。具體操作參照李鵬等[5]的方法進行。

表2 LAMP擴增反應(yīng)體系Table 2 LAMP amplification reaction system

1.5 LAMP重復(fù)性試驗

全部的待檢樣本均重檢一次。

2 結(jié)果

2.1 病料的M h檢測

實驗應(yīng)用LAMP技術(shù)共檢測了64份患呼吸道病的豬肺臟病料,其中54份為陽性,占84.2%,表3為LAMP對各病料的檢測結(jié)果。

表3 LAMP檢測肺炎支原體陽性結(jié)果Table 3 Mycoplasma hyopneumoniae positive results detected by LAMP

2.2 健康豬鼻拭子的檢測

共檢測健康豬鼻拭子共176份,支原體陽性數(shù)為157份,陽性率為89.2%。

表4 LAM P對健康豬鼻拭子的檢測結(jié)果Table 4 LAMP test results of nasal swabs of healthy pigs

2.3 重復(fù)性試驗

全部材料重復(fù)檢測一次,結(jié)果一致。

3 討論

豬氣喘病又稱為豬支原體肺炎(Mycoplasma hyopneumoniae of swine,MPS),此病是長期以來在豬場中難以凈化的一種疾病。尤其近年來研究發(fā)現(xiàn),豬肺炎支原體可與豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV),圓環(huán)病毒2型(PCV2)以及其他病原體混合感染,使感染的嚴重程度進一步提高,造成養(yǎng)豬業(yè)的重大經(jīng)濟損失[6]。因此,及時準確地檢測豬群中豬肺炎支原體的感染情況變得尤為重要。日前,用于檢測豬肺炎支原體的方法主要包括分離培養(yǎng)法、免疫熒光法、核酸探針法和PCR法等[7]。傳統(tǒng)分離培養(yǎng)法費時,操作復(fù)雜,對技術(shù)要求高,除非在條件具備的實驗室作特殊的診斷外,一般不將分離培養(yǎng)作為病原診斷方法;免疫熒光法適用于急性感染期檢測,此時患病豬肺內(nèi)存在大量的病原。但患病豬在受到抗生素治療后或轉(zhuǎn)為慢性感染時,血清陽性豬支原體數(shù)量不足以用免疫熒光技術(shù)檢出而易出現(xiàn)假陰性;核酸探針法雖然簡單、靈敏,但各種類型支原體之間常有交叉反應(yīng),易出現(xiàn)假陽性,影響檢驗準確性。PCR和實時熒光定量PCR方法雖然可以克服支原體培養(yǎng)難、易產(chǎn)生交叉反應(yīng)的缺點,還具有敏感性高、特異性強的特點。然其敏感性非常好且能有效避免污染,但由于需要昂貴的試驗器材及試劑,且對實驗室環(huán)境要求高以及在檢測時易出現(xiàn)假陽性等缺點而難以推廣到臨床應(yīng)用[8]。研究根據(jù)GenBank上發(fā)表的豬肺炎支原體的核苷酸序列,針對該核苷酸序列設(shè)計4條特異性引物,其外引物擴增片段大小為276 bp,通過對內(nèi)外引物的比例、dNTP+濃度、Mg2+濃度和Bst DNA聚合酶用量等條件逐一優(yōu)化后,成功建立的豬支原體環(huán)介導(dǎo)等溫擴增方法(LAMP)。LAMP方法在恒溫60℃條件下1 h特異性較強,其敏感性為當(dāng)其豬肺炎支原體的拷貝數(shù)低于為3~6時,不能檢測到該病原體。且經(jīng)特異性試驗中檢測多殺性巴氏桿菌、豬胸膜肺炎放線桿菌、肺炎雙球菌、支氣管敗血波氏桿菌、副豬嗜血桿菌和鏈球菌均呈陰性。與常規(guī)PCR反應(yīng)相比,LAMP法大大縮短了檢測時間,且能夠特異性鑒別豬肺炎支原體,其敏感性與常規(guī)PCR方法一致,但該方法具有較好的臨床應(yīng)用性。

應(yīng)用LAMP技術(shù)診斷結(jié)果表明:對來自黑龍江不同地區(qū)的患豬呼吸道疾病的肺臟病料64份進行檢測,54份診斷為陽性,陽性率84.3%。健康豬鼻拭子共176份,經(jīng)LAMP檢測,157份陽性,陽性率為89.20%。健康豬鼻拭子帶菌率較高,這一檢測結(jié)果與郭盼盼等的報道基本一致,應(yīng)引起獸醫(yī)工作者高度重視。

[1]Fablet C,Marois C,Kobisch M,et al.Estimation of the sensitivity of four sampling methods for Mycoplasma hyopneumoniae detection in live pigs using a Bayesian approach[J].VetMicrobiol,2010,143(2):238-245.

[2]Marois C,Dory D,F(xiàn)ablet C,et al.Development of a quantitative Real-Time TaqMan PCR assay for determination of the minimal dose of Mycoplasma hyopneumoniae strain 116 required to induce pneumonia in SPF pigs[J].JAppl Microbiol,2010,108(5):1523-1533.

[3]Caron J,Ouardani M,Dea S.Diagnosis and differentiation of Mycoplasma hyopneumoniae and Mycoplasma hyorhinis infections in pigs by PCR amplification of the p36 and p46 genes[J].JClin Microbiol,2000,38(4):1390-1396.

[4]Notomi T,Okayama H,Masubuchi H,et al.Loop-mediated i-sothermal amplification of DNA[J].Nucleic acids research,2000,28(12):63-67.

[5]李鵬,馬艷嬌,于劍,等.豬肺炎支原體環(huán)介導(dǎo)等溫擴增檢測方法的建立[J].中國生物制品學(xué)雜志,2011,24(4):480-483.

[6]趙東升,劉有昌,李祥健,等.豬肺炎支原體與其他病原的相互作用[J].養(yǎng)豬,2008(5):66-68.

[7]侯美如,侯喜林,高俊峰,等.牛輪狀病毒雙抗體夾心ELISA檢測方法的建立[J].黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報,2011(3):19-23.

[8]郭盼盼,黃書林,張躍偉,等.環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)快速診斷豬肺炎支原體[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報,2010,18(4):822-826.

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