吳云華,楊 帆
(中南民族大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,武漢430074)
艾氏劑是持久性有機(jī)污染物(POPs)之一,可引起人肝功能障礙、致癌[1].通過生物修復(fù)改善持久性有機(jī)污染物的環(huán)境污染是全球環(huán)境保護(hù)的研究熱點(diǎn)[2].細(xì)胞色素 P450(cytochrome P450,CYP450)是一類依賴于氧氣與NADPH催化內(nèi)源性和外源性化合物代謝的酶.CYP450酶可通過羥基化、環(huán)氧化、脫烷基化和脫鹵化氫等作用催化多種結(jié)構(gòu)不同的物質(zhì),使許多類型化合物的化學(xué)性質(zhì)發(fā)生變化,以解毒或降解POPs[3].近年來利用CYP450對(duì)污染物進(jìn)行生物降解的研究有很大進(jìn)展__[4],但對(duì)艾氏劑的生物降解未見報(bào)道.本研究以大腸桿菌為宿主表達(dá)家蠅細(xì)胞色素P450 6A1酶,研究CYP6A1酶及重組大腸桿菌對(duì)艾氏劑的生物降解能力.
CYP450 6A1基因?yàn)楸臼壹蚁壙寺∷?,表達(dá)載體PCW由美國Vanderbilt大學(xué)醫(yī)學(xué)中心提供,載體上含有CPR(人細(xì)胞色素P450還原酶)基因.
限制性內(nèi)切酶Nde I和Hin dⅢ,DNA聚合酶(LA Taq酶)和T4 DNA連接酶(Takara公司);氨芐青霉素(Amp)(上海生工生物工程有限公司);異丙基-β-D-硫代吡喃 半 乳糖苷(IPTG),δ-氨 基-γ-酮 戊酸(ALA)和二硫蘇糖醇(DTT)(Alfa Aesar公司).
2 ×TSE Buffer:將34.22g蔗糖和0.0372g EDTA·2Na溶于20mL,1mol/L的 Tris Buffer(pH7.6)過濾除菌.
磷酸緩沖液(spheroplast buffer):將0.1286g乙酸鎂加少許水溶解后加20 mL甘油,1mol/L的K2HPO4和1mol/L的KH2PO4共10 mL,調(diào)pH為7.6,定容至100 mL.
將CYP6A1基因C末端原有SalⅠ酶切位點(diǎn)改為Hin dⅢ酶切位點(diǎn),同時(shí)用Hin dⅢ單酶切CYP3A4 PCW載體,獲得CPR基因片段(N端含有一段連接片段),再將CYP6A1基因和CPR基因連接在一起.(見圖1).
圖1 pCW/CYP6A1-CPR載體構(gòu)建流程圖Fig.1 Construction of expression vector pCW/CYP6A1-CPR
CYP6A1 PCR擴(kuò)增所用引物序列為:5'-AGCGACATATGGCTTTTGGTTCATTTCT-3'(上游),5'-GCCAAGCTTTTATTTAATTTTCTTTCTT-3'(下游).
將含有pCW空載體質(zhì)粒和重組表達(dá)質(zhì)粒pCW/CYP6A1和pCW/CYP6A1-CPR的大腸桿菌單菌落接種到5mL LB培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)過夜.取4mL菌液加至400mL新鮮含 50 ng/L Amp、1 mmol/L VB1和100μL微量元素的TB培養(yǎng)基中,培養(yǎng)約3h使其OD600值約0.6,加 IPTG 至終濃度為1mmol/L,同時(shí)加入33.6mg ALA,28℃誘導(dǎo)36h[5].
取50mL誘導(dǎo)的培養(yǎng)物,冰上放置30 min.4℃,2800g離心20 min,棄上清收集菌體,用10mL 2×TSE Buffer加等體積冷無菌水重懸.再加10mg溶菌酶,冰上輕搖30 min后,4℃,2800g離心20min,用16mL冰磷酸緩沖液重懸,加16μL DTT,置-70℃凍存過夜.凍存樣品融化后于冰浴中超聲破碎,4mL/次,每破碎5s間隔5s,共8min.取5mL破碎后混合物-80℃保存,其余于4℃,1.2 ×104g離心12min,取上清4℃,1.8 ×105g離心60 min,用4mL磷酸緩沖液重懸沉淀[6].
CYP6A1含量按Omura和Sato分光光度法測(cè)定.在2個(gè)比色杯中各加2mL P450測(cè)定液,再分別加入20μL待測(cè)樣品和10μL連二亞硫酸鈉,混勻,1min后于紫外分光光度儀上掃描基線,樣品杯中通入CO約1min,穩(wěn)定1min后于400~500 nm內(nèi)掃描,得還原型細(xì)胞色素P450-CO復(fù)合物的吸收光譜圖,記錄A450和A490,按如下公式計(jì)算P450含量:
CPR活性測(cè)定按照Dignam方法[7]改良:分別吸取含0.05mmol/L細(xì)胞色素C的0.1mol/L磷酸緩沖液(pH 7.4)0.98mL、CPR 酶粗液 1 0μL,混勻后測(cè)A550,在樣品池中加入5mmol/L NADPH 10μL,立即混勻后隔15s測(cè)定A5501次,連續(xù)測(cè)定3min.根據(jù)A550差值,按如下公式計(jì)算酶活力:
根據(jù)CYP6A1及CPR的活性分別對(duì)其進(jìn)行定量,在磷酸緩沖液中分別加入終濃度為50μmol/L CYP450膜蛋白和2,4,20,40μmol/L艾氏劑,再加入1.5mmol/L NADPH起始反應(yīng),總反應(yīng)體積為0.5mL,37℃水浴15min后加入-20℃預(yù)冷的乙酸乙酯終止反應(yīng),以七氯作內(nèi)標(biāo),用酯和正己烷(體積比1∶1)的混合液萃取若干次,蒸干,加入石油醚溶解,做GC-MS分析[8].色譜條件:DB-5MS毛細(xì)管柱(30m ×0.25mm ×0.25μm),He 載氣(純度 >99.999%),柱頭壓61.8kPa,載氣恒線速度1.0mL/min,不分流進(jìn)樣1.0μL,進(jìn)樣口溫度 0℃,檢測(cè)器 300℃,氣質(zhì)接口250℃.色譜柱升溫程序:50℃ (保持1min)→50℃(25℃ /min)→150℃(5℃ /min)→250℃ (20℃ /min)→250℃ (保持 5min)[9].
將活化的菌液按1∶100加至30mL LB培養(yǎng)液中,培養(yǎng)至 A600約為0.6,加入艾氏劑使其終濃度為5μmol/L,混勻后按2mL/2h取菌液進(jìn)行萃取,共取8h.用旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀蒸干萃取樣品后進(jìn)行GC-MS分析.
構(gòu)建的CYP450載體用1.3中引物做PCR鑒定,CYP450-CPR載體用NdeⅠ內(nèi)切酶和Hin dⅢ內(nèi)切酶做雙酶切鑒定,見圖2.由圖2可見,CYP6A1基因?yàn)?537bp,CPR基因?yàn)?034bp.2個(gè)載體均為陽性,測(cè)序結(jié)果正確.
圖2 重組質(zhì)粒鑒定圖Fig.2 Identification of recombinant plasmid
原核蛋白電泳結(jié)果見圖3.由圖3可見,2種轉(zhuǎn)基因大腸桿菌表達(dá)的蛋白與對(duì)照組(空載體)蛋白對(duì)比,可明顯看到目的蛋白CYP6A1的表達(dá),大小為58kDa.CPR蛋白由于表達(dá)量較低,SDS-PAGE無法檢出.
圖3 CYP6A1在不同重組菌表達(dá)的SDS-PAGE電泳圖Fig.3 Characterization of expression of CYP6A1in different recombinant cells by SDS-PAGE
用CO差異光譜法測(cè)定CYP6A1蛋白含量,結(jié)果見圖4.由圖4可見,400~500nm掃描為最大吸收波長(zhǎng),ΔACYP6A1-CPR=0.029,ΔACYP6A1=0.024.根據(jù)公式(1)算得表達(dá)的CYP6A1在CYP6A1-CPR和CYP6A1宿主菌的含量分別為68.2nmol/g和50.05 nmol/g.時(shí)間掃描法測(cè)定CPR的酶活力,根據(jù)公式(2)算得8 nmoL/(min·mg).
圖4 重組菌的CYP6A1及CPR表達(dá)量的測(cè)定Fig.4 Determination of the expressed amount of CYP6A1-CPR and CYP6A1 in recombinant E.coli cells
用3種膜蛋白催化艾氏劑,僅有CYP6A1-CPR蛋白顯示催化艾氏劑氧化的能力,氧化產(chǎn)物為狄氏劑,結(jié)果見圖5.PCW空載宿主菌及CYP6A1宿主菌的膜蛋白與艾氏劑混合后未出現(xiàn)產(chǎn)物,而CYP6A1-CPR宿主菌的膜蛋白與艾氏劑混合后有明顯的產(chǎn)物峰生成,結(jié)果見圖6.
根據(jù)各濃度樣品的狄氏劑產(chǎn)量及剩余的艾氏劑的量,由雙倒數(shù)作圖法可求得CYP6A1的米氏常數(shù)Km=46.1μmol/L.
圖5 CYP6A1-CPR蛋白催化艾氏劑質(zhì)譜分析圖Fig.5 GC-MSprofiles of aldrin catalyzed by CYP6A1-CPR protein
將3種宿主菌活化,于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期(A600分別為0.492,0.581,0.630)加入艾氏劑,取樣 1 次/2h,萃取后進(jìn)行GC-MS分析,并根據(jù)狄氏劑產(chǎn)量確定不同宿主菌對(duì)艾氏劑的代謝能力,結(jié)果見圖7.
圖7 不同菌液對(duì)艾氏劑代謝產(chǎn)物狄氏劑的生成量-時(shí)間變化圖Fig.7 Time-amount changes of aldrin metabolites-dieldrin by different recombinant E.coli cells
由圖7可見,CYP6A1宿主菌菌液培養(yǎng)2h未檢測(cè)到到狄氏劑的生成,而4,6,8h后測(cè)得狄氏劑含量分別為1.40,3.50,7.57nmol/L;CYP6A1-CPR 宿主菌菌液培養(yǎng)2,4,6,8h后測(cè)得狄氏劑含量分別為3.39,10.52,127.76nM,163.36nmol/L.說明 PCW空載宿主菌無代謝艾氏劑的活性,CYP6A1宿主菌顯示微弱的代謝活性,因大腸桿菌體內(nèi)存在與CPR蛋白功能類似的遞H+蛋白,而CYP6A1-CPR宿主菌顯示較強(qiáng)的代謝活性.
將家蠅體內(nèi)提取得到的CYP6A1基因轉(zhuǎn)入到大腸桿菌,由大腸桿菌大量表達(dá)CYP6A1蛋白,研究CYP6A1蛋白對(duì)艾氏劑的代謝能力,并在CYP6A1基因后面加入CPR基因,探討CPR蛋白在CYP6A1蛋白對(duì)艾氏劑催化的過程中的作用.結(jié)果表明:CYP6A1蛋白對(duì)艾氏劑有環(huán)氧化作用,CPR蛋白在CYP6A1對(duì)艾氏劑催化的過程中起關(guān)鍵作用,CYP6A1-CPR宿主菌有一定的代謝艾氏劑的能力.
圖6 代謝產(chǎn)物狄氏劑的二次離子質(zhì)譜圖(SIM)Fig.6 Detection ofmetabolism product dieldrin by SIM
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