鐘 山 高 云 孫銘娟 楊生生 張建鵬 王梁華
第二軍醫(yī)大學(xué)基礎(chǔ)部生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室,上海 200433
《生化與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)》的動(dòng)態(tài)教學(xué)初探
鐘 山 高 云 孫銘娟 楊生生 張建鵬 王梁華
第二軍醫(yī)大學(xué)基礎(chǔ)部生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室,上海 200433
生物化學(xué)與分子生物學(xué)是一門醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)課程,為了進(jìn)一步提供學(xué)生在實(shí)驗(yàn)課中的學(xué)習(xí)效果,本研究初探《生化與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)》的教學(xué)內(nèi)容重新編排,發(fā)現(xiàn)能更大的調(diào)動(dòng)學(xué)生學(xué)習(xí)的積極性,理論掌握與動(dòng)手能力得到提高。
生物化學(xué);分子生物學(xué);動(dòng)態(tài)教學(xué)
現(xiàn)代生物化學(xué)與分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,不僅推動(dòng)了分子生物學(xué)理論在廣度和深度2個(gè)方面的進(jìn)展[1],同時(shí)以基因工程為主導(dǎo)的生化與分子生物學(xué)技術(shù),也已經(jīng)進(jìn)入產(chǎn)業(yè)化階段,并推動(dòng)著社會(huì)生產(chǎn)力的發(fā)展[2]。鑒于現(xiàn)代生物化學(xué)與分子生物學(xué)新技術(shù)的不斷涌現(xiàn),熟練掌握其實(shí)驗(yàn)操作技術(shù),就成為生命科學(xué)工作者包括醫(yī)療工作者的基本素質(zhì)要求,而實(shí)驗(yàn)教學(xué)是整個(gè)《生化與分子生物學(xué)》教學(xué)過(guò)程的重要環(huán)節(jié)[3]。本研究通過(guò)對(duì)實(shí)驗(yàn)課學(xué)生反饋與課程技術(shù)討論總結(jié),從生化與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)的培養(yǎng)目標(biāo)出發(fā),針對(duì)目前第二軍醫(yī)大學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)的現(xiàn)狀,以及傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)教學(xué)模式顯露出來(lái)的弊端進(jìn)行分析,提出以下實(shí)驗(yàn)課程改革方案。
新課程,新理念,要求新的學(xué)習(xí)方法。先理論后實(shí)踐,圍繞分子生物學(xué)技術(shù)的基本過(guò)程,以人腫瘤壞死因子α(TNFα)在大腸桿菌中表達(dá)為主線,以“分、切、接、轉(zhuǎn)、篩”五大步驟展開(kāi)。第一節(jié)介紹抽提組織細(xì)胞的核酸,并以此為模板,利用聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)或反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)的方法分離其編碼DNA序列,即目的基因的獲得(目的基因的“分”);第二節(jié)為分離純化質(zhì)粒的各種方法,即載體的獲得(載體的“分”),然后目的基因與載體分別進(jìn)行限制性核酸內(nèi)切酶的酶切及回收與鑒定,即“切”;第三節(jié)為目的基因與載體以連接酶連接,然后轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞,并以質(zhì)粒所帶的篩選標(biāo)志進(jìn)行篩選,即“接”“轉(zhuǎn)”與“篩”。第四節(jié)對(duì)重組子進(jìn)一步篩選,通過(guò)誘導(dǎo)表達(dá)重組子編碼的產(chǎn)物(人TNFα),然后進(jìn)行分離鑒定重組蛋白質(zhì),這是根據(jù)表達(dá)產(chǎn)物的理化性質(zhì)進(jìn)一步“篩”;以及以蛋白質(zhì)電泳(SDS-PAGE)為基礎(chǔ),從表達(dá)產(chǎn)物的分子量,免疫學(xué)性質(zhì)、殺傷腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)活性等方面進(jìn)一步分析與鑒定重組表達(dá)產(chǎn)物,也是“篩”的過(guò)程。
圍繞思維目標(biāo),指引思維的“曲徑”,這“曲徑”實(shí)際上是指不同角度、不同層次的思維指向。教學(xué)中,讓學(xué)生沿著“曲徑”逐層“探幽”,促其對(duì)思維目標(biāo)的深層感悟,并從中引出實(shí)驗(yàn)課教學(xué)的重點(diǎn)-實(shí)驗(yàn)原理及操作。
2.1 第一節(jié)課:理論教授內(nèi)容:TNF家族簡(jiǎn)介
(1)TNF配體及受體超家族基因結(jié)構(gòu)特征:復(fù)習(xí)內(nèi)含子,外顯子,單拷貝基因,基因家族;(2)TNF配體及受體超家族分子結(jié)構(gòu):復(fù)習(xí)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)層次,跨膜蛋白(Ⅰ、Ⅱ型),信號(hào)肽;(3)TNF配體及受體超家族結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系:凋亡(形態(tài)、分子標(biāo)志,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程),壞死;信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)(蛋白質(zhì)聚集,剪切,磷酸化等修飾)(重點(diǎn))。
帶著理論中存在的實(shí)驗(yàn)問(wèn)題,回到實(shí)驗(yàn)中去掌握具體的實(shí)驗(yàn)原理及操作。(1)PCR原理:DNA合成,3步反應(yīng)循環(huán);(2)引物(探針)設(shè)計(jì)原理:11條,結(jié)合TNF可溶性編碼序列的擴(kuò)增引物講解(重點(diǎn));(3)PCR擴(kuò)增體系:各組分(特別是dNTP、Mg、Taq酶),濃度,純度要求,使用時(shí)注意點(diǎn);(4)PCR擴(kuò)增條件:溫度、循環(huán)次數(shù),各種類型PCR儀簡(jiǎn)介;(5)PCR衍生技術(shù)(T-A克隆、RT-PCR、熒光定量PCR等)和用途。
2.2 第二節(jié)課:理論教授內(nèi)容
(1)質(zhì)粒:概念,質(zhì)粒不相容性;嚴(yán)緊性與松弛型質(zhì)粒差別的基礎(chǔ);其他常用載體(重點(diǎn));(2)限制性內(nèi)切酶:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ特征,Ⅱ型詳介(回文結(jié)構(gòu)、粘端、平端、同尾酶)(重點(diǎn));酶切圖譜;(3)連接酶:T4 DNA連接酶,其他連接酶;(4)其他工具酶;(5)定向克隆;(6)細(xì)胞組分。同時(shí)對(duì)應(yīng)本節(jié)帶出的要掌握實(shí)驗(yàn)操作:(1)質(zhì)粒抽提試劑盒原理、各溶液組分和作用,操作要點(diǎn)(重點(diǎn));(2)限制性內(nèi)切酶反應(yīng)條件,使用注意事項(xiàng)(甘油影響,質(zhì)粒純化時(shí)酒精殘余的影響);(3)凝膠回收試劑盒原理、各溶液組分和作用,操作要點(diǎn);(4)連接酶反應(yīng)條件,使用注意事項(xiàng)(徹底融化和溶解,溫度,膠回收純化時(shí)酒精殘余的影響);(5)電泳詳解:各類電泳(瓊脂糖凝膠電泳,薄膜電泳,SDSPAGE等,水平式、垂直、管狀、脈沖等)原理;核酸電泳操作要點(diǎn)(凝膠濃度,核酸濃度測(cè)算,分子量測(cè)算),適用范圍,注意事項(xiàng)(重點(diǎn))。(6)細(xì)胞組分分離:破碎細(xì)胞方法(物理方法:反復(fù)凍融,超聲,(高壓)勻漿;化學(xué)方法:酸解,堿裂解(質(zhì)粒抽提);生物方法:各種酶解)。
2.3 第三節(jié)課:理論教授內(nèi)容
(1)外源基因?qū)胨拗鞣绞剑ń雍?,轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)導(dǎo),感染等);感受態(tài);(2)重組子篩選原理(質(zhì)粒-抗性、生化標(biāo)志,外源DNA片段,表達(dá)產(chǎn)物)。同時(shí)對(duì)應(yīng)本節(jié)帶出的要掌握的實(shí)驗(yàn)操作:(1)轉(zhuǎn)化(CaCl2法):操作要點(diǎn):恒低溫(0℃)保持,復(fù)蘇溫度與時(shí)間;(2)藍(lán)白斑篩選。
2.4 第四節(jié)課:理論教授內(nèi)容
(1)蛋白質(zhì)的哪些性質(zhì)可作為蛋白質(zhì)分離純化的依據(jù)?(2)重組蛋白表達(dá)的特性(包涵體的形成,融合表達(dá),誘導(dǎo)表達(dá));(3)抗體簡(jiǎn)介:結(jié)構(gòu),類型(一抗,二抗;單抗,多抗,抗血清;(酶、熒光等)標(biāo)記抗體);(4)蛋白質(zhì)功能研究策略。
同時(shí)對(duì)應(yīng)本節(jié)帶出的要掌握實(shí)驗(yàn)操作:(1)鹽析:原理;分段鹽析;(2)離心技術(shù)詳解:轉(zhuǎn)速(超速),離心力;密度梯度離心;差速離心;溫度,真空度;(3)層析:分子篩(分子量測(cè)算,純度測(cè)算)(重點(diǎn));其他方法(離子層析,親和層析,反相,HPLC等);方法的選擇;(4)SDS-PAGE(分子量測(cè)算,純度測(cè)算)(重點(diǎn));Western-blot分析:操作要點(diǎn)(膜,電轉(zhuǎn)移,封閉,顯色:底物,化學(xué)發(fā)光,熒光);(5)活性測(cè)定:分子相互作用分析;酶活性分析,細(xì)胞功能分析,動(dòng)物模型分析。
2.5 第五節(jié)課:總復(fù)習(xí)
(1)分子克隆原理與流程總結(jié);(2)基因功能研究策略:表達(dá);表達(dá)調(diào)控;產(chǎn)物(蛋白質(zhì))結(jié)構(gòu),理化性質(zhì)鑒定,相互作用,功能研究。
在教學(xué)中采用的是以小組為單位進(jìn)行討論,開(kāi)展實(shí)驗(yàn)探索活動(dòng),以培養(yǎng)學(xué)生的探究能力。每節(jié)理論與操作課完成后預(yù)留部分時(shí)間,讓學(xué)生帶著思考回顧內(nèi)容,在討論中,每個(gè)成員是平等的,可以自由地發(fā)表個(gè)人的見(jiàn)解,通過(guò)討論可以集思廣益,互相合作,加速知識(shí)的同化。
3.1 第一節(jié)課思考題
(1)PCR時(shí)降低退火溫度對(duì)反應(yīng)有何影響?(2)PCR時(shí)延長(zhǎng)變性時(shí)間對(duì)反應(yīng)有何影響?(3)PCR時(shí)循環(huán)次數(shù)是否越多越好?為什么?(4)PCR時(shí)如果出現(xiàn)非特異性帶,可能有哪些原因?(5)如要闡述某蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)與功能,應(yīng)如何展開(kāi)?
3.2 第二節(jié)課思考題
(1)質(zhì)粒的基本性質(zhì)有哪些?(2)質(zhì)粒載體與天然質(zhì)粒相比有哪些改進(jìn)?(3)在堿法提取質(zhì)粒DNA操作過(guò)程中應(yīng)注意哪些問(wèn)題?(4)如果一個(gè)DNA酶解液在電泳后發(fā)現(xiàn)DNA未被切動(dòng),你認(rèn)為可能是什么原因?(5)瓊脂糖凝膠電泳中DNA分子遷移率受哪些因素的影響?(6)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)來(lái)判斷雙酶切時(shí),證實(shí)2個(gè)限制性內(nèi)切酶都起到了作用。
3.3 第三節(jié)課思考題
(1)制備感受態(tài)細(xì)胞的原理是什么?(2)如果實(shí)驗(yàn)中對(duì)照組本不該長(zhǎng)出菌落的平板上長(zhǎng)出了一些菌落,你將如何解釋這種現(xiàn)象?(3)在用質(zhì)粒載體進(jìn)行外源DNA片段克隆時(shí)主要應(yīng)考慮哪些因素?
生物化學(xué)與分子生物學(xué)是一門基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)學(xué)科[4],學(xué)生經(jīng)過(guò)對(duì)理論學(xué)習(xí)對(duì)生化與生物化學(xué)的研究?jī)?nèi)容及研究手段有了深入的理解,此時(shí)需要更進(jìn)一步的深入,通過(guò)對(duì)實(shí)驗(yàn)操作技能的學(xué)習(xí)與掌握,能夠利用分子生物學(xué)手段解決實(shí)際的實(shí)驗(yàn)問(wèn)題。
本實(shí)驗(yàn)課程改革正處于一個(gè)初步探索的階段,通過(guò)學(xué)生的反饋調(diào)查,新教學(xué)方法受到了同學(xué)們的歡迎,總體上體現(xiàn)在:注意力更加集中,運(yùn)用了理論與實(shí)驗(yàn)操作結(jié)合學(xué)習(xí),減輕了學(xué)生純理論學(xué)習(xí)的枯燥乏味的“填鴨式”教育;帶著問(wèn)題學(xué)習(xí)技術(shù),本教學(xué)摒棄了傳統(tǒng)上孤立的純實(shí)驗(yàn)技術(shù)學(xué)習(xí),而是采用帶著問(wèn)題,解決問(wèn)題,圍繞分子生物學(xué)技術(shù)的基本過(guò)程,以人腫瘤壞死因子α(TNFα)在大腸桿菌中表達(dá)為主線,以“分、切、接、轉(zhuǎn)、篩”五大步驟展開(kāi);及時(shí)溫故,經(jīng)過(guò)理論與操作技能的學(xué)習(xí),還預(yù)留部分時(shí)間讓學(xué)生對(duì)思考題進(jìn)行討論,有利于集思廣益,互相合作,加速知識(shí)的同化。
總之,通過(guò)對(duì)生化實(shí)驗(yàn)教學(xué)的改革,學(xué)生對(duì)生化實(shí)驗(yàn)產(chǎn)生了濃厚的興趣,參與實(shí)驗(yàn)的自覺(jué)性和積極性得到有效提高,提高了實(shí)驗(yàn)教學(xué)質(zhì)量。
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2095-0616(2012)01-150-02
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