王先磊, 譚訓剛 張培軍 徐永立
(1. 中國科學院 海洋研究所, 實驗海洋生物學重點實驗室 山東 青島 266071; 2. 青島國家海洋科學研究中心, 山東 青島 266071)
牙鲆RAG2基因的質(zhì)粒構(gòu)建和體外原核表達
王先磊1,2, 譚訓剛1, 張培軍1, 徐永立1
(1. 中國科學院 海洋研究所, 實驗海洋生物學重點實驗室 山東 青島 266071; 2. 青島國家海洋科學研究中心, 山東 青島 266071)
將牙鲆(Paralichthys olivaceus)RAG2 cDNA序列插入到體外表達質(zhì)粒pProEXTM HT, 在大腸桿菌(Escherichiacoli) BL-21中進行體外表達, 分析了誘導時間和 IPTG濃度對重組蛋白產(chǎn)生量的影響,確定了最佳誘導條件為:誘導時間為3 h, IPTG誘導濃度0.2 mmol/L。本研究同時對RAG2重組蛋白的可溶性進行確認, 并利用BD TALONTM 金屬親和柱純化了RAG2蛋白。本研究結(jié)果為進一步深入研究RAG2蛋白的生物學功能奠定了良好的基礎(chǔ)。
牙鲆(Paralichthys olivaceus); RAG2; 重組; 純化
重組活化基因2(Recombination activating gene 2,RAG2)在基因序列上與 RAG1基因緊密相連, 對于淋巴細胞的V(D)J重排是必需的。如果缺失了RAG1或者 RAG2基因產(chǎn)物, 淋巴細胞無法發(fā)育成熟, 從而在小鼠(Mus musculus)和人體內(nèi)導致嚴重的免疫缺陷[1]。
最初關(guān)于 RAG2蛋白的功能研究主要集中在哺乳動物、兩棲類和鳥類[2-4], 隨著魚類疾病的頻繁發(fā)生和水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展, 各國學者將目光開始轉(zhuǎn)移到魚類的 RAG2基因功能研究, 目前虹鱒(Oncorhynchus mykiss)[5-6]、斑馬魚(Denio rerio)[7-8]、紅鰭東方豚(Fugu rubripes)[9]、鯽魚(Carassius auratus)[10]、草魚(Ctenopharyngodon idellus)[11]等硬骨魚類的 RAG2基因已得到克隆, 而軟骨魚的代表物種鯊魚(Rhizoprionodon lalandii)RAG2基因也得到克隆[12], 其在硬骨魚類體內(nèi) mRNA水平的時空表達情況也進行了分析[13]。研究發(fā)現(xiàn), 目前已知的所有生物的RAG2的基因序列內(nèi)沒有內(nèi)含子。
牙鲆(Paralichthys olivaceus)是中國北方重要的經(jīng)濟養(yǎng)殖品種, 目前, 病害的頻繁發(fā)生嚴重阻礙了牙鲆養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展。為了保證牙鲆產(chǎn)業(yè)穩(wěn)定、健康、持續(xù)發(fā)展, 通過研究牙鲆免疫系統(tǒng)的基本結(jié)構(gòu)和功能而提高牙鲆抵抗病原菌侵害的能力是一條重要的途徑[14]。RAG2基因產(chǎn)物對于魚類免疫系統(tǒng)的發(fā)育具有重要意義。
在機體內(nèi)真正起作用的是蛋白質(zhì), 只有蛋白質(zhì)時空表達的確定才能更真實有效地反映免疫細胞和器官發(fā)揮作用的時間和空間分布。目前關(guān)于硬骨魚類 RAG2生物學功能研究基本上是在 mRNA水平,為進一步研究在蛋白水平 RAG2的生物學功能, 本研究在本實驗室的研究[15-16]及克隆了的牙鲆 RAG2基因的基礎(chǔ)上, 構(gòu)建了RAG2體外原核表達質(zhì)粒, 并進行了原核表達和純化, 為 RAG2蛋白抗體制備奠定了基礎(chǔ)。
限制性內(nèi)切酶(TaKaRa, 大連), T4Ligase (Ta-KaRa, 大連),Pfupolymerase(Shanghai Promega,上海), 蛋白 Marker(上海生物所), BD TALONTMMetal Affinity Resins(Clontech, USA)。
大腸桿菌(Escherichiacoli)BL-21及質(zhì)粒pBluescriptⅡSK, pProEXTMHT由本試驗室保存。
依據(jù)GST Gene Fusion System手冊(Amersham Pharmacia Biotech, USA。GST Gene Fusion System,Third Edition, Revision2,1997)[17], 將重組表達質(zhì)粒轉(zhuǎn)入到大腸桿菌BL-21, 獲得重組表達菌株。
按照 Qiagen公司(Qiagen, UAS。The QIAexpressionist? fifth edition- A handbook for high-level expression and purification of 6xHis-tagged proteins,2003)蛋白表達及純化手冊進行蛋白的誘導表達。IPTG的誘導濃度為 0.2、0.4、0.6、1.0、1.5、2.0、3.0和4.0 mmol/L。
實驗方法同 1.4, 只是 IPTG誘導濃度為 0.6 mmol/L, 第一次取樣時間為誘導后1 h, 此后每隔1 h取樣, 共取至第6小時, 探討其誘導時間對重組蛋白表達量的影響。
將誘導表達的菌液5 mL 12 000g離心1 min, 收集菌體, PBS洗滌后加入1 mL PBS重懸菌體。超聲破碎菌體后, 12 000g離心1 min。取上清, 加等體積2×蛋白處理液, 然后沸水浴5 min, 取20 μL電泳。沉淀加 500 μL PBS重懸, 加等體積 2×樣品處理液,沸水浴5 min, 取10 μL電泳。
按照 Qiagen公司蛋白表達及純化手冊(Qiagen,UAS。The QIAexpressionist? fifth edition-A handbook for high-level expression and purification of 6xHis-tagged proteins, 2003)進行蛋白的純化。
蛋白電泳用SDS-PAGE電泳, 濃縮膠濃度為5%,分離膠濃度為8%。電泳采用恒流, 電流強度10 mA??捡R斯亮藍R250進行染色, 7%的醋酸進行脫色。
根據(jù)本實驗室獲得的牙鲆 RAG2的基因序列,設(shè)計特異性引物(R2F7, R2R7, 引物序列見 1.2), 利用Pfu聚合酶擴增牙鲆RAG2 cDNA的全序列; 將得到的基因片段插入到pBluescriptⅡSK的SmaⅠ位點;通過酶切將RAG2基因片段轉(zhuǎn)移到帶6組氨酸標簽的pProEXTM HT表達質(zhì)粒, 構(gòu)建重組表達質(zhì)粒。測序確認 RAG2基因插入方向及閱讀框架的正確性。成功構(gòu)建的重組表達質(zhì)粒圖譜見下圖:
重組質(zhì)粒插入的RAG2基因的全長為1602 bp,可以編碼533個氨基酸, 加上pPROEXTMHT表達質(zhì)粒的氨基酸片段, 表達的融合蛋白 RAG2的分子量理論值為60 kDa。
當培養(yǎng)溫度為 37℃, IPTG誘導濃度為 0.6 mmoL/L時, 加入誘導劑IPTG后1 h, SDS-PAGE電泳的結(jié)果顯示, 在接近預測重組蛋白分子量的位置附近出現(xiàn)了一條新的蛋白條帶, 與預測的 RAG2重組蛋白的分子量60 kDa接近, 可以確認為該蛋白條帶為帶6組氨酸標簽的RAG2重組蛋白(圖1)。
隨著培養(yǎng)時間的延長, RAG2蛋白的表達量也不斷增加。到3 h, RAG2蛋白的表達量達到最大, 在此后的研究時間段內(nèi) RAG2蛋白的表達量變化不大。因此, 在以后誘導RAG2蛋白表達時, 誘導時間定為3 h。
圖1 誘導時間對RAG2蛋白表達量的影響Fig. 1 The effect of induction time on the expression of recombinant RAG2 protein
當培養(yǎng)溫度為 37℃, 誘導時間為 2 h時, 盡管IPTG濃度(0.2 ~4.0 mmoL/L)變化比較大, 但是其對RAG2蛋白的重組表達量的影響卻變化不大(圖2),因此在大量表達RAG2蛋白時, IPTG濃度用最小濃度0.2 mmoL/L對重組表達質(zhì)粒進行誘導即可。
菌體經(jīng)超聲破碎后電泳結(jié)果顯示, 上清中幾乎沒有目的蛋白帶, 而沉淀中主要以目的蛋白為主,這說明 RAG2蛋白是主要以包涵體的形式存在于宿主細胞中(圖3)。
圖2 IPTG濃度對RAG2蛋白表達量的影響Fig. 2 The effect of IPTG concentration on the expression of recombinant RAG2 protein
圖3 RAG2蛋白可溶性的確定Fig. 3 Determination of the solubility of the recombinant RAG2 protein
將菌體離心后, 用變性裂解緩沖液裂解后, 加入到BD TALONTM金屬親和柱, 通過緩沖液pH逐漸降低的梯度變化, 進行純化。實驗結(jié)果顯示, 當緩沖液pH為8.0和6.3時, 洗滌液中沒有目的蛋白, 當pH降到4.5時, 在對應的RAG2蛋白的位置出現(xiàn)了單一的蛋白電泳條帶(圖4, 帶6-9), 說明攜帶組氨酸序列標簽表達的 RAG2蛋白可以結(jié)合到 BD TALONTM Metal Affinity Resins親和柱, 通過pH的改變, RAG2蛋白可被洗脫下來, 并且蛋白純化效果比較好。
圖4 體外重組表達蛋白的純化Fig. 4 Purification of recombinant RAG2 protein
對原核表達載體作者使用了帶 6組氨酸標簽的pPROEXTMHT表達質(zhì)粒, 6組氨酸標簽可與 BD TALONTM 金屬親和柱結(jié)合, 從而將目的蛋白吸附在親和柱上, 通過改變pH值梯度變化進行洗脫, 從而獲取高純度的目的蛋白。得到的 RAG2蛋白電泳后分子量比理論分子量偏大, 這可能是由于在重組蛋白前面加上一段帶6組氨酸的載體序列造成的。
重組蛋白的表達量受到宿主菌、誘導時間和誘導物濃度的影響。作者最終使用的宿主菌株是大腸桿菌 BL-21, 作者實驗初期使用的菌株是大腸桿菌DH 5α, 但是沒有誘導出 RAG2蛋白的表達(實驗結(jié)果沒有列出), 可能大腸桿菌DH 5α不適合RAG2蛋白的表達, 說明選擇合適的宿主菌對于重組蛋白在原核表達是一個重要的因素。重組蛋白表達量的多少與誘導物的濃度和誘導時間有密切關(guān)系, 本實驗所用的誘導物為IPTG, 由于IPTG本身有毒性, 而且價格較貴, 經(jīng)過條件優(yōu)化, 最終IPTG誘導濃度為0.2 m moL/L。誘導時間實驗顯示, 經(jīng)過IPTG的誘導, 菌體很快產(chǎn)生目的蛋白, 隨著誘導時間的增加, 重組蛋白的量不斷增加, 到3 h時, 重組蛋白表達量達到最大值, 此后進入平臺期, 因此作者使用的誘導時間為3 h。
外源基因在大腸桿菌中的表達產(chǎn)物, 通??梢砸钥扇苄院筒豢扇?即包涵體)的形式存在。RAG2蛋白主要以包涵體的形式存在于宿主菌中, 由于包涵體的不溶性、致密性和相對穩(wěn)定性, 通過超聲波破碎、離心可以很容易地進行初級分離。純化后, 通過在包涵體中加入含尿素的變性裂解緩沖液, 打開蛋白中的次級鍵, 使組蛋白標簽暴露出來, 與樹脂上的Co2+離子結(jié)合。另外, 在沉淀中發(fā)現(xiàn)了大量的目的蛋白存在(圖3), 可能是由于在將重懸浮液放到搖床上振蕩得不夠充分, 大多數(shù)包涵體都沒有溶解, 可以將沉淀用變性裂解液重新懸浮, 通過 BD TALONTM 金屬親和柱進一步進行純化, 提高目的蛋白的回收率。
[1]Shinkai Y, Rathbun G, Lam K P, et al. RAG-2-deficient mice lack mature lymphocytes owing to inability to initiate V(D)J rearrangement[J]. Cell, 1992, 68(5):855-867.
[2]Oettinger M A, Schatz D G, Gorka C, et al. RAG-1 and RAG-2, adjacent genes that synergistically activate V(D)J recombination[J]. Science, 1990, 248(4962):1517-1523.
[3]Carlson L M, Oettinger M A, Schatz D G, et al. Selective expression of RAG-2 in chicken B cells undergoing immunoglobulin gene conversion[J]. Cell, 1991,64(1):201-208.
[4]Greenhalgh P, Olesen C E, Steiner L A. Characterization and expression of recombination activating genes(RAG-1 and RAG-2) inXenopus laevis[J]. J Immunol,1993, 151(6):3100-3110.
[5]Hansen J D. Inspection of the 3' UTR genomic region for RAG1 and RAG2 in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) reveals potential regulatory motifs[J]. Dev Immunol, 1997, 5(2):129-131.
[6]Hansen J D, Kaattari S L. The recombination activating gene 2 (RAG2) of the rainbow troutOncorhynchus mykiss[J]. Immunogenetics, 1996, 44(3):203-211.
[7]Willett C E, Cherry J J, Steiner L A. Characterization and expression of the recombination activating genes(rag1 and rag2) of zebrafish[J]. Immunogenetics, 1997,45(6):394-404.
[8]Zhong H, Li Z, Lin S, et al. Initiation of V(D)J recombination in zebrafish (Danio rerio) ovaries[J]. Mol Immunol, 2007, 44(7):1784-1792.
[9]Peixoto B R, Mikawa Y, Brenner S. Characterization of the recombinase activating gene-1 and 2 locus in the Japanese pufferfish,Fugu rubripes[J]. Gene, 2000,246(1-2):275-283.
[10]范嗣剛, 張瓊宇, 羅琛. 鯽魚Rag基因的克隆及表達分析[J]. 水生生物學報, 2009, 33(4):603-612.
[11]張瓊宇, 范嗣剛, 羅琛. 草魚 RAGs的克隆及不同發(fā)育階段的表達分析[J]. 水生生物學報,2009, 2009,33(5):795-803.
[12]Bernstein R M, Schluter S F, Bernstein H, et al. Primordial emergence of the recombination activating gene 1 (RAG1):sequence of the complete shark gene indicates homology to microbial integrases[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1996, 93(18):9454-9459.
[13]Zapata A, Diez B, Cejalvo T, et al. Ontogeny of the immune system of fish[J]. Fish Shellfish Immunol,2006, 20(2):126-136.
[14]Liu Y, Zhang S, Jiang G, et al. The development of the lymphoid organs of flounder,Paralichthys olivaceus,from hatching to 13 months[J]. Fish Shellfish Immunol,2004, 16(5):621-632.
[15]徐芃, 譚訓剛, 張培軍, 等. 牙鲆Myogenin蛋白在大腸桿菌中重組表達的研究[J]. 中國海洋大學學報,2007, 35(5):754-758.
[16]文愛韻. 性別相關(guān)基因在牙鲆性腺分化和性別表型形成中的遺傳學分析[D]. 北京:中國科學院研究生院, 2010.
[17]Sambrook J, Russell D. Molecular cloning:a laboratory manual (3rd ed) [M]. New York:Cold Spring Harbor Press, 2001:636-644.
Construction and expression of a prokaryotic vector of recombinant olive flounder RAG2
WANG Xian-lei1,2, TAN Xun-gang1, ZHANG Pei-jun1, XU Yong-li1
(1. Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences,Qingdao 266071, China; 2. National Oceanographic Center, Qingdao 266071, China)
Nov.,4,2011
Olive flounder (Paralichthys olivaceus); RAG2; recombination; purification
The full length of olive flounder RAG2 cDNA was ligated to plasmid pPROEXTM HT, and was transferred intoEscherichia coli(BL-21) for recombinant protein expression. It showed that the protein expression was induced by IPTG. The optimal concentration of IPTG and optimal induction time were 0.2 mmoL/L and 3 h, respectively. The recombinant RAG2 protein was purified by BD TALONTM Metal Affinity Resins. This study will be useful for further research on the function of flounder RAG2.
Q78 文獻標識碼:A 文章編號:1000-3096(2012)09-0059-05
2011-11-04;
2012-02-17
國家863計劃資助項目(2012AA092203); 國家自然科學基金項目(30800838); 山東省自然科學基金項目(Y2008E12)
王先磊(1976-), 女, 山東膠南人, 助理研究員, 博士, 主要從事海洋生物學研究, 電話:0532-80970745, E-mail:wxl@nocq.org;譚訓剛, 通信作者, 電話:0532-82898559, E-mail:tanx@qdio.ac.cn
譚雪靜)