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雌核發(fā)育、野生及養(yǎng)殖牙鲆形態(tài)差異分析

2019-12-11 10:07:35趙海濤范寧寧萬玉美孫桂清吳彥徐晨曦
河北漁業(yè) 2019年11期
關(guān)鍵詞:牙鲆體長形態(tài)學(xué)

趙海濤 范寧寧 萬玉美 孫桂清 吳彥 徐晨曦

摘要:通過測定牙鲆(Paralichthys olivaceus)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)和現(xiàn)代框架結(jié)構(gòu)特征數(shù)據(jù),利用方差、聚類、主成分和判別分析等方法,分析了雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)特征差異。結(jié)果顯示:雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆間38個指標(biāo)存在顯著差異(P<0.05)。雌核發(fā)育牙鲆先和野生牙鲆聚成一支,二者再與養(yǎng)殖牙鲆聚到一支。共得到9個主成分,表明三種牙鲆的形態(tài)差異主要體現(xiàn)在牙鲆魚體縱向和頭部性狀指標(biāo)間。雌核發(fā)育、野生、養(yǎng)殖牙鲆的判別準(zhǔn)確率P1均為90%,其判別準(zhǔn)確率P2分別為96.43%、90%、8438%,綜合判別率為90%。研究表明:方差、聚類、主成分和判別分析等方法對三種牙鲆差異分析比較有效。

關(guān)鍵詞:牙鲆(Paralichthys olivaceus);形態(tài)差異;多元分析;聚類;主成分;判別分析

牙鲆(Paralichthys olivaceus),隸屬硬骨魚綱,鰈形目,鲆科[1-2],主要分布于中國、朝鮮半島和日本沿海,是我國重要的海洋經(jīng)濟(jì)魚類之一。它肉質(zhì)細(xì)嫩鮮美、營養(yǎng)成分高,是人們喜愛的佳肴,具有非常廣闊的市場,經(jīng)濟(jì)價值高。牙鲆在我國漁業(yè)生產(chǎn)上占有一定的地位,但是由于過度捕撈和環(huán)境污染,造成牙鲆自然資源大幅度下降。為滿足市場需求,20世紀(jì)90年代初期,國內(nèi)開始進(jìn)行牙鲆親魚越冬、自然產(chǎn)卵和苗種繁育技術(shù)研究,并取得成功。20世紀(jì)90年代后期開始進(jìn)行人工養(yǎng)殖,隨著養(yǎng)殖技術(shù)的發(fā)展,牙鲆養(yǎng)殖業(yè)逐漸發(fā)展壯大,但人工養(yǎng)殖牙鲆也出現(xiàn)了生長緩慢、疾病頻發(fā)等種質(zhì)退化現(xiàn)象,針對這一現(xiàn)象,種質(zhì)改良和新品種的研發(fā)成了牙鲆研究的重點,由中國水產(chǎn)科學(xué)研究院利用雌核發(fā)育選育全雌牙鲆研究取得成功[3]。雌核發(fā)育是只有母本遺傳的特殊生殖方式[4-5],該方法培育的后代具有提高生長速度、抗病性和產(chǎn)量等優(yōu)勢,具有很大的經(jīng)濟(jì)價值。

形態(tài)學(xué)特征是遺傳因子與環(huán)境因子相互作用的結(jié)果[6],是物種鑒定和分類的參考依據(jù)。利用多元分析法對形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行綜合分析,可以有效地鑒定不同的種群或家系。國內(nèi)外學(xué)者在這方面的研究已取得一些成績[4,6-15]。牙鲆方面主要集中在牙鲆雌核發(fā)育間[3,15]、普通牙鲆間[2]、不同地域牙鲆間[2]的研究,但迄今未見有雌核發(fā)育牙鲆與野生牙鲆和普通養(yǎng)殖牙鲆間形態(tài)差異研究的報道。本研究通過對傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)和現(xiàn)代框架結(jié)構(gòu)指標(biāo)的測定,用方差、聚類、主成分和判別分析等多元分析方法,分析了雌核發(fā)育、野生、養(yǎng)殖三種牙鲆的形態(tài)特征差異,以期為牙鲆新品種的研發(fā)和家系選育提供理論依據(jù)。

1材料與方法

1.1材料

實驗對象為雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆和養(yǎng)殖牙鲆,采自河北省紅鰭東方鲀良種場,每個種類均隨機(jī)采集樣本30尾[2],實驗魚均體型健壯、體表無損傷,無疾病,生命力強(qiáng)。

1.2數(shù)據(jù)采集

實驗選取形態(tài)特征共52個,包括5個采用傳統(tǒng)形態(tài)特征和47個現(xiàn)代框架結(jié)構(gòu)性狀。數(shù)據(jù)采用Motic Images Plus 2.0軟件進(jìn)行測量。5個特征的度量值:體長、體高、頭長、吻長、尾柄長、尾柄高[2]?,F(xiàn)代框架測量共用了14個框架數(shù)據(jù)采集點,以獲得牙鲆的框架結(jié)構(gòu)。如圖1所示,根據(jù)14個框架數(shù)據(jù)采集點之間的直線距離共測量了47個牙鲆的框架結(jié)構(gòu)性狀。

1.3分析方法

為消除魚體大小不同對參數(shù)的影響,對52個測量特征進(jìn)行校正,度量值除以體長,共得到51個可量參數(shù)。運用SPSS 19.0對校正后的51個特征數(shù)據(jù)進(jìn)行了方差分析、主成分分析、判別分析和聚類分析[2]。

方差分析:運用SPSS 19.0對三種牙鲆群體的傳統(tǒng)數(shù)據(jù)和框架數(shù)據(jù)分別進(jìn)行單因素方差分析(ANOVA),當(dāng)數(shù)據(jù)具有方差齊性的時候采用LSD法,當(dāng)數(shù)據(jù)不具有方差齊性的情況下采用Tamhane's T2法分析牙鲆的形態(tài)差異。當(dāng)P>0.05時,牙鲆形態(tài)無顯著性差異;當(dāng)P<0.05時,牙鲆形態(tài)差異顯著;當(dāng)P<0.01時,牙鲆形態(tài)差異極顯著。

聚類分析:運用SPSS19.0 中的系統(tǒng)聚類功能對三種牙鲆進(jìn)行聚類分析,首先計算51項形態(tài)比例參數(shù)的均值,然后利用歐氏距離的最短系統(tǒng)聚類法構(gòu)建聚類樹,即歐氏距離系數(shù)越小樣本差異性越小,反之則越大。

主成分分析:首先運用SPSS 19.0對三種牙鲆的形態(tài)學(xué)特征數(shù)據(jù)進(jìn)行主成分分析,得到的各主成分負(fù)荷值和貢獻(xiàn)率,然后根據(jù)各主成分的得分繪制主成分散點圖,以進(jìn)一步判斷種群之間相似性大小。

判別分析:運用SPSS 19.0對三種牙鲆的形態(tài)學(xué)特征數(shù)據(jù)進(jìn)行判別分析,采用逐步判別法,并用以下公式計算其判別率。

P1=判別正確的尾數(shù)/實際尾數(shù)

P2=判別正確的尾數(shù)/判別尾數(shù)

綜合判別率=∑Ai/∑Bi

式中:Ai為第i個群體判別正確的尾數(shù),Bi為第i群體的實際尾數(shù),綜合判別率為三組相應(yīng)數(shù)的和[2,16]。

2結(jié)果與分析

2.1方差分析

方差分析結(jié)果顯示(見表1):養(yǎng)殖牙鲆與雌核發(fā)育牙鲆相比,可量性狀中尾柄長/體長差異極顯著(P<0.01),頭長、體高、吻長與體長之比差異不明顯;47個指標(biāo)框架數(shù)據(jù)中,9個指標(biāo)差異極顯著(P<0.01)占19.1%,12個指標(biāo)差異顯著(P<0.05),占25.5%,其余差異不顯著,占55.3%。養(yǎng)殖牙鲆與野生牙鲆相比較,尾柄長/體長差異顯著,頭長、體高、吻長與體長之比差異不顯著;47個指標(biāo)框架數(shù)據(jù)中,8個指標(biāo)差異顯著,占17.0%(P<0.05),5個指標(biāo)差異極顯著,占10.6%(P<0.01),34個指標(biāo)差異不顯著,占72.3%。雌核發(fā)育牙鲆與野生牙鲆相比,頭長/體長差異顯著,吻長/體長、尾柄長/體長差異極顯著;可量性狀體高/體長差異不顯著,在47個指標(biāo)框架數(shù)據(jù)中31個指標(biāo)差異不顯著,占66.0%,6個指標(biāo)差異顯著,占12.8%,10個指標(biāo)差異極顯著,占21.3%。

2.2聚類分析

聚類分析結(jié)果顯示,雌核發(fā)育牙鲆先和野生牙鲆聚成一支,二者再與養(yǎng)殖牙鲆聚到一起。表明,雌核發(fā)育牙鲆與野生牙鲆形態(tài)特征差異較小,而與養(yǎng)殖牙鲆差異較大(見圖2)。

1.代表養(yǎng)殖牙鲆,2.代表雌核發(fā)育牙鲆,3.代表野生牙鲆

2.3主成分分析

基于5個可量性狀及47個框架性狀對雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆進(jìn)行主成分分析,得到9個主成分,其特征根、方差貢獻(xiàn)率、累計貢獻(xiàn)率如表2所示。9個主成分對三種牙鲆總變異的累積貢獻(xiàn)率為86.389%,其中第一主成分的變異貢獻(xiàn)率最大,為50.237%,主要取決于D3-7/體長、D5-2/體長、D5-4/體長、D5-6/體長、D5-8/體長、D5-14/體長、D6-10/體長、D7-14/體長等比例性狀指標(biāo)(見表3),其中D5-2/體長、D5-4/體長、D5-6/體長、D5-8/體長反映了牙鲆魚體縱向指標(biāo),D3-7/體長、D5-14/體長、D6-10/體長反映了牙鲆魚體橫向指標(biāo),D7-14/體長反映的是牙鲆尾部的形態(tài)。第二主成分的變異貢獻(xiàn)率為9.675%,貢獻(xiàn)率最大的比例性狀指標(biāo)為D1-4/體長、D1-6/體長、D3-4/體長、D3-6/體長,主要反映牙鲆頭部指標(biāo)。因此,可認(rèn)為雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)差異主要體現(xiàn)在牙鲆魚體縱向和頭部性狀指標(biāo)間。

三種牙鲆的第一、二主成分的散點分布圖(圖3)顯示,野生牙鲆重疊最多,與養(yǎng)殖牙鲆重疊最少,與全雌牙鲆重疊最多。三種牙鲆均有不同程度的相互疊交。

2.4判別分析

如表4所示,基于5個可量性狀及47個框架性狀的判別結(jié)果表明:三種牙鲆的判別準(zhǔn)確率P1均為90%,雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆判別準(zhǔn)確率P2分別為96.43%、90%、84.38%,綜合判別率為90%。

采用逐步判別法進(jìn)行了變量逐步篩選,從51個性狀中篩選出10個變量對區(qū)分三種牙鲆有顯著貢獻(xiàn)。10個變量為尾柄長/體長、D1-4/體長、D3-2/體長、D7-6/體長、D5-8/體長、D6-10/體長、D13-14/體長、D10-14/體長、D9-14/體長、D12-13/體長。建立三種牙鲆的判別函數(shù),利用判別函數(shù)可以對未知種群的牙鲆魚進(jìn)行判定。判別函數(shù)如下:

3討論

傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)方法不能對種下的群體如不同地域內(nèi)種群、雜交種、人工選育家系等等進(jìn)行分類或鑒定,是由于HUBBS和 LAGLER[17]提出魚類傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分析的參數(shù)主要集中在魚體的橫軸方向、頭部及尾部的局限性。然而框架分析法可與形態(tài)學(xué)分析有效地結(jié)合用于魚類的形態(tài)分析、種質(zhì)鑒定及分類,如團(tuán)頭魴地理種群間[16]、尼羅羅非魚品系間[6]、“奧尼”魚同其親本(尼羅羅非魚[6,16],奧利亞羅非魚)間[16]、雜交種與親本間[11-12]的形態(tài)判別。本研究對三種牙鲆8個可量性狀和47個框架性狀對雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)特征差異進(jìn)行分析,研究表明,方差、聚類、主成分和判別分析等方法對三種牙鲆區(qū)分比較有效。主成分中,9個主成分對三種牙鲆間總變異的累積貢獻(xiàn)率為86.389%,第一主成分的變異貢獻(xiàn)率指標(biāo)為D3-7/體長、D5-2/體長、D5-4/體長、D5-6/體長、D5-8/體長、D5-14/體長、D6-10/體長、D7-14/體長等比例性狀指標(biāo),其主要反映的是牙鲆魚體縱向、橫向、頭部框架指標(biāo),可認(rèn)為雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)差異主要體現(xiàn)在牙鲆魚體縱向和頭部性狀指標(biāo)間。聚類分析的結(jié)果顯示,雌核發(fā)育牙鲆與野生牙鲆形態(tài)接近,這可能是由于雌核發(fā)育牙鲆主要是由母本遺傳而來,而本研究采集的雌核發(fā)育牙鲆基本上是以野生牙鲆為母本培育而成,這一結(jié)果充分說明了雌核發(fā)育母本遺傳的優(yōu)勢,其結(jié)果同羅非魚[16]報道一致。判別分析是多元分析中比較有效的方法,直觀地判斷出牙鲆個體屬于哪個品種,綜合判別率為90%。這樣對于未知種的牙鲆魚類可以用不同品種的判別函數(shù)去判斷其所屬種類。這與其他物種如紅鰭東方鲀[10]、羅非魚[6,11,16]等等的研究結(jié)果是一致的??傊?,多元分析方法可以有效鑒別牙鲆種類。

4結(jié)論

本研究采用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)和現(xiàn)代框架結(jié)構(gòu)測定相結(jié)合,利用多元分析法分析了雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆的形態(tài)特征差異。結(jié)果表明,雌核發(fā)育牙鲆、野生牙鲆、養(yǎng)殖牙鲆間38個指標(biāo)差異顯著(P<0.05),聚類分析和主成分分析顯示,雌核發(fā)育牙鲆先和野生牙鲆形態(tài)接近,與養(yǎng)殖牙鲆距離遠(yuǎn),其形態(tài)差異主要體現(xiàn)在牙鲆魚體縱向和頭部性狀指標(biāo)間。利用判別分析法進(jìn)行分析綜合判別率為90%。研究表明:方差、聚類、主成分和判別分析等多元分析方法對三種牙鲆形態(tài)比較有效,在牙鲆其他家系等的鑒定中值得推廣。

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