魏勝華 孟娜
摘要:由于大戟屬(Euphorbia Linn)植物葉片中含大量的多糖、酚類等次生代謝物質(zhì),嚴(yán)重影響總DNA的提取,因此,以大戟屬藥用植物葉片為材料,對(duì)常用的CTAB(Hexadecyltrimethy ammonium bromide)法進(jìn)行了改良,并通過瓊脂凝膠電泳法對(duì)所提DNA樣品進(jìn)行了檢測(cè)。結(jié)果表明,改良CTAB法提取的植物總DNA純度很高,較適合提取大戟屬植物的總DNA。
關(guān)鍵詞:大戟屬;藥用植物;CTAB法;總DNA提取
中圖分類號(hào):Q949.753.5;Q503文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):0439-8114(2011)16-3418-03
A Modified CTAB Method for Total DNA Extraction from the Medicinal Herb Leaves of Euphorbia Linn
WEI Sheng-hua,MENG Na
(College of Biology and Chemical Engineering, Anhui Polytechnic University,Wuhu 241000,Anhui, China)
Abstract: The cells in Euphorbia Linn leaves were rich in amylose and hydroxybenzene. These substances provided some seriously adverse effects on extraction of DNA from Euphorbia. Using the leaves of Euphorbia as material, the DNA were extracted by a modified CTAB(Hexadecyltrimethy ammonium bromide) method and detected by means of agarose gel electrophoresis. The results showed that the modified CTAB method was suitable for extraction of its DNA and it was a goodmethod for total DNA extraction from Euphorbia.
Key words: Euphorbia Linn; medicinal herb; hexadecyltrimethy ammonium bromide(CTAB) method; total DNA extraction
DNA的提取與純化是進(jìn)行分子標(biāo)記試驗(yàn)最關(guān)鍵的一步,獲得高質(zhì)量的DNA樣品是進(jìn)行PCR擴(kuò)增的首要步驟[1]。從植物材料中提取基因組DNA的質(zhì)量受到多種因素的影響,在不同植物或同種植物不同時(shí)期組織中存在著不同數(shù)量的多糖、色素以及種類繁多的次生物質(zhì),特別是多糖、酚類在提取過程中可與DNA產(chǎn)生沉淀,形成包裹DNA的黏稠膠狀物,其難以溶解或產(chǎn)生褐變,使得DNA提取質(zhì)量較低,獲得的DNA溶液常常黏度大乃至呈膠狀,這些物質(zhì)如果清除不凈則會(huì)影響后續(xù)的試驗(yàn)研究[2-4]。大戟屬(Euphorbia Linn)為大戟科(Euphorbiaceaec)植物中最大的一屬,全世界有2 000余種[5],其中不少種具有很高的藥用價(jià)值,李忠國(guó)[6]調(diào)查發(fā)現(xiàn),安徽省瑯琊山藥用植物資源中有22種大戟科藥用植物;李惠等[7]通過研究華東地區(qū)大戟屬藥用植物資源后,整理出了26種大戟屬藥用植物,并且藥用部位明確,療效確切,具有較高的藥用價(jià)值。大戟屬藥用植物的醫(yī)藥價(jià)值使得其研究開發(fā)成為了熱點(diǎn),尤其是對(duì)大戟屬藥用植物在分子水平上的探討方興未艾。目前在大戟屬藥用植物進(jìn)行分子標(biāo)記試驗(yàn)中,由于本屬植物具有白色或黃白色乳汁,含酚類、黃酮類等次生物質(zhì)較多,若提取方法不當(dāng),不僅提取出來的DNA容易降解,而且會(huì)影響PCR擴(kuò)增反應(yīng)的穩(wěn)定性和重復(fù)性。因此,如何高效簡(jiǎn)便地去除多糖、多酚等次生物質(zhì),對(duì)提取純化大戟屬植物DNA至關(guān)重要。目前,大戟屬藥用植物總DNA提取方法的研究在國(guó)內(nèi)外尚未見報(bào)道,所以在前期研究的基礎(chǔ)上[8,9],結(jié)合本屬植物特點(diǎn),以經(jīng)典提取植物DNA的CTAB(十六烷基三乙基溴化銨,Hexadecyltrimethy ammonium bromide)法為基礎(chǔ)[10],并加以改進(jìn),篩選出一種比較適合大戟屬植物DNA提取的方法,為大戟屬藥用植物進(jìn)一步開發(fā)利用提供技術(shù)支持。
1材料與方法
1.1材料
1.1.1供試材料試驗(yàn)所用植物材料為采自安徽省瑯琊山的大戟(E. pekinensis Rupr.)、月腺大戟
(E. ebracteolata Hayata);采自蕪湖市的乳漿大戟(E. esula L.)、斑地錦(E. supina Rafin)、地錦(E. humifusa Willd.)、一品紅(E. pulcherrima Willd. et Klotzsch.),原植物均經(jīng)安徽師范大學(xué)周守標(biāo)教授鑒定。用于提?。模危恋牟牧蠟楦鞴┰囍参锏男迈r葉片,采后迅速置于冰盒中,帶回實(shí)驗(yàn)室后,除去主葉脈,在電子天平上精確稱?。埃?g,于-20 ℃冰箱保存3 d。
1.1.2主要試劑①DNA抽提緩沖液,NaCl 500 mmol/L,Tris-HCl 100 mmol/L、pH值8.0和EDTA 20 mmol/L、pH值8.0。②DNA裂解緩沖液,NaCl 700 mmol/L, Tris-HCl 50 mmol/L、 pH值8.0和
EDTA 20 mmol/L、pH值8.0,CTAB 5%(m/V),β-巰基乙醇1%(用前加)[11]。③TE緩沖液,Tris-HCl 10 mmol/L、pH值8.0和EDTA 1 mmol/L、pH值8.0。④50×TAE緩沖液,Tris 242 g,冰乙酸57.1 mL,EDTA(0.5 mol/L、pH值8.0)100 mL。⑤氯仿-異戊醇混合液(體積比為24∶1,下同)。配制藥品用的水均為雙蒸餾水。將以上緩沖液分裝后,密封、滅菌,置于冰箱4℃保存。
1.1.3主要儀器試驗(yàn)中的主要儀器有凝膠成像儀、微波爐、離心機(jī)、超低溫冰箱、電泳槽、電泳儀、手掌型離心機(jī)、恒溫水浴鍋、電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱、超凈工作臺(tái)等。
1.2方法
1.2.1改良CTAB法提取植物總DNA①提取前將裂解緩沖液放至65 ℃水浴中。②稱?。埃?g植物材料,用液氮速凍后,迅速研磨成細(xì)粉,分裝于1.5 mL的Eppendorf管中。③在Eppendorf管中加入1 mL DNA提取緩沖液,用力搖動(dòng)使其充分混勻后,于15 ℃、8 000 g離心5 min。④靜止后棄上清,再加入1 mL DNA提取緩沖液,充分混勻,于15 ℃、
8 000 g離心5 min。⑤靜止后棄上清,加入1 mL 65 ℃預(yù)熱的DNA提取緩沖液,懸浮沉淀,充分混勻,放入65 ℃水?。常?min。⑥于15 ℃、12 000 g離心5 min,取上清,加入等體積的氯仿-異戊醇混合液,輕輕顛倒混勻,靜置10 min。⑦于15 ℃、12 000 g離心5 min,取上清,加入等體積的異丙醇,充分混勻,4 ℃靜置30 min 。⑧于15 ℃、12 000 g離心10 min,靜止后棄上清,加入75 %(V/V)乙醇洗數(shù)次。⑨于15 ℃、12 000 g離心3 min,靜止后棄上清,自然風(fēng)干直至無酒精味。⑩加入100 μL TE緩沖液,放入4 ℃環(huán)境待用,或-20 ℃儲(chǔ)存。
1.2.2電泳檢測(cè)對(duì)所提取的DNA取3~5 μL于0.8%的瓊脂糖凝膠上,以5 V/cm電泳1 h左右,EB染色20~25 min,在凝膠成像系統(tǒng)(AlphaImager)中觀察和拍照。
2結(jié)果與分析
2.1DNA電泳結(jié)果
將葉片各部位提取的DNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,檢測(cè)結(jié)果見圖1。DNA電泳結(jié)果顯示,改良CTAB法所提取的大戟屬植物葉片的DNA為一條清晰完整的條帶,DNA片段大小較一致,條帶后面沒有明顯的拖尾,證明所提葉片的總DNA含雜質(zhì)較少。
2.2總DNA純化
加入等體積的氯仿-異戊醇混合液,輕緩顛倒混勻,室溫靜置10~15 min;于12 000 g離心10 min;重復(fù)前面步驟。取上清液,加入終濃度0. 2~0. 4 mol/L的NaAc、12倍體積的無水乙醇,放置1 h。12 000 g離心10 min,棄上清液。用70 %乙醇洗滌沉淀2~3次,自然干燥后,溶于50~100 μL TE中,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
3討論
雖然植物DNA的提取是一項(xiàng)常規(guī)的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù),但由于大戟屬植物組織細(xì)胞中含有大量的酚類、多糖及其他次生代謝產(chǎn)物,使得用傳統(tǒng)的CTAB方法難以分離出高質(zhì)量的DNA,如果提取方法選擇不當(dāng),會(huì)干擾后續(xù)的操作。作者對(duì)大戟屬植物葉片總DNA的提取過程經(jīng)過反復(fù)的改進(jìn),最后提取出了質(zhì)量較高的總DNA,并在提取中總結(jié)出以下操作事項(xiàng),以期為大戟屬藥用植物的分子生物學(xué)研究提供技術(shù)支撐。
1)首先,用于DNA提取的植物材料是從遠(yuǎn)離實(shí)驗(yàn)室的野外采集獲得,新鮮材料在旅途中容易枯萎、腐爛,特別是一些離體材料極易受到DNA酶的作用,導(dǎo)致DNA的降解。因此采集后必須迅速置于冰盒中,帶回實(shí)驗(yàn)室。
2)植物材料在研磨時(shí),一定要使材料處于低溫狀態(tài),而且所用研缽應(yīng)該是預(yù)先在-20 ℃冰箱冷凍過夜、待其徹底冷卻后再放入植物材料。在研磨過程中,確保不要讓液氮揮發(fā)干凈,以防止植物材料回溫,否則會(huì)造成DNA的嚴(yán)重降解;研磨葉片時(shí),粉末研得越細(xì)越好,研磨好的材料非常容易變褐,宜迅速轉(zhuǎn)入Eppendorf管中,不要使之融化,以免造成DNA的降解。
3)在提?。模危恋倪^程中,所有的操作均需要?jiǎng)幼鬏p柔,避免劇烈振動(dòng),以免DNA斷裂降解。
4)在用氯仿-異戊醇混合液抽提時(shí),離心溫度應(yīng)保持不低于15 ℃;若溫度太低,可能導(dǎo)致CTAB沉淀,從而損失DNA;在離心前增加氯仿-異戊醇混合液和提取緩沖液的接觸時(shí)間,讓雜質(zhì)更好地被分離,減少用氯仿-異戊醇混合液的抽提次數(shù),避免操作過程中DNA的污染。
5)CTAB是一種陽離子去污劑,既能有效裂解植物的細(xì)胞壁,又能去除多糖類物質(zhì),還可以溶解細(xì)胞膜,較好去除多糖的干擾。在加入CTAB緩沖液進(jìn)行溫浴時(shí),將時(shí)間延長(zhǎng)至2 h能更好地處理多糖、酚類及其他雜質(zhì),所獲得的DNA質(zhì)量也將較高。
6)在提取過程中,采用常規(guī)CTAB法常出現(xiàn)多酚類物質(zhì)的褐化現(xiàn)象,使DNA溶液顏色產(chǎn)生渾濁。β-巰基乙醇具有抗氧化作用,在改良CTAB法中,提取液中加入1% β-巰基乙醇可以有效地去除植物組織內(nèi)的多糖物質(zhì)和多酚類物質(zhì),防止酚類物質(zhì)造成褐化現(xiàn)象。
7)PCR技術(shù)對(duì)DNA樣品量和純度的要求均不高,但因PCR具有很高的靈敏度,為防止試劑交叉污染,應(yīng)盡量減少提取步驟;采用改良的CTAB法提取大戟屬植物DNA,能夠獲得高質(zhì)量的DNA樣品。
8)在DNA提取過程中,用異丙醇沉淀時(shí),若異丙醇未揮發(fā)盡,會(huì)直接影響Taq DNA聚合酶的活性,試驗(yàn)中應(yīng)該讓異丙醇沉淀離心后充分揮發(fā)。
9)在DNA提取過程中,氯仿是蛋白的有效沉淀劑,對(duì)Taq DNA聚合酶有變性作用。
10)DNA沉淀出現(xiàn)后,絮狀沉淀不一定全是DNA沉淀,判斷絮狀沉淀的標(biāo)準(zhǔn)是看其是否易溶于TE,若易溶則說明其雜質(zhì)含量較少,若難溶則說明其雜質(zhì)含量較高,純度較差。而TE溶解是一個(gè)比較緩慢的過程,為了充分溶解,通常在4℃條件下溶解1 d。
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