從長期來看，基金的統(tǒng)籌層次越高，各地區(qū)在制度層面的差異、在利益方面的博弈就會相對減弱。與此同時，在保證醫(yī)?；鸬某惺芰统掷m(xù)力的前提下，政府應(yīng)不斷推進(jìn)不同類型的保險制度合并，逐步建立城鄉(xiāng)一體化的全民醫(yī)保制度。

從短期來看，為解決眼前的矛盾，政府可以考慮在制度上進(jìn)行一些細(xì)節(jié)性的調(diào)整。比如，在轉(zhuǎn)移資金的實施細(xì)則中，對個人賬戶的提取、使用和攜帶方式加以細(xì)化。又如，根據(jù)農(nóng)民工的年齡、教育程度、工作性質(zhì)、收入水平等，確定其城市化（市民化）傾向，分類分層設(shè)計醫(yī)保轉(zhuǎn)接方案。再如，從轉(zhuǎn)出地和轉(zhuǎn)入地的角度對農(nóng)民工做出區(qū)分：一類是由城市到城市的轉(zhuǎn)移，即“城城轉(zhuǎn)移”；還有一類是從農(nóng)村到城市的轉(zhuǎn)移，即“城鄉(xiāng)轉(zhuǎn)移”。根據(jù)不同轉(zhuǎn)移方式確定銜接方案和融資模式。