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EML4-ALK融合基因與非小細(xì)胞肺癌

2010-08-14 05:17:18陳佳艷綜述樊旼審校
中國癌癥雜志 2010年6期
關(guān)鍵詞:外顯子腺癌靶點(diǎn)

陳佳艷 綜述 樊旼 審校

復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院放射治療科,復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)系,上海 200032

肺癌是世界范圍內(nèi)最常見的惡性腫瘤,其中80%~85%的病例為非小細(xì)胞肺癌(nonsmall cell lung cancer,NSCLC)。據(jù)統(tǒng)計(jì),在歐洲,每年肺癌新發(fā)病例超過20萬,因其死亡的人數(shù)占所有癌癥相關(guān)死亡的20%。在美國,每年約有15萬患者死于肺癌[1-3]。在中國大陸,肺癌的發(fā)病率和病死率均呈顯著升高的趨勢。據(jù)2008年我國衛(wèi)生部的統(tǒng)計(jì),肺癌相關(guān)死亡率居惡性腫瘤總死亡率的首位,為30.83/10萬。在男女惡性腫瘤相關(guān)死亡中,肺癌均為最主要原因[4]。

手術(shù)、放療和化療一直都是NSCLC的主要治療方法。隨著對腫瘤發(fā)病機(jī)制及其生物學(xué)行為研究的不斷深入,人們越來越多的把焦點(diǎn)聚向了以特異性高、不良反應(yīng)輕為特點(diǎn)的分子靶向治療。近幾年來,在肺癌的分子靶向治療領(lǐng)域,研究熱點(diǎn)一直集中在EGFR、K-ras和VEGF等靶點(diǎn)上,涌現(xiàn)出許多針對這些靶點(diǎn)的分子靶向藥物。臨床實(shí)踐證明并非所有患者都能從中獲益,NSCLC各組織類型間存在分子靶向藥物療效上的差異。例如多項(xiàng)臨床試驗(yàn)結(jié)果均證實(shí)腺癌為EGFR-TKI的優(yōu)勢人群。然而即便同樣身為腺癌患者,使用EGFR-TKI后有些可以獲得疾病的長期緩解,有些會(huì)在TKI初始有效后出現(xiàn)獲得性耐藥,還有一些患者則原發(fā)性耐藥。目前,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)在原有突變基礎(chǔ)上,EGFR 20號外顯子上C-T堿基置換后導(dǎo)致的T790M的錯(cuò)義突變,MET癌基因的擴(kuò)增與EGFR-TKI獲得性耐藥有關(guān)[5],K-ras基因突變則是產(chǎn)生原發(fā)耐藥的相關(guān)機(jī)制之一[6]。近期發(fā)現(xiàn)的EML4-ALK融合基因,其與EGFR突變,K-ras突變的不共存現(xiàn)象以及含有該基因患者的鮮明臨床特征,提示該靶點(diǎn)是肺腺癌特異性較高的分子標(biāo)記物,并且很有可能是繼T790M、K-ras之后EGFR-TKI耐藥的又一重要機(jī)制,因此備受關(guān)注。

1 EML4-ALK基因的發(fā)現(xiàn)

2007年Soda等[7]在1例62歲的吸煙肺腺癌患者手術(shù)切除的標(biāo)本中,擴(kuò)增出一個(gè)由3 926 bp組成的DNA片段,可以編碼一個(gè)由1 059個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì),該蛋白的氨基端(殘基1-496)是人類EML4編碼蛋白(基因庫編號NM-019063)的一部分,而羧基端(殘基497-1059)則由人類ALK(基因庫編號 AB209477)編碼蛋白的一部分構(gòu)成,研究人員從中得到啟發(fā),編碼這一蛋白的基因很有可能是EML4和ALK融合基因。

EML4屬于棘皮動(dòng)物微管相關(guān)蛋白樣蛋白家族,由N末端堿基區(qū),疏水的棘皮動(dòng)物微管相關(guān)蛋白區(qū)(hydrophobic echinoderm microtubule-associated protein-like protein,HELP)以及WD重復(fù)區(qū)3部分構(gòu)成。在EML4-ALK融合基因中,與ALK的胞內(nèi)近胞膜部分發(fā)生融合的是EML4的部分N末端堿基、HELP和部分WD重復(fù)區(qū)[8-10]。

ALK于1994年首先發(fā)現(xiàn)于間變性大細(xì)胞淋巴瘤AMS3細(xì)胞株中[11],是由1 620個(gè)氨基酸組成的跨膜蛋白,屬于胰島素受體家族[12]。該蛋白由膜外部分、跨膜區(qū)域以及膜內(nèi)催化區(qū)域組成,下游信號通路為Ras-ERK,JAK3-STAT3,以及PI3-K/Akt等,這些通路與細(xì)胞增殖、存活、遷移密切相關(guān)[13-14]。

2 EML4-ALK基因的體外轉(zhuǎn)化致瘤活性

EML4-ALK融合基因的重排發(fā)生在2號染色體短臂上的2區(qū)1帶和2區(qū)3帶。Soda等[7]通過測序得出,EML4的13號外顯子上斷裂產(chǎn)生的3.6 kb大小的片段插入并連接上ALK的20號外顯子的一個(gè)297 bp大小的片段,共同構(gòu)成了融合基因(1型)。在這一研究的基礎(chǔ)上,2008年研究人員把轉(zhuǎn)染了融合基因的小鼠3T3成纖維細(xì)胞接種在裸鼠身上,建立了表達(dá)EML4-ALK融合基因的肺癌的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物模型(小鼠),發(fā)現(xiàn)在小鼠肺部腫瘤發(fā)生的全過程中,EML4-ALK基因均發(fā)揮著重要作用,進(jìn)一步在體外證實(shí)了該融合基因的轉(zhuǎn)化致瘤活性。同時(shí),他們發(fā)現(xiàn)EML4 N末端的堿基區(qū)域?qū)τ谄渲铝龌钚宰顬殛P(guān)鍵,可能與其在EML4-ALK基因聚合過程中發(fā)揮重要作用有關(guān)[15]。

3 EML4-ALK基因與NSCLC

Soda等[7]在隨后的研究中,應(yīng)用RT-PCR的方法對于75例NSCLC患者的組織標(biāo)本進(jìn)行了EML4-ALK融合基因、EGFR18、19、20號外顯子突變,以及K-ras突變的檢測,發(fā)現(xiàn)5例患者存在EML4-ALK 1型融合基因(3例腺癌,2例鱗癌),同時(shí)發(fā)現(xiàn)該基因陽性的患者與EGFR以及K-ras突變陽性的患者沒有重疊。并且,在繼續(xù)檢測了261例包括非霍奇金淋巴瘤、結(jié)直腸癌、胃腸道腫瘤在內(nèi)的其他惡性腫瘤的EML4-ALK融合基因后,均未發(fā)現(xiàn)含有該基因。此外,研究中還發(fā)現(xiàn)了EML4在20號外顯子附近斷裂后與ALK進(jìn)行融合的第2種亞型(2型)。最終,研究者得出結(jié)論,該融合基因很有可能是NSCLC特有的一個(gè)新型基因靶點(diǎn)。在檢測方法上,RT-PCR是一種較為敏感的方法,可以在很少DNA拷貝數(shù)的情況下,甚至是在只有極少數(shù)EML4-ALK陽性細(xì)胞的痰液中,檢測出融合基因的存在。

同年,Inamura等[16]使用RT-PCR的方法檢測221例包含了腺癌、鱗癌、大細(xì)胞癌以及小細(xì)胞癌在內(nèi)的肺癌患者EML4-ALK融合基因的mRNA情況,對于檢測陽性的患者,進(jìn)一步使用免疫組化的方法觀察融合基因的表達(dá)。結(jié)果只在腺癌這一組織類型中檢測到5例患者(3.4%)有融合基因的mRNA并均在細(xì)胞質(zhì)中用免疫組化檢測到ALK融合蛋白。

上述2項(xiàng)研究均來自日本,隨后在1項(xiàng)來自歐美的多中心參與的研究中,Perner等[17]使用FISH方法檢測600例NSCLC患者EML4-ALK基因情況,發(fā)現(xiàn)融合基因的發(fā)生率小于Soda報(bào)道的6.7%以及Kentaro 報(bào)道的3.4%,只有2.7%。并且在檢測出融合基因的腫瘤中,并不是所有的腫瘤細(xì)胞均含有該融合基因。發(fā)生率的差異,可能與人種不同有關(guān)。研究人員因?yàn)閮H僅在1例患者中證實(shí)融合基因?yàn)榛蛑嘏艑?dǎo)致,由此認(rèn)為就其機(jī)制而言,存在著比Soda等報(bào)道的簡單插入更為復(fù)雜的,導(dǎo)致EML4-ALK融合基因產(chǎn)生的基因水平的改變。

由于早先研究淋巴瘤ALK融合基因類型的過程中,發(fā)現(xiàn)除了人們熟知的NPM-ALK之外還有10多種其他的融合方式,與淋巴瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。那么在NSCLC中,是否也存在除了EML4-ALK融合基因以外的其他類型的ALK融合基因,也有學(xué)者就此展開研究。Rikova等[18]的實(shí)驗(yàn)中,研究了41種NSCLC細(xì)胞株以及150例NSCLC腫瘤標(biāo)本中磷酸化的酪氨酸相關(guān)的多個(gè)靶點(diǎn),ALK相關(guān)融合基因除了3例為EML4-ALK外,還有1例為TFG-ALK融合基因。但在2008年Shinmura等[19]的研究中,使用RT-PCR以及測序檢測的77例NSCLC患者,除了2例腺癌患者檢測到EML4-ALK(2.6%,1型融合體和2型融合體各1例)外,并沒有發(fā)現(xiàn)含有NPM、TPM3、CLTC、ATIC和TFG-ALK的其他ALK相關(guān)的融合基因。

隨著研究的深入,研究人員還發(fā)現(xiàn)了EML4-ALK融合基因的其他亞型,區(qū)別主要在于EML4發(fā)生截?cái)嗟奈稽c(diǎn)不同。Choi等[20]報(bào)道了EML4的6號外顯子附近與ALK 20號外顯子銜接的亞型3。Takeuchi等[21]發(fā)現(xiàn)的EML4的14號外顯子和2號外顯子與ALK 20號外顯子結(jié)合的亞型4和亞型5以及后來發(fā)現(xiàn)的亞型6和亞型7[22]。

就EML4-ALK是否為NSCLC唯一特有的靶點(diǎn)這一問題,F(xiàn)ukuyoshi等[23]分別檢測了104例肺癌、555例胃腸道腫瘤、90例乳腺癌標(biāo)本,僅1例肺癌標(biāo)本中發(fā)現(xiàn)了EML4-ALK的轉(zhuǎn)錄,在其余的腫瘤中均未發(fā)現(xiàn)該融合基因,研究者認(rèn)為這樣的實(shí)驗(yàn)結(jié)果強(qiáng)烈提示這一靶點(diǎn)很有可能為NSCLC所特有。但是緊接著2009年Lin等[24]發(fā)表在 Mol Cancer Res上的研究中,209例乳癌患者5例檢出該融合基因,83例結(jié)直腸癌患者2例檢出,106例NSCLC中有12例檢出,提示該融合基因也可能與包括肺癌在內(nèi)的多種實(shí)體腫瘤相關(guān),但仍以NSCLC中檢出率最高。

4 EML4-ALK陽性患者的臨床特征

有趣的是,隨著實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的不斷積累,和最初Soda等[7]得出的結(jié)果相一致,EML4-ALK融合基因確實(shí)極少與常見于NSCLC的EGFR突變以及K-ras突變并存于同一組織標(biāo)本。一組來自日本的數(shù)據(jù)中,Inamura等[25]檢測了363例肺癌組織樣本,11例腺癌中檢出融合基因,對于這11例標(biāo)本,進(jìn)一步研究其與EGFR、K-ras、TP53突變以及TTF-1的關(guān)系,他們發(fā)現(xiàn)EML4-ALK陽性的腫瘤具有下列特征:腺泡來源,分化更差,極少伴有EGFR以及K-ras的突變,偶爾伴有TP53突變,多發(fā)生于不吸煙或輕度吸煙患者,經(jīng)常伴有TTF-1表達(dá)。香港大學(xué)的Wong等[26]對266例手術(shù)切除的原發(fā)性肺癌患者的標(biāo)本進(jìn)行了檢測,13例患者(4.9%)標(biāo)本中檢出了融合基因,腺癌11例,腺鱗癌2例;同樣地,他們發(fā)現(xiàn)融合基因更易發(fā)生于不吸煙、年輕以及EGFR,K-ras野生型的肺癌患者,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)合以上數(shù)據(jù),2009年Shaw等[27]進(jìn)行了更為細(xì)致的研究,他們以女性、亞裔、輕度或者不吸煙的腺癌中至少符合2項(xiàng)為標(biāo)準(zhǔn),有選擇性地挑選了141例NSCLC,檢測了標(biāo)本中的EML4-ALK、EGFR以及K-ras突變情況,共檢出了19例(13%)EML4-ALK,其中18例為腺癌,1例為腺鱗癌。發(fā)生上述3種突變的患者沒有重疊。與EGFR突變組以及EGFR、ALK突變均陰性的野生組相比,EML4-ALK陽性的患者更年輕,多為男性,輕度或者不吸煙。在有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的患者中,該融合基因與EGFR TKI的抗拒性有關(guān)。

那么中國人群NSCLC患者中該融合基因的情況究竟如何。2009年Zhang等[28]使用RACEPCR為基礎(chǔ)的測序法共檢測了109例NSCLC標(biāo)本,檢出12例陽性(11.01%),除外1、2、3、5亞型外,在3例腺癌患者中檢出了EML4 18號外顯子的亞型。所有EML4-ALK陽性患者均無K-ras突變,但是與以往研究不同的是,在1例女性腺癌中出現(xiàn)EML4-ALK與EGFR19號外顯子突變的并存。是否在中國NSCLC患者中有不一樣的情況,還需要進(jìn)一步研究。關(guān)于EML4-ALK基因在NSCLC中檢出情況見表1。

表1 EML4-ALK在NSCLC中檢出情況Tab.1 Studies evaluating EML4-ALK positivity in NSCLC

5 針對EML4/ALK基因的抑制劑

任何一個(gè)腫瘤新靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn),最后都著眼于設(shè)計(jì)出安全有效的藥物,在分子水平治療上腫瘤。1項(xiàng)歐美與韓國共同參與的多中心研究初步評價(jià)了針對EML4-ALK這一新型靶點(diǎn)的抑制劑。Koivunen等[29]使用RT-PCR以及外顯子序列分析的方法分析了305例NSCLC患者(美國138例,韓國167例)組織以及83個(gè)NSCLC細(xì)胞株,8例(3%)患者腫瘤中以及3個(gè)細(xì)胞株中(3.6%)檢出融合基因。在1例NSCLC細(xì)胞株體外、體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中,針對ALK的抑制劑TAE684體現(xiàn)了抑制ALK激酶活性、增加腫瘤細(xì)胞凋亡的作用。另外一種口服的AKT抑制劑(PF02341066)目前正在Ⅰ期臨床試驗(yàn)中接受安全性和有效性的評估[30]。

綜上所述,EML4-ALK是NSCLC發(fā)生發(fā)展中獨(dú)立而又關(guān)鍵的分子靶點(diǎn),主要發(fā)生于腺癌,EGFR、K-ras野生型,輕度吸煙/不吸煙,年輕男性患者??赡苁荰790M、K-ras和MET之外另一潛在的EGFR-TKI耐藥機(jī)制之一。針對這一靶點(diǎn)的深入研究,將有助于篩選EGFRTKI合適的治療人群并開創(chuàng)EGFR-TKI耐藥的NSCLC靶向治療新領(lǐng)域。

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