由香港中文大學(xué)、華大基因研究院、農(nóng)業(yè)部、中國科學(xué)院等單位合作的“大豆回家”項(xiàng)目研究成果，“31個大豆基因組重測序揭示遺傳多樣性和進(jìn)化選擇模式”11月14日在國際著名雜志《自然-遺傳學(xué)》上在線發(fā)表。

該研究首次對野生大豆和栽培大豆全基因組進(jìn)行了大規(guī)模遺傳多態(tài)性分析，為全球大豆的遺傳學(xué)研究、大豆種質(zhì)資源保護(hù)和分子育種提供了非常有價值的資源，有助農(nóng)業(yè)發(fā)展。

據(jù)悉，這是首次全由中國科學(xué)家在大豆的故鄉(xiāng)-中國完成的一項(xiàng)大型大豆基因組課題，突破了先進(jìn)國家在大豆高端研究的壟斷，亦是內(nèi)地和香港之間的緊密合作獲得顯著科研突破的典范。

據(jù)介紹，研究人員運(yùn)用新一代測序技術(shù)對17株野生大豆和14株栽培大豆進(jìn)行了全基因組重測序，利用SOAP軟件v2.18比對到大豆的參考基因組上，總共發(fā)現(xiàn)了630多萬個單核甘酸多態(tài)性位點(diǎn)（SNPs），建立了高密度的分子標(biāo)記圖譜。同時通過SOAPdenovo軟件分別對野生大豆和栽培大豆進(jìn)行組裝，從而鑒定出了18萬多個兩種大豆中獲得和缺失變異（PAVs），得到了在栽培大豆中獲得及丟失的基因。

華大基因研究人員表示，大豆基因組不同于其它農(nóng)作物植物的特點(diǎn)在于，大豆存在較高程度的基因連鎖不平衡和較高比例的單核甘酸非同義替換/同義替換比例。該項(xiàng)發(fā)現(xiàn)表明，在大豆育種方面，分子標(biāo)記育種比基因圖位克隆可能會擁有更多的優(yōu)勢。

香港中文大學(xué)的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人林漢明說，作為內(nèi)地與香港科研合作史上極具里程碑意義的科學(xué)研究，該項(xiàng)研究所產(chǎn)生的大量基因組數(shù)據(jù)可以促進(jìn)日后的大豆研究，同時亦為大豆育種提供重要信息。香港中文大學(xué)與華大基因研究院的科研工作者將作物科學(xué)、分子生物學(xué)與新一代測序技術(shù)相結(jié)合，研究成果將會進(jìn)一步深化大豆的科學(xué)研究與應(yīng)有開發(fā)，為農(nóng)業(yè)做出貢獻(xiàn)。