基金項目 湖北省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項目[(2023)-2]。
作者簡介 安相茹(1998—),女,河南洛陽人,碩士研究生,從事漁業(yè)發(fā)展研究。
通信作者 蘇應(yīng)兵(1978—),男,湖北荊州人,碩士,副教授,從事水產(chǎn)動物病害防治研究。
收稿日期 2024-03-13
摘要 為篩選出對維氏氣單胞菌(Aeromonas Veronii)有拮抗效果的最優(yōu)菌株,本試驗從湖北荊州太湖加州鱸池塘底泥中分離獲得一株細(xì)菌C2-1,對其進行全基因組測序,并研究其生防作用機制。結(jié)果表明,細(xì)菌C2-1為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis),具有廣譜抑菌性,對希瓦氏菌(Shiva's bacteria)、溶血鏈球菌(Streptococcus hemolysis)等多種水產(chǎn)病原菌的抑菌直徑達18.57~25.28 mm。菌株C2-1具有較高的酸堿穩(wěn)定性且對溫度適應(yīng)范圍較為廣泛。掃描電子顯微鏡鏡觀察發(fā)現(xiàn)細(xì)菌C2-1的發(fā)酵產(chǎn)物對維氏氣單胞菌具有破壞效果。液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)分析該細(xì)菌包含多種不同的脂肽類活性物質(zhì),如伊枯草菌素等。研究發(fā)現(xiàn),貝萊斯芽孢桿菌C2-1是防治維氏氣單胞菌的潛力菌株,對維氏氣單胞菌具有較好的抑制作用,且應(yīng)用前景良好。
關(guān)鍵詞 維氏氣單胞菌;貝萊斯芽孢桿菌;加州鱸;生物防治
中圖分類號 S947.9"" 文獻標(biāo)識碼 A
文章編號 1007-7731(2024)13-0042-07
Screening of antagonistic bacteria against Aeromonas veronii in Micropterus salmoides
AN Xiangru1""" SU Yingbing1""" ZHOU Yi2
(1College of Animal Science, Yangtze University, Jingzhou 434000, China;
2College of Agriculture, Yangtze University, Jingzhou 434000, China)
Abstract In order to select the best antagonistic strain against Aeromonas Veronii, a strain of bacteria C2-1 was isolated from the bottom mud of perch ponds in Tai Lake, Jingzhou, and whole genome sequencing, the biological control mechanism was studied. The results showed that the bacterial C2-1 was found to be Bacillus velezensis, with broad-spectrum antibacterial activity. Its antibacterial diameter against various aquatic pathogens such as Shiva's bacteria and Streptococcus hemolysis ranged from 18.57 to 25.28 mm. The antibacterial substances of strain C2-1 had high acid-base stability and a wide range of temperature adaptation. Electron microscopy revealed that the fermentation products of bacterial C2-1 had a destructive effect on Aeromonas veronii. LC-MS analysis showed that the bacterium contains various lipopeptide active substances, such as imidacloprid. It was found that Bacillus velezensis C2-1 was a potential strain for the control of Aeromonas veronii and had good inhibition effect on Aeromonas veronii.
Keywords Aeromonas veronii; Bacillus velezensis; Micropterus salmoides; biological control
水產(chǎn)養(yǎng)殖產(chǎn)量每年穩(wěn)步增長,捕撈生產(chǎn)量保持相對穩(wěn)定[1],并能在有限的空間內(nèi)生產(chǎn)大量產(chǎn)品,克服了捕獲野生物種的相關(guān)限制[2]。水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)作為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的重要組成部分[3-4],在一定程度上滿足了人們對海產(chǎn)品可食用蛋白質(zhì)和營養(yǎng)素日益增長的需求。海洋水產(chǎn)養(yǎng)殖在經(jīng)濟發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用[5]。水產(chǎn)養(yǎng)殖是較大的動物生產(chǎn)部門之一,消費魚類中超過50%的魚來自水產(chǎn)養(yǎng)殖[6]。為了滿足日益增長的消費需求,水產(chǎn)養(yǎng)殖逐漸向集約化養(yǎng)殖轉(zhuǎn)變,這在一定程度上可能增加漁業(yè)傳染病傳播風(fēng)險[7]。部分水產(chǎn)養(yǎng)殖中可能存在過量使用抗生素防治水產(chǎn)疾病的現(xiàn)象,如在水產(chǎn)養(yǎng)殖環(huán)境和產(chǎn)品中能檢測到部分抗藥性基因(ARGs)和抗藥性細(xì)菌[8-9],抗生素的使用對水生微生物種群產(chǎn)生較大選擇壓力[10],可能對動物和人類健康以及生態(tài)安全造成風(fēng)險[11]。
加州鱸(Micropterus salmoides)是重要的食用魚類之一,其肉味鮮美,肉質(zhì)細(xì)嫩,營養(yǎng)價值高。為滿足市場需求,加州鱸的人工養(yǎng)殖規(guī)模不斷擴大,規(guī)?;B(yǎng)殖在一定程度上增加了加州鱸細(xì)菌性疾病的發(fā)生概率。常見病原體有維氏氣單胞菌(Aeromonas veronii)、嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophial)和溫和氣單胞菌(Aeromonas sobria)等。為了控制水產(chǎn)養(yǎng)殖生產(chǎn)所面臨的疾病,采取了各種措施。其中,芽孢桿菌是應(yīng)用較廣泛的益生菌之一,被認(rèn)為是部分魚類腸道微生物區(qū)系中的天然成員。芽孢桿菌廣泛存在于陸地環(huán)境、水生環(huán)境和大氣環(huán)境中。貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)是革蘭氏陽性好氧菌,菌體呈桿狀,能形成芽孢,廣泛分布于自然界的水體、泥土和動物腸道[12];與普通生防芽孢桿菌相似,貝萊斯芽孢桿菌具有溶菌、拮抗和誘導(dǎo)植物系統(tǒng)抗性等作用[13]。張德鋒等[12]、Zhang等[14]認(rèn)為,通過拮抗、競爭作用和誘導(dǎo)系統(tǒng)耐藥來抑制病原菌,其中拮抗活性主要依賴于其產(chǎn)生的各種次生代謝物[15],包括脂肽、聚酮和細(xì)菌素等,對水生動物疾病表現(xiàn)出良好的生物防治效果。貝萊斯芽孢桿菌表現(xiàn)出廣譜抗菌活性,是各種動植物疾病的重要生防劑[16]。例如,貝萊斯芽孢桿菌對馬鈴薯赤霉病[17]、蓮根腐病[18]和小麥赤霉病[19]等植物病害,以及對嗜水氣單胞菌引起的鯽魚[20]、無乳鏈球菌(Streptococcus agalactiae)引起的尼羅羅非魚[21]、哈維弧菌(Vibrio harveyi)引起的雜交石斑魚[22]和嗜水氣單胞菌引起的草魚[23]等感染,均有明顯生防效果。其中,貝萊斯芽孢桿菌FZB42菌株主要用于防治根際細(xì)菌和促進植物生長[16]。
本試驗從太湖鱸養(yǎng)殖池塘底泥中共分離出8株生防菌分離物,篩選出對維氏氣單胞菌表現(xiàn)抑菌活性的菌株C2-1,對其進行全基因組測序,并研究其生防作用機制,為防治水生動物疾病提供參考。
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.1.1 供試菌株" 病原菌來自長江大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院已分離鑒定的維氏氣單胞菌(登錄號QQ781151),拮抗菌從湖北荊州太湖加州鱸養(yǎng)殖池塘底泥中分離。
1.1.2 培養(yǎng)基" 采用LB液體培養(yǎng)基和LB固體培養(yǎng)基。
1.1.3 主要試劑及儀器" PCR產(chǎn)物純化試劑盒、細(xì)菌基因組提取試劑盒購自深圳華大基因股份有限公司;掃描電子顯微鏡(VEGA3 SBU),超高效液相色譜儀購自Eppendorf AG;電泳儀購自北京市六一儀器廠生物科技有限公司。
1.2 試驗方法
1.2.1 拮抗菌的初篩和復(fù)篩" 采用打孔法進行初篩,將生長至對數(shù)期的維氏氣單胞菌無菌濾液80 μL涂于LB固體培養(yǎng)基上,干燥后用打孔器在同一平皿上等距離打4個孔,吸取從底泥中分離的菌株菌液50 μL加入孔中,28 ℃恒溫培養(yǎng)24 h,記錄抑菌直徑,同時對有抑菌圈的分離菌株采用初篩的方法進行復(fù)篩;拮抗菌的抑菌譜,同樣以初篩的方法處理所有的病原菌。
1.2.2 拮抗菌株的形態(tài)觀察和分子鑒定" (1)形態(tài)觀察。將菌株C2-1劃線于LB瓊脂平板,28 ℃恒溫培養(yǎng)48 h,觀察其形態(tài)、濕潤度等,并挑取單菌落,經(jīng)革蘭氏染色后使用顯微鏡觀察菌體。(2)分子鑒定。按照Omega細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒的步驟操作。將獲得的拮抗菌DNA作為模板,采用27F和1492R引物進行擴增,擴增后的PCR產(chǎn)物測序后使用BLAST進行比對分析,利用MEGAX構(gòu)建發(fā)育樹。
1.2.3 拮抗菌株對病原菌菌絲生長的抑制作用觀察" 通過掃描電子顯微鏡觀察細(xì)菌的形態(tài)。樣品制備方法參考李川北等[24]的方法。
1.2.4 拮抗菌發(fā)酵液耐酸堿性及最適溫度測定" (1)菌株C2-1耐酸堿性測定。將拮抗菌在28 °C、130 r/min下培養(yǎng)2 d,收集上清液并于4 °C、10 000 r/min下離心20 min。離心后取上清液,經(jīng)微孔過濾器(0.22 μm孔徑)過濾獲得C2-1無菌濾液,取無菌濾液按不同pH梯度處理1 h后,調(diào)整pH值為7.0,測定發(fā)酵上清液的拮抗活性。
(2)菌株C2-1最適溫度測定。將拮抗菌按(1)中方法處理后,取無菌濾液分別于30、40、60、80、90和100 ℃恒溫水浴1 h后,測定無菌濾液的拮抗活性。
1.2.5 菌株C2-1抑菌物質(zhì)提取及抑菌活性測定" 抑菌物質(zhì)提取和色譜分析參考鄭通文[15]的方法。
1.2.6 拮抗菌株對加州鱸的保護性評價" 拮抗菌株C2-1和病原菌維氏氣單胞菌分別設(shè)置106、107和108 CFU/mL濃度梯度。分為3個處理組,1個空白對照組。第一組腹腔注射100 μL(106、107和108 CFU/mL拮抗菌菌液)+100 μL(106、107和108 CFU/mL病原菌菌液)的混合液;第二組注射100 μL(106、107和108 CFU/mL 拮抗菌菌液)+100 μL(LB);第三組注射100 μL(106、107和108 CFU/mL病原菌菌液)+100 μL(LB),連續(xù)7 d觀察并記錄加州鱸的狀態(tài)。
2 結(jié)果與分析
2.1 拮抗菌株的分離和篩選
通過對池塘底泥中的多株細(xì)菌進行初次篩選和再次篩選,發(fā)現(xiàn)一株對維氏氣單胞菌具有明顯抑菌效果的菌株,命名為C2-1。圖1為C2-1株菌的初篩和復(fù)篩結(jié)果,其抑菌直徑分別為(24.32±0.40) mm和(25.28±0.56) mm。
2.2 菌株C2-1的抑菌譜
菌株C2-1對多種病原菌均有拮抗效果,C2-1對維氏氣單胞菌抑菌圈直徑達(25.28±0.56)mm,對愛德華氏菌(Edwardsiella)抑菌圈直徑達(20.11±0.17)mm,對希瓦氏菌(Shiva's bacteria)抑菌圈直徑達(21.53±0.21)mm,對溶血鏈球菌(Streptococcus hemolysis)抑菌圈直徑達(23.74±0.26)mm,對嗜水氣單胞菌抑菌圈直徑達(16.02±0.12)mm,對金葡萄球菌(Staphylococcus aureus)抑菌圈直徑達(18.57±0.15)mm。抑菌效果如表1所示。
2.3 菌株C2-1的形態(tài)觀察和分子鑒定
2.3.1 形態(tài)鑒定" C2-1菌株在LB培養(yǎng)基上的菌落較濕潤,呈不透明且具有黏性(圖2A),其形狀接近圓形,表面粗糙并帶有凸起。顯微鏡下觀察菌株呈短桿狀(圖2B)。通過革蘭氏染色觀察,確認(rèn)該菌株為革蘭氏陽性菌。
2.3.2 分子鑒定" 將菌株C2-1測序序列提交至NCBI數(shù)據(jù)庫進行比對,發(fā)現(xiàn)菌株C2-1與貝萊斯芽孢桿菌相似性達到98.88%。通過構(gòu)建發(fā)育樹,發(fā)現(xiàn)C2-1與貝萊斯芽孢桿菌歸為一支(圖3),故將C2-1鑒定為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis),登錄號為OR574410。
2.4 菌株C2-1對維氏氣單胞菌絲生長抑制作用
通過掃描電鏡觀察菌絲特征(圖4)發(fā)現(xiàn),對照組菌絲體飽滿,而菌株C2-1處理組菌絲體側(cè)端呈現(xiàn)球狀褶皺,處理后菌絲扭曲且凹陷。
2.5 菌株C2-1耐酸堿性和最適溫度測定
溫度升高時,菌株C2-1發(fā)酵上清液的抑菌活性出現(xiàn)明顯變化。在60 ℃以下,抑菌活性保持較高水平,高于60 ℃時,抑菌活性有所下降。C2-1在pH中性情況下抑菌效果最佳,隨pH值的升高或降低其抑菌活性均下降。測定結(jié)果如表2所示。
2.6 菌株C2-1抑菌物質(zhì)的提取
液相色譜-質(zhì)譜(LC-MS)分析結(jié)果顯示,C2-1的抑菌物質(zhì)中包含多種有機化合物。匹配度高的有表面活性素、伊枯草菌素、草菌素、桿菌霉素、多黏菌素B1和多黏菌素B2等。由表3可知,表面活性素的質(zhì)荷比為1"036.674"3,其出峰時間位于26.93~26.95"min。伊枯草菌素的分子質(zhì)量的質(zhì)荷比為1"044.536"0,出峰時間位于21.80~21.81"min。草菌素的出峰時間在21.82~21.83"min,分子質(zhì)荷比為1"199.641"9;桿菌霉素的出峰時間在30.33~30.34"min,分子質(zhì)荷比為1"032.524"8;多黏菌素B1的出峰時間在28.60~28.76"min,分子質(zhì)荷比為1"203.757"2;多黏菌素B2的出峰時間在21.77~21.81"min,分子質(zhì)荷比為1"189.741"6。
2.7 菌株C2-1對加州鱸的保護性評價
2.7.1 菌株C2-1的拮抗性檢驗" 腹腔注入100 μL(106、107和108 CFU/mL 的拮抗菌菌液)+100 μL(106、107和108 CFU/mL的維氏氣單胞菌液)的混合液,加州鱸死亡率分別為10%、20%和30%。注射100 μL(106、107和108 CFU/mL的拮抗菌菌液)+100 μL(LB)死亡率均為0。注射100 μL(106、107和108 CFU/mL的維氏氣單胞菌液)+100"μL(LB),死亡率均為100%。由表4可知,菌株C2-1對加州鱸有較好的保護作用。
2.7.2 病原菌鑒定" 解剖僅注射維氏氣單胞菌死亡的魚,從其肝臟、鰓等部位分離并純化得到的病原菌,提取病原菌DNA并測序,鑒定方法同1.2.2分子鑒定。鑒定結(jié)果顯示,病原菌與注射的維氏氣單胞菌(QQ781151)系列相似性達99.58%,即分離得到的病原菌為維氏氣單胞菌。
3 結(jié)論與討論
本研究從太湖鱸養(yǎng)殖池塘底泥中分離生防菌株,篩選得到一株對維氏氣單胞菌表現(xiàn)抑菌活性的菌株,命名為C2-1,其抑菌圈直徑達21.62~24.32 mm。菌株C2-1的抑菌物質(zhì)具有很高的酸堿穩(wěn)定性和熱穩(wěn)定性;掃描電子顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)菌株C2-1的發(fā)酵產(chǎn)物對維氏氣單胞菌的膜結(jié)構(gòu)具有損壞效果;LC-MC分析表明菌株C2-1包含多種脂肽類化合物,如伊枯草菌素等。該研究結(jié)果與程心怡等[25]報道的解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)J2-2的無菌濾液對維氏氣單胞菌的抑制作用結(jié)果相似。通過對菌株C2-1進行形態(tài)學(xué)觀察和分子生物學(xué)鑒定,該菌初步鑒定為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)。掃描電鏡中拮抗菌株作用于病原菌體表面出現(xiàn)的溶解現(xiàn)象,推測是貝萊斯芽孢桿菌產(chǎn)生的抑菌物質(zhì)如脂肽類抗生素等物質(zhì)引起[26-28]。
本試驗從加州鱸池塘底泥中分離獲得C2-1菌株,經(jīng)鑒定為貝萊斯芽孢桿菌,對維氏氣單胞菌有明顯抑菌作用,其直徑可達(25.28±0.56)mm,對希瓦氏菌、溶血鏈球菌等多種水產(chǎn)致病細(xì)菌也有較好的抑制效果。貝萊斯芽孢桿菌可以產(chǎn)生多種脂肽類物質(zhì),對魚類安全可靠,在加州鱸水產(chǎn)養(yǎng)殖中具有較大的應(yīng)用潛力。
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(責(zé)編:何 艷)