[摘要]目的基于外周血環(huán)形RNA(circularRNAs,circRNAs)表達(dá)構(gòu)建抑郁癥嚴(yán)重程度的預(yù)測(cè)模型。方法選取2022年8月至2023年8月于筆者醫(yī)院就診的抑郁癥80例患者,分為輕中度組49例、重度組31例,并以40名健康人作為健康組,經(jīng)基因芯片篩查,選擇差異較大的5種circRNAs,進(jìn)一步分析circRNAs與抑郁癥嚴(yán)重程度的關(guān)系,分析影響抑郁癥嚴(yán)重程度的獨(dú)立危險(xiǎn)因子,根據(jù)分析結(jié)果構(gòu)建基于外周血circRNAs表達(dá)的抑郁癥嚴(yán)重程度列線(xiàn)圖預(yù)測(cè)模型。結(jié)果與健康組、輕中度組比較,重度組circRNA_100679、circRNA_103636相對(duì)表達(dá)量降低,circRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143相對(duì)表達(dá)量升高(P<0.05)。circRNA_100679、circRNA_103636與抑郁癥嚴(yán)重程度呈負(fù)相關(guān)(r=-0.594、-0.512,P<0.05),CircRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143與抑郁癥嚴(yán)重程度呈正相關(guān)(r=0.603、0.425、0.412,P<0.05)。CircRNA_100679、circRNA_102802、circRNA_103636、circRNA_103964、circRNA_002143、家族精神疾病史、5-羥色胺(5-hydroxytryptamine,5-HT)均為抑郁癥嚴(yán)重程度的危險(xiǎn)因子(P<0.05)?;谕庵苎猚ircRNAs等危險(xiǎn)因子構(gòu)建的列線(xiàn)圖預(yù)測(cè)模型的預(yù)測(cè)曲線(xiàn)下面積為0.900(95%CI:0.811~0.945),模型區(qū)分度較好,內(nèi)部驗(yàn)證一致性較高。結(jié)論構(gòu)建基于circRNAs表達(dá)的抑郁癥嚴(yán)重程度的列線(xiàn)圖模型預(yù)測(cè)價(jià)值良好,可為臨床抑郁癥嚴(yán)重程度的診斷提供參考。
[關(guān)鍵詞]環(huán)形RNA;抑郁癥;嚴(yán)重程度;預(yù)測(cè)模型
[中圖分類(lèi)號(hào)]R749[文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼]A[DOI]10.3969/j.issn.1673-9701.2024.20.005
ConstructingapredictivemodelfortheseverityofdepressionbasedontheexpressionofcircRNAsinperipheralblood
YANHuanran,XUDongqin,CHENJing
DepartmentofPsychiatry,SeventhPeople’sHospital,Shaoxing312000,Zhejiang,China
[Abstract]ObjectiveToconstructapredictivemodelfortheseverityofdepressionbasedontheexpressionofcircularRNAs(circRNAs)inperipheralblood.MethodsSelecting80patientswithdepressionwhovisitedourhospitalfromAugust2022toAugust2023,theyweredividedintoamildtomoderategroupof49casesandaseveregroupof31cases.Fortyhealthyindividualswereselectedasthehealthygroup,andaftergenechipscreening,fivecircRNAswithsignificantdifferenceswereselected.FurtheranalysiswasconductedontherelationshipbetweencircRNAsandtheseverityofdepression,andindependentriskfactorsaffectingtheseverityofdepressionwereanalyzed,basedontheanalysisresults,constructadepressionseveritypredictionmodelusingacolumnchartbasedontheexpressionofcircRNAsinperipheralblood.ResultsComparedwiththehealthygroupandmildtomoderategroup,theseveregrouphadcircRNA_100679,circRNA_103636relativeexpressionleveldecreased,circRNA_102802,circRNA_103964,TherelativeexpressionlevelofcircRNA_002143increased(P<0.05).CircRNA_100679,circRNA_103636isnegativelycorrelatedwiththeseverityofdepression(r=-0.594,-0.512,P<0.05),circRNA_102802,circRNA_103964,circRNA_002143ispositivelycorrelatedwiththeseverityofdepression(r=0.603,0.425,0.412,P<0.05).CircRNA_100679,circRNA_102802,circRNA_103636,circRNA_103964,circRNA_002143,familyhistoryofmentalillness,and5-hydroxytryptamine(5-HT)areallriskfactorsfortheseverityofdepression(P<0.05).ThepredictedareaunderthecurveofthecolumnchartpredictionmodelbasedonriskfactorssuchasperipheralbloodcircRNAsis0.900,witha95%CI:0.811-0.945.Themodelhasgooddiscriminationandhighinternalvalidationconsistency.ConclusionTheconstructionofacolumnchartmodelbasedoncircRNAsexpressionforpredictingtheseverityofdepressionhasgoodpredictivevalueandcanprovidereferenceforthediagnosisandtreatmentofdepressionseverityinclinicalpractice.
[Keywords]CircularRNA;Depression;Severity;Predictionmodel
抑郁癥又稱(chēng)抑郁障礙,是一種以情緒低落、睡眠障礙、興趣減退或有自殺觀念為主要表現(xiàn)的精神疾病。一項(xiàng)關(guān)于中國(guó)成人抑郁障礙終生患病情況調(diào)查顯示,我國(guó)大約有6.8%的成人終生伴有抑郁障礙[1]。世界衛(wèi)生組織預(yù)計(jì)到2030年,抑郁癥將成為第2類(lèi)世界負(fù)擔(dān)疾病,給患者家庭、社會(huì)均帶來(lái)沉重負(fù)擔(dān)[2]。目前對(duì)于抑郁癥嚴(yán)重程度的總體識(shí)別率較低,雖然研究表明,神經(jīng)免疫狀態(tài)、突觸可塑性、神經(jīng)遞質(zhì)紊亂、個(gè)體遺傳、環(huán)境與此病密切相關(guān),但由于確切機(jī)制尚不明確,臨床誤診率、漏診率較高[3]。近年來(lái)隨著對(duì)抑郁癥的逐漸深入研究發(fā)現(xiàn),與表現(xiàn)遺傳觀有關(guān)的環(huán)形RNA(circularRNAs,circRNAs)在此病中具有重要的介導(dǎo)作用,circRNAs是一類(lèi)半衰期較長(zhǎng)的單鏈非編碼RNA,表達(dá)具有組織、疾病特異性,被證實(shí)具有巨大的生物標(biāo)志物潛力[4]。鑒于目前抑郁癥發(fā)生形勢(shì),為提高抑郁癥病情嚴(yán)重程度的診斷準(zhǔn)確性,本研究構(gòu)建基于外周血circRNAs表達(dá)的預(yù)測(cè)模型,旨在初步評(píng)估外周血circRNAs能否作為抑郁癥嚴(yán)重程度的新興風(fēng)險(xiǎn)因素,為改善人群風(fēng)險(xiǎn)分層提供臨床證據(jù)。
1對(duì)象與方法
1.1研究對(duì)象
選取2022年8月至到2023年8月于筆者醫(yī)院初次確診的80例抑郁癥患者,其中,男45例,女35例,年齡25~68歲,平均(42.31±3.98)歲,根據(jù)漢密爾頓抑郁癥評(píng)定量表(Hamiltondepressionratingscale,HAMD)對(duì)病情嚴(yán)重程度的評(píng)價(jià)結(jié)果分為輕中度組49例(8~23分)、重度組31例(≥24分),另外以同期于體檢的健康人40名作為健康組,其中,男20名,女20名,年齡24~67歲,平均(43.00±3.62)歲。各組一般資料比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。納入標(biāo)準(zhǔn):①抑郁癥患者符合臨床診斷診斷標(biāo)準(zhǔn),主要癥狀為心境低落,并伴有以下任意4項(xiàng)即可確診:a.睡眠障礙;b.性欲減退;c.精神減退或lNgFPi2JhXOY8hw9UtYBkg==疲憊感;d.食欲減退;e.有自傷、自殺行為或自殺念頭;f.無(wú)愉快感、興趣喪失;g.精神運(yùn)動(dòng)性激越或遲滯;h.自主思考能力降低;i.自我評(píng)價(jià)低;②健康組無(wú)精神疾病史,身體健康;③簽署知情同意書(shū)。排除標(biāo)準(zhǔn):①有抑郁藥物治療史;②焦慮癥、躁狂癥者;③意識(shí)不清者;④感染性疾病者;⑤免疫、凝血異常者;⑥妊娠或哺乳期婦女;⑦重要臟器功能障礙者。本研究經(jīng)筆者醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(倫理審批號(hào):2023-001-01)
1.2研究方法
1.2.1外周血circRNAs表達(dá)檢測(cè)①外周血單個(gè)核細(xì)胞(peripheralbloodmononuclearcells,PBMC)分離及RNA提取:取所有研究對(duì)象入組清晨空腹靜脈血5ml,使用PBMC分離液離心獲得PBMC,-80℃保存,提取PBMC總RNA,測(cè)定RNA濃度及純度備用。②基因芯片檢測(cè):將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,并進(jìn)一步合成用吲哚菁綠-花青素?zé)晒馊玖蠘?biāo)記cRNA,而后將吲哚菁綠-花青素?zé)晒馊玖蠘?biāo)記的cRNA與芯片ArraystarHumancircRNAArray雜交,洗脫后獲得原始圖像。③實(shí)時(shí)熒光定量PCR法:選取基因芯片結(jié)果中差異較大的circRNA行RT-PCR檢測(cè),RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增條件:預(yù)變性:95℃30s,變性:95℃5s,退火:60℃30s,延伸:72℃30s,40個(gè)循環(huán),擴(kuò)增體系:預(yù)混液10μl,上、下游引物各1μl,cDNA4μl,加雙蒸水至20μl,circRNA相對(duì)表達(dá)量采用2-ΔΔCt法計(jì)算。引物序列見(jiàn)表1。
1.2.2臨床資料采集包括性別、年齡、體質(zhì)量指數(shù)(bodymassindex,BMI)、文化程度、家庭居住地、收入水平、婚姻狀況、吸煙、飲酒、家族精神疾病史、家庭結(jié)構(gòu)、血清神經(jīng)遞質(zhì)指標(biāo)[多巴胺(dopamine,DA)、去甲腎上腺素(norepinephrine,NE)、5-羥色胺(5-hydroxytryptamine,5-HT)]水平。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
采用SPSS20.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析,計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()描述,兩組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),多組間比較采用F檢驗(yàn),組間有差異進(jìn)一步采用SNK-q檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料比較采用例數(shù)(百分率)[n(%)]表示,采用χ2檢驗(yàn);相關(guān)性采用Pearson檢驗(yàn);經(jīng)Logistic回歸分析篩選模型的最終危險(xiǎn)因素,RMS程序包繪制列線(xiàn)圖模型建立預(yù)測(cè)模型。通過(guò)繪制校準(zhǔn)曲線(xiàn)、臨床模型的受試者操作特征(receiveroperatingcharacteristic,ROC)曲線(xiàn)以及臨床適用度檢驗(yàn)?zāi)P偷膮^(qū)分度和實(shí)際應(yīng)用效能。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2結(jié)果
2.1抑郁癥與健康人差異倍數(shù)較大的5種circRNA相對(duì)表達(dá)量比較
輕中度組、重度組circRNA_100679、circRNA_103636低于健康組,circRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143高于健康組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。重度組circRNA_100679、circRNA_103636低于輕中度組,circRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143高于輕中度組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)表2。相關(guān)性分析顯示,circRNA_100679、circRNA_103636與抑郁癥嚴(yán)重程度呈負(fù)相關(guān)(r=-0.594、-0.512,P<0.05),circRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143與抑郁癥嚴(yán)重程度呈正相關(guān)(r=0.603、0.425、0.412,P<0.05),見(jiàn)圖1。
2.2輕中度、重度抑郁癥患者臨床資料比較
重度組家族精神疾病史比例高于輕中度組,DA、NE、5-HT水平低于輕中度組(P<0.05),其余資料比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表3。
2.3篩選抑郁癥嚴(yán)重程度的危險(xiǎn)因素
選取輕中度組、重度組組間比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的指標(biāo)作為自變量,行多因素Logistic回歸分析發(fā)現(xiàn),circRNA_100679、circRNA_102802、circRNA_103636、circRNA_103964、circRNA_002143、家族精神疾病史、5-HT為抑郁癥嚴(yán)重程度的危險(xiǎn)因子(P<0.05)。見(jiàn)表4。
2.4基于circRNAs表達(dá)的抑郁癥嚴(yán)重程度的預(yù)測(cè)模型構(gòu)建及驗(yàn)證結(jié)果分析
根據(jù)危險(xiǎn)因素分子結(jié)果綜合了circRNA_100679、circRNA_102802、circRNA_103636、circRNA_103964、circRNA_002143、家族精神疾病史、5-HT等7個(gè)獨(dú)立危險(xiǎn)因子構(gòu)建抑郁癥嚴(yán)重程度的預(yù)測(cè)模型。使用ROC曲線(xiàn)分析抑郁癥嚴(yán)重程度列線(xiàn)圖預(yù)測(cè)模型的預(yù)測(cè)價(jià)值,曲線(xiàn)下面積為0.900,95%CI:0.811~0.945,提示所構(gòu)建的模型區(qū)分度較好。再以Bootstrap法進(jìn)行內(nèi)部驗(yàn)證,將原始數(shù)據(jù)重復(fù)抽樣1000次建立校準(zhǔn)曲線(xiàn)(圖2),預(yù)測(cè)抑郁癥嚴(yán)重程度與實(shí)際一致性較高。
3討論
circRNAs來(lái)源于前體RNA,早期認(rèn)為是基因轉(zhuǎn)錄剪切錯(cuò)誤所致,但后續(xù)研究發(fā)現(xiàn),circRNAs具有多種生物學(xué)功能:①1個(gè)circRNA上存在多個(gè)微小RNA結(jié)合位點(diǎn),具有感染微小RNA表達(dá)的作用;②部分circRNA可翻譯為活性小分子多肽,經(jīng)m6A的修飾作用參與蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程;③與蛋白質(zhì)結(jié)合,阻礙RNA剪切;④與mRNA調(diào)控轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)[6-9]。由于circRNAs分子頭尾相連,為封閉性的環(huán)狀結(jié)構(gòu),與其他RNA比較,具有更強(qiáng)的穩(wěn)定性,可避免核糖核酸酶R的降解,且其半衰期較長(zhǎng),因此臨床認(rèn)為circRNAs更加適用于作為生物標(biāo)志物診斷疾病[10-11]。鑒于circRNAs的生物學(xué)功能,目前已有部分研究發(fā)現(xiàn)其與抑郁癥發(fā)生進(jìn)展有關(guān),如Zhang等[12]經(jīng)基因芯片發(fā)現(xiàn),與健康人比較,抑郁癥患者中外周血中有445個(gè)表達(dá)有差異的circRNA。Zhou等[13]通過(guò)基因芯片分析發(fā)現(xiàn)在抑郁癥中有340個(gè)表達(dá)有差異的circRNA。而后研究驗(yàn)證了外周血circRNAs在抑郁癥與精神分裂癥鑒別和抑郁癥嚴(yán)重程度診斷中的作用,抑郁癥嚴(yán)重程度的早期判斷可依賴(lài)外周血circRNAs差異表達(dá)實(shí)現(xiàn)[14-15]。
本研究經(jīng)基因芯片篩選circRNAs,而后選擇其中差異較大的5種circRNAs行PCR分析,抑郁癥患者外周血circRNA_100679、circRNA_103636表達(dá)降低,circRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143表達(dá)升高,驗(yàn)證了circRNA在抑郁癥中的表達(dá)狀態(tài)。后續(xù)進(jìn)一步比較病情不同嚴(yán)重程度患者上述circRNAs表達(dá)差異,結(jié)果發(fā)現(xiàn),重度患者circRNA_100679、circRNA_103636相對(duì)表達(dá)量更低,circRNA_102802、circRNA_103964、circRNA_002143相對(duì)表達(dá)量更高,且與病情嚴(yán)重程度呈高度相關(guān),因此推測(cè)circRNA表達(dá)異??赡軈⑴c抑郁癥進(jìn)展。
既往研究發(fā)現(xiàn),有家族精神疾病史的抑郁癥患者有更嚴(yán)重的自殺傾向,且病情更嚴(yán)重,認(rèn)為這可能與遺傳表現(xiàn)觀有關(guān)[16]。5-HT作為單胺類(lèi)神經(jīng)遞質(zhì),主要經(jīng)5-HT轉(zhuǎn)運(yùn)體聚集于神經(jīng)末梢,具有調(diào)節(jié)人情緒、記憶作用,其含量減少增加抑郁發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)[17]。本研究中家族精神疾病史、血清5-HT降低同樣均為導(dǎo)致患者病情加重的重要危險(xiǎn)因子,這可能與遺傳表現(xiàn)觀及5-HT不足無(wú)法克服神經(jīng)元萎縮和細(xì)胞死亡的突觸性障礙從而導(dǎo)致情緒改變,引起抑郁有關(guān)。
本研究從外周血circRNAs表達(dá)、臨床資料中篩選出影響抑郁癥患者病情嚴(yán)重程度的危險(xiǎn)因子,通過(guò)circRNA_100679、circRNA_102802、circRNA_103636、circRNA_103964、circRNA_002143、家族精神疾病史、5-HT等7個(gè)獨(dú)立危險(xiǎn)因子構(gòu)建列線(xiàn)圖預(yù)測(cè)模型,經(jīng)內(nèi)部驗(yàn)證顯示基于預(yù)測(cè)外周血circRNAs表達(dá)的抑郁癥嚴(yán)重程度的列線(xiàn)圖模型與實(shí)際一致性較高,提示外周血circRNAs能夠良好地反映出患者抑郁癥狀變化,臨床可根據(jù)模型中預(yù)測(cè)因子來(lái)計(jì)算患者病情加重的風(fēng)險(xiǎn)系數(shù),早期制定個(gè)性化治療方案干預(yù),阻止病情加重。
綜上所述,構(gòu)建基于外周血circRNAs表達(dá)的抑郁癥嚴(yán)重程度的列線(xiàn)圖模型預(yù)測(cè)價(jià)值良好,臨床可經(jīng)檢測(cè)外周血circRNAs表達(dá)來(lái)監(jiān)測(cè)抑郁癥患者病情嚴(yán)重程度,一旦外周血circRNAs表達(dá)異常應(yīng)及時(shí)干預(yù),以便于促進(jìn)患者轉(zhuǎn)歸。
利益沖突:所有作者均聲明不存在利益沖突。
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(收稿日期:2024–03–16)
(修回日期:2024–04–18)
InformaticsandHealth征稿啟事
InformaticsandHealth(《信息學(xué)與健康》)是由中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院主辦,中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)信息研究所與科愛(ài)公司合作編輯出版,旨在反映醫(yī)學(xué)衛(wèi)生健康領(lǐng)域與信息科學(xué)技術(shù)相關(guān)的前沿學(xué)術(shù)研究進(jìn)展的英文期刊(ISSN:2949-9534),本刊由中國(guó)工程院院士、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院院校長(zhǎng)王辰教授擔(dān)任主編,中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)信息研究所所長(zhǎng)劉輝研究員擔(dān)任執(zhí)行主編。
期刊將持續(xù)組織聚焦前沿的研究專(zhuān)題,誠(chéng)邀國(guó)內(nèi)外專(zhuān)家學(xué)者共同參與選題策劃、開(kāi)設(shè)相關(guān)研究專(zhuān)題和賜稿,編委會(huì)和編輯部將竭誠(chéng)為您做好同行評(píng)議、編輯出版、成果推介等工作。期刊收稿范圍包括但不限于以下研究領(lǐng)域的內(nèi)容:健康研究中的創(chuàng)新性信息學(xué)方法、臨床前期基礎(chǔ)科學(xué)研究中的數(shù)字化轉(zhuǎn)型、臨床決策支持和衛(wèi)生保健應(yīng)用中的多源信息分析、公共健康與環(huán)境健康中的信息學(xué)實(shí)踐、科學(xué)智能在衛(wèi)生保健領(lǐng)域的應(yīng)用、人口健康與信息學(xué)相關(guān)的經(jīng)濟(jì)與社會(huì)決定因素。
本刊的收稿類(lèi)型以原創(chuàng)性研究論文和綜述文章為主,所有收稿將經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的同行評(píng)議后決定是否錄用,錄用后即安排單篇上線(xiàn)(onlinefirst),2023—2025年免收文章出版費(fèi)。投稿系統(tǒng)地址:www.editorialmanager.com/infoh/default2.aspx,電子郵箱:info_health@imicams.ac.cn,inforhealth@163.com,聯(lián)系電話(huà):010-52328735。