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FMD73D基因真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建、表達及對I型IFN信號通路的作用

2024-04-27 22:21:11苗勤吳香菊齊靜叢曉燕李均同王林杜以軍
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年2期
關(guān)鍵詞:真核質(zhì)粒試劑盒

苗勤 吳香菊 齊靜 叢曉燕 李均同 王林 杜以軍

關(guān)鍵詞:口蹄疫病毒:3D蛋白;真核表達:I型IFN信號通路

口蹄疫(foot-and -mouthdisease,F(xiàn)MD)是由口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease VLrLLS,F(xiàn)M-DV)引起的一種急性、高度接觸性人畜共患傳染病,主要感染牛、羊、豬等偶蹄動物,給畜牧業(yè)造成了嚴重的經(jīng)濟損失,被世界衛(wèi)生組織列為A類動物疫病之首,我國也將其列為一類傳染病??谔阋卟《緦傩NA病毒科,是單股正鏈RNA病毒,呈二十面體對稱結(jié)構(gòu)。FMDV基因組全長約8500bp,僅有一個開放閱讀框(open readingframe,ORF),約6.5 kb,編碼一個大的多聚蛋白,在L、2A和3C的作用下裂解產(chǎn)生了病毒的4種結(jié)構(gòu)蛋白[VP4(1A)、VP2(1B)、VP3(1C)和VPl(1D)]和8個非結(jié)構(gòu)蛋白(L、2A、2B、2C、3A、3B、3C、3D)。FMDV有7種血清型,分別為A型、O型、C型、亞洲I型、SAT1型、SAT2型和SAT3型,且各血清型之間無交叉保護。

I型IFN是機體抵抗病毒天然免疫的核心,F(xiàn)MDV感染細胞后,病毒復(fù)制產(chǎn)生的RNA被宿主細胞的模式識別受體所識別,激活下游信號通路,刺激產(chǎn)生I型IFN和促炎細胞因子,從而啟動抗病毒反應(yīng)。已有研究表明,F(xiàn)MDV多種蛋白,如前導(dǎo)蛋白L、蛋白水解酶3C、非結(jié)構(gòu)蛋白2B、2C等,參與調(diào)節(jié)先天性免疫信號通路,拮抗宿主天然免疫,促進病毒增殖。

FMDV 3D蛋白是病毒的RNA聚合酶,介導(dǎo)FMDV基因組的合成,且核苷酸和氨基酸序列高度保守。此外,3D蛋白具有T細胞表位,是一種潛在的免疫增強劑,還可以作為免疫佐劑使用。但3D蛋白在天然免疫中的作用尚不明確,本研究旨在構(gòu)建FMDV 3D基因的真核表達質(zhì)粒,并探索3D蛋白對I型IFN信號通路的影響,為FMD的防控提供新的靶向分子。

1材料與方法

1.1試驗材料

1.1.1細胞與質(zhì)粒HEK-293T細胞、PK-15細胞、pXJ41真核表達載體、熒光素酶報告基因質(zhì)粒pIFN-Luc和內(nèi)參報告質(zhì)粒pRL-TK均由山東省畜禽疫病防治與繁育重點實驗室保存。

1.1.2主要試劑PrimeSTAR⑩HS DNA Polymer-ase、DL5000 DNA Marker、DL2000 DNA Marker,pMD18-T載體購自TaKaRa寶生物工程(大連)有限公司;Lipofectamine3000 Reagent、Alexa Flu-or 488-羊抗鼠IgG(H+L)購自Invitrogen公司;Western一抗稀釋液購自碧云天生物技術(shù)有限公司;NC膜購自BIO-RAD公司;辣根過氧化物(HRP)標記的羊抗兔抗體購自武漢博士德生物工程有限公司;Sparkjade ECL super(極超敏化學(xué)發(fā)光試劑盒)購自山東思科捷生物技術(shù)有限公司;感受態(tài)細胞DH5a、雙熒光素酶報告基因試劑盒、RNA-easy Isolation Reagent試劑盒均購自南京諾唯贊生物科技有限公司:限制性內(nèi)切酶HindⅢ、Kpn I及T4 DNA Ligase購自Thermo FisherScientific公司;質(zhì)粒小提試劑盒、通用型DNA純化回收試劑盒購自北京天根生物工程有限公司:DMEM細胞培養(yǎng)基、Opti-MEM培養(yǎng)基、胰蛋白酶一EDTA均購自Gibco公司:抗熒光衰減封閉劑購自Solarbio公司;鼠源、兔源Myc抗體購自Sigma -Aldrich公司;actin抗體購自上海泊灣生物科技有限公司。

1.2試驗設(shè)計與方法

1.2.1FMDV 3D基因真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定

根據(jù)GenBank公布的FMDV O/BY/CHA/2010(GenBank accession no. JN998085) 3D基因序列,由北京擎科生物技術(shù)有限公司合成3D基因并連接到pMD18-T載體上。結(jié)合真核表達載體pXJ41上的酶切位點序列,加入保護性堿基及Myc標簽序列,利用分子生物學(xué)軟件Primer Premier5.0設(shè)計了一對擴增3D基因的特異性引物:Myc-3D-Fwd(HindⅢ)和Myc-3D-Rev,引物削匕京擎科生物技術(shù)有限公司合成,序列見表1。

以pMD18-T-3D克隆質(zhì)粒為模板進行PCR擴增,PCR反應(yīng)體系(總體系為25uL)如下:上、下游引物(10pmol/uL)各1uL,模板(200ng/uL)0.5uL,dNTP 2uL,5xPrime STAR buffer 5uL,PrimeSTARHS DNA Polyerase(2.5 U/卜LL) 0.25uL,ddH,0補足至25uL。反應(yīng)條件如下:98℃預(yù)變性2min;98℃變性10s,58℃退火30s,72℃延伸2min,30個循環(huán);72℃延伸7min;4℃保存。PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳,用DNA純化回收試劑盒進行回收。

將回收純化的3D基因和pXJ41載體用Hindm/Kpn I雙酶切,酶切產(chǎn)物膠回收純化后用T4DNA Ligase進行16℃過夜連接,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至DH5a感受態(tài)細胞,37℃過夜培養(yǎng)16h,挑取單菌落接種于含有氨芐西林抗性的LB培養(yǎng)基中,37℃、200r/min過夜培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,進行HindⅢlKpn I雙酶切鑒定,鑒定為陽性的質(zhì)粒送北京擎科生物科技有限公司測序,命名為pXJ41 -Myc-3D。

1.2.2Western blotting檢測FMDV 3D蛋白的表達

將HEK-293T細胞接種于6孔板中進行培養(yǎng),待細胞密度達到70%~90%時,用Lipofectamine3000轉(zhuǎn)染試劑按說明書進行操作,轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pXJ41-Myc-3D和pXJ41空載體各2ug。培養(yǎng)24h后,棄去上清,用等體積預(yù)冷的PBS洗滌細胞2次,將6孑L板置于冰上,加入細胞裂解液裂解細胞20min后,4℃12000r/min離心10min。取上清液與上樣緩沖液混合后煮沸10min。將處理好的樣品進行12% SDS-PAGE凝膠電泳后,采用濕法(100V,70min)將蛋白轉(zhuǎn)印至NC膜。將NC膜轉(zhuǎn)移至5%脫脂奶粉封閉液中,室溫輕搖封閉1h,用一抗稀釋液稀釋的兔抗Myc和兔抗actin于4℃過夜孵育,二抗為用5%脫脂奶粉稀釋的辣根過氧化物(HRP)標記的羊抗兔抗體,室溫孵育1h,洗膜后用Sparkjade ECL super(極超敏化學(xué)發(fā)光試劑盒)顯色,BIO-RAD凝膠成像儀進行曝光。

1.2.3IFA檢測FMDV 3D蛋白的細胞定位用無菌鑷子夾取細胞爬片置于24孔板內(nèi),接種PK-15細胞,待細胞密度達到40%~50%時,用Lipo-fectamine3000轉(zhuǎn)染試劑按說明書進行操作,各孔分別轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pXJ41-Myc-3D和pXJ41空載體各0.5ug。培養(yǎng)24h后棄上清,用4%多聚甲醛固定45min;PBS洗10minx3次后,加入0.1%TritonX-100室溫通透30min;PBS洗10min×3次后,加入1:600稀釋的鼠源Myc抗體室溫孵育2h;PBS洗10minx3次后,加入1:1000稀釋的Alexa Fluor488-羊抗鼠抗體,室溫避光孵育1h:PBS洗10minx3次后,加入1:10000稀釋的DA-PI室溫孵育5min;PBS洗10minx3次后,取出爬片置于滴有抗熒光衰減封閉劑的載玻片上,封片后于熒光顯微鏡下觀察3D蛋白在細胞內(nèi)的定位情況。

1.2.4Luciferase檢測FMDV 3D蛋白對IFN啟動子的影響

將HEK-293T細胞接種于12孔板中進行培養(yǎng),待細胞密度達到70%~90%時,用Lipofectamine3000轉(zhuǎn)染試劑按說明書進行操作,分別轉(zhuǎn)染pXJ41-Myc-3D和空載體pXJ41各0.4ug,同時分別轉(zhuǎn)染IFN啟動子報告基因質(zhì)粒和內(nèi)參質(zhì)粒pRL-TK 0.04ug。24 h后感染水皰性口炎病毒(Versicular sto-matLtLs VLrUS,VSV)(MOI=0.1),10h后,按雙熒光素酶報告基因試劑盒說明書方法收取細胞進行檢測。

1.2.5Real-time PCR檢測FMDV 3D蛋白對IFN-mRNA的影響將HEK-293T細胞接種于24孔板中進行培養(yǎng),待細胞密度達到70%~90%時,用Lipofectamine⑩3000轉(zhuǎn)染試劑按說明書進行操作,分別轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pXJ41-Myc-3D和空載體pXJ41各0.5ug,24h后感染VSV(MOI=0.1),10h后,收集細胞使用RNA-easy Isolation Reagent試劑盒提取總RNA,以其為模板反轉(zhuǎn)錄得到cD-NA,以GAPDH作為內(nèi)參基因檢測IFN mRNA水平,Real-time PCR引物序列詳見表2。

1.2.6Real-time PCR檢測病毒拷貝數(shù)將HEK-293T細胞接種于24孔板中進行培養(yǎng),待細胞密度達到70%~90%時,用Lipofectamine3000轉(zhuǎn)染試劑按說明書進行操作,分別轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pXJ41-Myc-3D和空載體pXJ41各0.5ug,24h后感染VSV(MOI=0.1),10h后,細胞及其上清反復(fù)凍融后,一部分用于病毒滴度檢測;一部分使用RNA-easyIsolation Reagent試劑盒提取總RNA,以其為模板反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,絕對熒光定量檢測VSV拷貝數(shù)。

1.2.7TCID50測定病毒滴度將HEK-293T細胞接種于96孔板中進行培養(yǎng),待細胞密度達到90%時,將1.2.6中的樣品12000r/min離心10min后取上清,用2%細胞維持液按10倍梯度稀釋,共10個梯度,每個梯度4個重復(fù),將稀釋好的樣品加入96孔板中,每孔100uL,并設(shè)置8個孔加入等體積細胞維持液做陰性對照,觀察并記錄細胞病變情況,按照Reed-Muench法計算TCID50。

1.3數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析

使用GraphPad Prism 5軟件對試驗數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學(xué)分析。

2結(jié)果與分析

2.1pXJ41-Myc-3D真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定

以pMD18-T-3D克隆質(zhì)粒為模板,PCR擴增獲得3D基因。擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳可見大小約1500bp的特異性目的片段,與預(yù)期大小相符(圖1)。重組質(zhì)粒pXJ41-Myc-3D經(jīng)HindⅢ/Kpn I雙酶切后得到預(yù)期大小的片段(圖2),測序結(jié)果表明pXJ41-Myc-3D真核表達質(zhì)粒構(gòu)建成功。

2.2Western blotting檢測3D蛋白的表達

經(jīng)Western blotting檢測到pXJ41-Myc-3D在HEK-293T細胞中成功表達,大小約55kDa左右(圖3)。

2.3IFA檢測FMDV 3D蛋白的細胞定位

IFA結(jié)果顯示,F(xiàn)MDV 3D蛋白在PK-15細胞中的表達主要定位在細胞核內(nèi),細胞胞漿中也有少量表達(圖4)。

2.4雙熒光素酶報告基因檢測FMDV 3D蛋白對IFN啟動子的影響

雙熒光素酶報告基因檢測結(jié)果顯示,VSV感染后,pXJ41-Myc-3D轉(zhuǎn)染組的IFN啟動子活性極顯著低于空載體pXJ41轉(zhuǎn)染組,表明FMDV3D蛋白抑制了VSV誘導(dǎo)的IFN啟動子活性(圖5)。

2.5Real-time PCR檢測FMDV 3D蛋白對IFNmRNA的影響

Real-time PCR檢測結(jié)果顯示,VSV刺激后,pXJ41-Myc-3D轉(zhuǎn)染組的IFN mRNA表達水平極顯著低于空載體pXJ41轉(zhuǎn)染組,表明FMDV 3D蛋白抑制了VSV誘導(dǎo)的IFN mRNA表達水平(圖6)。

2.6FMDV 3D蛋白對VSV增殖的影響

Real-time PCR檢測VSV拷貝數(shù)結(jié)果顯示,pXJ41-Myc-3D轉(zhuǎn)染組極顯著高于空載體組(圖7)。TCID50結(jié)果顯示,pXJ41-Myc-3D轉(zhuǎn)染組VSV TCID50明顯高于空載體轉(zhuǎn)染組(圖8)。表明FMDV 3D蛋白通過抑制I型IFN的產(chǎn)生促進了VSV的復(fù)制。

3討論與結(jié)論

口蹄疫是一種急性、高度接觸性人畜共患傳染病,我國主要以0型口蹄疫為主,A型口蹄疫呈點狀散發(fā),加之境外疫情傳人的影響,給我國的畜牧業(yè)帶來嚴峻的挑戰(zhàn)。FMDV 3D蛋白作為RNA病毒依賴的RNA聚合酶,催化病毒RNA合成,在不同血清型中高度保守,且有研究表明3D在病毒復(fù)制早期產(chǎn)生,感染后1.5h首先檢測到3D瞬時表達,在核仁中均勻分布。本試驗成功構(gòu)建了真核表達質(zhì)粒pXJ41-Myc-3D,并在HEK-293T細胞中進行了表達驗證。通過IFA檢測到3D蛋白在PK-15胞核和細胞胞漿中都有表達,且胞核內(nèi)表達明顯,顯示3D主要定位于細胞核,與畢研麗等的研究結(jié)果一致。

天然免疫又稱先天性免疫或固有免疫,是機體對抗病毒感染的第一道防線,當(dāng)病毒感染機體后模式識別受體(pattern recognition receptors,PRRs)識別病原相關(guān)模式分子(pathogen associat-ed molecule patterns,PAMPs),激活下游信號通路,誘導(dǎo)產(chǎn)生I型IFN等細胞因子,進而啟動免疫應(yīng)答。PRRs家族包括Toll樣受體(TLRs)、RIG-I樣受體(RLRs)、Nod樣受體(NLRs).C型凝集素受體(CLRs),其中TLRs和RLRs主要識別病毒RNA。FMDV在長期進化中形成了一系列策略逃逸宿主的天然免疫,從而促進自身復(fù)制,維持對宿主的持續(xù)感染。已有研究表明,F(xiàn)MDV編碼的多種蛋白可參與調(diào)控先天性免疫信號通路,例如Lb蛋白可以通過去除ISG15的泛素化阻斷天然免疫的啟動,裂解LGP2抑制IFN的表達。3C蛋白通過溶酶體路徑降解蛋白激酶PKR,也能通過抑制NF-KB信號通路促進病毒復(fù)制。3A蛋白與RIG-I、MDA5和MAVS互作并抑制蛋白表達,抑制RLR介導(dǎo)的IFN產(chǎn)生。2B通過降解RIG-I和MDA5調(diào)節(jié)IFN信號通路。2B和2C蛋白協(xié)同作用,影響MHC-I復(fù)合物的形成,逃避機體的天然免疫。3B與RIG-I互作,抑制RIG-I介導(dǎo)的信號通路。本實驗室前期發(fā)現(xiàn)FMDV3C通過阻斷STATl/STAT2核易位來拮抗干擾素信號通路。FMDV L通過與sRNaseL的N末端結(jié)構(gòu)域相互作用,抑制細胞凋亡,拮抗OAS/RNase L通路,抑制抗病毒天然免疫。有研究表明FMDV非結(jié)構(gòu)蛋白3D作為一種反式作用元件調(diào)控TLR3信號通路的激活,促進TLR3通路介導(dǎo)的I型干擾素的產(chǎn)生。但天然免疫反應(yīng)交錯復(fù)雜,不同的PAMPs可能激活多條信號通路,通過不同分子間相互作用共同完成天然免疫應(yīng)答。本試驗選用HEK-293T作為研究細胞,由于該模式細胞中不含TLR3受體,可排除TLR3信號通路的影響,探究3D蛋白對I型IFN信號通路的作用。

水皰性口炎病毒是一種負鏈RNA病毒,屬彈狀病毒科水皰病毒屬,是研究I型IFN信號通路常用的模式病毒,細胞感染VSV后可激活I(lǐng)型IFN信號通路。本研究采用VSV模擬病毒感染,通過雙熒光素酶報告基因、Real-time

PCR及TCID50試驗,發(fā)現(xiàn)3D蛋白能夠通過抑制I型IFN信號通路的活化抑制先天性免疫,進而促進VSV的復(fù)制。

綜上,F(xiàn)MDV 3D蛋白抑制了VSV誘導(dǎo)的IFN啟動子的活性和IFN mRNA水平,促進了VSV的復(fù)制,提示FMDV 3D蛋白是病毒抵抗先天性免疫的重要因子,為其在I型IFN信號通路的作用及機制研究奠定了基礎(chǔ)。

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