羅飛,張紅
遵義醫(yī)科大學附屬醫(yī)院麻醉科,貴州遵義 563000
急性肺損傷(acute lung injury,ALI)是肺泡上皮細胞及毛細血管內(nèi)皮細胞損傷,造成彌漫性肺間質(zhì)及肺泡水腫導(dǎo)致的急性低氧性呼吸功能不全,是一種危重的臨床綜合征[1],嚴重者可發(fā)展為急性呼吸窘 迫 綜 合 征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)。ALI 的直接危險因素包括肺部嚴重感染、溺水、肺挫傷和肺栓塞等;間接因素包括敗血癥、大量輸血、外傷、胰腺炎、脂肪栓塞和體外循環(huán)等[2]。目前ALI 的發(fā)病機制尚未闡明,積極探索ALI 發(fā)生發(fā)展中的具體作用機制具有重要臨床意義。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一種RNA 聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄生成的類似信使RNA( mRNA )的新型轉(zhuǎn)錄物,其長度通常大于200 個核苷酸且不具備編碼蛋白質(zhì)的能力,可通過充當競爭性內(nèi)源 RNA(ceRNA) ,在細胞增殖、細胞凋亡及氧化應(yīng)激等細胞過程中發(fā)揮重要作用[3]。最新研究[4]發(fā)現(xiàn),脂多糖(LPS)誘導(dǎo)的ALI 模型小鼠肺組織lncRNA 表達上調(diào)者78 個、表達下調(diào)者21 個,說明lncRNA 可能在ALI 的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用?,F(xiàn)就lncRNA 在ALI 發(fā)生發(fā)展中的作用及分子調(diào)控機制研究進展綜述如下,旨在為后續(xù)ALI治療藥物的研發(fā)提供參考。
LncRNA 通過與調(diào)節(jié)蛋白、miRNA 或其他細胞因子相互作用來發(fā)揮其生物學功能。既往研究[4]發(fā)現(xiàn),與健康對照者相比,ALI 中存在著較多差異表達lncRNA。 其中l(wèi)ncRNA 核富集豐富轉(zhuǎn)錄物 1(NEAT1)、lncRNA HOX 轉(zhuǎn) 錄 反 義 基 因 間RNA(HOX antisense intergenic RNA,HOTAIR)、lncRNA牛 磺 酸 上 調(diào)1(Taurine up-regulated 1,TUG1)、lncRNA 小核仁RNA 宿主基因(SNHG)、lncRNA 癌癥易感性候選物(CASC)、lncRNA X 失活特異性轉(zhuǎn)錄本 (XIST)及l(fā)ncRNA 轉(zhuǎn)移相關(guān)肺腺癌轉(zhuǎn)錄物 1(MALAT1)等lncRNA,可作為競爭性內(nèi)源 RNA(ceRNA),與微小RNA(miRNA)結(jié)合,調(diào)控下游相關(guān)蛋白的表達,參與ALI的發(fā)生發(fā)展。
1.1 LncRNA NEAT1 在ALI 發(fā)生發(fā)展中的作用lncRNA NEAT1 與炎癥性疾病的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。研究[5]發(fā)現(xiàn),膿毒癥患者外周血單個核細胞(PBMCs)中NEAT1 表達上調(diào),高表達的 NEAT1 與膿毒癥患者的病情嚴重程度和不良預(yù)后呈正相關(guān),在高表達的 NEAT1膿毒癥診斷的靈敏度及特異度均較高,但NEAT1 在膿毒癥ALI發(fā)生發(fā)展中的具體作用機制仍不明確。研究[6]發(fā)現(xiàn),LPS處理后小鼠肺組織或巨噬細胞(MH-S)細胞中均存在lncRNA NEAT1,敲低NEAT1 可促進肺組織miR-182-5p 表達、降低MH-S細胞中的Wnt1誘導(dǎo)的信號通路蛋白1(WISP1)含量,恢復(fù)細胞活力,抑制細胞凋亡和炎癥。另有研究[7]發(fā)現(xiàn),在LPS 處理后的人肺支氣管上皮BEAS-2B 細胞中 NEAT1 和Rho 關(guān)聯(lián)含卷曲螺旋結(jié)合蛋白激酶1(Rock1)蛋白 表達水平增加、miR-26a-5p 表達降低。沉默NEAT1 基因可以通過靶向 miR-26a-5p 抑制ROCK1 表達,逆轉(zhuǎn)LPS 導(dǎo)致的BEAS-2B 細胞的焦亡;同時,miR-26a-5p 抑制劑可抵消NEAT1 對細胞死亡和細胞焦亡的抑制作用,而ROCK1 上調(diào)同樣降低了 miR-26a-5p 過表達對細胞死亡和細胞焦亡產(chǎn)生的抑制作用;說明過表達NEAT1 可以通過miR-26a-5p/ROCK1 軸來增強 LPS 誘導(dǎo)的細胞死亡和細胞焦亡,從而加重ALI。
1.2 LncRNA HOTAIR 在ALI 發(fā)生發(fā)展中的作用及作用機制 HOTAIR 是一種剪接的多腺苷酸化lncRNA,由哺乳動物HOXC(同源框轉(zhuǎn)錄因子C)基因座反義鏈轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生,是首個被發(fā)現(xiàn)的具有反式調(diào)控作用的lncRNA[8],其主要通過調(diào)節(jié)細胞周期來調(diào)控人類腫瘤的發(fā)生發(fā)展。研究[9]發(fā)現(xiàn),在盲腸結(jié)扎穿孔(CLP )誘導(dǎo)的敗血癥小鼠模型中,高表達的lncRNA HOTAIR 可以充當 miR-211 海綿來抑制單核細胞增殖,同時促進單核細胞凋亡和炎癥反應(yīng)導(dǎo)致小鼠膿毒癥的形成。在LPS 誘導(dǎo)ALI 模型中,HOTAIR在人非小細胞肺癌細胞系A(chǔ)549和BEAS-2B細胞中高表達,HOTAIR 可能通過抑制miR-17-5p 表達介導(dǎo)了自噬效應(yīng)蛋白1( Beclin-1)、微管相關(guān)蛋白輕鏈 3 (LC3)、自噬相關(guān)蛋白5(ATG5)和ATG7、ATG16 等自噬蛋白的表達,抑制HOTAIR 可在進入S 期之前將細胞阻滯在G0/G1期,減輕LPS 誘導(dǎo)的細胞自噬、細胞凋亡,緩解LPS導(dǎo)致的肺損傷[10]。
1.3 LncRNA TUG1 在ALI 發(fā)生發(fā)展中的作用 作為內(nèi)源性競爭性RNA,lncRNA通過海綿吸附作用抑制miRNA 表達,間接調(diào) 控miRNA 下游mRNA 的表達。TUG1 是一種位于染色體 22q12 的內(nèi)源性競爭性lncRNA,其在ALI中表達下調(diào),促進TUG1 的表達通過抑制 miR-34b-5p 和促進 GRB2 關(guān)聯(lián)結(jié)合蛋白1(GAB1)表達改善膿毒癥引起的肺損傷,同時抑制促炎細胞因子的分泌和細胞凋亡,lncRNA TUG1 也可通過靶向抑制 miR-33b-5p 發(fā)揮同樣作用[11]。此外,人們發(fā)現(xiàn)激活lncRNA TUG1 基因可通過抑制miR-494/丙酮酸脫氫酶激酶同工酶4(PDK4)表達改善小鼠的肺組織形態(tài),降低肺損傷評分,同時減弱肺毛細血管內(nèi)皮細胞的損傷,增強了肺的抗炎和抗凋亡功能[12]。
1.4 LncRNA SNHG 在ALI 發(fā)生發(fā)展中的作用SNHG 是存在于細胞核和細胞質(zhì)中的snoRNA 的宿主基因,迄今為止共發(fā)現(xiàn)22 個SNHG 家族成員[13]。其中SNHG14、SHNG16 及SNHG5 等亞型與炎癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。在LPS處理的肺泡Ⅱ型上皮細胞中,lncRNA SNHG14 基因表達上調(diào),過表達的lncRNA-SNHG14 可作為競爭性內(nèi)源RNA,抑制miR-223-3p 表達以介導(dǎo)miR-223-3p 靶標叉頭轉(zhuǎn)錄因子Foxo3a 的表達,誘導(dǎo)細胞過度自噬,從而加重細胞損傷[14];在LPS 誘導(dǎo)建立的小鼠體內(nèi)和體外A549 細胞ARDS 模型中,SNHG5 的上調(diào)或miR-205的下調(diào)通過調(diào)節(jié)含銅代謝域(COMMD1)來改善LPS誘導(dǎo)的A549 細胞的活力,減輕ARDS 小鼠的肺損傷[15];低表達SNHG16 通過miR-146a-5p 與趨化因子CCL5 競爭性結(jié)合,進一步介導(dǎo)c-Jun N-末端激酶(JNK)通路和核因子(NF)-κB 通路改善WI-38 細胞中LPS 誘導(dǎo)的炎癥損傷[16],多種亞型的SNHG 基因在肺損傷中發(fā)揮重要作用,為ALI 的診斷和治療提供了新的思路。
1.5 LncRNA CASC在ALI發(fā)生發(fā)展中的作用 CASC是一類與腫瘤密切相關(guān)的長鏈非編碼RNA,其在腫瘤組織中差異表達,主要亞型包括1、2、9、11 等,其中2、9 亞型發(fā)現(xiàn)與肺部炎癥關(guān)系密切。在LPS 刺激的 人肺泡上皮細胞(HPAEpiC 細胞)中CASC2 和PDK4 表達被抑制,CASC2 的過表達通過海綿吸附miR-152-3p 靶向促進PDK4 分泌從而減輕LPS 導(dǎo)致的HPAEpiC 細胞細胞活力下降、細胞凋亡、炎癥和氧化損傷,改善了LPS 誘導(dǎo)的HPAEpiC 損傷[17]。除此之外,人們發(fā)現(xiàn)lncRNA CASC9 也可通過調(diào)節(jié)PDK4的表達來改善肺損傷,在體外用LPS處理的人小氣道上皮細胞 (HSAEC)建立的肺損傷模型中,發(fā)現(xiàn)lncRNA CASC9 的上調(diào)通過抑制miR-195-5p 表達促進PDK4分泌來改善肺損傷[18]。
1.6 LncRNA XIST 在ALI 發(fā)生發(fā)展中的作用 lncRNA X 失活特異性轉(zhuǎn)錄本 (XIST)是一種新的參與調(diào)節(jié)ALI 過程的基因,在LPS 處理的小鼠肺上皮細胞(MLE-12)細胞和小鼠中,XIST、絲裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)表達上調(diào),同時miR-132-3p 表達被抑制,XIST 充當miR-132-3p 分子海綿來間接調(diào)控MAPK14的表達,抑制XIST表達可以激活miR-132-3p表達、減少MAPK14分泌,減少下游Bcl-2、IL-1β、IL-6和腫瘤壞死因子α(TNF-α)的釋放來減輕細胞損傷[19]。研究[20]發(fā)現(xiàn),經(jīng)LPS 誘導(dǎo)的小鼠ALI 肺組織中miR-448-5p顯著低表達,而XIST和高遷移率族的蛋白2(HMGB2)高表達,其通路可能是XIST 競爭性抑 制miR-448-5p 并 減少miR-448-5-p 與HMGB2 的結(jié)合,從而上調(diào)HMGB2 表達,最終導(dǎo)致小鼠ALI。研究XIST 及其下游靶標可能有助于開發(fā)治療肺炎急性期的新療法。
1.7 LncRNA MALAT1在ALI發(fā)生發(fā)展中的作用MALAT1 是一種長度超過8 000 nt 的非蛋白編碼RNA (lncRNA)。作為一種重要的多功能基因表達調(diào)節(jié)因子,MALAT1不僅參與腫瘤的進展,還與免疫反應(yīng)相關(guān)[21]。LPS 誘導(dǎo)的MLE-12 細胞和ALI 小鼠肺組織中,MALAT1、轉(zhuǎn)錄因子PAX6 和鋅指E-盒結(jié)合同源盒2(ZEB2)表達升高,miR-129-5p表達降低,下調(diào)MALAT1 可減少ALI 小鼠的肺水腫、炎性細胞因子水平、肺損傷和細胞凋亡。miR-129-5p 抑制或PAX6-oe 逆轉(zhuǎn)了低表達MALAT1 對ALI 的保護作用;MALAT1 通 過miR-129-5p/PAX6/ZEB2 軸加 重敗血癥誘導(dǎo)的ALI[22]。此外,MALAT1 還可以作為一種潛在的生物學標志物來預(yù)測ARDS 的預(yù)后,其表達水平與ARDS疾病的嚴重程度正相關(guān)[23]。
1.8 其他LncRNA 在ALI 發(fā)生發(fā)展中的作用 如lncRNA OIP5-AS1 在ALI/ARDS 患者和經(jīng)LPS 處理的人肺微血管內(nèi)皮細胞(HPMEC)血清中上調(diào),而miR-223 下調(diào)。OIP5-AS1 的敲低和miR-223 過表達可誘導(dǎo)細胞增殖并抑制 LPS 處理的 HPMEC 的細胞凋亡、細胞焦亡、炎癥反應(yīng)和氧化應(yīng)激,減輕體內(nèi)LPS誘導(dǎo)的ALI/ARDS[24];然而另一篇研究[25]得到了完全相反的結(jié)論,他們發(fā)現(xiàn)OIP5-AS1和沉默調(diào)節(jié)蛋白1 (Sirtuin1,SIRT1)在CLP或LPS引發(fā)的膿毒癥模型中下調(diào),而 miR-128-3p表達上調(diào)。OIP5-AS1過表達抑制NF-κB、誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(iNOS)、IL-1β、TNF-α 和IL-6 在細胞中的表達,而miR-128-3p 過表達導(dǎo)致相反的現(xiàn)象。從機制上講是OIP5-AS1 過表達可通過miR-128-3p/Sirtuin-1 軸改善大鼠模型中膿毒癥誘導(dǎo)的肺損傷,OIP5-AS1 的研究有助于對急性肺損傷治療產(chǎn)生新的認識。另外lncRNA PFI 的表達水平也與ALI嚴重程度密切相關(guān),PFI過表達可通過調(diào)節(jié)miR-328-3p 和環(huán)腺苷酸反應(yīng)原件結(jié)合蛋白Creb1 的表達來減輕博來霉素誘導(dǎo)的Ⅱ型肺泡上皮細胞損傷[26]。
lncRNA 的表達異常與ALI 的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),其介導(dǎo)的蛋白表達涉及多種機制。lncRNA 可能在表觀遺傳水平、轉(zhuǎn)錄和/或轉(zhuǎn)錄后水平,調(diào)控ALI的發(fā)生發(fā)展。
2.1 LncRNA 在表觀遺傳水平調(diào)控ALI 的發(fā)生發(fā)展 lncRNA 可以通過招募染色質(zhì)修飾因子來激活或失活不同的基因座,主要形式包括DNA 甲基化、組蛋白修飾等[27]。DNA 甲基化是胞嘧啶(5-甲基胞嘧啶,5mC)第五個碳的甲基修飾,通常由DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶 (DNMT)來實現(xiàn)甲基化,DNMT 包含三個成員:DNMT1、DNMT3A 和DNMT3B[28];其中DNMT3A和 DNMT3B 對于起始DNA 甲基化至關(guān)重要,而 DNMT1多用于DNA復(fù)制過程中甲基化的維持;lncRNA可以募集DNMT1至基因啟動子區(qū)域,使啟動子區(qū)域去甲基化或高甲基化,進而促進和(或)抑制基因表達。組蛋白與DNA 一起構(gòu)成染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)。組蛋白的乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化等翻譯后修飾是已知的表觀遺傳機制,可通過調(diào)節(jié)染色質(zhì)壓實度來調(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達;lncRNA 可以作為分子向?qū)Щ蚍肿又Ъ軄碚心级嗍岬鞍讖?fù)合體2(PRC2)參與到組蛋白甲基化進程,最終參與ALI 的發(fā)生發(fā)展[29]。
2.2 LncRNA 在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控ALI的發(fā)生發(fā)展 多數(shù)基因的轉(zhuǎn)錄涉及近端啟動子與更遠的增強子元件的相互作用。增強子通常位于距離轉(zhuǎn)錄起始位點(TSS)很遠的地方,并結(jié)合具有調(diào)節(jié)差異基因表達功能的組織特異性轉(zhuǎn)錄因子[30]。LncRNA 可以通過組裝轉(zhuǎn)錄激活因子和抑制因子來調(diào)節(jié)RNA 聚合酶II 的轉(zhuǎn)錄起始,從而充當轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子;lncRNAs 還可能通過募集染色質(zhì)修飾酶參與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的調(diào)節(jié),從而導(dǎo)致大量基因的表達或抑制。例如H19 通過募集染色質(zhì)修飾劑參與了蛋白的調(diào)節(jié),lncRNA H19 的上調(diào)抑制了TNF-α、IL-6、IL-17、caspase-3、caspase-9 和凋亡蛋白(Bax),同時通過抑制肺細胞凋亡和炎癥減輕膿毒癥引起的ALI[31]。
2.3 LncRNA在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控ALI的發(fā)生發(fā)展 在轉(zhuǎn)錄后水平,lncRNA 可能與多種RNA 結(jié)合蛋白(RBP)相互作用,導(dǎo)致mRNA 穩(wěn)定性、剪接、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和亞細胞定位發(fā)生變化[32]。lncRNA 通過與剪接因子的相互作用來調(diào)節(jié)基因剪接,其中高等真核生物可利用pre-mRNA 的可變剪接來實現(xiàn)更高的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組復(fù)雜性[33]。某些早期基因,例如c-Jun 和c-Myc 的半衰期非常短。在c-Myc 存在的情況下,mRNA 轉(zhuǎn)換是轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的主要機制是mRNA,部分是通過3'-非翻譯區(qū)(3'-UTR) 中的AU富集元件(ARE)和ARE 結(jié)合因子,Linc-RoR 與hnRNP I 和/或AUF1 的相互作用會影響c-Myc 穩(wěn)定性,Linc-RoR 參與了特定基因如c-Myc 的mRNA 穩(wěn)定性的選擇性調(diào)節(jié)[34]。
綜上所述,lncRNA NEAT1 可通過抑制肺組織miR-26a-5p 表達,提高肺組織WISP1 表達,抑制Rock1 表達,促進支氣管上皮細胞的死亡和焦亡,促進ALI 的發(fā)生發(fā)展;lncRNA HOTAIR 可通過抑制miR-17-5p 表達,抑制Beclin-1、LC3 及ATG5 等自噬蛋白表達,阻滯細胞周期在G0/G1期,緩解LPS 導(dǎo)致的肺損傷;lncRNA TUG1 可通過抑制miR-34b-5p、miR-33b-5p 及miR-494 表達,抑制肺上皮細胞的凋亡,減輕肺組織損傷;lncRNA SNHG 可抑制miR-223-3p、miR-34c-3p 表達,抑制肺組織的炎癥反應(yīng);lncRNA CASC 可通過miR-152-3p 靶向抑制表達丙酮酸脫氫酶激酶同工酶4表達,減輕細胞活力下降、細胞凋亡、炎癥和氧化損傷程度;lncRNA XIST 可通過miR-93/IRAK4/NF-κB、miR-93/IL-6R/STAT3 信號通路,促進肺部的炎癥反應(yīng);lncRNA MALAT1 可通 過 miR-129-5p/PAX6/ZEB2 軸 、miR-17-5p/FOXA1軸,促進肺組織的細胞凋亡,促進ALI的發(fā)生發(fā)展。lncRNA 有可能成為ALI 發(fā)診斷和治療標志物。lncRNAs 可抑lncRNAs 可以與微小RNA、信使RNA 或蛋白質(zhì)結(jié)合,在表觀遺傳水平、轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平參與ALI的發(fā)生發(fā)展。