限制酶的命名,1973年由Smith和Nathans提出:用屬名的頭1個(gè)字母和種名的頭2個(gè)字母,組成3個(gè)字母的略語(yǔ),表示寄主菌的物種名稱(chēng);如有菌株名,再加上一個(gè)字母,即第4個(gè)字母表示菌株; 1種特殊的菌株,具有幾個(gè)不同的限制與修飾體系,則以羅馬數(shù)字表示在該菌株中發(fā)現(xiàn)某種酶的先后次序。例如:EcoR I, 第1個(gè)大寫(xiě)字母E為大腸桿菌Escherichiacoli的屬名的第1個(gè)字母;第2、3兩個(gè)小寫(xiě)字母co為其種名的2個(gè)字母;第4個(gè)字母大寫(xiě)R表示所用大腸桿菌的菌株編號(hào)。再如,流感嗜血菌(Haemophilusinfluenzae)用Hin表示。例如,從流感嗜血桿菌d株(Haemophilusinfluenzadd)中先后分離到3種限制酶,則分別命名為Hind I、Hind Ⅱ和Hind Ⅲ。
限制性?xún)?nèi)切酶符號(hào)前3個(gè)字母為其來(lái)源菌株的拉丁名縮寫(xiě)形式,根據(jù)現(xiàn)有的外文字符使用規(guī)范,“生物學(xué)中屬以下(含屬)的拉丁文學(xué)名要用斜體字母”表示,所以,前3個(gè)字母用斜體形式編排。第4個(gè)字母表示菌株,一般表示菌株的字母都用正體形式。
DNA聚合酶是PCR反應(yīng)的重要工具。同限制性?xún)?nèi)切酶命名方法類(lèi)似,耐熱DNA聚合酶也與其來(lái)源菌名稱(chēng)有關(guān)。例如:TaqDNA聚合酶、PfuDNA聚合酶、TthDNA聚合酶等,前3個(gè)字母都是表示來(lái)源于生物的,第1個(gè)字母是其來(lái)源生物的屬名的首字母,第2、3個(gè)字母是其種名前的2個(gè)字母。因此,這3個(gè)字母都應(yīng)該用斜體,并且首字母要用大寫(xiě);因?yàn)門(mén)aqDNA聚合酶是從一種水生棲熱菌(Thermusaquaticus)yT1株分離提取的,PfuDNA聚合酶是來(lái)自耐熱菌Pyrococcusfuriosus的一種DNA聚合酶,TthDNA聚合酶是來(lái)自嗜熱細(xì)菌Thermusthermophilus的一種DNA聚合酶。