黃稚清, 吳林源, 高筱鈺, 丁釋豐, 馮志堅(jiān)*, 秦新生, 劉奕彤,肖觀康

基于SSR標(biāo)記的紫花風(fēng)鈴木群體遺傳多樣性分析

黃稚清1,2, 吳林源1,3, 高筱鈺1, 丁釋豐1, 馮志堅(jiān)1*, 秦新生1, 劉奕彤2,肖觀康1

(1. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院，廣州 510642；2. 廣東生態(tài)工程職業(yè)學(xué)院生態(tài)工程學(xué)院，廣州 510520；3. 廣東職業(yè)技術(shù)學(xué)院輕工與材料學(xué)院，廣東 佛山 528041)

為揭示紫花風(fēng)鈴木()的群體遺傳變異特征，對(duì)廣東省6市12個(gè)群體72份種質(zhì)材料進(jìn)行遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明，9對(duì)引物共擴(kuò)增出123個(gè)等位基因位點(diǎn)，引物的平均多態(tài)信息量為0.754，具有較高的多態(tài)性。12個(gè)群體均具有較高的遺傳多樣性，群體間平均有效等位基因數(shù)為3.272個(gè)，平均Shannon指數(shù)為1.159。AMOVA分析表明群體間遺傳分化程度相對(duì)較低，群體內(nèi)遺傳分化程度較高。群體的總體遺傳分化系數(shù)為0.077，處于中等程度?；赟tructure分析、主坐標(biāo)分析和NJ聚類(lèi)分析均可將12個(gè)群體分為2大類(lèi)群，分組結(jié)果具有一定相似性，表明供試紫花風(fēng)鈴木群體遺傳結(jié)構(gòu)較為簡(jiǎn)單。這為紫花風(fēng)鈴木優(yōu)良種質(zhì)資源的利用、遺傳變異和科學(xué)育種提供了理論參考。

紫花風(fēng)鈴木；遺傳多樣性；SSR標(biāo)記；遺傳結(jié)構(gòu)

紫花風(fēng)鈴木()是紫葳科(Bignoniaceae)風(fēng)鈴木屬落葉喬木，原產(chǎn)于南美和中美地區(qū)，可作為用材樹(shù)種和觀賞樹(shù)種。盛花期時(shí)觀賞效果極佳，花量大，花色多樣[1–3]。自20世紀(jì)70年代引入我國(guó)，紫花風(fēng)鈴木常被用作行道樹(shù)、庭院樹(shù)、園林觀花樹(shù)種且表現(xiàn)良好[4–5]。但目前, 我國(guó)紫花風(fēng)鈴木園林應(yīng)用具有如下問(wèn)題：一是引種來(lái)源較為復(fù)雜，前人研究已發(fā)現(xiàn)我國(guó)園林栽培種中存在紫花風(fēng)鈴木和紅花風(fēng)鈴木的雜交種[6]以及種質(zhì)資源和命名混亂的情況[7]。二是紫花風(fēng)鈴木良種選育工作比較滯后，園林應(yīng)用中可觀測(cè)到不同個(gè)體在觀賞效果上的差異，有的個(gè)體花量小、花色不顯著, 群植時(shí)花期不統(tǒng)一。因此亟待開(kāi)展紫花風(fēng)鈴木的遺傳多樣性研究，有助于推動(dòng)繁育和保存紫花風(fēng)鈴木優(yōu)質(zhì)種質(zhì)資源工作的開(kāi)展，同時(shí)為優(yōu)質(zhì)種質(zhì)創(chuàng)新提供支撐，提升景觀觀賞效果。

目前關(guān)于紫花風(fēng)鈴木的研究主要集中在栽種、觀賞性、抗逆性等研究[8–14]，關(guān)于分子水平遺傳多樣性在風(fēng)鈴木類(lèi)中開(kāi)展較多，單以紫花風(fēng)鈴木作為研究對(duì)象開(kāi)展研究較少。對(duì)風(fēng)鈴木類(lèi)植物的DNA分子水平遺傳多樣性的探究，已采用多種分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)風(fēng)鈴木類(lèi)植物進(jìn)行分類(lèi)與鑒別[6–7]和遺傳多樣性差異分析，如單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)位點(diǎn)結(jié)合測(cè)序基因分型技術(shù)(genotyping-by-sequencing, GBS)、葉綠體L-F、C序列分子遺傳分析、簡(jiǎn)單重復(fù)序列(simplesequence repeats, SSR)分子標(biāo)記[15]和區(qū)間簡(jiǎn)單重復(fù)序列(inter simple sequence repeats, ISSR)分子標(biāo)記[16]等。

在分子標(biāo)記技術(shù)中，SSR分子標(biāo)記技術(shù)因具有高靈活性、成本低、易推廣、多態(tài)性豐富、重復(fù)性好的優(yōu)勢(shì)而得到廣泛應(yīng)用[18–19]。SSR又叫微衛(wèi)星DNA，SSR的產(chǎn)生是在DNA復(fù)制或修復(fù)過(guò)程中DNA滑動(dòng)和錯(cuò)配或者有絲分裂、減數(shù)分裂姐妹染色單體不均等交換的結(jié)果，具有較高的物種特異性[20–21]。SSR分子標(biāo)記技術(shù)目前已廣泛應(yīng)用于植物的種群遺傳學(xué)、遺傳圖譜構(gòu)建、指紋分析等研究領(lǐng)域[19–21]。當(dāng)前國(guó)內(nèi)還沒(méi)有針對(duì)紫花風(fēng)鈴木進(jìn)行基于SSR標(biāo)記的群體遺傳多樣性研究, 因此本文利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)廣東省內(nèi)6市12個(gè)群體的紫花風(fēng)鈴木進(jìn)行遺傳多樣性分析研究, 探究其遺傳多樣性豐富度、遺傳結(jié)構(gòu)以及類(lèi)群的劃分，為紫花風(fēng)鈴木優(yōu)良種質(zhì)資源的保存和優(yōu)質(zhì)繁育提供理論依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 材料

紫花風(fēng)鈴木()材料采自廣東省6市12個(gè)群體，共72份，來(lái)源于同一個(gè)采樣地的樣本為1個(gè)群體(表1)。于2020—2021年采集樣本，采集新鮮葉片后，放入-80 ℃冰箱保存。

1.2 DNA提取與引物擴(kuò)增

風(fēng)鈴木葉片中含有較多多糖和多酚物質(zhì)[22]，為減少DNA提取時(shí)多糖和多酚的干擾，參考周仙莉等[23]的改良CTAB法提取DNA, 然后用1.5%瓊脂糖凝膠電泳和核酸檢測(cè)儀檢測(cè)DNA質(zhì)量和濃度, 后保存于4 ℃冰箱中待用。

選取同屬植物的30對(duì)引物(mTb002～ mTb052)[24]和紫葳科印葉藤屬植物的28對(duì)引物(Stiz2～Stiz45)[25]，共計(jì)58對(duì)引物進(jìn)行聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction, PCR)擴(kuò)增。所用引物由生工生物工程(上海)股份有限公司提供。隨機(jī)選取8個(gè)樣本進(jìn)行引物的特異性和多態(tài)性篩選，最終篩選出9對(duì)雜帶較少、主帶清晰、多態(tài)性較好、條帶差異明顯的SSR引物進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)(表2)。

采用熒光標(biāo)記法進(jìn)行基因分型，在每對(duì)引物的5′端標(biāo)記熒光染料。PCR反應(yīng)體系為30L，包含2×SanTaq PCR Master Mix 15L，正、反向引物(10mol/L)各1L，模板DNA (50 ng/L) 1L, ddH2O 12L。PCR擴(kuò)增程序?yàn)?5 ℃預(yù)變性5 min，然后95 ℃變性30 s，57 ℃復(fù)性90 s，72 ℃延伸30 s, 共28個(gè)循環(huán)，最后72 ℃延伸30 min，擴(kuò)增產(chǎn)物于4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

表1 紫花風(fēng)鈴木群體信息

表2 紫花風(fēng)鈴木的SSR引物

1.3 數(shù)據(jù)整理與分析

利用Genemaker v2.2.0軟件對(duì)基因分型結(jié)果進(jìn)行判讀，按引物預(yù)期擴(kuò)增長(zhǎng)度范圍讀出符合條件的數(shù)值并進(jìn)行整理。利用GenAlEx 6.5進(jìn)行遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)、分子變異方差檢驗(yàn)分析(analysis of molecular variance, AMOVA)和主坐標(biāo)分析(principal coordinates analysis, PCoA)。利用Structure 2.3.4軟件對(duì)群體進(jìn)行遺傳結(jié)構(gòu)分析，并用Structure Harvester計(jì)算△K和LnP(D)，從而計(jì)算出最佳群體數(shù)目(K值)。利用PowerMaker 3.25計(jì)算多態(tài)性信息量(polymorphism information content, PIC)和計(jì)算Nei’s遺傳距離和遺傳一致度，并使用MEGA X 10.1進(jìn)行鄰接聚類(lèi)分析(neighboring-joining clustering analysis, NJ聚類(lèi))。

2 結(jié)果和分析

2.1 群體遺傳多樣性分析

2.1.1 SSR位點(diǎn)多態(tài)性

從表3可見(jiàn)，9對(duì)引物在72份材料中檢測(cè)出123個(gè)等位基因，觀測(cè)等位基因數(shù)(N)和有效等位基因數(shù)(N)分別為6.000～22.000和2.317～12.314，均值分別為13.667和6.072。Shannon指數(shù)()為1.133～2.519，平均為1.964，遺傳多樣性較為豐富。平均觀測(cè)雜合度(H)和期望雜合度(H)分別為0.310和0.775?；蛄?N)為0.519～1.611，平均為0.941。

2.1.2 群體遺傳多樣性分析

從表4可見(jiàn)，群體間的平均N為3.272個(gè),其中jm群體的最大，hd群體最?。粸?.448～ 1.630，平均為1.159，最大、最小的群體分別為jm和hd，與N的一致；H為0.292～0.734，H為0.222～ 0.389。

表3 9對(duì)SSR引物的遺傳多樣性參數(shù)

表4 紫花風(fēng)鈴木的群體遺傳多樣性

sf、fs、zc、ns、th、ld、hn、jl、xm、jm、hd、zs見(jiàn)表1;N、N、、H、H見(jiàn)表3; 下同

sf, fs, zc, ns, th, ld, hn, jl, xm, jm, hd, zs see Table 1. N,N,,H,Hsee Table 3. The same below

2.1.3 群體遺傳分化和AMOVA分析

AMOVA分析表明(表5)，紫花風(fēng)鈴木群體間的遺傳變異僅占8%，而大部分遺傳變異發(fā)生在群體內(nèi)(92%)，說(shuō)明紫花風(fēng)鈴木群體間結(jié)構(gòu)弱，群體間遺傳分化程度相對(duì)較低，群體內(nèi)遺傳分化程度相對(duì)較高。從表6可見(jiàn)，紫花風(fēng)鈴木群體間的分化系數(shù)(st)為0.077，居于0.050～0.150，表明所有樣本的遺傳分化有7.7%來(lái)自群體間，有92.3%來(lái)自群體內(nèi)部，其結(jié)果與反映的結(jié)果一致。來(lái)自群體內(nèi)近交系數(shù)(is)是0.574，群體間近交系數(shù)(it)為0.607。

表5 紫花風(fēng)鈴木群體的AMOVA分析

2.2 遺傳結(jié)構(gòu)分析

2.2.1 群體結(jié)構(gòu)分析

用Structure軟件中基于貝葉斯聚類(lèi)方法對(duì)紫花風(fēng)鈴木群體的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行初步分析(圖1)，當(dāng)K=2時(shí)最佳。此時(shí)可將12個(gè)紫花風(fēng)鈴木群體分為2個(gè)不同類(lèi)群(圖2)。其中類(lèi)群1包括sf、ld、zc、zs共4個(gè)群體，彼此之間遺傳背景較為相似，尤其是ld和zs結(jié)合前文簡(jiǎn)要收集的形態(tài)學(xué)信息也觀察到這2個(gè)群體表型性狀較接近；類(lèi)群2包括ns、th、hn、jl、xm、jm、hd和fs共8個(gè)群體。

2.2.2 群體主坐標(biāo)分析(PCoA)

主坐標(biāo)分析大致將紫花風(fēng)鈴木群體分為2個(gè)類(lèi)群，類(lèi)群A有sf、ld、zs、zc群體，類(lèi)群B有ns、th、hn、hd、fs群體，而jm、jl、xm群體的個(gè)體分散在A、B類(lèi)群中，但大多數(shù)個(gè)體分布在類(lèi)群B中(圖3)。主坐標(biāo)分析中個(gè)體位置越近說(shuō)明親緣關(guān)系較近，紫花風(fēng)鈴木不同群體的個(gè)體間存在相互交叉, 說(shuō)明來(lái)自不同群體的個(gè)體間可能存在較近的親緣關(guān)系。主坐標(biāo)分析結(jié)果與Structure結(jié)構(gòu)分析的結(jié)果基本一致，在Structure結(jié)構(gòu)分析中jm、jl、xm則與ns、th、hn、hd、fs群體歸屬一類(lèi)。但結(jié)合形態(tài)學(xué)特征來(lái)看，類(lèi)群與形態(tài)特征之間并沒(méi)有明顯的關(guān)系，不同形態(tài)特征的群體被分為同一類(lèi)。

圖1 基于△K=mean(|L*(K)|)/sd(L(K))準(zhǔn)則選擇K值

圖2 紫花風(fēng)鈴木群體的遺傳結(jié)構(gòu)圖

2.2.3 群體聚類(lèi)分析

應(yīng)用NJ聚類(lèi)法對(duì)12個(gè)紫花風(fēng)鈴木群體基于Nei’s遺傳距離進(jìn)行群體聚類(lèi)分析，可劃分為2個(gè)類(lèi)群(圖4)，第一類(lèi)包括sf、ld、zs、zc、xm、jl、jm群體，來(lái)自佛山、廣州、中山、深圳和江門(mén)；第二類(lèi)包括ns、th、hn、hd、fs，來(lái)自廣州、惠州和佛山。這與Structure結(jié)構(gòu)分析和主坐標(biāo)分析的結(jié)果相近,均可被分為2個(gè)群體。xm、jl、jm這3個(gè)群體在不同的分析方法中歸在不同的類(lèi)群里，說(shuō)明紫花風(fēng)鈴木遺傳距離與地理距離之間可能無(wú)顯著相關(guān)性。

3 結(jié)論和討論

生物的遺傳多樣性是物種多樣性和生態(tài)系統(tǒng)多樣性的基礎(chǔ)，也是生物多樣性的基礎(chǔ)。一般情況下，狹義遺傳多樣性側(cè)重于描述物種之間的遺傳變異。豐富的遺傳多樣性是物種適應(yīng)環(huán)境變化的物質(zhì)基礎(chǔ), 物種為了適應(yīng)環(huán)境變化而進(jìn)化, 遺傳變異與進(jìn)化相伴相生。變異的豐富度越大意味著物種的遺傳多樣性越高, 表明物種適應(yīng)能力越強(qiáng)。評(píng)價(jià)物種遺傳多樣性水平，可以從形態(tài)學(xué)或DNA分子等角度切入研究[26–27]，而隨著分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展, 其在物種鑒定、種群遺傳多樣性研究及物種起源等方面得到了廣泛的應(yīng)用[28]。相比于使用形態(tài)學(xué)評(píng)價(jià)遺傳多樣性，DNA分子水平分析受環(huán)境影響較小，穩(wěn)定性高，結(jié)果更為可靠[29]。而群體遺傳多樣性主要分析和把握群體內(nèi)和群體間的遺傳多樣性分布情況，可以用來(lái)衡量種群的數(shù)量變化、遺傳變異、生態(tài)習(xí)性等情況[26–27,30–31]。

圖3 紫花風(fēng)鈴木群體的主坐標(biāo)分析。黃色和藍(lán)色圓圈分別為類(lèi)群A和類(lèi)群B。

圖4 基于Nei’s遺傳距離的紫花風(fēng)鈴木群體的NJ聚類(lèi)分析

對(duì)紫花風(fēng)鈴木遺傳多樣性開(kāi)展DNA分子水平研究，能為科學(xué)利用和培育優(yōu)良紫花風(fēng)鈴木品種提供更多的參考。目前已經(jīng)有多種分子標(biāo)記技術(shù)在風(fēng)鈴木類(lèi)植物中應(yīng)用于遺傳多樣性研究，葉綠體L-F和C序列標(biāo)記和SNP分子標(biāo)記用于對(duì)風(fēng)鈴木類(lèi)樹(shù)種進(jìn)行分子水平的鑒種和分類(lèi)，糾正采集樣本中風(fēng)鈴木類(lèi)樹(shù)種同名異物或異物同名的問(wèn)題，同時(shí)也表明紫花風(fēng)鈴木遺傳多樣性較為豐富，種下變異較多[6–7]。Collevatti等[15]對(duì)分布在巴西Altamiro de Moura Pacheco生態(tài)公園的4種風(fēng)鈴木植物進(jìn)行SSR分子標(biāo)記研究，采集了75個(gè)紫花風(fēng)鈴木的樣本,平均H和H分別為0.857和0.703，結(jié)合種群結(jié)構(gòu)分析表明紫花風(fēng)鈴木具有較高的遺傳多樣性, 但多態(tài)性水平較低。Alves等[16]采用8對(duì)ISSR引物對(duì)巴西A?u國(guó)家森林公園內(nèi)30個(gè)紫花風(fēng)鈴木樣本進(jìn)行研究，共檢測(cè)出62個(gè)等位基因位點(diǎn)，為0.34～ 0.49，平均為0.43，表明ISSR標(biāo)記的多態(tài)性為中等，能有效反映紫花風(fēng)鈴木的遺傳多樣性。同時(shí)，當(dāng)Nei’s遺傳距離為0.70時(shí)可將30份樣本劃分成12個(gè)群體，但Shannon指數(shù)僅為0.52，說(shuō)明多樣性指數(shù)較低。

一般認(rèn)為>0.5時(shí)該標(biāo)記是高度多態(tài)的；為0.25～0.5時(shí)具有中度多態(tài)；<0.25時(shí)為低多態(tài)性的[32]。本研究中9對(duì)引物的為0.529～0.913，說(shuō)明具有高度多態(tài)性，比Collevatti等[15]基于SSR分子標(biāo)記和Alves等[16]基于ISSR分子標(biāo)記的紫花風(fēng)鈴木樣本遺傳多樣性分析的多態(tài)性較高，說(shuō)明篩選的9對(duì)引物可以用于對(duì)紫花風(fēng)鈴木群體的遺傳多樣性研究。

本文采用9對(duì)SSR引物對(duì)來(lái)自12個(gè)群體的72份紫花風(fēng)鈴木樣本進(jìn)行遺傳多樣性分析，Shannon多樣性指數(shù)為1.964，H和H分別為0.775和0.310，表明紫花風(fēng)鈴木具有豐富的遺傳多樣性，采集自深圳和江門(mén)的樣本群體遺傳多樣性相對(duì)較高，但均比Collevatti等[15]研究中的H和H偏小。H明顯大于H，說(shuō)明供試紫花風(fēng)鈴木樣本受到人為選擇或近交等因素的影響較大。李蓉蓉[6]的研究也表明，目前園林苗圃中存在紫花風(fēng)鈴木和紅花風(fēng)鈴木的雜交個(gè)體，這值得進(jìn)一步去探究園林應(yīng)用中的紫花風(fēng)鈴木的雜交現(xiàn)象。

物種的群體遺傳結(jié)構(gòu)受地理位置、生境環(huán)境等多種因素的影響。Ayala[33]對(duì)群體的遺傳分化程度進(jìn)行了劃分，st為0～0.05時(shí)群體間遺傳分化很小, 可不考慮；st為0.05～0.15時(shí)群體間存在中等程度的遺傳分化；st為0.15～0.25時(shí)群體間遺傳分化較大；st大于0.25表明群體間有很大的遺傳分化。本研究中12個(gè)紫花風(fēng)鈴木群體的st為0.077，表明群體的遺傳分化處于中等程度。AMOVA分析表明，紫花風(fēng)鈴木遺傳變異僅有8%來(lái)自群體間，而大部分遺傳變異發(fā)生在群體內(nèi)。而群體的基因流為0.941，小于1。本研究中的紫花風(fēng)鈴木群體處于中等水平遺傳分化和低基因流，這主要與紫花風(fēng)鈴木的引種與栽培繁殖方式有關(guān)。目前我國(guó)園林栽培應(yīng)用的紫花風(fēng)鈴木引種來(lái)源不一，情況較為復(fù)雜。本研究選取的紫花風(fēng)鈴木樣本多栽種于道路或城市綠地中，每個(gè)群體的個(gè)體構(gòu)成受到人為因素影響較大，并不是以自然更新為主形成的自然群體，群體遺傳分化規(guī)律性較弱。人們更側(cè)重選擇觀賞效果優(yōu)良的個(gè)體栽種在一起，因此同一樣地采集的紫花風(fēng)鈴木可能有多個(gè)引種來(lái)源。再加上園林應(yīng)用中為了加快優(yōu)良紫花風(fēng)鈴木繁殖速度，常常采用嫁接、扦插等無(wú)性繁殖[10]手段，更延緩了紫花風(fēng)鈴木遺傳分化速度。此外，由于本研究在收集樣本階段沒(méi)有記錄樣本對(duì)應(yīng)植株是否為實(shí)生苗還是無(wú)性繁殖苗，因此若樣本中有來(lái)自實(shí)生苗個(gè)體組成的群體，其在苗圃繁育階段遺傳分化也可能受到紫花風(fēng)鈴木傳粉方式的影響。紫花風(fēng)鈴木授粉存在同株同花合子后自交不親和的現(xiàn)象，但可以進(jìn)行同株異花傳粉自交[34]，紫花風(fēng)鈴木簇生花相和花量大的特點(diǎn)也利于促進(jìn)同株異花傳粉自交。其次，紫花風(fēng)鈴木的花結(jié)構(gòu)決定了其主要依靠具有長(zhǎng)距離飛行能力且具有長(zhǎng)喙的昆蟲(chóng)進(jìn)行傳粉[35]，因此對(duì)異株傳粉也有一定的限制。

依據(jù)Structure結(jié)構(gòu)分析、主坐標(biāo)分析以及聚類(lèi)分析，均可將12個(gè)群體大致分為2大類(lèi)群，相互補(bǔ)充，但與本研究中簡(jiǎn)要提及的各群體形態(tài)學(xué)上的特征分類(lèi)并沒(méi)有完全對(duì)應(yīng)，因此日后對(duì)紫花風(fēng)鈴木開(kāi)展遺傳多樣性分析可以將分子研究結(jié)合更多細(xì)致的形態(tài)學(xué)指標(biāo)如雌雄蕊的細(xì)部結(jié)構(gòu)特征，進(jìn)行更加全面的遺傳多樣性分析。這3種方法中，來(lái)自深圳的xm、jl以及江門(mén)的jm這3個(gè)群體在不同方法中被歸屬于不同的類(lèi)群，在主坐標(biāo)分析中還呈現(xiàn)散布的特征，總體而言分布規(guī)律并不顯著。推測(cè)這3個(gè)群體的個(gè)體存在種間雜交的可能，值得進(jìn)一步探究。這也表明紫花風(fēng)鈴木群體結(jié)構(gòu)與地理分布并沒(méi)有完全統(tǒng)一，很可能還是因?yàn)椴煌貐^(qū)的引種來(lái)源情況復(fù)雜的問(wèn)題。本研究的不足之處在于選取的樣本數(shù)量相對(duì)較少，且集中在廣東。今后對(duì)紫花風(fēng)鈴木開(kāi)展遺傳多樣性研究和選育工作時(shí)，要進(jìn)一步擴(kuò)充取樣范圍和取樣數(shù)量，采集不同地區(qū)栽培種或有條件獲取原產(chǎn)地的樣本，為紫花風(fēng)鈴木的優(yōu)質(zhì)種質(zhì)資源收集、科學(xué)育種等提供更多有利的遺傳學(xué)數(shù)據(jù)。

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Genetic Diversity Analysis ofPopulations by SSR Markers

HUANG Zhiqing1,2, WU Linyuan1,3, GAO Xiaoyu1, DING Shifeng1, FENG Zhijian1*, QIN Xinsheng1, LIU Yitong2, XIAO Guankang1

(1. College of Forestery and Landscape Architecture, South China Agricultural University,Guangzhou 510642, China; 2. College of Ecological Engineering, Guangdong Eco-Engineering Polythenic, Guangzhou 510520, China; 3. School of Light Industry and Materials, Guangdong Vocational and Technical College, Foshan 528041, Guangdong, China)

,introduced from South America and Central America, had widely used as ornamental tree in southern China, which had rich germplasm resources. However, the resources of introduction is complex while the work of improved variety breeding is lagging. In order to reveal genetic variation ofpopulations, the genetic diversity and population genetic structure of 72 samples from 12 populations collected from 6 cities in Guangdong Province were analyzed. The results showed that a total of 123 alleles were amplified by 9 pairs of SSR primers with average PIC of 0.754, indicating that thegermplasm had high genetic diversity. All 12 populations ofalso had high genetic diversity, the average effective alleles between populations was 3.272, and the average Shannon information index was 1.159. AMOVA analysis showed that genetic differentiation among populations was relatively low, while that within populations was high. The overall genetic differentiation coefficient of populations was 0.077, which was in the medium degree. Based on the Structure analysis, PCoA analysis and NJ clustering analysis, 12 populations ofcould be divided into 2 groups, and the grouping results had certain similarity, indicating that the genetic structure of tested populations was not complex. These would provide a theoretical basis for the utilization of germplasm resources, genetic variation and scientific breeding for

; Genetic diversity; SSR marker; Genetic structure

10.11926/jtsb.4697

2022-07-07

2022-11-11

國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31870699)；廣東省林業(yè)科技創(chuàng)新項(xiàng)目(2018KJCX030)資助

This work was supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 31870699), and the Project for Forestry Science and Technology Innovation in Guangdong (Grant No. 2018KJCX030).

黃稚清(1995年生)，女，助理實(shí)驗(yàn)員，從事野生植物資源利用與園林植物應(yīng)用研究。E-mail: starlight0715@foxmail.com

* 通訊作者 Corresponding author. E-mail: fengzj@scau.edu.cn