呂薇,祁全,宋佳希,胡雪玲,章金春
南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬南京中醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)科,江蘇南京 210022
泛素化-去泛素化修飾可調(diào)節(jié)細(xì)胞中蛋白質(zhì)的定位、功能并降解蛋白質(zhì),參與胞內(nèi)信號(hào)傳遞、基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞增殖、炎癥免疫等生命活動(dòng)的調(diào)控[1]。去泛素化酶是蛋白酶的超家族之一。根據(jù)催化機(jī)制,去泛素化酶分為半胱氨酸蛋白酶和金屬蛋白酶兩類,其在調(diào)節(jié)泛素信號(hào)傳導(dǎo)中至關(guān)重要,并與癌癥、中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病、自身免疫疾病和感染性疾病等相關(guān)[2]。
炎癥性腸?。╥nflammatory bowel disease,IBD)是慢性、非特異性、腸道炎癥性疾病,包括克羅恩病和潰瘍性結(jié)腸炎[3]。IBD主要由腸道免疫系統(tǒng)失調(diào)、微生物群紊亂和腸道上皮屏障功能障礙引起,其臨床表現(xiàn)主要為腹瀉、腹痛和直腸出血等。多數(shù)患者病情反復(fù)發(fā)作,可引發(fā)腸穿孔、腸梗阻和腸癌等疾病。目前,IBD的致病性和病理學(xué)機(jī)制尚不明確,且缺乏有效治療藥物。
在IBD的發(fā)病機(jī)制中,先天性免疫和適應(yīng)性免疫發(fā)揮重要作用。先天免疫細(xì)胞可抵御病原體和腸道微生物的過度進(jìn)入,同時(shí)保持對常駐腸道微生物群的免疫耐受性。腸道先天免疫細(xì)胞可產(chǎn)生快速和非特異性反應(yīng)作為一線反應(yīng);先天免疫細(xì)胞可通過產(chǎn)生細(xì)胞因子和趨化因子、激活補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)和吞噬作用或呈遞抗原,激活免疫應(yīng)答介導(dǎo)宿主防御反應(yīng)、炎癥和組織愈合。適應(yīng)性免疫應(yīng)答通過B細(xì)胞或T細(xì)胞特異性激活,主要介導(dǎo)體液免疫和細(xì)胞免疫。免疫細(xì)胞主要有細(xì)胞毒性T細(xì)胞、效應(yīng)T細(xì)胞、調(diào)節(jié)性T細(xì)胞、輔助性T細(xì)胞和分泌抗體的B細(xì)胞[4]。此外,免疫細(xì)胞通過分泌促炎細(xì)胞因子和抗炎細(xì)胞因子等多細(xì)胞因子調(diào)節(jié)腸道穩(wěn)態(tài)[5]。
泛素、泛素活化酶E1、泛素結(jié)合酶E2、泛素連接酶E3和去泛素化酶參與蛋白質(zhì)的泛素化過程。泛素化是泛素分子在一系列特殊酶的作用下,識(shí)別靶蛋白,并對靶蛋白進(jìn)行特異性修飾的過程[6]。在三磷酸腺苷供能的情況下,泛素活化酶E1與泛素形成硫酯鍵,使泛素與泛素結(jié)合酶E2結(jié)合,在泛素連接酶E3的作用下,泛素的羧基端與底物蛋白上的賴氨酸殘基形成異肽鍵,對底物蛋白進(jìn)行泛素化修飾[6]。
泛素是一種高度保守的含有76個(gè)氨基酸殘基的蛋白質(zhì)。根據(jù)泛素分子內(nèi)的賴氨酸殘基,至少可形成7種賴氨酸泛素鏈,包括K6、K11、K27、K29、K33、K48和K63[7]。此外,將泛素的C端甘氨酸鏈接到另一個(gè)泛素的N端甲硫氨酸可形成線性泛素鏈M1[7]。蛋白酶體是一種多亞基復(fù)合物,可募集蛋白質(zhì)并水解泛素修飾底物,該過程在細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)和蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)中起關(guān)鍵作用[8]。泛素化是一個(gè)可逆的過程,底物上的泛素鏈可通過去泛素化酶去除并水解成單個(gè)泛素分子,該過程稱為去泛素化,在維持泛素系統(tǒng)平衡、限制信號(hào)傳導(dǎo)以避免信號(hào)通路過度激活等方面起關(guān)鍵作用[9]。
去泛素化酶分為半胱氨酸蛋白酶家族和金屬蛋白酶家族兩大類。半胱氨酸蛋白酶包含泛素羧基末端水解酶、泛素特異性蛋白酶(ubiquitin specific protease,USP)、卵巢腫瘤相關(guān)蛋白酶(ovarian tumor-related protease,OTU)、Machado-Joseph結(jié)構(gòu)域蛋白酶、單核細(xì)胞趨化蛋白誘導(dǎo)蛋白(monocyte chemotactic protein-induced protein,MCPIP)等。金屬蛋白酶家族只包含MPN(+)/JAMM蛋白酶家族。USP是最大的去泛素化酶家族,在細(xì)胞周期、信號(hào)傳導(dǎo)、DNA損傷修復(fù)、染色體易位、基因轉(zhuǎn)錄、自噬、內(nèi)吞和細(xì)胞凋亡中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用[10]。USP的異常表達(dá)或活性阻斷通常會(huì)導(dǎo)致組織發(fā)育異常,甚至引發(fā)一系列疾病[11]。
泛素化和去泛素化異??梢l(fā)癌癥、代謝綜合征、神經(jīng)退行性疾病、自身免疫疾病、炎癥性疾病、感染和肌肉營養(yǎng)不良等多種疾病[12]。去泛素化酶及其介導(dǎo)的泛素化和去泛素化修飾在IBD發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮重要作用[13]。
在IBD患者的結(jié)腸中,核因子κB(nuclear factorκB,NF-κB)信號(hào)通路在促炎因子基因表達(dá)、調(diào)節(jié)炎癥小體、激活炎癥T細(xì)胞和先天免疫細(xì)胞分化中發(fā)揮重要作用[14]。其關(guān)鍵激酶IKKβ通過選擇性識(shí)別其下游底物p105、p65、IκBα等,參與多種病理生理過程,但上述底物的具體作用機(jī)制尚不明確。
CYLD是一種USP家族的去泛素化酶,CYLD基因突變會(huì)引發(fā)家族性圓柱瘤病。在結(jié)腸炎相關(guān)腫瘤模型中,CYLD缺陷小鼠易發(fā)生結(jié)腸炎癥,伴有組織學(xué)損傷、白細(xì)胞浸潤、發(fā)育不良及腸上皮黏膜潰瘍增多等。在CYLD基因缺陷小鼠中,先天性免疫和適應(yīng)性免疫因子被激活后,B細(xì)胞、T細(xì)胞和髓系細(xì)胞中的NF-κB和c-Jun氨基末端激酶活性增強(qiáng),腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子2和NF-κB必需調(diào)節(jié)劑的泛素化增加,CYLD通過調(diào)節(jié)體內(nèi)泛素化來制約炎癥和腫瘤的發(fā)生[15]。在嚴(yán)重炎癥模型中,CYLD介導(dǎo)的炎癥小體NLRP6的K63連鎖去泛素化可負(fù)向調(diào)節(jié)NLRP6-ASC依賴的炎癥小體活化和白細(xì)胞介素(interleukin,IL)-18生成,從而抑制腸道炎癥[16]。在免疫信號(hào)傳導(dǎo)中,USP7通過穩(wěn)定NF-κB促進(jìn)炎癥信號(hào)傳導(dǎo);在適應(yīng)性免疫反應(yīng)期間,USP7通過促進(jìn)蛋白質(zhì)的去泛素化、增加穩(wěn)定性促進(jìn)腫瘤逃逸;此外,USP7在促進(jìn)調(diào)節(jié)性T細(xì)胞和效應(yīng)T細(xì)胞的抑制功能中起關(guān)鍵作用[17]。
研究證實(shí),IBD患者結(jié)腸巨噬細(xì)胞中USP16高表達(dá),條件性敲除USP16基因的IBD小鼠的炎癥程度降低[18]。在小鼠結(jié)腸炎模型中,與野生型小鼠相比,USP47基因敲除小鼠更易患急慢性結(jié)腸炎,炎癥細(xì)胞因子表達(dá)更高,腸組織損傷更嚴(yán)重[19];USP47通過腸上皮細(xì)胞中K63連接的多聚泛素化腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子6的去泛素化調(diào)節(jié)腸道炎癥[19]。
轉(zhuǎn)錄因子的泛素化修飾可調(diào)控腸道中免疫細(xì)胞的比例和功能。T細(xì)胞特異性USP8缺陷小鼠易發(fā)展為結(jié)腸炎,USP8主要與叉頭盒轉(zhuǎn)錄因子O1介導(dǎo)的細(xì)胞因子受體IL-7Rα的上調(diào)有關(guān)[20]。腸道中缺乏USP9X的小鼠表現(xiàn)出腫瘤抑制因子F-box和WD40重復(fù)域(F-box and WD repeat domain-containing 7,F(xiàn)bw7)表達(dá)減少,而腫瘤抑制因子Fbw7可以c-Myc等癌蛋白為靶點(diǎn)進(jìn)行泛素化,并在多種人類癌癥中發(fā)生突變。因此,USP9X通過調(diào)節(jié)Fbw7的穩(wěn)定性抑制腫瘤形成[21]。
在IBD模型中,去泛素化酶與IBD的發(fā)病機(jī)制相關(guān)。USP38是一種新型組蛋白去泛素化酶,可與組蛋白H3K4修飾劑組蛋白去甲基化轉(zhuǎn)移酶(lysine demethylation 5B,KDM5B)結(jié)合并阻止其被蛋白酶體降解,進(jìn)一步增強(qiáng)KDM5B在炎癥相關(guān)基因調(diào)控中的功能。USP38-KDM5B被鑒定為一種獨(dú)特的染色質(zhì)修飾復(fù)合物,通過調(diào)控組蛋白泛素化和甲基化抑制炎癥反應(yīng)[22]。在實(shí)驗(yàn)性結(jié)腸炎或細(xì)菌感染模型中發(fā)現(xiàn),USP25缺失可增強(qiáng)免疫反應(yīng)、促進(jìn)感染細(xì)菌的清除和炎癥的消退,并抑制Wnt等信號(hào)通路,從而抑制結(jié)腸癌的發(fā)生[23]。研究表明,USP25是胃腸道感染和相關(guān)癌癥的藥物靶標(biāo)[23]。
卵巢腫瘤結(jié)構(gòu)域蛋白酶(ovarian tumor domainantaining protein,OTUD)1是炎癥、先天性免疫反應(yīng)、氧化應(yīng)激反應(yīng)及活性氧相關(guān)細(xì)胞死亡途徑的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子[24]。OTUD1通過水解K63連接的泛素鏈調(diào)節(jié)NF-κB信號(hào)通路。研究發(fā)現(xiàn),OTUD1與受體相互作用蛋白激酶1(receptor-interacting protein kinase 1,RIPK1)相互作用,并從RIPK63選擇性地切割K1連接的多泛素鏈以抑制NF-κB必需調(diào)節(jié)劑的募集[25]。Nemo信號(hào)泛素化在調(diào)控NF-κB等的活化過程中發(fā)揮重要作用,且與IBD的發(fā)病密切相關(guān)[26]。OTUD1-RIPK1軸可能是IBD治療的潛在靶標(biāo)[25]。OTUD5是另一種去泛素化酶,可調(diào)節(jié)先天性免疫細(xì)胞和適應(yīng)性免疫細(xì)胞的細(xì)胞因子生成。OTUD5在克羅恩病和潰瘍性結(jié)腸炎中均過表達(dá),表明這種蛋白質(zhì)參與IBD異常細(xì)胞因子反應(yīng)的擴(kuò)增[27]。
A20是一種有效的抗炎分子,編碼A20的基因發(fā)生突變與人、小鼠的各種炎癥病理有關(guān)。A20可發(fā)揮泛素編輯酶作用,抑制NF-κB信號(hào)通路,從而發(fā)揮抗炎作用[28]。特異性敲除小鼠腸上皮細(xì)胞中A20后,并未發(fā)生自發(fā)性腸道炎癥,但對葡聚糖硫酸鈉鹽誘導(dǎo)的結(jié)腸炎的敏感性增加,并抑制葡聚糖硫酸鈉鹽誘導(dǎo)的急性腸道炎癥的恢復(fù),表明A20在緩解腸道炎癥和促進(jìn)腸上皮損傷后恢復(fù)等方面可發(fā)揮作用[29]。A20和ABIN-1通過抑制胱天蛋白酶8的激活和細(xì)胞凋亡信號(hào)通路共同預(yù)防腸上皮細(xì)胞的死亡[30]。A20和ABIN-1也可調(diào)節(jié)RIPK1的不同泛素化事件,影響RIPK1磷酸化和RIPK1激酶活性,抑制RIPK1介導(dǎo)的壞死[30]。此外,A20也可通過對樹突狀細(xì)胞功能的調(diào)控,參與IBD的發(fā)生和發(fā)展[31]。
Sigma-1受體具有抗炎作用。Sigma-1激動(dòng)劑氟伏沙明可顯著減輕結(jié)腸損傷,增加泛素C端水解酶連接酶-1和內(nèi)皮型一氧化氮合酶的水平,并降低IL-6和誘導(dǎo)一氧化氮合酶的表達(dá)水平[32]。
黏蛋白2(mucoprotein 2,MUC2)是結(jié)腸黏液層的成分之一,其表達(dá)在腸道穩(wěn)態(tài)中起重要作用。去泛素化酶ZRANB1的443氨基酸位置發(fā)生突變,半胱氨酸變?yōu)榻z氨酸,從而影響泛素的形成。研究表明,ZRANB1調(diào)節(jié)MUC2的表達(dá)和腸道炎癥,這可能有助于闡明IBD的發(fā)病機(jī)制并開發(fā)靶向ZRANB1的新療法[33]。
MCPIP-1在活化的免疫細(xì)胞中高表達(dá),在負(fù)調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)中起重要作用。MCPIP-1可顯著下調(diào)活性氧和促炎細(xì)胞因子的生成,并抑制IBD中性粒細(xì)胞的遷移。靶向MCPIP-1有可能為IBD的治療提供新方法[34]。
本文綜述去泛素化酶與IBD發(fā)病機(jī)制之間的關(guān)系。去泛素化酶是IBD的重要調(diào)節(jié)因子,在調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)翻譯后修飾中起重要作用。在調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)活化和降解方面,去泛素化酶對蛋白質(zhì)的修飾可為炎癥的有效治療提供新思路。因此,仍需對USP進(jìn)行更深入的研究以探索其調(diào)控機(jī)制。